Lsi01G018230 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview


Name	Lsi01G018230
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Unknown protein
Location	chr01: 18676137 .. 18683215 (-)
RNA-Seq Expression	Lsi01G018230
Synteny	Lsi01G018230

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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ATGACACTTTTCCTGCCACGTGTAGGGCAGAGGTTAGTTAAAAATGGGAAGACATGGATTGCAAGGCTATGTGGCAACCATCCAGCAGGTGCAAGAGTGTGGGGGTGTGTGCCAGGGACACGCCCTTCATCCAACGACCGAGGTAGACCTAGGCCTACGCTTGCCGCTACTGCAGCTGGCTGGTGCGCGGTGGCCTATCTCGTCCTCTTCTTTTTTTTTAATTTGAATTTGATTTTTAAATTTTGAGTTGCCACTTCCCTCTCATTTTTCCCTATAAATAGGTGCCCACAATCCTTTTCATTCTCACTTTATCTCCAACTCACTTCAATCCTTCAAGGTAGGTTCTTCTTTTCATCTTTCTCCTTTTTCTTTTAGAAAAAATGTCACTGTAGGACAACAAGGTGAGTGAAAATATTTTTTTTTCTGAGGATCATTCTCTTTCCTCCTATTGTGAGTCCCCAAAGCCTTCTGAATATTTTGTTGAGGAGCCTTCTATTCTTGTTGGGGGTTTACCATCCTCTGTGATTGGTGCTCAACTTGAGTTACTATGTTTTAAGTATGGTATTCCCCGCATAGTGCATCTGAGGGTTCCTCTCCCTGATGAAACCATAAATAACCCTCATGGGGGTGAGGTAGCTTTTTATCCAGCCATGTTTCGTTTTGGGATTCGTCTTCCTCTTCAGTACCTACATAAATAACCCTCTTACCGAATGGGTGGAGTCATCTCATTAGTACCTACTCCCTTTGGCAAATTAATCCCGACGGTGCCCCAATGTCTATTCCTACTTTTCTGTCTTTATATCAAATTTGTCATACCGGAAATACAGTGACTTTTTTTTTATTATATTATGGCCCATAATAAAGTTCTAGTTGGTAGTGTCTCTTCTATCAAGAATTGGAAAGAATGTTGTGGTTTTTTGTTAGCAGTGATTGGTTTTCTACTGATAAATCCAATTTGAGCTATGCAGTTTCGACAGGGTTTAGTGATTATGGTAAGGGCCTTTTCCCTTTTCCTTTGTTTGGAATTGCCTTTTTCCCTATTTTCTGACTTTTTATACTTTCTTTCCCAGCGCCTCTGAAGTTTAGTTGCTCCTCGATTGCCAGAAATTTTGCTAGGGCTGCCAGAGCTTGGATACCGACTCCAACCACAGTTCAAATTTTATTTCTCAAGAGAATTTGGTCATCATTGGACTTGCCACCTCAAGTCCCCCAATAGGTAATTGTTTTTCTTTTTTCTCTCATTTTTTTGGTTGGCCTCGGCGTCCGAGGCCGACCTAGGTTTTTTTTCTATTTTTTTAAACAAGTCTCTTACCCCCTTTTTATCTGCCTCCCAGGGATGAGCACCCGAAAAAGCTTCCTTTTTTTAGAGTGTTAGTATGAGAAAGAAGAAAAACAAAGATGGTGTTGGAACTTCTCGAGATTGTCTGATGTTGACACGCAAGACTTTACTCAAGATGAGGCTGAAATAGATCATTCGCGTCGTGGCTAAAACCCTCCTCCTGAGGGCTTGCGCCGGTCAACTCATTTGCAGCACACTCCCATGTCTCAGGAAGCTAGTTGGATTTTATGTCCTAAAACTCGTTGTTTGTAAACATGAATATGCATTTTAGTTATCAATAAAGTTGTTATCGAGGTTATTCAGCAAACTTGTTATTGAATAAGTGAATTGTTGTTAATATAACTCTAAATCCAATAAACTAAGAACCCATAGCTATAGTATGAATACTTGAACTATATATAGTGACATAAAAGTGGATCAAGTTCGAGTAAATAACCAAAACGGTTGAAACGCACCTAAATTGTGCGTTAACTACTCTTTATTTAAAAGTATTTTTGGTAGATTTGACGTGTTTGCTGGTGGATTTCAGGTTATAACGAAGAAAATGAGTTGCGGAAGCAATGGAATTAAACCAATCGTGCGAGTCAAAACCGGACAAGAATAGCTCAAAAACCCTAAAAAAAGGGCAACATAGAGCAAGAGCATCGCTACGCTGCCCCTTTATGCTCAAGACCCGAGAGCACCTTATTTTTGTACACTTGAGAGTGCAGCTACACTCCTGGAGAGTATAGCGACGCTAAAGCAGTGTAGCTATGCTAATACACAACACAACGCTACGGTATGGTGAAATTAGACCAGTGTCGCAACACTCTTCCTTAGCGTAGCGACGTTGGCTTTCCTTTTTCAATTATGATATATTTTAGGAAATCTTTTTCAATTATGGAAGCCGTTCAAGATCCTGAAGTGCCGGCCAAGCGGAGATCAAAGGAGTTCAACAACGGGGAGTGGTTCGAGAGATTTTCTTCCTAAGTTTTCTTTTCTCATTACTCTTATGCTTCCAAATTCATATGATAATATGTATTTGAAAGTCTGTGTGGCTAAACTCATAGTTTTAGAGTCCTGAATGATTTAATTATGAATTTAAGTTAATGGTTTAGTGTTTTTCATGGATGTTTTGAAAGATATGTTTTTCAATACTATTGTGCTTTATTCTTCCTTGATTGATCACCAATGAATGTTAGGTTTGATGTATGATTGAAGGGTTGTATGTCTAATTGGATCTATAGTATTGAACCTTTATCGATCTTTCATGAAAATAGGTTAGATTGTTAAAGGAAGTTGTTGATGATTGTTCTTAATGCTATGTTCTTTAACTTGATTTCATGAAAATAGTAATCAATTAGATTGCATAAGAAAGGGTTGTCTTTGAGAGAAAATAATCTAGATTTTAGTTTCTAGACTTAAACATATCGTTTGTTTATTCCATGAAAACCCTAAACCTTAATTTAATGAAGTAATTAATGATATCTACACCCTAGAACGCTTTGATCTCTTGATTTTCAATTGCTTTTACTTTCTTTATTTTCTTTTCTCAAAACAAAACTCGAAGTTGATTCCTTAACTAAAGTCGAAACATTTCTTAAATAGCTTAGTATTTAAACTATAACAAGGTCTTCAGTGGAACAATACTCGGACTTAATCATTTTATATTATAACTTGACCCGTGCACTTGTAGAAATCGCGCATCAATGGTCTATATTATAAGGATAAGGTTGGGTACCTTATCTTGGAGACACTATTGACTGCGATCTACTTTGTATTTAGTACAAAAAAATGTGGTCCTAAATCATTCATGTGAATACATGTGACTGGGGGCATTATGTGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGGCCACGAAATAGTCACTATTACTTTATAACGTCGTTTACTGTTAAATACTGACTATTTCAACTAGATGGTCTATATAACTCGATCTTAATTCTGAGCTAACTATGAACTCATGTTTATTCAGGATTATCCTTAGATCTGCATGGGTGAGAGTGGCCCGAGTACGCCGACTCAATAAGCCTCCCATTTTAGGGGTAAGACCGAGTAGATAGCTTGGGACATAGTCTTGCAAGAAGGAATTCACTCCTACCTGAATTAGGGTTAGTAGATAGGTTGTTCCTTTAAGTACTGATTCTGAGTCTTGAACAAGGGGCCCCACCCTCTCATTGGCCCAAGAGGGACTTGTCGTGTTCATAAAGTGAAGCCAAAGTATGTGATGTGATTTATGCTACTTCTACAAGAAAGAATTAATATATATGTATATATAAACAGGCAATGAACACAAGCTTTACCTAATCTGAATGCAAGTATAAATTAAAATCAGGATCCTAGTGAGTCTAGGGTCAAACACAGAGACTTTAATGCGATAGTGATTAAAAATTTGCGACGATAACTATGCAATGAATATTTGTACACAAAATAAAGAGATGAGAATTTATCTAAAATGTAATTACAATACAAGAGAGGGTTATGCGATGAGCAAAGGGGAATATGGTGACTGTCGATGAAATTCTGATCTTCAATCAAGTAGCATGCGATGACGTTTGAAATAGACTTAATAACAGTACTAAGATTTCTATTGTTTCATTTATGCAAGAGTTGCGTTGTCAATCTTGTAACTTTACAGCGACCTCTCAGCTTTTAACCCACATTTTCTCTTATTTCCAAGGTGCATCCGATGATTGACTAAATGACTATATCAATTTATCTCTAAAGTGCTACTCCTAACTACTCAATGCTTTCTACAATTTCTTCACCCTCTCAGGTAAGAACTCAAGCTTAAATTTATCTCTCAATAATTTTAAGCAAGGATTAATGGTGTATCAAATAGTAAAGCTGCTTAATCATGCATAAATTCAGCCACTAGGTAAATCTTTCCAACTATAAAAAAGATCAATATGCAAACAAGTGAAGCTTTTATGGATGAAAGATATGAACTTATATTGACATTTAGAATTAGAAGTCTTTCAAAATCAATTCATAATACAAATATAAGTAAGAGAAAGAACTAGAAGTAGAGATGTCGAGCCGTTGAGACAATCTCTTGATCTCGCTAGCTTGAATTGACTACTTGTTGATGATAAACTTCAAAGTTGATGATGACTCATGCTATTCTAAGAAGAATTCTGAAGTTTGCACTCAAAATTCTGCAGAGAAATGCTTGAGGATTGATAATGGCGATGCTTTGACTCTCTCTTGGGGAAGATGATCTCTCGACTCAACCAACCCCTTCTTCAGTCTTTGGGTTGATTATTTATAGGTGCCAAAACGAGCTTCTCTCTAATGATTTCCTGACGCATGCATTAAATTTCATGCCCTGCTGCGTCGACTTGATTTATCATGAGTTCATTGGCTCTATCATGAATCAGTCTAATCAGCTGCCAACTTGTTATGCACATGTCAGGCCTTTTTTTCATTGCATGGCTTGTTTTGTAAACACGTTGGTCACCTTCTTTGTGTTTATGCGATCATGGCCACAACATTTTCTTCATTTTTTTTATAGTTTTCTCTTCATTTCTGCGATGAGACAAAAAGATTTGCATGATTTCTAGATTTAAAGTACTTGTAAACACATGATCGCAAAGTATGCTCATTTGCTAGGATTTATAACAAATTTCTATTTCTCTAATTACTTTAAATAACATAATAGAATAACT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mRNA sequence

ATGACACTTTTCCTGCCACGTGTAGGGCAGAGGTTAGTTAAAAATGGGAAGACATGGATTGCAAGGCTATGTGGCAACCATCCAGCAGGTGCAAGAGTGTGGGGGTGTGTGCCAGGGACACGCCCTTCATCCAACGACCGAGGTAGACCTAGGCCTACGCTTGCCGCTACTGCAGCTGGCTGCTTCCAACTGCAGCAAGGGATTGGTCATCAAATTGGAACATGTGAGGTTGGAGCTGCGGATCCCTCTGAAGCTCTCACTTCGACACTTTGCGGTCTCCAAGAGAGTAAGAAGTGCACTCGCCAATATCCTGGTCAAGACTACTCTTTCCTACGCGAAAGGTACATCAGACATCACGATAATCCCGATCTACCACCTTCATCTGATGATTCAGAAGGGAGTCGTGGTGGTGATGGTACTATGGAGACTAATTTAGTCCAAAAGGATGCTTGTCGTGGTGGTGATGGTACTATGGAGACTAATTTAGTCCAAAAGGATGCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGACACTTTTCCTGCCACGTGTAGGGCAGAGGTTAGTTAAAAATGGGAAGACATGGATTGCAAGGCTATGTGGCAACCATCCAGCAGGTGCAAGAGTGTGGGGGTGTGTGCCAGGGACACGCCCTTCATCCAACGACCGAGGTAGACCTAGGCCTACGCTTGCCGCTACTGCAGCTGGCTGCTTCCAACTGCAGCAAGGGATTGGTCATCAAATTGGAACATGTGAGGTTGGAGCTGCGGATCCCTCTGAAGCTCTCACTTCGACACTTTGCGGTCTCCAAGAGAGTAAGAAGTGCACTCGCCAATATCCTGGTCAAGACTACTCTTTCCTACGCGAAAGGTACATCAGACATCACGATAATCCCGATCTACCACCTTCATCTGATGATTCAGAAGGGAGTCGTGGTGGTGATGGTACTATGGAGACTAATTTAGTCCAAAAGGATGCTTGTCGTGGTGGTGATGGTACTATGGAGACTAATTTAGTCCAAAAGGATGCTTAG

Protein sequence

MTLFLPRVGQRLVKNGKTWIARLCGNHPAGARVWGCVPGTRPSSNDRGRPRPTLAATAAGCFQLQQGIGHQIGTCEVGAADPSEALTSTLCGLQESKKCTRQYPGQDYSFLRERYIRHHDNPDLPPSSDDSEGSRGGDGTMETNLVQKDACRGGDGTMETNLVQKDA

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lsi01G018230 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lsi01G018230 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lsi01G018230 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lsi01G018230 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 118..167

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lsi01G018230.1	Lsi01G018230.1	mRNA