Lcy13g011840 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CGAACTTTATCCAGAGAAAGGAAAAAGAAAAAGGTGCCTTCCGAAAGCAAGCTTTTTATTTCTCACTTCTTCATTCTTATTTCTGACAGTCGAACCCCCCCACCAGCACGCCCCCTCAATTCCTTCTCAATCTCCCTCACTCTCAGCTCTCTTTTCAGGTCCCCTTGGCCCTCAATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAATCGCACAAAAGAATCGTCAGTTCTTGGCATTTCCAGTGTGGCAATTGCACATACACCGCCGGCAAGGTGATTTTCTCTTCACTCTCTAGCTTCCACCCTCTTCTACATGTTCAAATAAGTCTAAATTTGCACTTATGATGATTTACAAGGCTTTTCCTGTGTTCATACACACAATCCCAAGTTAACCCACGATCCATTTGAGAATCGACACACATTATTCCTGGGCACTTCGTATTTGGAGACTCTTACAATCCCAACTTTTCCTTTCCTGTACAGTGAAGCAAGTTATTTTAGGTAGATGCATACACTGAATTTGCATAGACCCTCTTTCGGGCATCTCTGGCTACATTCGAATTTGCGGAGCTGTGCTAGACGGTTAGGACACATCCCAATCTCTACTGCTCGCGGCTTAGTTTCCAGGTATTTGTATGGTTTCCTAGTCGTCATGAGTATGTTGCAAAACCATTTCTACAGGGTTTATACAATTAGGAGTAAGGGAAACAAAGAATTTAAGATCATGAATGTGAAAATGAATGCATGTTGGTATCTCATGATTACTAGTTAATAGTATAATAATTCATACATCTTAGAATGTAAAATTATCGAAATGTGTTAGACCTCAATCTCAATTTTTTTTTTTGTTTAACAAGAAACAAAACTTTTCATTGATATAATGAGAAGAATGAGAAGAGACTGTTGCTCAAAGGATACAAACTCCACAAGGAGTGAGAAAGAAAAGTGGTAAGAGAAAGCAATAAAAGATTAATTCGGGCTGTCATCTTGTTAAATGGAGTTGGACTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATATGGGGCCTGGGTATCGATTCATTGAGGCAAAGGAACAATGCTCTTCTCATTAAATGGTTGTGGAGATTTTCCCAAGAAGAGAAAGCTTTGTAGAGAAAGGTAGTTGATAGTATTTATGGCAGTGAACCTAGTGATTGGACGTCTATTCCTCCATAAGGGGCCTCAAAGGCAAGACCGTGGGTTGAAATTGCTAAACGCAGTGCCTCTTTTTTGTGAATTTCTTTATGTTCAAGGTGAAAAGTGGGGGGAGAATTTATTTCTGGAAGGATAAATGGGTGGGCAGTACTCCTTTGAAGGATGCCTTTCCAAACCTTTTTCATGTAATGGTTATTTTATCTTAATGTAGAGCTCGTCTTTTGTGCTGTAATGAATTATAGTGACCTGTTAGCTTTCCCCTTTGTTAATGACTCAACAACTTCAGGAAAATTACTGCAATGTCTGCATCTGTGTCACAAGATTCTGGGATTTCACTTGCATCAGTAACAATCCAGCCTCCATCTCACCCTACCTATGATTTGCGTGGCATCATCAAATTAGCCCTTGCAGAAGATTCTGCTGACTTCGGTATGATAAATTATTTTATTGTTATTATTTTTTAATGTTCTGTGAATTATGATGATGTTTGGGTTTACCTACCTCCCACTCATTGTGATGCAAATTGCATCTGAAGATTAAAAAAACAAGCAGGAATTAGTTGCTGAAATTTTCTGTTGCCAAGTTATCCAAAGCATAAGTTTTGCTTCCTAGCCCCTTGGTATGCTTTTGGTCTCAAGTCTTATTTTGGTCGGAAAGAAGTTTATAGATGCATTCAAATCATCAATGTAATTAGATTTTCAAACTAAGATCTACTTGAGTTAGTTCTGTTTTTTTCCCAAGTGAAGCTGCTGTGACAGAGGTCCAGTAAGGCAATAGAATTTAAGCAATTCCCGTTGAAGGATCTCCTAGCCAATGCTTGTAGATCCAACTCTTATGCCATGATATTCTACTACTTTCTTTATGATTTTTCTATTTTTTTTTCCTCTGTGAGGGGTATTCTCAAATCTGATTTTAGATTAATTTCCAGTTTCCAGCAACTGTTCTAATGGGCCAACTTCCAACGACATAGACCTACCCTGCATCAGATTGATTATATCTCCTGCATGTTATGTCATGCCTAAGTTTCTTTTTTAAGATTTCTTTCCTCAATGCACCATGTTTGTATCAATTTGACAGGAACCAAAAAATTGAAATAAAAACCAAAAAGTTGAAATAGAAATTGTATTGATGACTTGCAGAATTGTGAATAAGAAATGTGGAAAAGATACCCCCCAAGTAATTTGAGGAGCTTGGATACATCCTCTTAAACAAACTCAAGCTCAAACAACTAATTAATTGCTTACCTTCATCCCCTCCCACTCACTCTTTTTGTAATCACTTTCTACTAATAGACTCCTTAACTAATGACTAACATATAAATCCTCAGTATCCTAGTAATATTTCTAACATCTATCCTGATAGTATTCCTAACACAAATGCAGGTGATGTAACTTCTCTGGCAACCATCCCTTCTGACATGGTAGTGGATGCTTTCTTCTTGGCCAAAGAGGACGGCATTGTTGCTGGTATTGCTCTTGCAGACATGGTATTCCAGGAGGTTGATCCTTCAATTCGGGTAATATTGATATTTTCTCTCCCCCGTTTTGGTTCTTGTTGAGTTATTTATGTGAGTGTGTTCTCATTCATCTTAATCCACATTTCCTCTTCAGGTGGAATGGTCTCAAAAGGATGGAGATTATATTCATAAAGGACTACAATTTGGAAAAGTTTCTGGTGAGAGTAGAAAATCTCCAGGAAAACTCTGTTAAGTTGTTAACCATAGTGTTGGTATGGGATGCGCTCCAAACACGTGAATTGAAGTGTTTGATTTTTAAATTCTCTTAATTACTTTTATACATGTTGGGACATGCTCGTGAGAAAGGGTTGGATGGCAGTTTGGTTTGGTTAGCTTTTCAAGGCTCTTCTTCAACGACAGTTTATTTAGGAAGTTCCACAACACTTTATCCTTATCCAAGTTGTATAGGGGATCTAGCTAGTAAGATCTTTGTCCTCCATAGAAAAATGGCTATGGTGCTTTCCTTTCAAGCTTGCATTGCCATATGAACAGGCATGTTTGTTAATCTGCTGGGTGGCTACAACCTTTGTGACTTAAGGCGCATTGAGGGTCATGGTAAAAAATTTAAGTGTATCAATAAACTCTATGAACTTTCTCTTTGGAAACGAGTCTCACATTTGTTTTTGGAAGGACCATTAGATGGATATCAAATCCCTTCATAATATGTTATCCGCACTCTTAATTTTCCCCTCTAAATGATTCATTTATTTAGTTGATTTCACTATTTTAAGGACGATTCTCCTTCCCCTTTCCACCATTTCCATTTTAGAAGACCTCTTTTTGAACATGAATCTTGGAGTTATTCATTTTGTCCTCCTTGTTACATAGAGTCATGGTCGATTATTTCCCTCTTCCTTTTATGCATCAGGACTCTTCCTCAACCTTGCTAAACAACCATTGTTGGCGTCAACATTGGTAAGCAAAGGATGAATTCTCAAGTGTCTAAGTTTGGCTGTAGAGTTGAAAGGTCTACCCTTCTTCGATATTGGTTTTCCCTTAGCTGGTAATCATTGAGCTTTATCCTTTTGGGAGCCTCAGGTGGATAAATTAAAAGCAAAGTTGGAAAAAATGGAAGAACCTCTCCTCTCAAAACGGGTAGCCTAACTATGGTAACAATCAATTCTTAATCTCCTCCCTATCTATTGTTTTTCTCTCCTCAAAACCCCCATTGGCATTACTAAATAGATGGACAAATTGGTTAGATAATTATCTCCCTTGTAGCTATTTAGTTAAAAGTGGATGACTTTGCTCCCTTTGCATAATGGGGACTTGGGGATTGGCGTGTTTCACCAAAGGAACAATGCCTTTCACCTTGAATGGTTGTGGATATTTACGCAAGAAAAAAGAGCTCTCTGGAAGAAAGTGGTCACCTATGTGGAACATGATGGTTGGATGACTTTGCTCCTTTTGGCAAGTCTTAAACCAAAAGGGAAGGCAAAAGGGAGACCTTGGTTTGACATTCCAAGAATAGTTCCTCTTTAGTCAGATTCATGGGCTTCTAGGTAAAGCAAGGGCTGACAATAAAATGCTTATTCTCTGGAAAGATAGACGAGGTGGGATCAAGCTTCTTAGCTCAATCAATCCCTGATCTCATCAGCATCTCTTTGAAAAAAGAACTCTACCATTGCTGATTGTTGGAATGAAAATCAAGACAACTGGGACTTGGGCATTATAAGAGGCTTCTTTGACAGAGAGCTTGATAGCTAGCTGGGCTTAGTGAACAAAATGGATTTGGTGCAGCTTGGGGGGGGCTGAAGAAAGTGGCATGATCCTTTGATTCTTCCTCCATATCGAACTTCCTAAAACTTGCAGAAACTATGCCCGAGCTAAAATCTCCCCATGTTAACTTGATATGGCAGTTTAAATGTTCCTAAGAAAGTGAATGTCTTCTTTTGAATTTTGATCCCTTGCTCATAGAGGACTAAACACCCTTGAGAAGATCTTGAAAAAATGTAGCCAGTGCATGCTTTCTCCGTCTTCATATCAGTGAATCTTTAGACCACTTACTTCTTCATTGTTCTTTTGCCTTTGAGGGTTGAGCCTTTATCCTCACGGAATTGGGTTGCTTAGCATACCTGCCTAAATATGTAGATGGGTCGCTTCTTAAGGTTCTAAAAGGTTGGCAATTGAAAGGCAAAGCTAAGATTTCGTGGAATTGCATAGGTAGGACACTTTTGTGGGGCATTTGGTTGGAAAGGAACCAAAGAGTGTTTGAAGGTAAACATCTTCCTTTGACGGTTTTTGTAATAGTGTACAGATCACCTCTTCGTCATGGTGCTACAAATTTGAGAAGAGAAACAGATTTC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ATGCATACACTGAATTTGCATAGACCCTCTTTCGGGCATCTCTGGCTACATTCGAATTTGCGGAGCTGTGCTAGACGGTTAGGACACATCCCAATCTCTACTGCTCGCGGCTTAGTTTCCAGGAAAATTACTGCAATGTCTGCATCTGTGTCACAAGATTCTGGGATTTCACTTGCATCAGTAACAATCCAGCCTCCATCTCACCCTACCTATGATTTGCGTGGCATCATCAAATTAGCCCTTGCAGAAGATTCTGCTGACTTCGGTGATGTAACTTCTCTGGCAACCATCCCTTCTGACATGGTAGTGGATGCTTTCTTCTTGGCCAAAGAGGACGGCATTGTTGCTGGTATTGCTCTTGCAGACATGGTATTCCAGGAGGTTGATCCTTCAATTCGGGTGGAATGGTCTCAAAAGGATGGAGATTATATTCATAAAGGACTACAATTTGGAAAAGTTTCTGGGCAGGCACAGAGCATCCTTGTAGCTGAAAGGGTGGCACTAAACTTTATGCAGAGAATGAGTGGAATTGCAACTTTAACTAAGGCAATGGCAGATGCTGCAAGCCCTGCATGTATTCTGGAAACGAGAAAAACTGCTCCAGGTTTACGTTTGGTGGATAAGTGGGCGGTATTAATCGGTGGAGGTCAAAATCACAGGATGGGTTTATTCGATATGGTGTTGATAAAAGACAATCATATATCAGCAGCTGGAGGCATCTCAAATGCCATTAAATCTGTTGACTTGTATCTGCAACAAAGAAATCTTAAAATGAACGTTGAGGTTGAGACCAGGACTCTTGAGGAAGTACATGAGGTACTACACTATGCAAGTCAAAACAAGACGTCCTTGACTAGGATGATGTTGGATAATATGGTAATTCCACTCCCAAGTGGCGATGTTGATGTGTCCATGCTTAAGGAGGCTGTAGACATCATCAATGGGAGATTTGAGACTGAGGCTTCAGGAAATGTTACTCTGCAAACAATACAGAAAATTGGACAAACTGGGGTTACTTACATATCCAGTGGTGCGCTGACACATTCTGTAAAAGCACTTGATATTTCTCTAAAGATTGACACGGAGTTGGCCCTTCAAGTTGGAAGACGTACAAAACGAGCCTGA MHTLNLHRPSFGHLWLHSNLRSCARRLGHIPISTARGLVSRKITAMSASVSQDSGISLASVTIQPPSHPTYDLRGIIKLALAEDSADFGDVTSLATIPSDMVVDAFFLAKEDGIVAGIALADMVFQEVDPSIRVEWSQKDGDYIHKGLQFGKVSGQAQSILVAERVALNFMQRMSGIATLTKAMADAASPACILETRKTAPGLRLVDKWAVLIGGGQNHRMGLFDMVLIKDNHISAAGGISNAIKSVDLYLQQRNLKMNVEVETRTLEEVHEVLHYASQNKTSLTRMMLDNMVIPLPSGDVDVSMLKEAVDIINGRFETEASGNVTLQTIQKIGQTGVTYISSGALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA Homology
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZU32 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=QPT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 3.5e-144 Identity = 261/336 (77.68%), Postives = 302/336 (89.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0IZS0 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os09g0553600 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 479.9 bits (1234), Expect = 2.5e-134 Identity = 236/316 (74.68%), Postives = 285/316 (90.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P77938 (Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Rhodospirillum rubrum OX=1085 GN=nadC PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 202.2 bits (513), Expect = 1.0e-50 Identity = 129/301 (42.86%), Postives = 174/301 (57.81%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P30819 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) OX=208964 GN=nadC PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 1.5e-41 Identity = 109/290 (37.59%), Postives = 162/290 (55.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P30012 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) OX=99287 GN=nadC PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 169.5 bits (428), Expect = 7.3e-41 Identity = 108/293 (36.86%), Postives = 161/293 (54.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQC2 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447821 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 4.1e-188 Identity = 349/377 (92.57%), Postives = 363/377 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ILM4 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477549 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 5.1e-186 Identity = 346/377 (91.78%), Postives = 363/377 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZD2 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495096 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 656.0 bits (1691), Expect = 9.5e-185 Identity = 347/377 (92.04%), Postives = 357/377 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQ18 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022503 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 9.6e-177 Identity = 335/377 (88.86%), Postives = 352/377 (93.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM89 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022503 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 9.6e-177 Identity = 335/377 (88.86%), Postives = 352/377 (93.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. NCBI nr
Match: XP_038892237.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 671.4 bits (1731), Expect = 4.5e-189 Identity = 352/377 (93.37%), Postives = 362/377 (96.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. NCBI nr
Match: XP_022942936.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 8.5e-188 Identity = 349/377 (92.57%), Postives = 363/377 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. NCBI nr
Match: XP_023513503.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 666.8 bits (1719), Expect = 1.1e-187 Identity = 349/377 (92.57%), Postives = 363/377 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. NCBI nr
Match: XP_022977195.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 1.0e-185 Identity = 346/377 (91.78%), Postives = 363/377 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. NCBI nr
Match: XP_008454775.1 (PREDICTED: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008454776.1 PREDICTED: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016901657.1 PREDICTED: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 656.0 bits (1691), Expect = 2.0e-184 Identity = 347/377 (92.04%), Postives = 357/377 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.1 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 2.5e-145 Identity = 261/336 (77.68%), Postives = 302/336 (89.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.4 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 511.1 bits (1315), Expect = 7.3e-145 Identity = 260/329 (79.03%), Postives = 300/329 (91.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.3 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 8.4e-141 Identity = 258/336 (76.79%), Postives = 297/336 (88.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011840 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.2 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 460.3 bits (1183), Expect = 1.5e-129 Identity = 231/281 (82.21%), Postives = 264/281 (93.95%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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