Lcy13g011650 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAGCAAGGAGTTTACTATTTTCCCTGGTATTTCATTTGATTCTTCGTTTCTCCGTCCCCTATTTCAACTTCTATAACCTTCCTTTTCTGTTATTTTTATTTTTGCTCTTTCTGCAATGTTCTTATTAGCCCTAATATTTGTAAAAGGTTTGTTAATAGAATACATGATATATACCAACACGAGCATCAGTGGTTAACCTTAATATGTAACTCTTCTTAGGCAGTTAGGCCTTGTAATTCTTTGAGTCGAGTCCCTACCTTTTATTTTCTTTTTTTCTTTTGTGCGCAAACTTACCTGTATACAGATTCCTGAATGATCTTGTCAATGATACAATATCAACTCTAGTGGGAGCAGCAGGTATGTCTGCACTGGAAGAGAAGCTAGATGAAATCGAACCTTCAACAAGGAATAATGATGAGTTGGAGGAAGAAGATGAAGTAGAGGAGGACATTTCATGGTCATCAGACCCAGAGATTGGAGATGCATTGGATTGGTTGGATGCAAAAGAAGATATCTGATAGCACCAAATTGGTGCTAATTATTTCCGTAAATTTTGCATATCCTAATGCTGCTATTTGTGATATTTGACTAATTTTGAGTCTTATTGATGCATAGGTCAATTTGGTGTTCTCGGGATCAAGGAAGGACATTTTGGTAAATAAAAGTAAGGCAAATTTGGCCAAAGAAGCGAAAGTCAACCAAAAAGTCAACAGGAACACAAATGAACTAGAGGTGCGCCCAAACACCGTCAGCGTCGAGACGCTGTCACGAGAATATAAAAGTCACATTTCGCATTTTAGGTCATTCATGCTCGTTTTTCTTCCGATTTTGACCGCATCACCTCATCTCTCTCTGTATTTTTCCAGTTCCATTGTATTTGCATTAGATTAGATTAGTTTTTAGATATAGGAATGGTTAATCGAGCCCCGGCGTTTAGTTGGAGCATTGCAATGTCCGGCTAAGTGTAGATCGTCGTAATTGGGGACTCCGAATGTAAGCTTGGCATTCCTTTGAGACCTTGTATATTTCATATTTCATAGAAAACTATTGTCTAATTGTGTTCTTAATTCCAGTTTGTATCACAATTGGCTTGAATGTATAGATTGACAACCTAATTTGTTTGAACCAATTGCTGTGCTAGAATTTGTAGCAAATAAATCTATTGTTAATCTTGATTAAAAGGCGTTTTATCCCAATTGATCAAAATTGCATTATAGATTTAGGAGTTAAGGCTTAGAATCGTATGAATTTAGGCTTTTCCTAGTTTATGCATTCTATCTAACGTTCCATCATTCTTAATGCGATTAAATTCTAATTAGTGAGACGTCATTGGTTAGATTTTTAATTAGGTTCTAACCTCGATGCTTTTGTCGGGTTAGAAAATAATTGGGATCATTAATCTCACTGGCTTTTCCAGTGGGAGGTTAGACAATTAGCTAGTAATTTGTTAATAAAGAGAGTCTATGATTTGGAATTGCCAAACTGAATTCGGATAACCAATTGCACGATCCTGAGGTAAGATTAGTCGGTTCATCCTTTTATTTTCTAGTTATTTAAAATTTAGTAATTTAATTTCTAGCTATTTTTATCTTTCATCCTCAAATTCTCTTCCATGCCAAACCACCCCCCTCCGGTTACTAATTGAAAAATCTTAAGTTAATTTAATTAATTTGATTGCTCCCTGCGTTCGACCCCGACCACTATTTCTACAAAAATAGTTGTAGTGTCGTGGAATTATAAATTTATTTGACCCGAAGCCTCGACAACTCTGGCCCGTCAATATCGAAGTAGTAAATGGGGCTTTTTCACTCAATGTTAGGCATCCTAATGCTCATGGTGGGCTTTATTCTCGTCATAATTCCTCGACTCTTCAACCTCTCTCAAATCGGAAACAAAAGTTTACCAATCACATTCGAGTTTCACCTCTTACGGTAATATACTTAATTTTCTAATTTTATATTGTTGGTTGTGTTTTCTTTTCTACTGACAAGATAAGGCAACAAGTTGAACACTCATATATTGTTGGCATGAGCGTCAGATGCCTAAGCCCTTTATGAACCATCATTCTAGTATCTTCGTATAGTTTTATACTATACTTGTAATTTGTAAAGGAATAGATACTACTATTCTTAATGCTCATATTCATAGATTACCTGTAACTGAGGGACACCTTAATTATTTATCATGTTTGTTATTGTAGGAATGAGAAGAGAGGTTTAATGTCGGAATGTCAAACTCTGTTACCACGACCATTCGTGACAGTGTTAAGGAAATGGCTATAGGAAAAACGAAAACTACAGAGAAAGCTGATTGTGTAACTTATATTTTTAGTTATCAACTGTGTTATTTTAGGTTCACTTTATGATAGAATTGAAGGCTGATTCTTTGCGATCTTGATCGAGGATCGGTTTGATTCGAGTTTTTGGATTACTGCTGAAGGAATTGAATCCCAGCAGAAGCGGTTTTCACCGAGCGTGAATGAATTTAAGTAATTAGAAAACCAATACATCGGGAAAATTTACAGAAACGATTTCTATACAACACAGATTAAGCATGCTAATTACTAGATCTAAACAATTTAGATTTCCGAAGACTTACCTGATTTAACAGAAGAACTGCATACGCTCCAAAATCACGTACTGTGAATTTCTCCTCCAAGAACACTACCAATCGCGAACACCTGCTATATCTCTAGGGAGAGATCTTGATGGTGGGATCAAAAGAAACGTCTTGGATAGGGAATTTTGCAGCAATCAATCGCTGTCGTTCTAGGGAGAGAATTTGAGAGAGATCTTCTGTGATAGCAGTAGCATTATGCGTGAGAGTGTGTGAGAGAGAGTAACCATCAGAACAGTATAATACGTGGAGAGGGAAGTTAAGTTCTCTAATAGATCTTGGCCATTGATTTTTTTTTTTTAGGAGTACAAAACAGAAAGACTAAACATGAAAAGTAAAAATTACATCCGAAAGAGTCATGTCATGAACTAAACTGCTGAGCCCAAGGGGGACAATCCTTGATCCAGACTTCAGAGTGCTTCGATGTGCGAGCGTGAGTGGCTAGACTATGGGCAACTTTATTCCCATCTCTAGGAGTAAATAAGAACCTCTAGATTTGGTGGCCATGGAATAACTGCTTGAGATGATCAATGAGTGGAGCGATCTCATTGAGATGTTGGTCATGGTCATGCAGTAGATTCCAAACTATTTTAGAATCTGTCTCCGCCCAGATAGGTGTAAGTCCATATTCCAAAGCTATTGTTACCCATCTATAAGAGCTTGAGCTTCCACCCATTCCACCGAACAATATGTTCTCGTGAACACTTCTCTGTAGATGCCATTGTCTCTCCTTTGGAATTTCGAATGATAATGCCTGAACCCATCTCGCCATTAGAAAATGCTACATCCACATTCAGCTTGAAATGGGTCTGTGGTGGTGGGGACCAGGTTGCATAATGACCAGAATCACCAATCGTCGACCTCGTCTCTCCATTACTTCTATTTGGTTGAGCATCTACATATTCAGAGATGTAATTTGATGCCCAGGCAATAGAATCATCTGTCTGTCTATTTGGGAGTGAGTTGCCCTGAAAAACTGCATGGTTTCGATTGTTCCAGATGGACCACATTGCTGTTGCAAAAATCAACATATCTTCCATACATAGAGTCTCTTGGGCCCTGCAAAAGAGATCGAGGATATTAGTAAAACGATCATTAAGGAAAGTTTGTACCAGACTCCAGCAAGCCCAATGCTTTTTCGTCTTCTTACACCCCCATAGAGCATGGGTTACTGTCTCATTTACTTTTCTGCACATGGGGCAACATGGGTCACAAGAGCTATGTCTTTTTATGAGATTCATCCTGCATGGCAATATGTCTAAATTGGCCTTCCAAACAAAGATCTTAATTTTGTTTGGTATGTTTAGATTCCAAAGTAGATTCCACCAACTGGAAATAGATGAATCAGACGATGAAGATTCTCCCTGGAAATCCTCCAAAGCAAGCTTGTACCCACTCCGGACAGTGTATCGGCCCCGCATTGTCATAATGCCAGAAGAAGCTGTCTAGGTGTTGAGCACCTGCAATGGGAATTTCTTGAATTTTTTCTACAACATCCTGCACAAAAAGATCTGTCAGTAAATTCACATTCCAGGATTGACTACTTGAGAAAAGACTTTTGACTCGATAGTCAGTCAGAGGCCTTTTGAGAGAGAGAAGTTTAAAAGTCTTCATCCTTGGAATCCGTTTATCCTCGTAGATGTCAATGGTTTCGCCATTCCCAATCCTTCAACGACCACCTTTCATTGCTAGTTCTCGACCCCATAAAATTCCTCGCCAAACATACGATGGTCTGCCCCCCAAATTTTCTTTCAAGAAATCATGATGAGGATAGTATCTTGCTTTCAGAACTTGTGCCACTAGAGATTGGGGTCTTTGTAGAAGTCTCCAAGTGTGCTTCGCCAATAAAGCTTGATTAAAAAGCCTTAGATCTCGGAAACCCATTCCGCCTCTTTCCTTTGGTTTTGTCATGATTCCCCATTTCAACCAATGAATTTTTCTCCCTTGATCAGAGCTTCCCCACCAGAAGTTAGCCATCATCCTGTTCAGGTCGTCACAACAACCTTGTGGAAGTTTAAAGCATGAGAGGGTGTACGTGGGAATTGCCTGTGCGACCGCCTTTATAAGAGTTTCCTTTCTAGAGGATGAGAACATCTTCCCTTTCCAACCCTGCAAAACTTTTTGGACCTTATTTTTGATGTAATTCAACGGAGCTTTCTTGTTTCTCGAAAGGGAAGATGGGCAGCCGAGATACTTTCCATGGTTAGCTACTATTTTGACCTTCAAAATATTGGCTAACTCGCTCCGTTTGTTGTTTGCAGTTCCAGGTCCAAAGGCTATTGCTGATTTTTGAAAGTTTATGATATGACCTGTGGCCTCCTCATAGACTTTTAGAAGCCTTTGTAACTCCACAAATTCCTCTTTGCGCGTTTTCAGAA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ATGTCTGCACTGGAAGAGAAGCTAGATGAAATCCAACCTTCAACAAGGAATAATGATGAGTTGGAGGAAGAAGATGAAGGAGAGGAGGACCTTTCATGGTCATCAGACTCAGAGATTGGAGATGCATTGGATTGGTTGGATGCAAAGGAAGATACCGAAGCAGTAGATGGGGCTTTTTCACTCAATGCTAGGCGTCCTAATGCTCATGGTGGGCTTTATTCTCGTCATAATTCCTCGACTCTTCAACCTCTCTCAAATCGGAACCAAAAGTTTACCAATCACATTCGAGCTTCACCTCTTGCGGAATGGGAAGGGAGATTTAATGTCGGAATGTCAAACTCTGTTACCACGGCTATTCGTGACAGTGTCAAGGAAATGGCTATAGGAAAAACGAAAACTACAGAGAAAGCTGATCGTGCAACTGTTGAACAGGCAATAGATCCCAGAACTCGGATGGTTCTATTCAAGATGCTCAACCGAGGTGTTTTTCATGACATTAATGGCTGCATTTCTACTGGTAAAGAAGCTAATGTCTATCATGCAACAAAATCTGATGGTCAAGAATTCGCTGTCAAAGTCTACAAAACTTCAGTTTTGGTGTTTAAGGATAGAGATCGCTATGTTCAAGGTGACTACCGTTTCAGACACGGATATTGCAGGCATAATCCCAGGAAAATGGTCAAGACATGGGCCGAGAAGGAAATGAGGAATTTGATGAGGCTAAAAGCTGCAGGGATTAGATGCCCGACTCCTCTCCTCTTGAGACTTCATGTGCTGGTCATGGAGTTCATTGGTAAGACAGGTTGGGCTGCACCTCGTCTTAAGGATGCTGCCTTGTCGTTGAACAGGCTACGTGAAAGTTATTTGGAGATAATTATTACAATGCGGACCCTCTACCAGAAGTGCAAGTTAGTGCATGGAGATCTTAGTGAATATAACATACTTTATTTTGAGGGTCACCTTTATATTATTGATGTTTCTCAAGCTGTTGATCTTGACCACCCTCATGCCCTCGATTTCCTTCGTGAAGATTGTCTGCATGTTTCTGATTTCTTTAAAAAACATGGTGTAGCTGTAATGACAATACGAGAACTATTTGATTTTATTGTTGATCCATGCCTCACTGATGAGACGATTGATAATTATCTAGAAGAGATGCAAGAAAAAATCTCGGCAAGAGGCGATATATCAGTGGAGGATGAGATTGCAGATTCTGTATTTGTACAGTCATATATTCCAAAAACACTGGATAGTGTCAAACATGCTGAGGAGGATGTAATACGTTTAACAAGTGGTCAGGACACTGAAGATATGTACTACAAGACCATTACAGGGTTAAAACAATCCCTTCCAAGAGTTGAACCTGTGTCAGAGCTAAAAGATGAGGAAGAACACAATGCAGACCCAATCGAACAATTCAAAAATTTAACCGGTTTGTCAAATTCTTCTGAGAAAGTGACTGAATCAACATTAGAGGAAGATGAAGAGAGCTCGAATGAGTCAGAAGGAGGACTAGGTTCTTTAACTGAGATGACGCAGGCGCCAGTTGACCGGAAAACTGCCAGAAAAGAGAACAAAAAGAAGGTGAAGGAAGAGAAGAGAGAGGCCCGCAAAAATAAGGTTCCAAAGGCTGTAAAGAAACGAAAGAAGAAGTTGGCCAAGTCCCATAAGTAA MSALEEKLDEIQPSTRNNDELEEEDEGEEDLSWSSDSEIGDALDWLDAKEDTEAVDGAFSLNARRPNAHGGLYSRHNSSTLQPLSNRNQKFTNHIRASPLAEWEGRFNVGMSNSVTTAIRDSVKEMAIGKTKTTEKADRATVEQAIDPRTRMVLFKMLNRGVFHDINGCISTGKEANVYHATKSDGQEFAVKVYKTSVLVFKDRDRYVQGDYRFRHGYCRHNPRKMVKTWAEKEMRNLMRLKAAGIRCPTPLLLRLHVLVMEFIGKTGWAAPRLKDAALSLNRLRESYLEIIITMRTLYQKCKLVHGDLSEYNILYFEGHLYIIDVSQAVDLDHPHALDFLREDCLHVSDFFKKHGVAVMTIRELFDFIVDPCLTDETIDNYLEEMQEKISARGDISVEDEIADSVFVQSYIPKTLDSVKHAEEDVIRLTSGQDTEDMYYKTITGLKQSLPRVEPVSELKDEEEHNADPIEQFKNLTGLSNSSEKVTESTLEEDEESSNESEGGLGSLTEMTQAPVDRKTARKENKKKVKEEKREARKNKVPKAVKKRKKKLAKSHK Homology
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54VD8 (Serine/threonine-protein kinase rio1 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=rio1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 409.5 bits (1051), Expect = 6.3e-113 Identity = 246/560 (43.93%), Postives = 346/560 (61.79%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9BRS2 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RIOK1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 402.1 bits (1032), Expect = 1.0e-110 Identity = 250/566 (44.17%), Postives = 337/566 (59.54%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q922Q2 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Riok1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 1.6e-108 Identity = 250/575 (43.48%), Postives = 346/575 (60.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O44959 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=riok-1 PE=2 SV=5) HSP 1 Score: 335.5 bits (859), Expect = 1.2e-90 Identity = 189/419 (45.11%), Postives = 268/419 (63.96%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O42650 (Serine/threonine-protein kinase rio1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=rio1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 1.9e-85 Identity = 209/540 (38.70%), Postives = 303/540 (56.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BH21 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold248G002840 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1005.0 bits (2597), Expect = 1.2e-289 Identity = 521/557 (93.54%), Postives = 533/557 (95.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3ATK0 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482696 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1005.0 bits (2597), Expect = 1.2e-289 Identity = 521/557 (93.54%), Postives = 533/557 (95.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQN2 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G043280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1003.8 bits (2594), Expect = 2.8e-289 Identity = 518/557 (93.00%), Postives = 534/557 (95.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JYS0 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490077 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 967.2 bits (2499), Expect = 2.9e-278 Identity = 509/560 (90.89%), Postives = 528/560 (94.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K0V1 (Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490077 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 967.2 bits (2499), Expect = 2.9e-278 Identity = 509/560 (90.89%), Postives = 528/560 (94.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. NCBI nr
Match: XP_038895087.1 (serine/threonine-protein kinase RIO1-like [Benincasa hispida] >XP_038895088.1 serine/threonine-protein kinase RIO1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1010.7 bits (2612), Expect = 4.7e-291 Identity = 524/557 (94.08%), Postives = 536/557 (96.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. NCBI nr
Match: XP_008437198.1 (PREDICTED: serine/threonine-protein kinase RIO1-like [Cucumis melo] >TYJ99080.1 serine/threonine-protein kinase RIO1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1005.0 bits (2597), Expect = 2.6e-289 Identity = 521/557 (93.54%), Postives = 533/557 (95.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. NCBI nr
Match: XP_004137539.1 (serine/threonine-protein kinase RIO1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1003.8 bits (2594), Expect = 5.7e-289 Identity = 518/557 (93.00%), Postives = 534/557 (95.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. NCBI nr
Match: XP_023542500.1 (serine/threonine-protein kinase RIO1-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 971.5 bits (2510), Expect = 3.2e-279 Identity = 513/560 (91.61%), Postives = 532/560 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. NCBI nr
Match: XP_023542499.1 (serine/threonine-protein kinase RIO1-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 971.5 bits (2510), Expect = 3.2e-279 Identity = 513/560 (91.61%), Postives = 532/560 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. TAIR 10
Match: AT2G24990.1 (Serine/threonine-protein kinase Rio1 ) HSP 1 Score: 719.9 bits (1857), Expect = 1.5e-207 Identity = 382/538 (71.00%), Postives = 440/538 (81.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. TAIR 10
Match: AT5G37350.1 (Serine/threonine-protein kinase Rio1 ) HSP 1 Score: 718.8 bits (1854), Expect = 3.4e-207 Identity = 383/548 (69.89%), Postives = 444/548 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011650 vs. TAIR 10
Match: AT5G37350.2 (Serine/threonine-protein kinase Rio1 ) HSP 1 Score: 508.1 bits (1307), Expect = 9.2e-144 Identity = 272/383 (71.02%), Postives = 309/383 (80.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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