Lcy13g011480 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTTAAATGTTCGAGAGATGGAGACGAAGAAAAATGACTGAACACAACAAACAATGGCTTCCTTCTGCTGCATTTCTGTAACCATAAATGTCGCTCTCGCTTCACTCAATCCCACCGGCGACTCTCACTCTCCTCCTCTCAAAACCAACGGCACAAAACCCGATTCCCTTCCGATCAACAATCCACGGCTATCGCGGCGGCTGCCAAAACCTCGCCGCCCCTCCGTTATCGAAATCGAACGTGCTATTGGCGCCGGAAGGTTCAGAGACGCCGACCCCAGGCAAGTCTCAGAGTTCCTCGCTTCCTGTTCTTCGGATTTAGCGCTCTTCTTAACTTTATTGTACTGGAATATGATATTCGATTTGGTGGATTTGAGGGAGGGCATGATCTGATCTGTGGTGTGTGATGCAAAAATATTTGTTCCTTAGGGATTTGGAAGAAGATCGGAAGACTGCATTTGACATGTTTATGCTGAGTTTTACGGGGAAATATGAAGGGCCACTCATGAAAAAGCTTCGCGAGACAGGGGAATGGGTAACTAATCAAACTGAAACCAAATTTCAAGCTTCTGGTAACCATTTTCTGTCTCTCTCTGTCTATTGAACTTGATTTTTTTTCTCTGTTTTAATCTTCATCCCCCTTCCTTTTCTTGACGATGTTTGAGTGTTAGAAAGGATATTACTCGTAGACTTCTTTTGATTGTTTTCTCCCCAAACTTTAGTGTACTTTTTGGGTGATGCTATGCAATATTGATTATGTTCAAATTAGGGGTTATCATGTTCAAATTAGAGGCTATCATCCGTCGGTGTGTCGGTTTTTGGCTCAAACCGATGCCGACCACTGACATGTGGTTGCCGGCGGTCGGTTAGGAGGTGGGTTGTTAGGCCGATCGACCGACCACACTAGCGGTAAGAAGATGAAAGAATAAATAAAGAAATGAAAACAAAGAAAAAAGTGAGGGAAAAAGAAGAAGATGGAGAGAGAGGAGAAAAGAGAGATCGGACGTGAGAGATTAAAAAAAAATACATATATTCTTAATGATGTCCTTGGGAAGACCATCAACAATAATAACAATAACCATTGATGGGATGCTGCACTGCAGCGCAGCACAGTTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTAATTATAATAATAATTTTTTATTATTATTTTAAATTTGGTCAGTTGAATCGGGCTATTTTGGACGAACTATTGAATGGTCGTTTTACTCCACGTAAAACTAACTCCGACTGTGAATATAAGAAAACTGACCGAATCGACGATTCGGTCGGTTTTTGGTTGATTGACTTCGGTTTTTCTAGTTCAAATGTCTTAAGAATTTTGGAATCCGCACTGAAAACTCTTGTAATTAAGAGAATGTTAAAGTTCTTCACACCTGCGAGGGAAATTTCAATTTTCAACTTTGAGGGAGAGATTAACACTAATTTCTCCATATATATATCTTTTGTCAGGTTGTCTTGTCATGTGTACTTTTGACCCGTTTTCAACACAAAAAATAAACTCTTACGATTTTAGTATCATTTTCTTTCTTGGAGTACGCATACCTTTGTCAAGAAGGAAGTAGAAGTACACTGGCTAACTGAACCGAAGGCAAAAGAATGAAAGAAGAGGGAGACTGCAAAAACAAAACAAAAATTTCAAGATTCCAAATGCAAAGAATAAAAATATATTGGGGGGAGTATTGGATCTGGACATCTGAACCTCTCAATCAGGTTGATTCTTATTGTGAAAAGGAACTTCAAGGAAAGTAGATAGATGAATAGTAAAACCAAAGCCTTTTATTTTCTGTAAAAGTAATGAATACTCCCTCTAGAATAGGGAGAATGAAGGAAGCCATCGTATTCGTTTTGGAGACCCTATTTTGAGTAGTGGGGTGACAGTTGATAGTAACAGAAGGAAAAGTAGAACTCTTCTCCAAATATCTCCCTAAGCAAGAAACACTGACTCCTTCCTTTAGAGATGGAGTGAAAGGTATTCAAACCATCGAATCTTGTAGGAGATGAGTTTCAACGACTTGCTGTGGTTCACACTACTTGTGGACAAATTACAAATCCTATCCATCTATAAGGGATTTCATTCTTTCAAAACCACTTACACATTCTTATTAACCAAAATTTCACCGTATAAACTTCAATATTTGTTCGTCCTATCGAATTAAGCGAACTCTCTTGTCATTGGCTTTAACTATTAGATATATGAATTAATCAAGTAATTAACTAAGATTGAACATGCTATTATTTCATAAATTAAGAAGGCACAGATAAAAACTATCTGCCCCGAACATAATTAACTTTCCTTGCTAATTAAGAAACCAATATTCCGATTCAGTTTCAATAATAAGCAAAGGCCTTGAGTCTACTTCTTTTTACAACTTCTAAAGAAATCCTAAATCTTCTGATCTTAGAACTACTTCAGTTATGCATTTAGATTCTAATCTAAACCACCTCTCCTGAGCTTAAGATTCAAATCAAACAACAATAATCAGTGATCAAAATATTAGGATCAAACGCATCAGTACATGAATGAGATAAAAGTAATCAATCAAGGCAATTTAATTAATTAACCCCTAGAAATCTAATAGTATTAGTTACATCAATCCTTAAGAATGGGAGAGTTTAGCTATTCATGTTCATCATTCCAAATCCAAAACTCAATAAATATCCATAAAAAAAAACGAGACTCAAGAGAAAGAAGTAGAAAAATTGATATCCATGTGTTGATCGTCTGCCCCATCACAGTATCCATGATCTTAAGCTTCGAGTTCTGCTCCAATAATCCCTTCTTACCCTCAAATTCAGGTCAACTTGAAAATATGGTTATTTTTCTCCAAAATCCCTTCCCCAAAACGGGTGAAAAAAGAAGATATATATAGAAAATCGAGACGTTGGCTAAAAAACATATGAATTACAAAAGGAGAGTGTCTAGTGTCGAGACACTGTGTGTAGCATATCTATGCTATGGACGGAATGACCCAAATAACATGCACATGTTTTTTCATTGACGGAAGCTTCATTTCTGTAGCACTGAGATGCTCTTGGTAGCGTCTCAACGCTACCTATGCAGGTATTCAATTTGCAATAACGCTATGTTTCAATGCTGTGGATAACGTCTCAACACTGTCCAATCGGGTTTTGTGCCTCATTTGCTTCTTTTCATTATTTGGTTTCGTATGTCTTTGTCCAATTATCTTGAATTTCTCAATAATTCCTTCAAAGTCTTGGTTTCAATCCTATTGCTCGATTCCTACAAAATATAAAAATTTGTGCATGAAAATGGCCAAATAAGCACCAAGACTAACAACAAATACATGAAAAACATAGCTCACGATGCGCTATCAATGATAAGGATATTGAATATTCAAACTGTCACGCCCAAAACCCGGTTTGTCATAAAGAAAAAACTATTAGAACCATCAAACTTTGTGGTAGTGGAGTTTCCATGGCTTGTTATGCATCTTGTTGGTGAACCAATAGAGCCATCCATTTATAGTGTTAGCTGTGTCTGGTTATCAAATAGTCCAGTGAAACTTTAGAAGGAAACTCTCAAAACGGCTCAACTAAAAAGAACCACACTCTTACTAACCAAATTGTCAAGGCACAAATCTTATTTGCTTTGAACTTCGGTAATTGCTTCTCCCATGTAAACCAAGTGACCTCTTTCCTCTCATCCACACCATTCAAAGGAATTTTGTTTTCGAACCAATTTTCTTTTGAACCTTGTTCTAAATTAGAAGAATTGAGCGAATGTTGTAGCAATATAGGTTGACTTAAAGACAAGACATGAAGTGATGGGTTCACGAACAAAGCATAAGAGCACACAAGAGAAGAAGAAGATGGTCTCTTGAATAACTCACTCTTTTAGAAAGGAAGGAGACAAATGACTCCTTTATTTAAGTTCATGGGGACATCAGAAAAGATAAAATAAATACAGATACATGCATACATATATTTTATATATCTAATAAATTAACTTTCATACCCTTAAAAATGCATAATTTCATTAATCTAGAAATACATCAAGTGATAAAACGATCTTATTTTCAAGCTCCTTTATTGCTTGGTTACGCCAGCGAAGAGAACATTTATTTTGTTATACTTGTTGTCTTGTTTGATTTACTTTTAATCTGCAGGCAAATGGTTTCTGCTGTTTACGTTTCAATGGGTTCTACCAATTTGGGCATTGTCACTCCTTGTGGCTTCTGGGCTCATTAAGCTACCATTCAACACTCCATTTCTTGATCAACTTCTCATGTAATAAGGTTAGTATATATGTTTACACTCTACTCTACGAAACCTTTTATCTTTTTGTACAAGTTTCTTCATCTAATATACTCTAGCACTTGTCTGTTTCTAAAAATACCGATAAAATGACATAAAATAGCCTGAAAAAACAGTTTTCAACAGAAAAAGACCGTGAAGAAATAATTTTCACAATTATTAGCTTGAAGAAAAGAAGTATCATTAATTGTAAGATATAATGGTTCATGTATCCTCTGTTTTACCACTTATAGTATGTAGAGTTTAACCAATAGATTTTTCTTTTAAAAGTATCAAGAAATGAAATATTATTTGAAGGAAAATCCCAAATCATTGCCAGTTGATATAAAAATTAGAAAAGAAAAGAAAAGAGATGGTTGCTTTCAAATTAAAACCTATTTAATTACACTATGCTTGTATGTGACTATGATGAAACAACTGGCATATGTAAATTAATGACAAGGTGAAACATTTTCTCAACTAGAAAAGAAACAAATTTTGATTTATCTCATCTGTTTATGACTATATTCCTTAGGTACTAAGTTGGTTTATAACAGAATAGGAAGTTAATCTAATTTGTTTCCTGTGTTGATCAATCAACTTTAGATTTATTGATGATGCAAGTTGGGAACTGAGTAATTTGGTGAAGATCCTGTATTTTTCATTTTTTTTTTTAAATATTCAATCACGTCGTACTGTTTTATTATCTTATTATAAG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Match: A0A6J1J6W0 (probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483096 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 2.2e-69 Identity = 140/166 (84.34%), Postives = 150/166 (90.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQ49 (probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 4.2e-68 Identity = 139/164 (84.76%), Postives = 148/164 (90.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CM65 (probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502523 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 3.9e-66 Identity = 135/168 (80.36%), Postives = 145/168 (86.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KJA3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G033460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 252.3 bits (643), Expect = 1.4e-63 Identity = 131/166 (78.92%), Postives = 143/166 (86.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. NCBI nr
Match: XP_038893324.1 (probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 281.6 bits (719), Expect = 4.4e-72 Identity = 141/164 (85.98%), Postives = 151/164 (92.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. NCBI nr
Match: XP_023511915.1 (probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 276.2 bits (705), Expect = 1.9e-70 Identity = 141/163 (86.50%), Postives = 149/163 (91.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. NCBI nr
Match: KAG6600832.1 (putative NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 274.6 bits (701), Expect = 5.4e-70 Identity = 140/163 (85.89%), Postives = 148/163 (90.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. NCBI nr
Match: XP_022942899.1 (probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 274.6 bits (701), Expect = 5.4e-70 Identity = 140/163 (85.89%), Postives = 148/163 (90.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. NCBI nr
Match: XP_022985001.1 (probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 4.6e-69 Identity = 140/166 (84.34%), Postives = 150/166 (90.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g011480 vs. TAIR 10
Match: AT2G01590.1 (chlororespiratory reduction 3 ) HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 1.8e-26 Identity = 64/147 (43.54%), Postives = 91/147 (61.90%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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