Lcy13g000050 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCATTTCACCTGCTATGGAAATAGACGCGAACTGATTCAACCGGCAAGGTATCATAAAATGTTATGTTATTAGTTTCTGTCTGCCATCTGGAGCCCTTTCCTTAGACATCATACTCTAAATTTCCATTGTACGTACATCATTAGTACTTTACCTTTTGATCCAGCTTTGCATGTTGAACTCTGATGTGATTCTTGCAACTTCCAAGTGGAAGGCTATCATCATTATCATCACAGTTCAACAGTCGTGTACAGTTTCATAAGGACGAGATACATTTTCTAGTTGTGCAGACTCAGGTTGCAACATATGAGGCAACAAAACTTTAGTGTGTAAAGCAGGTCTTTGTTTTACCCCTTTTTTGTTCGTTCATTTGTTATTTGTTTTGGAAGCAATGTCTTACCTCCTTTTCCTTTGTCGATTCACATTTTAGTGGATGCCACGTAAATCTGCCACACCAATCTCTCACCCAACATTCTCTTGTGACAGTCAAATGATATATGCCAGCTTCTTGGATGAAACTGCTTGTTCACCGTTGCTAATCTCAGATTACGTTGTCGAATTAGTCCTTCAGCTTATCTTCCTGCTAACATGAGGTATTTCTCTAATCCTACTTTGTAGTTCACTAGTTTGGTTATATTCTCCTGCTTTGAAAAATTTTGCTATCATGAGCTCTTAGAATGGACATATGACAACTTGATCTGTCAATGGTTTATTCTCGTACAATCACCTGTTCCTTGTGTCAAATATTGATCATGTAGTGATTGCTGTATTTTTCTTTTATTTCAAAAAACATAGGATGGGTATTCGATATTAGATGTCTATAAATAAAAATGTATTTCAAAAGAAGGGGATTGTCATGTCTCAGTGAAAATACATCATAAATCTCTTGAAAGACTCGAGAATGAGTGAACGTGATCCGATAAATTTACTTATTGATCCAAACAATAAACTTAGTGACATGAAGGAAGGTGCTCTAGTGAATACACAACAATATCAACGCTTGGTTGGGAGACTCATTTACCCCTTACTATTAAAATGGTTCCATCTATCAAGTTTGTTGTGGTTTTTGTCTTTCATCGGTTGCTAAAAAGAAGAATTTGGATGACCACACAATGGAAGATCAAGATAAAGAAAATGTATACCTTCCTCCTTACAATTTCGTCTTTGAGATACTTCAAACAATTTAGAACCTTCCACATTGATATTGCAAGTAGGAGATTTTACCCAATTTACCTTCAAACCTGAACAAGCTTCAAACAAGGCAACGATTTGAATTAAGATTTGAAGTGTATTGTTATCATATTCACAAAACACCAAAGTATCATCGGCAAATTGAAGAATCGACACATGAATCTTTTCTTTCCCCACGTTTCTTCTAGTAGTAGCCCATTTGTGGAAGAAGCTCGTGTTTTCATTGCCTTCTTTTGAGCCATTGAAATCTGCACTTTTGGTTCCACATCATTTTCTCCTTTAAAATTGTCGATTCTAGTAGAAATATGCCTTTCCTTGCCATTCGAACCAAGTGAATTTACTATTATATAAGGGAACACCAATGAGGTCAACATTTTCAATCAACCCATTAAACGTCGTCGTACTTTTAATCACTCTCCCCCATTTGATTTTTCAGATAGTCATCAAACCACTTTAAAATCCACCTAAACACAACACATCTGAACAAATGCTTGCTAAATCAGTCAACTCTTGCCAAAATATGACAATGTTACAAGTAGCAGGGACCATAAACCCTTGTCATTCAATCACCAAAAGAATTATGGGCAAAATGCACTTTTGGTCCTCGAGGTTTGGAGTTGATGTCTATTTGGTCCCTGAGGTTTCAAAAAATACACTTTAGTCCTCCAGGTTTGTAAAATCATTCTAAATGGTCCCTGACTTAACTTTGACTTAACGGAATGCTGACTGGACCGTTATTTGCTGACATGGATAAGTTAAAAAATAAAAATAAAAAACTAAACTATTAAAAAAAGGTTACAAATTAAGGTGGAAAGCTTACACCGTTGTCGTCGTCAATGTCACTTTTCCGCTCAATCCCAATCACGAAAATTCAGGTGGAAAGCTTACCGTTAATGCCTACTACGGTCGGTCCCAGAGGAAGTACGAAAAGTTCATTGCTTTGGAGGAATTGCCAGGTTCTTACAATGCCTCCAAATACCGTCCTCCTTTCGACTACGAATATTTGTACTATGGTTCGTCTCTCTACGGGAACCTCATTGCCGCCAGGATCAGAGAATGGATGGCCTATCATGCCTGGTTCTTCCGGCCTAAATCTCATTTCGTGTTTCACGACGCCGGCGGGGTCTCCCCTGAGGTTATGGCCGTTCTCGAGTCGTGGGTGCACGCTGGAAGGGTTACCGTTCAAGACATCAGAGCACAGTCGGAACACGATGGGTATTACTATAATCAGTTTCTGGTAGTGAACGATTGCCTCCACCGCTACCGACATGCAACAAATTGGACGTTTTATTTCGATGTGGACGAGTACATTAATTTGCCTGAGGGCAATACCTTGGAGTTTGTGTTGGAAGAGTTTTCAAAATATACTCAATTTACAATCGAGCAGAACCCTATGTCCAGTATGCTCAATTCAAAATATACTCATGATTGATGGAAAATCATGAGTATAATGTTGTGAGCGTGTTGTCCATTTGATGTGTTTTATGACTTAATGCATGGTTTAGAAAGCATGTTTGGAATGTGCATTCTAGTTTGTGAGCATGTCATTGGCATGAAGCATCTCCTAAAAGCATGATGAGTAGGATTCATGCATTCTAGTGAGAGTGTGAGGTCAGAGGACCTTGTGTGTCTAAAAGGAAAGTTAGGTGAATACCAAGTGCCTCGGATAAAAATGGTCGAGGGGTGGTATGTCACCAATGGATTAAGAGGAGCATCGGGTGCGTTGGGTAATATGGCCAAGGGGCGATGTGATGAGTCTATACGTTATGAAAGTCATCAGGTGCCTTGGGTAATATGGCCAAGGGGCGATGTACAGTTTGATTGTGAAGTCATCGGGTGCCTTGGGTAATATGGCCAAGGGGCGATGCACAGTTCAAGGCCTTGGATAATATATGGTCAAGGGTCGAACGTTGAGCGTCGTAAAGAAATGTCGAGGCCTTGGGTAATATGGTCAGGGGTCGGCGTGACTCGAAGGAGTCAGTCTCAGAGAGCTTGTGAGGGCTACGAGTATTGAGAGAGCTTGTGTAGTGTGAGTGAAAACTGAGAGTGCACGGCATGGTGCGGAATTCATGTGTTAGGTGCATGGTTAGTTGCACGTTTACATAATTGAGTATGTTACAATATGTATGTTGTTCATCTCGTATATAAGGGGTGTTATTGTGATTGAAAAGCATGATGTTTACCATGTATGTTGTATGTTGTTTGATGGCTCTTCAGGTGTGAGCCACTTACTCAGTACCGTGGTTTTGTACTGACCCACCACCAGATTTTGCAGGTGATGAGGAATACTACGAGCCTGGTGATGCTGAGGAGCAAGCATGAGAAAGAATATAATATTTGATAAACTTAGTACTTGTAGTGGGACTTTGTTTTCTTATGGTCTTGTCTTCTTCTATTCTATATTACTTGTTTTATGCTTAATTTTGAGCTGAGTTGTATTCTGGTTGTTTTCCTTTGCGATGCAATTGGGTAAAAATTAGTGTCAATTGAGGTTAGTGTCGTCGAAAGTTATGAGTTCATTATTAAGGGTTCCTATTTTTACTTGGTAGTTGTTAAAGTTTGTATGGTTGAGAATTTGTGGATGTTATGTTGGGTCTGATGTGTAATGTAGCTGCTGGTTGGTTATCTAGAATTATAGAAGTGTGTAAATCTCATTTTCAGGTAGTAAATAAATTTTGGGTTAGTTAAAGTTATGTCGTTATGCTGTCGAAATTTTCGAACCATGAGGTTGACATTAGAGAAAAGTTAAGTAATGTCTCTTAGTTAGTTCTCTTTCGAGATCACTCTTCTCTTGTATTTTTTATTAGTGGTAGATAACTTCTTCTCTATATGTATAGTTTTTTTTCATGTTTGGTATTTTTTCGTAGTTTGTTTAATATTTTTTTCCTTTTTTATGGGTCAATCATCTAGTTTCTCTTTTTTATATTAGTTTGTTTTTTAGATTTGTAACTTTTTTTTTTTATTGATGTGTTAATTTTATATATTTATTTTGTTTCATCTCTGACTTTTTATTTATCCATTGATCAACTTTTTTTTTTCTCTCTTTATTAGCAATTTATAGGTTGGTTTCATTTTATTTGATATTCTGTATTTTTCTAGTTCTTTTTCATGTGCAAATTGTAGTTCCCTTTGCAGAATGCTTCTCAATGTCTTGAATTGTTCTGTTTTCCATATGGTGCATTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTCGTTCGACAATGGGGTGAGAACTATCAACTTTTGAGATGATAATTGTTGTCTTATCCTCCAATTTTTTTTTCTTGGTGTTAGATTCAATTCTTTTTTTTAGTTGATTTTCTTTTTCATAGTTTTAGTTAATTTGAGATTGAGATGATGATTGATGTCATCCCACTTTTATATATTTTATGGATTTATGGATTATGGATTTATGGATTGTTTTGTCTTTCTTATTTGACGGGCTTTTAATTTTACTTTTCTATTTATTTTGCTTTGTTTTCTTGTTATTTAGTGGTTAGTTTTTATCTTATTCGGTTTATTATTCAATTATCAAATTTAGGTTTCTTTTTTAAACTGATTTGTCAGCTTTGTAAATGGCTTTTTTTTTTTGGACAACTGTAGATGACTATCTTTTATTTTTATATGTTTCGTTTAACATTTAATTATTAGTTCTCAATAACTCTTCTCTTCTATTTTATTAATAGATAATCTCTTTTCTATATTTTATTTGATGTTTCGTATCTTTTGTTCCTTTTCTTTGTTGGTATTTACCATTTAGTTTCACTATTTTTTTTTACAATACATTTAGTTTCACTTTTATATACTAATTTGT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BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22807 (Galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GALS1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 5.2e-83 Identity = 146/220 (66.36%), Postives = 171/220 (77.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTZ9 (Galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GALS2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 207.2 bits (526), Expect = 2.8e-52 Identity = 106/203 (52.22%), Postives = 133/203 (65.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65431 (Galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GALS3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 201.4 bits (511), Expect = 1.5e-50 Identity = 106/206 (51.46%), Postives = 134/206 (65.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J3E1 (Glycosyltransferase family 92 protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480985 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 2.0e-98 Identity = 176/220 (80.00%), Postives = 190/220 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQW1 (Glycosyltransferase family 92 protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446100 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 2.0e-98 Identity = 176/220 (80.00%), Postives = 190/220 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D6M5 (Glycosyltransferase family 92 protein OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017506 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 354.8 bits (909), Expect = 4.0e-94 Identity = 171/225 (76.00%), Postives = 183/225 (81.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6KVY1 (Glycosyltransferase family 92 protein OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_013125 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 348.6 bits (893), Expect = 2.8e-92 Identity = 167/225 (74.22%), Postives = 179/225 (79.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0B0MJN6 (Glycosyltransferase family 92 protein OS=Gossypium arboreum OX=29729 GN=LOC108470508 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 347.4 bits (890), Expect = 6.3e-92 Identity = 166/219 (75.80%), Postives = 179/219 (81.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. NCBI nr
Match: KAG7037984.1 (Galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 1.9e-98 Identity = 177/220 (80.45%), Postives = 190/220 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. NCBI nr
Match: XP_023525128.1 (galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 1.9e-98 Identity = 177/220 (80.45%), Postives = 190/220 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. NCBI nr
Match: KAG6608669.1 (Galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 1.9e-98 Identity = 177/220 (80.45%), Postives = 190/220 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. NCBI nr
Match: XP_022982004.1 (galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 4.2e-98 Identity = 176/220 (80.00%), Postives = 190/220 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. NCBI nr
Match: XP_022940530.1 (galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 4.2e-98 Identity = 176/220 (80.00%), Postives = 190/220 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. TAIR 10
Match: AT2G33570.1 (Domain of unknown function (DUF23) ) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 3.7e-84 Identity = 146/220 (66.36%), Postives = 171/220 (77.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. TAIR 10
Match: AT5G44670.1 (Domain of unknown function (DUF23) ) HSP 1 Score: 207.2 bits (526), Expect = 2.0e-53 Identity = 106/203 (52.22%), Postives = 133/203 (65.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000050 vs. TAIR 10
Match: AT4G20170.1 (Domain of unknown function (DUF23) ) HSP 1 Score: 201.4 bits (511), Expect = 1.1e-51 Identity = 106/206 (51.46%), Postives = 134/206 (65.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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