Lcy12g002610 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGATGAGGCTCTTCAACTTTTTTCCCAAAAGGCATTTCGAGAGGATCGTCCAAAGGAAGGCTATTTTGACCTTTGTAGCCAAGTTGTGGACTATTGTGGAGGCCTGCCATTAGCAATTGAGGTTCTTGGCTCCTCTTTACGTGAGAAGCCAATGGAGGAATGGGTAAATGCAGTGGATAAGTTGAAGGAAGTTCGTGATATGGAAATTCTTGAGAAGTTAAAAATTAGTTATTATATGTTAGAAGAGTCTGAACAGAAGATTTTTCTAGACATTGCATGTTTTTTTAAGAGGAAGAGTAAGAGACAAGCAATTGAAATTCTACAGAGCTTTGGATTTCCTGTCGTTCTTGGATTGGAAATCTTGGAGGAGAAATCTCTTATTACCACACCTCATGATAAGCTACAAATGCATGATTTGATCCAAGAAATGGGTCAGGATATTGTTTGTCAAAAGTTTCCAAATGATCCCCAAAAACGAAGTAGGCTGTGGCTTCGTGACGATATAAATCTTGCTCTAAGTCGTGATCAGGTAACACTTCCAAATTCAAGAACCTATTAGATACAACTCTATATGATATATCTGATCTCTCATGGTTTTCTCAGGGAACAGAAGCCATTGAAGGCATAATGATGGATTTGGATGAGAAGGGAGAATCACACTTGAAAGCCAAGTCCTTTTCAGCAATGACAAATCTCAGAGTGTTGAAAATTAACAATGTTTATCTTTCTGGAGAGCTTGAATATCTCTCTGATCAGCTGAGGTTTCTCAATTGGCATGGATACCCTTTGAAGTGTTTGCCATCAAATTTCAATCCCACAAACCTATTGGAGCTTGAGTTGCCTAGTAGCTGTATTGACCATCTTTGGAAAGGTCCAAAGGTAAATATAACATAAATATGGTATATGATTTTTAGTTAAATTCTACAAAAATATCTCTATGTGTTGGTTTCAAGTTTTCTCTAATCTTTTTTCTTCAACCATATGTTAGAAATATCCTTTAACATGTCTAATGAAAGTTAAAAAGATTGTGTAAAATTGAAAATTTCAAAACTTTATGGACTGTATATATGTTAGCTAGAGGCATATATTTGTATAGTTTAGCTTGGTTTGATCAATATTTTTTCCCAACTATGTACTTTAGTTTCAATTTTGTTTCCTAAAGTTTTAAATGTTTAAATTATAATGGAGAAATTGCTCACGAAGAGATTTTTTTTTTTTTCATATTTGGAAAATTAAAAGATTGGAAAAATGGAAACTTGTAAAGCATTGGGGATAAATTTGAAACCAACCACATACATAGGGTTATTTTGTATGACTTAACTTAGCTATGATTTTTGTTCTTTTCATATATATTTTTTTGGGGGCTTTGCACATATAGCAAAAACCAGCAAAAGAATTGCAAAAATAGCAAAAAAAATAAAATTATTTGTGGAAATAGCAAAAAATACGTTAAATTACGAAAATACCCTTAGTATCTCCAATAGTCTATCAGTCCCTATTATTGATAGTCACTGATAGACTTCGATTAATCGGAGTCTATCAATGATAAATACTGATAGACTTTGATGATAAGTTTCAATTAATCGGAGTCTATTAGTGATAGACACTGATAGACTTTGATTAATCGAAGTCTATCAGTGTGTATCACTGATAGACTTTGATGATCATAATCTATAAGTTTTTATAGTGTTTAATTCAAGGCTATCAGTGATAGCTGCTGATAGAAAACAATTTAATTCAAGGCTATTAGTTCAGTTTAATTCAAGGCTATCAGTTTCTATCCATCAGTTTAATTTAAGTCTATCAGTGATAATCACTAATAGAAAACCGTTTAATTCAAGGTTATCAGTTTCTGTCACTAATAGAAATCAATTTAATTCAAGACTATTAGTTTCTATCACTGATAGAAACCAATTTAATTGAAGTTTATCAGTTTCTATCAGAAATCAATTTAATTAAAGTCTATTGACTTGTATCACTGATGGAAATTAGTTTAATTCAAATCTATCATTTTCTATCGAGGATAGAAATCAGTTAATTGAAGTCTATTAGTTTCTATCTCGGATAGAAATCAGTTAATTATCAATTAATTGAAGTCTACCAATGATTGTTACTGATAGAAATCAATTTAATTGAAATCAATCAATAAAGTACTTTGCATTGCAATCATCTTGGTAATTAGAAACTCATCCAAAATTATTATACTACAATCATAAATTGAACAAAAAATTTAAGTCTCTTGTGGTAATTTGAACATAAAATCCAAAAATAACCATTACGAACAAGCGACTCTCAATCAACATTATAATTTTTAAAGCCTAGCACACAAGCTCCGTGACCACCACCATAAAATTGCTATTCTTGTATTCTTTTTATTTCATTATCTATCAATTATAGTCCTGATAGACTTCGACAAGTGATAGTCAGTGATAGACTACGATTAACCGGAGTATATCAGTGATATACTTTGATATACCTATACAAACACTCACCAAAATTGCTATTTTTGTATTCTTGGCATTCTTGAATTAAAAAGAAGGCCAATAAGAGCTTAGCTCAATTGACATAAAGTTGTACCGATAACCACAAGGTCTGTGGTTCGAATTCCCCTCCCCACATATTATCAAATATATATATATATATAAAGAAGAATAAAAAGATGAAGAAACAATCATAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAAGAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATCGTAACAGATTTCAAAATATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGTAACAGATTGCAAAAAGAAAGGACAAGAAATGAGGGAGAAAAGGTAGATGGAAACGGAGAGAGAGAAGGATAAAATGAGAATATTCTAATTTTTTTGTCATATTTCCAATTATTTTAACCTTGGGCTAAATTTGCTATTATATATAATTAATTTGCCACCCACTGTAATTACTCTATTTTTTTTTTTTTTTTGCAGAGTTTGGATAAATTGAAACCAACCACATACATAGGGTTATTTTGTATGACTTAACTTAGCTATGATTTTTGTTCTTTTCATATATTTTAGTAGACTTTGTTACTAAAATTACTATATTCTTGCAGAGCTTGGATAAATTGAAAGTGATAAACCTAAGTGACTCAGAATTCCTATCCAAGACCCCAGATTTTTCTGGAGTTCCAAATCTTGAAAGATTGGTTTTGAGTGGTTGTGTAAGATTGTTCGAGCTACACCAATCTTTGGGTACTCTAAAGCATCTAATTCAATTGGATCTCAAAGATTGCAAGCAACTAACAAGTATTCCTTTCAATATTTCTTTAGAATCACTCAATACTTTAGTTCTTTCAGGTTGTTGGAGTCTAAAAAGTTTTCCAAAGATCTCAGGAAACATGAACCATTTATTAGAGCTTCATTTAGATGGAACATCCATAAAAGTTTTGCATCCATCAATGGGACATTTAACAGGACTTGTCCTATTAAATCTCAAAAATTGCAAAAATCTTGTAAAACTTCCAAGCACTATCGGCTGTTTAACATCTTTGAAAAGTCTCAATTTGCATGGCTGCTCAAAACTTGATAGCATTCCAGAGAGCTTAGGAAATATTTCTTGCTTGGAGAAGCTTGATGTCACTGGCACTTGTATAAACGAAGCTCCATTCTCCCTTCAACTTTTGACAAATCTTGAGATCCTAAATTGCCAAGGTTTGTCTCGTAAGTTCCTCCATTCATTATTTCCTCGTTGGAATAATTTTTCTCGAAACTACTCGCATTCTCAAGGCTTGAAATTGACGAATTGCTTCAGTTTTGGCTCTTCTTTGAGGATTTTGAATTTAAGTGATTGCAATTTGTGGGATGGAGATATCCCCAGTGACCTTCGCAGCTTATCTTCATTGCAAATTCTTGATCTAAGTCAAAACCATTTTAGCATATTACCCGAAAGCATTTCTCATCTCATTAATTTGAGGGATCTGTTTCTGGAGGAATGTTTTCATCTTCAATCATTGCCGAAGCTCCCACTTAGTGTTAGAGAAGTGGACGCAAGGGATTGTGTTTCACTTAAAGAATATTATAATCAAGAGAAACACATTCCTTCAAGTGAAATGGGGATGACTTTTATTCGTTGTCCCATATCGACTGAACCAGCTGGAAGCTATAGAATTGATCAGCTTGGCCTTTCTGGAATTCACCAACGGACAATGGCCCAACGTTACCTTGAGGTTTGTTTTGTTTGAGTTTAGTTTCAATTTAATTTTGATGATTTCAAAAGTTATAATTTTAGGTCATTTTGATTTGAGTGGAGTTTCAATTTTATCAATATAGTCCCTTGTTTTTATACTTGAGTCAATTATCTTCTCTTATGATTTTTTGTTGGTTAAGTTGGTAATTTGATTATTATGATTTGATGAACTTTGTTCTTATTGGTTTTTATCATTTTAAAAGTTTCAATTTAGTCTGATATGATTTTGAGTTGGGTTTCAATTTTGTTAATATATAGTTCTTTGTTTTTGTATACTTGGCTTTTTTCAATTATTTGCTCTTATGAATTTTCTTTGGTTTAATTGCTAATTTTATTATTATTATTATTTGTTCTTATAGGGTGGAAGTTGTGTTTGTAGGCTTAATTTTCAAAAACCAAAAACCGAATGGTTATTAAACGGGGCCGTAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTATTTTTGGAATTATTTGACTAGGAGTTCAAATGTATCATTGCGAATGATGAAAACCATGGTAAGAAAATTGGGAGGAAATAGGTATAATTTACAAACTAAAAACCAAAACCCAAATGGTTATGAGAAGAGGCTTTTAACTATGTTGATTTTGTTTTTCAGGTACTTACATGGCAACAAGAAGATTATTATTTTGCGTTTCCAAATCCTAGCTTCATAGCATGCTTCGATGATAAAAGATATGGATTCTCAATCACAGTCCACTGCCCTCCAGACTATGTATCAGAGGACAACGAAAGGATTGGAATTGCT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MEEWVNAVDKLKEVRDMEILEKLKISYYMLEESEQKIFLDIACFFKRKSKRQAIEILQSFGFPVVLGLEILEEKSLITTPHDKLQMHDLIQEMGQDIVCQKFPNDPQKRSRLWLRDDINLALSRDQGTEAIEGIMMDLDEKGESHLKAKSFSAMTNLRVLKINNVYLSGELEYLSDQLRFLNWHGYPLKCLPSNFNPTNLLELELPSSCIDHLWKGPKSLDKLKVINLSDSEFLSKTPDFSGVPNLERLVLSGCVRLFELHQSLGTLKHLIQLDLKDCKQLTSIPFNISLESLNTLVLSGCWSLKSFPKISGNMNHLLELHLDGTSIKVLHPSMGHLTGLVLLNLKNCKNLVKLPSTIGCLTSLKSLNLHGCSKLDSIPESLGNISCLEKLDVTGTCINEAPFSLQLLTNLEILNCQGLSRKFLHSLFPRWNNFSRNYSHSQGLKLTNCFSFGSSLRILNLSDCNLWDGDIPSDLRSLSSLQILDLSQNHFSILPESISHLINLRDLFLEECFHLQSLPKLPLSVREVDARDCVSLKEYYNQEKHIPSSEMGMTFIRCPISTEPAGSYRIDQLGLSGIHQRTMAQRYLEVLTWQQEDYYFAFPNPSFIACFDDKRYGFSITVHCPPDYVSEDNERIGIALGAAFQVQKRETNNSKVSCDFIIRMETDECPLKSALVFDGNDDELDWPHGLLVFYIPMRRISGWLNQCCCIDVSILTDNPLVKVKWCGASILYEQNAGKFIGMIIKGLFGSPGKYYTSILDHILNRQNRVDVSSLLDGGTRYKTSWLNALQRTIGSFQRLRPSKPPPEAIEDCSTSMNASIEVQENENDSSIMIKRNLKAALLRTFEDLKLYGEYYIFPQKEISRSCFDLQLKKPKVTIKVPPNLHKDKKWMGFACFVVFAVDEKSPNNSHSFSYQLENDEYKMQRESILYLNEGLFDDSHQLWLFFEPRAVYPYRLNHWRHLCVSFVCNNNSALKVVLCGARLVYKQDVEGFIDTIINNVLVSCPADLHEFYDQEYVKSMLKMINSHKYDPKQKEEERRQDSTPTSNTASSLVHADQNQERSHILQLKENIPSFLQKDLKDRFGTTFDFIIPRRDIPQLFNQQSQKNYTTIQLPPGLYTNSDWIGFAVCTLFQVNKHPTAILNNLRSVSRHELICQFAIKDGLIEPFHIHTITEDKFIWLHERQFIWLYYSPRKTYGNIFRHKSHICALIEADTPDLTVRCCGLQLVYKKDVEMIDKILMEAIQSS Homology
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q40392 (TMV resistance protein N OS=Nicotiana glutinosa OX=35889 GN=N PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 320.5 bits (820), Expect = 8.6e-86 Identity = 214/543 (39.41%), Postives = 313/543 (57.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: V9M2S5 (Disease resistance protein RPV1 OS=Vitis rotundifolia OX=103349 GN=RPV1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 312.0 bits (798), Expect = 3.0e-83 Identity = 207/578 (35.81%), Postives = 297/578 (51.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SZ66 (Disease resistance-like protein DSC1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DSC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 7.5e-82 Identity = 228/685 (33.28%), Postives = 341/685 (49.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: V9M398 (Disease resistance protein RUN1 OS=Vitis rotundifolia OX=103349 GN=RUN1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 304.3 bits (778), Expect = 6.4e-81 Identity = 223/638 (34.95%), Postives = 322/638 (50.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JT80 (Disease resistance protein RPP2B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPP2B PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 302.4 bits (773), Expect = 2.4e-80 Identity = 203/568 (35.74%), Postives = 307/568 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CK08 (TMV resistance protein N-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012131 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2127.8 bits (5512), Expect = 0.0e+00 Identity = 1052/1257 (83.69%), Postives = 1133/1257 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CJB7 (uncharacterized protein LOC111012131 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012131 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2127.8 bits (5512), Expect = 0.0e+00 Identity = 1052/1257 (83.69%), Postives = 1133/1257 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EC12 (TMV resistance protein N-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2069.3 bits (5360), Expect = 0.0e+00 Identity = 1013/1264 (80.14%), Postives = 1122/1264 (88.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IBG2 (TMV resistance protein N-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472024 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2063.9 bits (5346), Expect = 0.0e+00 Identity = 1011/1264 (79.98%), Postives = 1121/1264 (88.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJJ5 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501686 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1944.5 bits (5036), Expect = 0.0e+00 Identity = 962/1265 (76.05%), Postives = 1079/1265 (85.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. NCBI nr
Match: XP_022141874.1 (TMV resistance protein N-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2127.8 bits (5512), Expect = 0.0e+00 Identity = 1052/1257 (83.69%), Postives = 1133/1257 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. NCBI nr
Match: XP_022141875.1 (uncharacterized protein LOC111012131 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2127.8 bits (5512), Expect = 0.0e+00 Identity = 1052/1257 (83.69%), Postives = 1133/1257 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. NCBI nr
Match: KAG6592337.1 (Disease resistance protein RUN1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2072.7 bits (5369), Expect = 0.0e+00 Identity = 1015/1264 (80.30%), Postives = 1123/1264 (88.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. NCBI nr
Match: XP_022925371.1 (TMV resistance protein N-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2069.3 bits (5360), Expect = 0.0e+00 Identity = 1013/1264 (80.14%), Postives = 1122/1264 (88.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. NCBI nr
Match: XP_022973475.1 (TMV resistance protein N-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2063.9 bits (5346), Expect = 0.0e+00 Identity = 1011/1264 (79.98%), Postives = 1121/1264 (88.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. TAIR 10
Match: AT5G17680.1 (disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative ) HSP 1 Score: 312.0 bits (798), Expect = 2.2e-84 Identity = 245/783 (31.29%), Postives = 367/783 (46.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. TAIR 10
Match: AT4G12010.1 (Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 5.3e-83 Identity = 228/685 (33.28%), Postives = 341/685 (49.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. TAIR 10
Match: AT4G12020.1 (protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 275.8 bits (704), Expect = 1.7e-73 Identity = 177/430 (41.16%), Postives = 243/430 (56.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. TAIR 10
Match: AT4G12020.2 (protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 275.8 bits (704), Expect = 1.7e-73 Identity = 177/430 (41.16%), Postives = 243/430 (56.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g002610 vs. TAIR 10
Match: AT4G12020.3 (protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 275.8 bits (704), Expect = 1.7e-73 Identity = 177/430 (41.16%), Postives = 243/430 (56.51%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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