Lcy11g014870 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTAAGAATTTGTTGTGGTTTGTTGAATGTTCGTTATAGAAAAATGATATTGCATCTTGAGGAATTCGTTGGTGGGAAAATTCTCATCTTTATCATTATTGGTATCTCATTGATGCCACAATTAGTTATTCAGTTTTGGCTGTTTGATTGGTTTACAGGTTTTGCTTTTATCTACATGGAGGATGAGAGAGATGCTGAGGATGCTATCCGTGCACTTGATCGGAGAGAATTTGGCCGGAAGGGCCGCAGGCTACGTGTTGAGTGGACCAAAGTAATATACCTTGATATATCACAACTTTCAATGAACTTTTTTCCTTTCCATTTCTTTGTGGTACTTTTATTTGATTTTATTTATCACACCTTCGAACTGTATTTCCATCCATCATTCTTTTGCCCTGTAGCAAGAGCGTGGCATTAGAAGACCTGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTTCGAGGAGATCCTCTACTAATACAAGACCTTCAAAGACTTTATTTGTTATCAACTTTGACCCATATCATACTAGGACAAGGGATTTGGAGAGGCACTTCGATCCTTATGGTAAGATATTAAGTGTAAGGATTCGAAGGAATTTTGCATTTGTCCAGTATGAATTGCAGGAGGATGCCACTAGAGCATTGGAGCTTACGAACATGAGGTGAATTTTCCATCATTGAATTGTGTTTTTCATTTTTATTTTGGTACGGTCATCATATTGAAGTTTGATTAATCCAATCCCCCTTAGCCCCTGTTGCACCGAGACCATCTGAAGGAAAATTTCATTGATATTTTCACTTGTTATAGGCCATTGGTTACATGTTCGGATATTGTTATGCCATTTGATCATTATTATTGTGTACAGCAAATTGATGGATCGAGTGATTTCTGTGGAATATGCTGTTCGAGATGATGACGAGAAAAGAAATGGATATAGTCCAGATAGGAATCGTGATAGGTCTCCTGACAGAAAACGGCGATCCCCAAGTCCCTATAGAAGAGAGCGAGGAAGCCCTGATTATGGCAATAATGGTATTAGTCGCAGTCCATATAGGAGACAAAGGGCTAGTCCTGATTATGGAAGTCGTCGTAGTCCAAGTCCTTATCAGAGAGAGAGGGAGAGGAATTCTCCTGATTATGGCCATGGTCGTAGCCCCAATCCTAGTCCTTATAGGAGGGAGAGAGAGAGATCAAGTGACCATGTTAGGGCCCCTAGCCATAGTCCTCATCAGAGGGAAAGAACAAATGATGACCGAGTCCACGACCAAAGTCGCAGTCCTTACGGACGAGAGAGGGGGAGTCCTGATGATGGACGTGGCACTAGCTATAGTCCTCGTGATAGAGAGAGGTCAAACCCTGACAATGGTCACGACCAACGGCTAAATACAGTAGCAGAACCTGGGGATAGCCCCAGTTATGGTGGAACTCAGAGCCCAAAGCATCGGGGATATAACAGGTTCGTATTCTTCTTACTTTTATTATTGATTCTTCTTTCAAAATTTTCATCTTTTGCGTTCATGTTTTATGGTGTTGCAGCCATTCACCTCAAGCAGAGGAATGATGATGATCTACAAAGAGAGGAAGTGATGTTGATTCCAATCTGCTTCAAAGTATGTTTAGTTGTATAATCAGTATCAGTGGTAAACATGTATTGTAAGGATATTGTTTCGTGACTTCCAAATACATTTATGCTTCAGTTTCTAGTGAGTATATGGATATGCTATTACTAGATTTAAATTATTAACAATAAAAAGTACATAGCACTCTTATCTAAATCTGGCCGTCTTTGTTCCTTTTGGCCTTGTTTGAAAAAAATTGAAGCACGTTGGTTGTGGAACTTGTTTCATTTTGGTTTTGATCATGTTTGCTTCTGTTTTGGGTGGGTTTGGAATGGCTGACTCTTAAAAGAGTAGAAAGTGTAGAGGTGACGAATTGAACTATTGATCTTTTGGTTGAAGATATATGTCTTAACTTTTTGTTTTGAAATGATATGTTTTAACTAGTTGAGTTATCTTTAGAGGCAAAATAATGAAGGTGGTTGTAGATATTTACTAGATAATATTTACAAACATATTATTTTTTCAAACATGTATTAATTATAATAAAATGAATATGTGATTTGTAATATGAAAAATTTTATAATGCATATGAGTGTGAAGTGAGGATTGAGTTTTAGAGTGGGTAAGACTCCCTAATTCGAATCCTTATTTGAGGTAAGGTTAAATAACAACATTTTATAATAATAAACATCTTTGAGCTTTTAAAGTTGTACCAATTACGTTTTTGAACTTTAAAAAGTTTCAAACAAGTCTGAACTTTCAATTTTTAAAAATTAACCAATTCACTATATATAAAATTGAATTTTATGCCTATTGAGACTCTAAGGACCTGTTTGATAATCATTTCGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTGTGCTTATTTTCTTTCAATCTTCTTACAATGGTTTTCATTTTCGTTAAGTAGATATTTTGAGTTTCTCGCCAAATTTCAAAAACAAAAACAATTTTTTGAAAACTACGTTTTTTTTTTGTTTTCAAAATTTGGCTTGGTTTTTTAAAACATGGGAAAGGATATAGATAAAAAAACAAAGAAGTTTATGGGTAAAAAATAGTGTTTATAGGCTTAATTTTCAAAAACAAAAAACAAAAAATGAAATGGTTATCAAACGGGGCCTAAACTTTCAATTTTGCATCTAGTAGGCTTGTGAATTTTAAAAAATGTTGAATAGGTCAAGGACTTATTAGACACAAAATTAAAAGTGAGAGATTATTAGACACAAAAGTGGAACTTAAGGACCTGTTTGATATTTTTTAACGTAGGGACATTTTTTTATATGTTAAAGTTTAGGGACTTATTTGAAACAAAATTGAAAGTTCAAGGACCTATTTGAGAATTTTTAAAGTTCATGGACTGAATTGACACAACTATAAAAGTTCAGGGACTAAACATGTTATTTAACCAACTTTTTATTATTTGACTTGTTGCTATTGAATGCTCAGTGGGATTGTGAGACCTTTAATTATGACATCGATTTGCATCTTGATTTTGCCAGAGTTCCCGATCAATTTTAATTCCTTAAAAAAGAAATTGAATCGAGAGGTTAACTAACAAAAAATTTAGGGAAAAATACACTTTTAGTCCTTGAGGTTTGAGTTAGGTTTCATTTTGGTCCCTGAGTTTTCAAACTCAACAATTTAGTTCCTGAGGTTTGATTTTAGTTGCATTTTAGTCTCTCAATCCATTTTTCCGTTAAAAACTAATGGACTGATGATGTGGCACTATTTTTTTATTTAAAAAAATTATTTTAAAGAATTTTTAATTAAAAATATATTAAAGTAATAAAAATATTATTATTTTTATTTCTTTTTATTACTTCTCTCTCTTCCTCCTTCTTCTACCACTTCATCTTCTTCAACCCACCTTCAACCATGGCCGGCGGCGGCGGCCGGTGACCACAGCTCGCCGGCTGCGACGACCTTTTTTTTTTCATTCTCTTCTCCTTTTCTTTTCCCTTCCTCTCCAGTTTTTTTTAAGGGCACAAGTATTTTTTCGTCAAAGGTTGTTATATACATATTCCTAAAAATCAGCCAGAATCTCACTCTTTCTCTCCAGCGATTCAAGTTTTCCTTCACGCGTTTTGCTTCCAGAAATCGCCAAGTTTCACGCGTTTTCACTCATTCTCTCCGTCGATTTAACCCAGCTCGCACAATGCAAGACTCGCGCGACCGAGAACACCTAAATCTCATCGACGACCACAACACCTGAACTTCGATCTCCCTTCCTTCCCTCTCCAAACATGAGACCCACGAAAGTGCAAAACCCATTTTTTCTCCATTTCTCCTCTCCCTTCCTTCCCTCCCCGAATGCGAGACCCACGAGACGAGCCATATCTGGGTTCATGTTTTTTTTTTTTTAAATAGAGTTCTGGTTCCGATCTGAAGAAAAGAAGGTGCTACGAACCCAGATCTAGTTTCGATCTAGTTCAGTTCTTTAACTTTTTTTAAAAAATAGAAAACAGAAAGAAAAAAAAGGAAGAAGGATGGAGAAGAAAAGAAGGAGAAAAAAAAAAGTTCGGCGGCGGCGACGGTGGGTGGCGGCGACCGGTGATGTTGGGCTGCAGCATCTAGAAAAAGTAGAAGAAGAAGAAGGTGGGAGAAGGAGAAGAAGGGGGAGAGAGAAAGATATAATAAAAATTAAAAAAAATAATAATCTTTTATTATTTTAATATATTTATATTTAAAAAATTCAAAAATAATTTTTTAACAAAAAAAATAGTGTCACGTCAGCAAACCGTTAGTTTTTAACGGAAAAATGGATGGAGGGACTAAAATGAAACTAAAACCAAACCTCAGACACTAAATTGTTGAGTTTGAAAACTCAGGGACCAAAATGAAATCTAACCCAAACCTTAGGGACTAAAAGTGTATTTTTCCCAAAAATTTATAATAATAAACATTTCACAAGGTTAAACAAAAATGCACGACTTGAGAGACATTATGAGATAAAAAAACATTGCCCAAATCGCCTCCTACAAGAAAAGAGTCGTCCAGTATATGTGACATTGCAAGAAAAAGTTCCTACTATGCAAGACATTATGAGATATCGTGTGAAAAATTCACCCACTATGCAACACATTGGGAGAAAAATAATAATAAAAGAAGTCTATTAATATTGCAAAAATAACCCCTATAACAACAATGTGAAACTAATGTTGGATATTTTACAAATAAAATGTGAAAGAAAGTGGTGTTTAAATTCAATTCATCAAAATTGAAACATCAAATTCAATTTGAAGTTTCATTTACAAATTTAACATATGGAAGTTAAATTTGGTGTTATAACTCAATTGAGTTATATTTTTCATATGTTTCAATTTTATTTATTTTTGTTCTTTGGAGTTACTAAGTTGCTAGCCTATAAATAGCAACTTGTTTCTTCATTTGAATCATCCCATTCCATTTGGAACATTCTTCTTT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ATGGTAAGAATTTGTTGTGGTTTGTTGAATGTTCGTTATAGAAAAATGATATTGCATCTTGAGGAATTCGTTGGTGGGAAAATTCTCATCTTTATCATTATTGGTATCTCATTGATGCCACAATTAGTTATTCAGTTTTGGCTGTTTGATTGGTTTACAGGTTTTGCTTTTATCTACATGGAGGATGAGAGAGATGCTGAGGATGCTATCCGTGCACTTGATCGGAGAGAATTTGGCCGGAAGGGCCGCAGGCTACGTGTTGAGTGGACCAAACAAGAGCGTGGCATTAGAAGACCTGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTTCGAGGAGATCCTCTACTAATACAAGACCTTCAAAGACTTTATTTGTTATCAACTTTGACCCATATCATACTAGGACAAGGGATTTGGAGAGGCACTTCGATCCTTATGGTAAGATATTAAGTGTAAGGATTCGAAGGAATTTTGCATTTGTCCAGTATGAATTGCAGGAGGATGCCACTAGAGCATTGGAGCTTACGAACATGAGCAAATTGATGGATCGAGTGATTTCTGTGGAATATGCTGTTCGAGATGATGACGAGAAAAGAAATGGATATAGTCCAGATAGGAATCGTGATAGGTCTCCTGACAGAAAACGGCGATCCCCAAGTCCCTATAGAAGAGAGCGAGGAAGCCCTGATTATGGCAATAATGGTATTAGTCGCAGTCCATATAGGAGACAAAGGGCTAGTCCTGATTATGGAAGTCGTCGTAGTCCAAGTCCTTATCAGAGAGAGAGGGAGAGGAATTCTCCTGATTATGGCCATGGTCGTAGCCCCAATCCTAGTCCTTATAGGAGGGAGAGAGAGAGATCAAGTGACCATGTTAGGGCCCCTAGCCATAGTCCTCATCAGAGGGAAAGAACAAATGATGACCGAGTCCACGACCAAAGTCGCAGTCCTTACGGACGAGAGAGGGGGAGTCCTGATGATGGACGTGGCACTAGCTATAGTCCTCGTGATAGAGAGAGGTCAAACCCTGACAATGGTCACGACCAACGGCTAAATACAGTAGCAGAACCTGGGGATAGCCCCAGTTATGGTGGAACTCAGAGCCCAAAGCATCGGGGATATAACAGCCATTCACCTCAAGCAGAGGAATGA MVRICCGLLNVRYRKMILHLEEFVGGKILIFIIIGISLMPQLVIQFWLFDWFTGFAFIYMEDERDAEDAIRALDRREFGRKGRRLRVEWTKQERGIRRPGGGGGGGGSRRSSTNTRPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILSVRIRRNFAFVQYELQEDATRALELTNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSPDRNRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNNGISRSPYRRQRASPDYGSRRSPSPYQRERERNSPDYGHGRSPNPSPYRRERERSSDHVRAPSHSPHQRERTNDDRVHDQSRSPYGRERGSPDDGRGTSYSPRDRERSNPDNGHDQRLNTVAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYNSHSPQAEE Homology
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P92965 (Serine/arginine-rich splicing factor RS40 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RS40 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 331.6 bits (849), Expect = 1.1e-89 Identity = 198/335 (59.10%), Postives = 244/335 (72.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P92966 (Serine/arginine-rich splicing factor RS41 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RS41 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 5.6e-81 Identity = 200/338 (59.17%), Postives = 226/338 (66.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P92964 (Serine/arginine-rich splicing factor RS31 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RS31 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 4.2e-52 Identity = 133/256 (51.95%), Postives = 162/256 (63.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZPX8 (Serine/arginine-rich splicing factor RS31A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RS31A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 198.7 bits (504), Expect = 1.1e-49 Identity = 129/272 (47.43%), Postives = 166/272 (61.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22315 (Serine/arginine-rich-splicing factor SR34 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SR34 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 1.2e-06 Identity = 79/260 (30.38%), Postives = 112/260 (43.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E078 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025956 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 581.3 bits (1497), Expect = 3.0e-162 Identity = 310/334 (92.81%), Postives = 316/334 (94.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ76 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025956 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 580.5 bits (1495), Expect = 5.2e-162 Identity = 309/330 (93.64%), Postives = 314/330 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E4D4 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025957 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 570.5 bits (1469), Expect = 5.4e-159 Identity = 307/334 (91.92%), Postives = 314/334 (94.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQ39 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445933 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 559.7 bits (1441), Expect = 9.5e-156 Identity = 300/345 (86.96%), Postives = 316/345 (91.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F1N4 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438593 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 557.8 bits (1436), Expect = 3.6e-155 Identity = 297/336 (88.39%), Postives = 306/336 (91.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. NCBI nr
Match: XP_022159582.1 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 581.3 bits (1497), Expect = 6.3e-162 Identity = 310/334 (92.81%), Postives = 316/334 (94.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. NCBI nr
Match: XP_038904888.1 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 8.2e-162 Identity = 311/337 (92.28%), Postives = 317/337 (94.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. NCBI nr
Match: XP_022159583.1 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 [Momordica charantia] >XP_022159584.1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 580.5 bits (1495), Expect = 1.1e-161 Identity = 309/330 (93.64%), Postives = 314/330 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. NCBI nr
Match: XP_022159586.1 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 570.5 bits (1469), Expect = 1.1e-158 Identity = 307/334 (91.92%), Postives = 314/334 (94.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. NCBI nr
Match: XP_038904889.1 (serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 [Benincasa hispida] >XP_038904890.1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 [Benincasa hispida] >XP_038904891.1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 9.4e-158 Identity = 304/327 (92.97%), Postives = 309/327 (94.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. TAIR 10
Match: AT4G25500.1 (arginine/serine-rich splicing factor 35 ) HSP 1 Score: 331.6 bits (849), Expect = 8.1e-91 Identity = 198/335 (59.10%), Postives = 244/335 (72.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. TAIR 10
Match: AT4G25500.4 (arginine/serine-rich splicing factor 35 ) HSP 1 Score: 331.6 bits (849), Expect = 8.1e-91 Identity = 198/335 (59.10%), Postives = 244/335 (72.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. TAIR 10
Match: AT4G25500.3 (arginine/serine-rich splicing factor 35 ) HSP 1 Score: 330.9 bits (847), Expect = 1.4e-90 Identity = 197/331 (59.52%), Postives = 243/331 (73.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. TAIR 10
Match: AT4G25500.2 (arginine/serine-rich splicing factor 35 ) HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 5.4e-87 Identity = 192/325 (59.08%), Postives = 237/325 (72.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g014870 vs. TAIR 10
Match: AT5G52040.2 (RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein ) HSP 1 Score: 306.2 bits (783), Expect = 3.6e-83 Identity = 199/338 (58.88%), Postives = 225/338 (66.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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