Lcy11g014230 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy11g014230
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr11: 27525450 .. 27537105 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy11g014230
SyntenyLcy11g014230
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCGAGAAAGAGAGACTTTGAGCATCACGAACATTGTGCAGCTGCTGCCATCACTGTCGAAGACTCAAACTCGTGCTAAAGAAAGAAACAGGGAGGTTTGGGCCGAAGAACTCAATTACCGGAGAACCTACGTCGTGACTTTTACTCGAGGAACAATCACTGAAGCTGTGGGCGTCACTAGTTGCTACACTCGCCGAAGGAGCAATTGTCGGGATCCAACAGGCTTGTGTTGCAGCTTGTGGGTCGCGATGGTCGAAGGAAGAAGACGAACAAAAAGGGCGGTGGGCTTACGTAGCTGCTGCTTCGCGCGTGGGTCGCCCAGCTCGTCGGAGGAGAAACACATGGGAGAGAGAGAGCCGACGCGAGATGAACACAACGGCCAGATTTGCGTGATTCCATGGTTTGCTACTGGCGCAAAACGCGAGTGAGAGGGAGAGAAGTGGGACGCGGGGCAGGCAGTCGGATGAAGAAGAAGAAATCGGGGGGGGGGGGATTGACGGCGCAAAGAGAGTGAGAGGGAAAGAGATGCCTAGGGTTTGAGATATTCTTTTCTTTTAGCTTTTTCCTTTCTTTTCTTTTAAGAATGAATAGCCAAAGAAATAATAAAGAAAGCCTTAATTTGAATTCCACATTAAATCTCTTATCTCAATTTTAAACCCAATTAAAATTTTGAATAATTGGGTAATGCTAAATAAAAGGAAACGATTTGGATTTCTAAAGAAAATTAGAGATACGACGCAAAACTAAATTCCTAACCTATCGAGATTTAACTCATCGATTTTGGAACTAAATGAACTTGTCTAATTTTTCAAATTAGAACTTGAATGAATAGGCTCGATTACTCCAAAAAGGTTTAATTCTGAAACGCGGGGCGTTACACCCATGACTCTTGCCATTGAGATTCACCAAAGTTTGCCACTTAATCACCGACCTAATTCTTAGTGATTTGGTGTCTTCATATGAGGAGGAAGTGTGCATGAATTTCCTCTGTGGTTGAAGCTGTGATTCTCTCTCCAAAAGAACAAACTCTCAAATATTAAGGGTTCTTACATTCCCTTCCAAATTCATCACTGAGAGGCTCCCAAAAGCCGTTCTAAGACCGAAGGATAGCGGGGAAGACGTTCGGAGTCGTCCACACACTGTTCATGTTCAAATAAACCTCACGGAGTAGTTGAATTGCTTCCAAAAAGGTTGGTGCAAAGTATGCTCTGTTTTCAGTGTCTTATTGACATGCTTTTAATTCCTAAAAATAAAGAAATTAGAGTGTTTTCGATCCAGATCGTTTCCGCACGAGTGTTGTACACTCCTTCAAATCGGTCACCTTTTAAAAGTACAAAAACCAAAATAAACATTTCACAAACACGCATGCATGCACGCACGCGCACACGTGCACGCGGATGCATGCACTCACACACATGACATCTAATCTTTAAAATAAATTTCAATTTAATTCTTTGAAAATTTTCACTAATGTCATTTTAACAGAATGTTAAAATTTGTTAAAAAAATTGTCTCACTAAATTCTTTTTCATTCATATATTTGGACCTTGAAAAAAAATAATTTTCAAATCATCAAAATTGATTTTGAATTATTAAAAGCATGTTTTGGGGTGATTTTGAATTTCACAAAAGTGATTTTAATCATTTCAAAATCACTCCCAAACATGCACTAAGTTGAATTGTAAAGATATGAATAGGTTAAACTTAGTGTCTCATATACAAATAAAATGTTAGGTCTAGTATTCAAATAGGCTAATAAAATAATAATTTAATGATCAATCAACTTTTTCTTATTACATATTTTTGGGAAAAATACACTTTTGGTCCTTGAGGTTTGGGTTAGGTTTCATTTTGGTCATTGAGTTTTCAAACTCGGCATTTTAGTCCTTGAGGTTTGGATTTTGTTTCATTTTGGTCCCTCCATCCGTTTTTCTGTTAGATTTTAATAGATTGTTGACGTGACACCTATTTTTTTATTTAAAAAATAATTTTTTGATTTTTAAAATAATATAATATAAATTAATTAAAAAAAATATTATTTTTAATTAAAAAAACTATTATTTCTTCTTCTCTCTTATTCTTCTCCTTCTGCACCTTCATCTTCTTCTCCATCACTCCCACTACCACCACCAGTAGCTGCTGGCCGCCGTCGTCGGATCGTCGCCTCCGCCGCCGGACCGTCGCCGCCTATTTTTCCCTTTTTTTTTATTCTTCCTTCTCCTCCCTTTTTTTCTTCTTCTTCCCTTTTCCTTCCCTTTCTTCTTTCACTTTTTCTTTTAAAAAAACAGAGCACCCAGATCTGGAAAGCTCGTCCCAGTTGCACGTCTGAACACTAGATCTCGAACGCTTGTCGCATCGGCACCTAAATTCGGTCAATCCAACGCGTTTTCTACATCTTGAGCACCGATTCACCTCAATCTTCACCGATTCTTCAGGCTTCTGACAATCGGCTGCCGCTGCAATCTTCCTAGACTCAGAAATGAACCGAAATTTCTTCGGCTAGCGAGACGTGGTAGATCTCGGAGTTTTCTCCCCGAAAAACTTCACCACCATGAACGTCGTCGTCGTGGTAGATCTGAAACGAAGGGAAACCTGAACGGGCATCATTTTTTTAGAGCAGTTAACCGGAACGGCGTGTTCGACGCGAGCTGTGAGCGATGGCGTGAGTAGGGCCCTAAGTGCTGTTCTACGACGGGTTCGGGCGTGAGGCTGGGACGAGCTTTCCAGATCTGGGCATTCTGTTTAAAAAAAAGTGAAAGAAGAAAGGGAAGGAAGGAAGAGGGAAGAAGAAGAAAAAAAATGGAGGAGAAGAAAAAATTTTAAAAAAAAGGAAAAATAGGTGGCAACGGTGACGACGATCTGGCGGCGGCGGCCGGTAGCTGGTGGTGGTGGTGGTGGGAGTGATGGAGAAGAAAATGAAGATGAAGAAGGAGAAGAATAAGAGAGAAGAAGAAATAATAGTTTTTTTTTTAATTAAAAATAATATTTTAAAATTAATTTATATTATATTATTTTAAAAATTAAAAAAATATTTTTTAAATAAAAAAATAGGTGCCACGTCAGCCATCTGTTAAAATCTAACGGAAAAATGGATGGAGGGACCAAAATGAAACAAAGTGCAAACCTCAGGGACTAAAATGCCGAGTTTGAAAACTCAGAGACCAAAATGAAACCTAACCCAAACCTCAGGACCAGAAGTGTATTTTTCCCCATATTTTTGAAAGGAACAAGGAAATCTTAACACAGTAAGGATAAAATTAAAAAATTGTAAATTATTGAAACAACAAATTAAGAATTTAGGAGTAGGTATGTTTTGTTGAATTATTCAAATAATTCATATTTCTACATTTTACCTTACAATTTAAATCTAAACATTTTAAAAAATTATCTAAATTGGTCATTGCAACACTACTCTTCTTTTCCAGCCATATAATGGAAAATTTGATATCATATTTTCTTTTATGTTAATGTAGCTTTAGTGATGTGTTAGTTTTTTTTAAGGGTCAAATTTCTTTGAAATGTTGCTTCAAGGATTAAGAAATTTAATATTCTAAAAGATTAAGATATTAGTAACTTTTGTTATAGATTGAGGTTTAAATCTCTACTATATATTCATATCATAATCATATATACTTTACAGAATTAATCCAAAATACTTAAATATTAATCTAAAATATTTAGGGTGAGTATGACAAACACTTGTGTATTATCTAACTCGGTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTGGAAAAAAAATACTTTTTGGTTCCTGAGTTTTGAGGAATAAGTGCATTTGGTCCCTGAGTTTTCAAAATAGACATTTTTAGTCCCTAAATTTTGAGAAATAAGTTTAAAAGGTCCCTGAGTTCTCAAAATAGACCTTTTTAGTCCTTTGAGTTTTGAGAAATAGGTTTAAAAGATCCCTCATGTTATTTTTTCAACTTTTTTAAATTAATATTTTTTTATTATTTTTTAATATTGAATGGTTTTTAAATTAAAAAATTAAAAAGTATTAATTAAAAAATTAAAAAAAATAATATGAGGGACTTTTAAGCCTATTTCTCAAAACTCGGGAACTAAAAATGTTCATTTTGAAAACTTAGGGACCTTTTGAACCTATTTCTCAAAACTCAGGGACTAAAAGGGTTTATTTTGAAAATTCAGGAACCAAACGTATCTATTCCTTAAAACTCAGGGACCAAAAATGTATTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTATTTCTAAGTCTCTCATCATCTTACTTCCTCTCTCCTCAAGGATGTGAATATGGTTAACGGATAGAGAAAAGCAAGCTTCCACATCAAGAAACCTACCAAGAAATTGATGGAGTAGAATGACTTTTTATAGAAGACAGTGAATTAAAAAAATTGAAATGATAAAGAGAGAAAAAAACAAAAACAAAGAGCATGAACAGAGAGAAAAGGTAAGATGGAAAAAAGGTTAGATTTGTAGCATGTCATAAAAAAATATTAAATTTTACAAAATACTCTTAAACTTCATATAGGTTTCAATTATGATTTTGGTTCATTTTTATTTTTTTTTCTTTAAATAGTTTCATTTTTATTTTTGAAATTTGTCTCAAAAAAATATCTTGAACTTTGTTATTGGTCTAAAAAATATCTTTTCAATATTAAAATAAAGATATGATAATTAAAAATGATTAATTATAATATAATTAATTAAGTCACAATTAAAATTTTTATTTAGTAATACAAATCATTTTCATATATATTTTTTAAATTACTGTACGCATCCACATTTCAAGTAACATTTTCATCTTCATATTGTCTTAATTTTATATATGATGATTAAAACTAGTCAATTATAGTCTAATTAAGCAACAATTAAAGTTTTATTAACTCTAATTCAAACAATTTCCATCAACTTCCACAATTTCCGTAAATTTTCCCGAAACGTCCATCGACATTTCCATAAAATCTGGACCTCGACATTTCCATCGACATCGA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mRNA sequence

ATGCGAGAAAGAGAGACTTTGAGCATCACGAACATTGTGCAGCTGCTGCCATCACTGTCGAAGACTCAAACTCGTGCTAAAGAAAGAAACAGGGAGGTTTGGGCCGAAGAACTCAATTACCGGAGAACCTACGTCGTGACTTTTACTCGAGGAACAATCACTGAAGCTGTGGGCGTCACTAGTTGCTACACTCGCCGAAGGAGCAATTGTCGGGATCCAACAGGCTTGTGTTGCAGCTTGTGGGTCGCGATGGTCGAAGGAAGAAGACGAACAAAAAGGGCGGTGGGCTTACGTAGCTGCTGCTTCGCGCGTGGGTCGCCCAGCTCGTCGGAGGAGAAACACATGGGAGAGAGAGAGCCGACGCGAGATGAACACAACGGCCAGATTTGCGTGATTCCATGGCTTCTGACAATCGGCTGCCGCTGCAATCTTCCTAGACTCAGAAATGAACCGAAATTTCTTCGGCTAGCGAGACGTGGTAGATCTCGGAGTTTTCTCCCCGAAAAACTTCACCACCATGAACGTCGTCGTCGTGGTAGATCTGAAACGAAGGGAAACCTGAACGGGCATCATTTTTTTAGAGCAGTTAACCGGAACGGCGTGTTCGACGCGAGCTGTGAGCGATGGCGGTTGGCCTCGACATTCTGGGGTCGACCTCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTTCTAACTTCTTTGTTCCTTTTGGTTTCAACCATGCCTCCCTATGCCCCTGCTGCATCCTTGTTCGAACTCTGTGGGAAGAAGAAGAAAAAAAGTTTCCGAGGTGAGGCGGGAACTTCGACGGTTGAAGTAACCGACCTTACTGAAAATGAAGCTCTTAATGTCTTTGACTCCTTGTTGTTCCTCTTCGCCCTTCTGTTTTGGGACTTCGAAGGTTCTGTTTGACATGGCCTCATCCGCCTCTGGGGGTGCAAGCCACACAAAGCTACCAGTATTTGTTCTCCCCGTGGGCTACTCGTAAACTGGGAATGAGGTTGAGCTCCTTAGATAAGACCTCAATTTATGACAGGGGTTGAGTTCCAGGAAATCCAAGGGAGTGTCAAAATTTAATGATCCTTCTGTTGTGGTTACAAATGTCTTGCTCGACCTTCACCATAAAAAGATGAAGATTTGGCCAAATAATGAAGATGTGGGTCAAAATGAGAGATCAAGGACTTAAAGATGAAGATTGAAGGCCAAAAATCTGGTGAGAAGAAGCCCAAAACCAGCCCAAAGCCGAGAAGATGGAAGTCCAAATCGAGGGGCAACATCTCGATGCTACCCTAGGTGTCTCGATGCTGAAGCTGCTTGGGGAATAAGTCGGTGACGTCACGACGTCAAGACGCTGTGACGTCAGTGTCTTGACACTGGCACGACTGGAGCACTATAAAAAGGAACCTTTGGCCTCAGTTTTGAATCATCAAACAACAATTTGGAGCATCTTTCAAAGGCTCTTAGAGCCTCTTAGAGGGAGGGATTGAGAGTAATGTTCTAAAGAGTTTTGTGAGC

Coding sequence (CDS)

ATGCGAGAAAGAGAGACTTTGAGCATCACGAACATTGTGCAGCTGCTGCCATCACTGTCGAAGACTCAAACTCGTGCTAAAGAAAGAAACAGGGAGGTTTGGGCCGAAGAACTCAATTACCGGAGAACCTACGTCGTGACTTTTACTCGAGGAACAATCACTGAAGCTGTGGGCGTCACTAGTTGCTACACTCGCCGAAGGAGCAATTGTCGGGATCCAACAGGCTTGTGTTGCAGCTTGTGGGTCGCGATGGTCGAAGGAAGAAGACGAACAAAAAGGGCGGTGGGCTTACGTAGCTGCTGCTTCGCGCGTGGGTCGCCCAGCTCGTCGGAGGAGAAACACATGGGAGAGAGAGAGCCGACGCGAGATGAACACAACGGCCAGATTTGCGTGATTCCATGGCTTCTGACAATCGGCTGCCGCTGCAATCTTCCTAGACTCAGAAATGAACCGAAATTTCTTCGGCTAGCGAGACGTGGTAGATCTCGGAGTTTTCTCCCCGAAAAACTTCACCACCATGAACGTCGTCGTCGTGGTAGATCTGAAACGAAGGGAAACCTGAACGGGCATCATTTTTTTAGAGCAGTTAACCGGAACGGCGTGTTCGACGCGAGCTGTGAGCGATGGCGGTTGGCCTCGACATTCTGGGGTCGACCTCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTTCTAACTTCTTTGTTCCTTTTGGTTTCAACCATGCCTCCCTATGCCCCTGCTGCATCCTTGTTCGAACTCTGTGGGAAGAAGAAGAAAAAAAGTTTCCGAGGTGAGGCGGGAACTTCGACGGTTGAAGTAACCGACCTTACTGAAAATGAAGCTCTTAATGTCTTTGACTCCTTGTTGTTCCTCTTCGCCCTTCTGTTTTGGGACTTCGAAGGTTCTGTTTGA

Protein sequence

MRERETLSITNIVQLLPSLSKTQTRAKERNREVWAEELNYRRTYVVTFTRGTITEAVGVTSCYTRRRSNCRDPTGLCCSLWVAMVEGRRRTKRAVGLRSCCFARGSPSSSEEKHMGEREPTRDEHNGQICVIPWLLTIGCRCNLPRLRNEPKFLRLARRGRSRSFLPEKLHHHERRRRGRSETKGNLNGHHFFRAVNRNGVFDASCERWRLASTFWGRPPFSLSLSLVLTSLFLLVSTMPPYAPAASLFELCGKKKKKSFRGEAGTSTVEVTDLTENEALNVFDSLLFLFALLFWDFEGSV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lcy11g014230 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy11g014230 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy11g014230 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy11g014230 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy11g014230.1Lcy11g014230.1mRNA