Lcy11g012770 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCCAGGATTCCCCCTTGCGTTGCGTGTGTTCCAGCCAGCCCCATCCGATTTCATTCTTCCTTCCCGTCGGCGTCAGGACCCACAGGCCGATTCCGGCGTCTTTTCCTTCTCCCTCTCTGCCGTGTGTTGCGCCGCCGCCAGCAGCCAAGCCCCGCCGTCCCTTTTCATCTCTTCCTCCCTCGCGTGAGCAGCCGCGGTTCCCATCTCTCTCTCTCTCGTTCATCCTCGGGTGAAACCGCCGGCGTCAAGACCCACGGACAGCAGCAGCTCGCGCCGCCGTTCGTCTCCCTCAAGCTTGAGCCGTTCTCTTCGCGCTTTCAAGTTCCTCAAGCAGCGAGTTTAATTCCTTGTTCCTCTTGTTTTCGGCTGGGTTAGTGAGTAGAAGGCAAGATCTTCGTCGTTCTGGCGCTTTGGGCACGTTTGGGCTGATTTAAGTTCCGTTCCAGCGTGTTCGGGCTCTCTTGGTGAGTTTTCGTCGTTACCCATGCTTATTCGAGTTTGATTTTAGTTAACCCATTCGTTATCGACCTCAAATTACAAGAATAAGCCTTGTTTGTGTGCTGTCCAGCTGTAAATTAGACCCAAAGCGAGCTTTTGGCGATTACCCACAATCCGTGCGACCTTGAATTGAAGTGCTCTTGGTCCAACGGCTTTAGATCGTCGTTTATGGAAGCTCTCGATCATTGGTCAACAAGTTTCAGGGCCGTTTAGGTGCTGTTCGGTAAGTTCCTCGTCCTTAGACCTTGGTAATCAATTATGTTGGCTTTTGAGTAGCCTATAACCTATGGGTGTTTCGTTAGTTTCAGTTTTAACCCAATTCGGACCTCAGGCAGCGCGTGTTCAAAGGAGTTTGGTGCTGGTCAGTAAGTTCCAGCAAGCTTTTGGACTCGTTTGGCGTGGTTCGGTAAGCTTCTTCACCTTTTAGCCTTGTTAGAACTCTTGTTAGGCTCTGCTAACTAGTCCCTGATGTTGGAAGTCGTTACTTGTAGCTTGGGATCAATTAGAGGTTACTCGAGTTATTTTCCAGCAAAGGACTTATCCTGTTTGATGGAGCTTTAAAGGAGCTCTTGGATTATCTTTGGAGCTTTTCATCTAGTTTAGGAGCGTTTAGAGCTTCCGGTAAGTGGAATTCTACCTTTTGAGTTTGTTTGCTTGTTTGCTAGCATGCTGTGTGTTATATCGACTTAGTTTTGTTATGTGCTCTGACGTATTGATGTTCATGAATTATTGTGAATTTTGAGCATGTTGGGCTGTTGTGGCATATGCTATGTCGCACTGTTGTGTTGAAGTATGTTGAACTGTTGTAGTGCGATATTGTCGTGATAAGCATGTTGTTATCATGTGCGATATAGTTTTTCAAATTATTATTTTTTATATTTTTTATTATTGTACTTTTTATTTAAAATGCTTGAATATGCTTTAATTTGTTTCTTTAATGTGAAGGTGGGAGTTCAAACCTCTAACCTTTAATTCAACGATATATATGTTACAAAAAGCCTTAACACCTTTGGTTTTAATGATTTTTTTAAAAAATTGTTTCTAATTCTAAATAAAACTTATTATACAAATAATTAAATAAAAAATTATAAAATATACATGTTATTGTTAAATAAAAATGTGATAGGTATTAACAAGTTTATGAAACGAAAATTACATAAATTAATTTAAAGCATTTATAAAATTATAAATTATATCATATTATATTAGTAATTAATCTATCATTTCTATTTTCCATAGAATTATTTGGTTATAAGAAAAAATAAGAATAAGTTGATATACAAACGTGCATCGCACGTGCTAAAAAACTACTTAATAATAAATGGGCAAGGCAACGAGAAAAATGGCAAGATTTAATAGGTGGGTTTTGAAAAATGGCTAAAAAAGTTTAGAAATCAACATGACTCTCCTAAGCCAAACCTCGTACATCTGTCTATGCAACTAACTAACCACTCATGCTTCACGAGCTCACTCAACAAACTTATTTAGCCCTCACTTGGTTCTCCAAGACTGATCCTTCGAGTCGCACTGTCCCCTGACCATTTGTACCCAGGGCCACAATGCTCTCTACGGAGCTCGGCGTTCGACCCTTGACCATTTGTACCCAAGGCCTCGAACTGTGCATCGCCCTTTGGCCATTTGTACTCAAGGTGCACCGATGCTTGCTAGACTCATCACACCGATCCTTGACCATTTGTACCCAAGGCCTCGATGCTCCTCTTAAACCATTGGTGATATGCCACCCCTCGACCATTTGTACCCGAGGTGCACTGACATTCACCCATCTAGCCTTTCTTTCACATTCAGGTCCCTGACCTCTTTATTACAACTATCTAGAGTGCATATGCCCTGCAACATGCTTCTAGACTCATGTACTATGCCCACCAAGAATATACATACCACACCAAGCTTAGGATGCTCTCTGTAGCTGGATAGATAGTTTGATTCGTTGAGTGATTCTTGTTTGGTAGTAGGAGTAGGATGCTCCCATAGATAGCTAGATAGCTCTTGATTATCTTGTCATTGTTTCGTGATGTTGCTTGTTAGTAGGCATAGGATGCTGCCATAGATTCTTAGATAGCTCGTGTGTTTTCGGTTGGTGCATGATGTGTGCTATCAGGTCTAGGTTGTTGCCTCAGTTCGATGTTAGTCCATCCTATTTAAGCTTCTTATGAAGGCTCATTAAGCAAGTTCTTTGTTTCCCCTCTTAGTGATGAGTTCTAGCGAGAGTCGAGAGAATGGTCGTTCTGGCTCTCCCAGTGTTCTTGAAGTCAATTCGCACCTCGATGCGAATTCCCCTGTTCCTCACCTGGTGCCTCAAGTGGCATTGACGTTGAAAGCCCTTTTTTTTTCGTGTTGGTTCTTCTTTGGCGAGGCCCAATTGGTAGTGGTAGTTGCAGACGACCAGCAAAGCGGACCTAAGGTTGGATCTTTTTACCTTGGAAGGTTAGTGAGTTGGCTTGAAGATTCTAGCAAGTGAAACCAAGACCGTAAAGAATTAAGAGAATTTCCATAGGAAGTAGTAAAGTTGGTGGACTTTCTATGCAAGCAAGATCTGTGGAGCAAGGTTGTCAAGTTGGAATATGCTAGACCTCGTCGTCGTTCCTGGATATAGATTGGTTGGCTTTAGTTAAGAAAACAAGAAGCTCTCTTGTAGTTTGGTGCTTGAGTCTATTTTGCAAATATCATGGACTTCTGGATAGAGTTGTTACTTGGGACAACCTATTATTCAAGGCACTTTATTGAATGATATCGATTCAAGGAAGAAACTTAAGGTGCCATTGGAAGAACTCTTGGACAAGAGATTTATTTACCCTATTGTGTCTCCCCAACTTTGTTGGTGAAGAAAAAGGTCAATTCATTGAGCCTAGGCATTGACTATTGGGAATTGATCAATGTGGCAGTAAGAGATAAGTATTCTCCAATCGTGATGGTGATTTTTTTTTTTACCAATTTCAAGGAGCTAAGGTTTTACCAAAGTTAGATTTGTGATGAGGTTACCCTCAGGTAAGGGTCAAGGAAGTTGTCGTTCCAAGGTTGCCTTCAAAACCAAGTGTGGCCATCACAAGAACATGATGTTTTTTTGGATTACTAATGCTCCTATAGCTTTTGGGCTTCACGAACCAGATTTTCAAGATCTTTTGGACTCGTTCATGATAGTGTTCCTTGGTTGTGAGTTGGTTTATTTAAAGACTAAGGAAGACTCATAAAGAGCACTTCGAGCAAGTTTTGGCAGCTTTGGGATGTAGTGAGTTGTACGCTATTCAAAGGATGAGTTTTGTTTGGATAAGGTTGCTTTCTTGGACATCTGGGTTCTAAGGACTGTATCCCAGCGAGTCTTGCTAAAGTAAAAGTAGAAGAAGTTTGCAATTGGTCCGACCCAATTTAATGGTTGAAAGTCACAATCTTCTTGATTGGAAAGTTACCTTTTGAAGCTGGGAGGTTGCTTAGAATGTTGCTAGTTTGGTAGTACCATGGATTCAGTTCTCTCGCAAGATTCAAGAACATCGCTATCGCTCGAAGCGAAGTTTGTAAGAAGCATTTCTAGAGGTTAAGGGAACAATTGGCTATAGTCTCGGTGTTAACTGTTCTTGATTGTACAAGAGGTTAGTGGTCGTTATTGACGCTTAAAGAAAAATGACAAGGTTGTAAACTAATGCGATATGGAAAAGATGTTCACACCTTGTGTCAACTAAGGAAATATGAGTTTAACTATTCCACACTCATGACTTGGAAGTCGTAGTTGCAATATTGACTTTAGATATCTGAAGACACCTTCCTTCTGAAGGAAGTATCCAGCTCATAGATCACAAAGAGTCGAAGGTGTTTCTTTATGCAAGAAGAGCTTGACTTAGGTTAAAGGAAGTGTTTGGATCTGGTAAAGCGGTAAGGTCAATTAGCACCTGACATGGAAATTGTGGTATGCTCTTAGCAAGAAACCAAGTTGGCGTTCTCGGTACCATTTCATAGTCCTTTGCTAGGAGGGTTGATTGCTCAGAAAGTGAGTTGGCAGCGGAAGCCTTTTCAGCATTGTTTGCTCATCTTTAGTGGTGTCTAGTTGAAAAAAAAAAAGTTGATTGTTGATAGCCATTAAGAAGACCTAGAATTGGTTAAACGCCTGAGTGAGGAAGATCAAGGGAATTATACCCTTACTGGAAATTCAGCTTTTTGTTATATCAAGGTTGTTGTGCCAAAGGATTATCCTCTAAAGCGAGGTTGATTGTAAGAGACACATAAAACACCTTTTTCAGTGCATTCTCATAAAGCCAAGATGTACAAGGGATTTAAGAAACATCATGGGCAGGCTCAATGCGTAGAGCGAATTGCTCAGTTGCTTAGTAAGTTGTTGTTCCTATCCAAGTTAGAGTTAGTGAAGTTAACTAACGAAGCTATCGAAGGATCAGAAAAAAAAAATGTTTAAGTTGCCAATGTAGACAGATGGTTTGTGAAGGTGATAGGTGCAAAGGTTGAGTTCAACATTGGTGACTTGTGTTCTC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ATGGAATCTTTGTTCAAAGCTTACTCAAATGCTTCTGACGAAGACGGTGAAGAAGAAGAACATAAGCCCAAGCGTTTGGCCCTCCCCTCTCCACCTTCAAATAGACCCGTATCCCAACCTTCCAAATTCCAGCCGAAGTTCCGACCATTGCATTGCTCGGACTCGAGTTCAGAGCCTCAAAAGGGGATTATGGTTCCTGGACGCTATGTTTCCAAGAGAGAGCGAGCACTCCTGAGTTCAACTCCAGTTTCTAGGGCTCCGGAATCATTTCTGAATCCATCCGTCCAATCTTCAATTGTTGGAAGTCTTTCGGATTCTGACCTTCCACGTGAGATCCTGTCATTATTGAGAAGTAGAGCTAAAGACTATTTGCAGCAAGGCCGGATGCCTAAAAGGATGTCTGTAACTCTTGATTGCCATACAAAACCCGTCAATGCAGTTCAATGGTCGCCAACACATGCTCATCTCCTTGCTTCTGCTGCTATGGATCACACGATCTGCATATGGAACGTATGGAGCACAGAGCAGAAGCTAGCATTCAAGTCAAGCATTCACGACGCTGCAGTTAAAGATGTTCAATGGTCACAACAAGGATTATCTATTCTTTCTTGTGGATATGATTGTGCTTCAAGATTGATTGATGTTGAGAAGGGGACAGAAGTTGGAGTATTCAAGGAGGAATCAGGAGTTGCTGTTGTAAAGTTCCATCCTAACAACCCAAGTCTCTTCCTTTCCGGTGGACTGAAAGGTAGCCTCCAAATGTGGGATATGAGAATTGGAAAAGTGGTTAACAAATACAACCGACGTCTTGGTCCAATTCTTGATGTTGAATTTACTCCCAATAGCAATCAATTCATCTCTTCCAGCGATGTTTCTGCAAGCAATAGCAGTGAAAGCTCTATCATCGTTTGGGATGTCACAAGAGAAGTTCCGCTTTCATATCAGGTTTATATGGAAGCCTACACTTGTCCATGCGTGAGATGCCACCCCTTTGATCCAGTTTTTATTGCCCAATCGAACGGAGATTATATTGCAATCTTCTCTCTAAACCCACCTTTCAAGTTAGACAAATACAAGAGGTATGAAAGTCATGGAGTCTCAGGCTTTCCAATAAAATGTAACTTCAGCCTGGATGCCAAGCAGATCATCTCTGGTTCTTCAGATGGCTCTATATATTTTTACGATTATGAATCATCCTTGATTATACATAAACTAAAAGCATCTGAACAGGCTTGCATAGATGTTGCCATCCACCCGACCTTGCCTAATGTAATCGCTACGTGCAGCTGGAATGGAAATATTTCACTGTTCCAGTGA MESLFKAYSNASDEDGEEEEHKPKRLALPSPPSNRPVSQPSKFQPKFRPLHCSDSSSEPQKGIMVPGRYVSKRERALLSSTPVSRAPESFLNPSVQSSIVGSLSDSDLPREILSLLRSRAKDYLQQGRMPKRMSVTLDCHTKPVNAVQWSPTHAHLLASAAMDHTICIWNVWSTEQKLAFKSSIHDAAVKDVQWSQQGLSILSCGYDCASRLIDVEKGTEVGVFKEESGVAVVKFHPNNPSLFLSGGLKGSLQMWDMRIGKVVNKYNRRLGPILDVEFTPNSNQFISSSDVSASNSSESSIIVWDVTREVPLSYQVYMEAYTCPCVRCHPFDPVFIAQSNGDYIAIFSLNPPFKLDKYKRYESHGVSGFPIKCNFSLDAKQIISGSSDGSIYFYDYESSLIIHKLKASEQACIDVAIHPTLPNVIATCSWNGNISLFQ Homology
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E9Q349 (WD repeat-containing protein 25 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Wdr25 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 7.7e-66 Identity = 134/403 (33.25%), Postives = 219/403 (54.34%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q64LD2 (WD repeat-containing protein 25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR25 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 246.5 bits (628), Expect = 5.5e-64 Identity = 111/317 (35.02%), Postives = 188/317 (59.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O60508 (Pre-mRNA-processing factor 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC40 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 9.5e-40 Identity = 94/311 (30.23%), Postives = 156/311 (50.16%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9DC48 (Pre-mRNA-processing factor 17 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cdc40 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 1.2e-39 Identity = 98/332 (29.52%), Postives = 165/332 (49.70%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O43071 (Pre-mRNA-processing factor 17 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=prp17 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 1.3e-33 Identity = 86/303 (28.38%), Postives = 151/303 (49.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FN47 (WD repeat-containing protein 25 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446958 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 786.6 bits (2030), Expect = 5.5e-224 Identity = 384/438 (87.67%), Postives = 413/438 (94.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JQD9 (WD repeat-containing protein 25 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 783.5 bits (2022), Expect = 4.6e-223 Identity = 382/438 (87.21%), Postives = 412/438 (94.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DZ03 (WD repeat-containing protein 25 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493399 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 776.9 bits (2005), Expect = 4.3e-221 Identity = 379/438 (86.53%), Postives = 404/438 (92.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CMQ5 (WD repeat-containing protein 25 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012887 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 760.0 bits (1961), Expect = 5.5e-216 Identity = 371/438 (84.70%), Postives = 406/438 (92.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5GRD2 (WD repeat-containing protein 25 OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_022358 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 544.7 bits (1402), Expect = 3.6e-151 Identity = 270/440 (61.36%), Postives = 339/440 (77.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. NCBI nr
Match: XP_022941667.1 (WD repeat-containing protein 25 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 786.6 bits (2030), Expect = 1.1e-223 Identity = 384/438 (87.67%), Postives = 413/438 (94.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. NCBI nr
Match: KAG6600751.1 (WD repeat-containing protein 25, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 786.2 bits (2029), Expect = 1.5e-223 Identity = 384/438 (87.67%), Postives = 412/438 (94.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. NCBI nr
Match: XP_022992622.1 (WD repeat-containing protein 25 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 783.5 bits (2022), Expect = 9.6e-223 Identity = 382/438 (87.21%), Postives = 412/438 (94.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. NCBI nr
Match: XP_023526021.1 (WD repeat-containing protein 25 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 780.4 bits (2014), Expect = 8.1e-222 Identity = 381/438 (86.99%), Postives = 411/438 (93.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. NCBI nr
Match: XP_011650540.1 (WD repeat-containing protein 25 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650152.1 hypothetical protein Csa_009510 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 776.9 bits (2005), Expect = 9.0e-221 Identity = 380/438 (86.76%), Postives = 405/438 (92.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. TAIR 10
Match: AT5G54520.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 493.4 bits (1269), Expect = 1.8e-139 Identity = 249/457 (54.49%), Postives = 320/457 (70.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. TAIR 10
Match: AT1G10580.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 178.3 bits (451), Expect = 1.3e-44 Identity = 97/308 (31.49%), Postives = 161/308 (52.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. TAIR 10
Match: AT4G02730.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 110.9 bits (276), Expect = 2.6e-24 Identity = 83/299 (27.76%), Postives = 138/299 (46.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. TAIR 10
Match: AT4G28450.1 (nucleotide binding;protein binding ) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 6.6e-12 Identity = 71/299 (23.75%), Postives = 126/299 (42.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g012770 vs. TAIR 10
Match: AT5G67320.1 (WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 6.2e-10 Identity = 52/232 (22.41%), Postives = 100/232 (43.10%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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