Lcy11g001350 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy11g001350
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionProlyl-tRNA synthetase
LocationChr11: 1342030 .. 1419348 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy11g001350
SyntenyLcy11g001350
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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AGTCAGTAAAGAAGCTATTCTCGAGATTATAAGATGAAAGGAGATGCTTAATCTATGCAAGTTTTCTTGCAATTAAAAGGAAGTTAGAGGCATTGGCTACGAATATGAATCTCTGAATGGTCTCCTTGCTAGTAGAAAGGCCATTACAAGCTAAACTTTAGTTGTAAGCCAAAGAAGAGAAGACACTATTGGCACTTTCCTGCTACTTGACTTGTTGGCATATATCTCTGATTAGAAGATTGAAAGAAAATCTAGAAGTAAAGAAATTGGAACTTACAAAGTACGTAAATGAAGTGGTGGATGTTTTTATTCCTCAGAGTTGGGAATTGTTTCTACAAGAAAGCAATACTCACCCTCTTCAATTGCGAAGGCACTTTCTATTGTTTCGACCCTTTCTCGCTCTTTTCTAATCATTATCCCATACCTTCATTTTTGCGTTAGTTGGTGGATAGTTACTGGCAGGTGATGAACCAACAAAGTGATTGATTCCAGAAATATGATTTCGTTTATGGATTTCAGGTCTGATGAACACCCTCCAAGATAAGGATTTTGAGGGGATGACAAATAGAGTCACTCTAACTTGTTGGAAATTGTGTTTGTAATATGCAATTTTTGAAGAAAACTTTCTACTCCAACAACAAAGTAGCCTTCGCCAATAGGGACTTCTTTCCAATCACGTTCTCAAGGTTCGGTTCTGGCATTTTCAAGTCATAATATGAATGAATGAATGCCATAAATGTGAAAGGTTGAAATATTTGATTTTGACTCCAATTTATACCATACTCGTTCATTGAGAAAGAAGCCAGTCATGTTGATCGAGGGGTTTAGTCCAAGGTTGAAATATTTGATTTTGACTCCAATTTATACCATACTCGTTCATTGAGAAAGAATCCAGTCATGTCGACCGAGGGGTTTAGTCCGGAGTTAGCTCTTGTAACAATTGGAGGAGGGAAAGAACTTGAAGAAAAGCTTGTGTGGGCAAATGTTACTAGATGGGAGATGCGCACGAAACTGTTTGTAAGAACTCTTGAATCTCTCTGGCAGGAGGGTCATACTGCTCATGTCAGTCCAGAAGAGGCAGAAAAAGAGGCTATTCAGATGATTGACATATATACAAAATTTGCTTATGAGCAAGCGGCAATACCTGTTATTGCAGGTCGAAAATCAAAGGTGGAGACATTTGCTGGTGCAGACAAGACCTATACAATAGAGGCCATGATGGGGATCGAAAAGCACTGCAGGCTCCCAGCCAAAACCTTGGGCAAAACTTTTCTCGTGCTTTTAGGGGGCGTTGCCCCCGAACCCCCACCGGGCGCGTCGCCCCTGGACCCCGACTCGCTGACCGGGCTTGGTCGTTCGGAGCGCTTCATATCAGATTCAAGGCATATCAACAATGTCCAATGGGGTTTGGGCTTGGTCCTTCAAGCCCATTGTAAAATGAAGGAATGGGAAAGAGCCATGAACTCCGATGGATTTTCCAATCATCATGTCAATGTCCTATCCATCTTTGCCATAACCATTGGTCTCAGGAAGCTGCTTCGCTTCGACCTGAAGTTGTTACTGAGAGCATCAAATGCCCACGTTGGAGGTCCCACGACAGCCTGCGGGATGGCCATTGGTTGGAGTTCAATGGTTATCCCTGGAATTTTCGGAATCGCTATTGCAACTCTCCTAGGTATTGGATTTGGATTGACAGTCGTAAAATGCATGCAAAACCATTTAAATTAGGATCATAAAATCGCTGGTTTCTCCAAAAGTTATATTGCAAGGGAATAACTTTTTAAAATTGTTTTCTCAAAAGACAATGGAGGAGAGAGCTTGGTTCCTCAGTGTACTTGCAGGCAGAGTACATTTAGACCATCTATTTGCTTTGCTTGTAAAAAAATTTATCTTAGATGCAAATCCTCTTTAGTACTTGTGCACATGATCTCATCTGTACATCTGTATGCTTCAACTTTGTTTGGAGTTCAATAGGAAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGACCGAGGGGTTTAGTCCGGAGTTAGCTCTTGTAACAATTGGAGGAGGGAAAGAACTTGAAGAAAAGCTTGTGTGGGCAAATGTTACTAGATGGGAGATGCGCACGAAACTGTTTGTAAGAACTCTTGAATCTCTCTGGCAGGAGGGTCATACTGCTCATGTCAGTCCAGAAGAGGCAGAAAAAGAGGCTATTCAGATGATTGACATATATACAAAATTTGCTTATGAGCAAGCGGCAATACCTGTTATTGCAGGTCGAAAATCAAAGGTGGAGACATTTGCTGGTGCAGACAAGACCTATACAATAGAGGCCATGATGGGGATCGAAAAGCACTGCAGGCTCCCAGCCAAAACCTTGGGCAAAACTTTTCTCGTGCTTTTAGGGGGCGTTGCCCCCGAACCCCCACCGGGCGCGTCGCCCCTGGACCCCGACTCGCTGACCGGGCTTGGTCGTTCGGAGCGCTTCATATCAGATTCAAGGCATATCAACAATGTCCAATGGGGTTTGGGCTTGGTCCTTCAAGCCCATTGTAAAATGAAGGAATGGGAAAGAGCCATGAACTCCGATGGATTTTCCAATCATCATGTCAATGTCCTATCCATCTTTGCCATAACCATTGGTCTCAGGAAGCTGCTTCGCTTCGACCTGAAGTTGTTACTGAGAGCATCAAATGCCCACGTTGGAGGTCCCACGACAGCCTGCGGGATGGCCATTGGTTGGAGTTCAATGGTTATCCCTGGAATTTTCGGAATCGCTATTGCAACTCTCCTAGGTATTGGATTTGGATTGACAGTCGTAAAATGCATGCAAAACCATTTAAATTAG

Protein sequence

MSTEGFSPELALVTIGGGKELEEKLVWANVTRWEMRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVETFAGADKTYTIEAMMGIEKHCRLPAKTLGKTFLVLLGGVAPEPPPGASPLDPDSLTGLGRSERFISDSRHINNVQWGLGLVLQAHCKMKEWERAMNSDGFSNHHVNVLSIFAITIGLRKLLRFDLKLLLRASNAHVGGPTTACGMAIGWSSMVIPGIFGIAIATLLGIGFGLTVVKCMQNHLN
Homology
[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FYR6 (Proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=OVA6 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 2.6e-43
Identity = 96/152 (63.16%), Postives = 106/152 (69.74%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVT+GGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 144 EGFSPELALVTVGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSYRDLPLMINQWANVTRWE 203

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK F+RTLE LWQEGHTAH +PEEAEKEA QMI+IYT+FA+EQ AIPVI GRKSK+ET
Sbjct: 204 MRTKPFIRTLEFLWQEGHTAHATPEEAEKEAKQMIEIYTRFAFEQTAIPVIPGRKSKLET 263

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGAD TYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 264 FAGADITYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 295

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8KCD1 (Proline--tRNA ligase OS=Chlorobaculum tepidum (strain ATCC 49652 / DSM 12025 / NBRC 103806 / TLS) OX=194439 GN=proS PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 137.5 bits (345), Expect = 2.3e-31
Identity = 73/134 (54.48%), Postives = 86/134 (64.18%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGF+PE A+VT GGG+EL EKL                              WANV RWE
Sbjct: 83  EGFAPECAVVTHGGGEELAEKLYVRPTSETIIWSSYKKWIQSYRDLPILINQWANVVRWE 142

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 109
           MRT+LF+RT E LWQEGHTAH +PEEA++E I+MI+IY  FA E  A+PVI G+KS+ E 
Sbjct: 143 MRTRLFLRTTEFLWQEGHTAHATPEEAQEEVIRMINIYRTFAEEYMAMPVIVGKKSESEK 202

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3QPX3 (Proline--tRNA ligase OS=Chlorobaculum parvum (strain DSM 263 / NCIMB 8327) OX=517417 GN=proS PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 136.7 bits (343), Expect = 3.9e-31
Identity = 72/134 (53.73%), Postives = 85/134 (63.43%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGF+PE A+VT GGG+EL EKL                              WANV RWE
Sbjct: 83  EGFAPECAVVTHGGGEELAEKLYVRPTSETIIWSSYKKWIQSYRDLPLLINQWANVVRWE 142

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 109
           MRT+LF+RT E LWQEGHTAH  PEEA++E I+MI++Y  FA E  A+PVI G+KS+ E 
Sbjct: 143 MRTRLFLRTTEFLWQEGHTAHADPEEAQEEVIRMINVYRTFAEEYMAMPVIVGKKSESEK 202

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3EE36 (Proline--tRNA ligase OS=Chlorobium limicola (strain DSM 245 / NBRC 103803 / 6330) OX=290315 GN=proS PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 3.3e-30
Identity = 71/134 (52.99%), Postives = 85/134 (63.43%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGF+PE A+VT GGG+EL EKL                              WANV RWE
Sbjct: 83  EGFAPECAVVTHGGGEELAEKLYVRPTSETIIWASYKKWIQSYRDLPILINQWANVVRWE 142

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 109
           MRT+LF+RT E LWQEGHTAH + EEA +E ++MI IY KFA E  A+PVI GRK++ E 
Sbjct: 143 MRTRLFLRTTEFLWQEGHTAHATKEEASEEVLRMITIYKKFAEEYMALPVIMGRKTESEK 202

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3EP23 (Proline--tRNA ligase OS=Chlorobium phaeobacteroides (strain BS1) OX=331678 GN=proS PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 3.3e-30
Identity = 73/152 (48.03%), Postives = 93/152 (61.18%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGF+PE A+VT GGG+EL EKL                              WANV RWE
Sbjct: 83  EGFAPECAVVTHGGGEELAEKLYVRPTSETVIWASYKKWIQSYRDLPLLINQWANVVRWE 142

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRT+LF+RT E LWQEGHTAH +PEEA+ E ++MI++Y  FA E  A+PV+ GRK+  E 
Sbjct: 143 MRTRLFLRTSEFLWQEGHTAHATPEEAQDEVLRMINVYKTFAEEYMAMPVLIGRKTDSEK 202

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGAD+T+ IEAMM  +K  +   +  LG+ F
Sbjct: 203 FAGADETWCIEAMMQDKKALQAGTSHNLGQNF 234

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G067 (Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449493 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 9.9e-46
Identity = 107/152 (70.39%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 149 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 208

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET
Sbjct: 209 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 268

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 269 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 300

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CUH7 (Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2047G00090 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 2.2e-45
Identity = 106/152 (69.74%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 154 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 213

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKF+YEQAAIPVIAGRKSKVET
Sbjct: 214 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFSYEQAAIPVIAGRKSKVET 273

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 274 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 305

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HTC6 (Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467631 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 2.2e-45
Identity = 106/152 (69.74%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 149 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 208

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSK+ET
Sbjct: 209 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKMET 268

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 269 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 300

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L6I6 (Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G213510 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 2.2e-45
Identity = 106/152 (69.74%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 156 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 215

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKF+YEQAAIPVIAGRKSKVET
Sbjct: 216 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFSYEQAAIPVIAGRKSKVET 275

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 276 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 307

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2J3 (Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496137 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 2.2e-45
Identity = 106/152 (69.74%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 145 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 204

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKF+YEQAAIPVIAGRKSKVET
Sbjct: 205 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFSYEQAAIPVIAGRKSKVET 264

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 265 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 296

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. NCBI nr
Match: GFP91356.1 (proline--tRNA ligase [Phtheirospermum japonicum])

HSP 1 Score: 197.6 bits (501), Expect = 1.4e-46
Identity = 100/123 (81.30%), Postives = 107/123 (86.99%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVWANVTRWEMRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEK 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVWANVTRWEMRTK FVRTLE LWQEGHTAH +PEEAE 
Sbjct: 155 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVWANVTRWEMRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHATPEEAEN 214

Query: 64  EAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVETFAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLG 123
           EA+QMI +YTKFA+EQAAIPVIAGRKSKVETFAGA KTYTIEAMMG  K  +   +  LG
Sbjct: 215 EALQMIGVYTKFAFEQAAIPVIAGRKSKVETFAGAAKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLG 274

Query: 124 KTF 126
           + F
Sbjct: 275 QNF 277

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. NCBI nr
Match: KAG8638382.1 (hypothetical protein MANES_14G023300v8 [Manihot esculenta])

HSP 1 Score: 194.9 bits (494), Expect = 9.2e-46
Identity = 100/128 (78.12%), Postives = 108/128 (84.38%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVWANVTRWEMRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEK 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVWANVTRWEMRTK FVRTLE LWQEGHTAH + EEAEK
Sbjct: 148 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVWANVTRWEMRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHATLEEAEK 207

Query: 64  EAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVETFAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLG 123
           EA+ MID+YTKFAY QAAIPVIAGRKSKVETFAGA +TYTIEAMMG  K  +   +  LG
Sbjct: 208 EALLMIDVYTKFAYAQAAIPVIAGRKSKVETFAGAVRTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLG 267

Query: 124 KTFLVLLG 131
           + F +  G
Sbjct: 268 QNFSLAFG 275

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. NCBI nr
Match: XP_023541480.1 (proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 2.0e-45
Identity = 107/152 (70.39%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 149 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 208

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET
Sbjct: 209 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 268

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 269 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 300

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. NCBI nr
Match: KAG6574195.1 (Proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 2.0e-45
Identity = 107/152 (70.39%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 168 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 227

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET
Sbjct: 228 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 287

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 288 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 319

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. NCBI nr
Match: XP_022945172.1 (proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 2.0e-45
Identity = 107/152 (70.39%), Postives = 110/152 (72.37%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 149 EGFSPELALVTIGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSHRDLPLMINQWANVTRWE 208

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK FVRTLE LWQEGHTAH SPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET
Sbjct: 209 MRTKPFVRTLEFLWQEGHTAHASPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 268

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGADKTYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 269 FAGADKTYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 300

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. TAIR 10
Match: AT5G52520.1 (Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein )

HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 1.8e-44
Identity = 96/152 (63.16%), Postives = 106/152 (69.74%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGFSPELALVT+GGGKELEEKLV                             WANVTRWE
Sbjct: 144 EGFSPELALVTVGGGKELEEKLVVRPTSETIVNHMFTQWIHSYRDLPLMINQWANVTRWE 203

Query: 64  MRTKLFVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVET 123
           MRTK F+RTLE LWQEGHTAH +PEEAEKEA QMI+IYT+FA+EQ AIPVI GRKSK+ET
Sbjct: 204 MRTKPFIRTLEFLWQEGHTAHATPEEAEKEAKQMIEIYTRFAFEQTAIPVIPGRKSKLET 263

Query: 124 FAGADKTYTIEAMMGIEKHCRL-PAKTLGKTF 126
           FAGAD TYTIEAMMG  K  +   +  LG+ F
Sbjct: 264 FAGADITYTIEAMMGDRKALQAGTSHNLGQNF 295

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. TAIR 10
Match: AT3G62120.1 (Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein )

HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 2.8e-16
Identity = 50/149 (33.56%), Postives = 71/149 (47.65%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGF+PE+A VT  G  +LE  +                              W NV RWE
Sbjct: 128 EGFAPEVAWVTKSGKSDLEVPIAIRPTSETVMYPYYSKWIRGHRDLPLKLNQWCNVVRWE 187

Query: 64  MRTKL-FVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVE 115
                 F+R+ E LWQEGHTA  +  EA++E +Q++++Y +   E  A+PV+ G KS+ E
Sbjct: 188 FSNPTPFIRSREFLWQEGHTAFATKAEADEEVLQILELYRRIYEEYLAVPVVKGMKSENE 247

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. TAIR 10
Match: AT3G62120.2 (Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein )

HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 2.8e-16
Identity = 50/149 (33.56%), Postives = 71/149 (47.65%), Query Frame = 0 

Query: 4   EGFSPELALVTIGGGKELEEKLV-----------------------------WANVTRWE 63
           EGF+PE+A VT  G  +LE  +                              W NV RWE
Sbjct: 128 EGFAPEVAWVTKSGKSDLEVPIAIRPTSETVMYPYYSKWIRGHRDLPLKLNQWCNVVRWE 187

Query: 64  MRTKL-FVRTLESLWQEGHTAHVSPEEAEKEAIQMIDIYTKFAYEQAAIPVIAGRKSKVE 115
                 F+R+ E LWQEGHTA  +  EA++E +Q++++Y +   E  A+PV+ G KS+ E
Sbjct: 188 FSNPTPFIRSREFLWQEGHTAFATKAEADEEVLQILELYRRIYEEYLAVPVVKGMKSENE 247

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. TAIR 10
Match: AT5G52540.1 (Protein of unknown function (DUF819) )

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.8e-15
Identity = 44/80 (55.00%), Postives = 59/80 (73.75%), Query Frame = 0 

Query: 198 VNVLSIFAITIGLRKLLRFDLKLLLRASNAHVGGPTTACGMAI--GWSSMVIP----GIF 257
           V + +  A+ +G+ KLL  +L+LLL ASNA+VGGPTTA GMA   GW+S+++P    GIF
Sbjct: 382 VQIGTHLAVILGIGKLLNIELRLLLLASNANVGGPTTAAGMATAKGWNSLIVPGILAGIF 441

Query: 258 GIAIATLLGIGFGLTVVKCM 272
           GIAIAT +GI FG+ V+K M
Sbjct: 442 GIAIATFIGIAFGVKVLKFM 461

[Close]
BLAST of Lcy11g001350 vs. TAIR 10
Match: AT5G24000.1 (Protein of unknown function (DUF819) )

HSP 1 Score: 79.0 bits (193), Expect = 6.8e-15
Identity = 43/78 (55.13%), Postives = 57/78 (73.08%), Query Frame = 0 

Query: 198 VNVLSIFAITIGLRKLLRFDLKLLLRASNAHVGGPTTACGMAI--GWSSMVIPGI----F 257
           + V+   A+T+ L KL   D+KLLL ASNA++GGPTTAC MA   GW+S+V+PGI    F
Sbjct: 364 IQVMVHLAVTLVLGKLFCIDMKLLLLASNANIGGPTTACAMATAKGWTSLVVPGILSGVF 423

Query: 258 GIAIATLLGIGFGLTVVK 270
           G++IAT LGIG G+ V+K
Sbjct: 424 GVSIATFLGIGCGVFVLK 441

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9FYR62.6e-4363.16Proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=370... [more]
Q8KCD12.3e-3154.48Proline--tRNA ligase OS=Chlorobaculum tepidum (strain ATCC 49652 / DSM 12025 / N... [more]
B3QPX33.9e-3153.73Proline--tRNA ligase OS=Chlorobaculum parvum (strain DSM 263 / NCIMB 8327) OX=51... [more]
B3EE363.3e-3052.99Proline--tRNA ligase OS=Chlorobium limicola (strain DSM 245 / NBRC 103803 / 6330... [more]
B3EP233.3e-3048.03Proline--tRNA ligase OS=Chlorobium phaeobacteroides (strain BS1) OX=331678 GN=pr... [more]
BLAST of Lcy11g001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1G0679.9e-4670.39Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449493 PE=3 SV=1[more]
A0A5D3CUH72.2e-4569.74Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2... [more]
A0A6J1HTC62.2e-4569.74Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467631 PE=3 SV=1[more]
A0A0A0L6I62.2e-4569.74Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G213510 PE=3 SV=1[more]
A0A1S3C2J32.2e-4569.74Prolyl-tRNA synthetase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496137 PE=3 SV=1[more]
BLAST of Lcy11g001350 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
GFP91356.11.4e-4681.30proline--tRNA ligase [Phtheirospermum japonicum][more]
KAG8638382.19.2e-4678.13hypothetical protein MANES_14G023300v8 [Manihot esculenta][more]
XP_023541480.12.0e-4570.39proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
KAG6574195.12.0e-4570.39Proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosper... [more]
XP_022945172.12.0e-4570.39proline--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita moschata][more]
BLAST of Lcy11g001350 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT5G52520.11.8e-4463.16Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein [more]
AT3G62120.12.8e-1633.56Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein [more]
AT3G62120.22.8e-1633.56Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein [more]
AT5G52540.11.8e-1555.00Protein of unknown function (DUF819) [more]
AT5G24000.16.8e-1555.13Protein of unknown function (DUF819) [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR008537Protein of unknown function DUF819PFAMPF05684DUF819coord: 200..268
e-value: 5.4E-13
score: 48.7
NoneNo IPR availableGENE3D3.30.930.10Bira Bifunctional Protein; Domain 2coord: 24..116
e-value: 5.5E-23
score: 83.8
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR43382:SF7BNAC09G28510D PROTEINcoord: 3..26
coord: 27..115
NoneNo IPR availableSUPERFAMILY55681Class II aaRS and biotin synthetasescoord: 4..112
IPR004499Proline-tRNA ligase, class IIa, archaeal-typePANTHERPTHR43382PROLYL-TRNA SYNTHETASEcoord: 3..26
IPR004499Proline-tRNA ligase, class IIa, archaeal-typePANTHERPTHR43382PROLYL-TRNA SYNTHETASEcoord: 27..115

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy11g001350.1Lcy11g001350.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0009791 post-embryonic development
biological_process GO:0006433 prolyl-tRNA aminoacylation
biological_process GO:0048608 reproductive structure development
cellular_component GO:0017101 aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex
cellular_component GO:0005739 mitochondrion
cellular_component GO:0005737 cytoplasm
molecular_function GO:0005524 ATP binding
molecular_function GO:0004827 proline-tRNA ligase activity