Lcy11g000010 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCAGTACACTCGATTTGGATTACCATATACTCTAGTGAATCTCCATCTTCATTTGATGTCCCTTATAACCACGTCATTGTGACCCTTTGAAAAGGATTGAAACACTACATCAGTATTATTTTGCCACTTAAGCATCAACCCTCCACTTTGTCCCAGACTAGGGACTTCAAACTAGATGTTGAAGTGTCCTAGGGTTCCCCAATCCTTACATTCCAACTTAATATTTCCACAGTGCTCGCGGTCTGTCAAACAGCTTCCACCAACCTTCCACCAACTTCCTCCACTATAAGCATCTTTTTGCTCAAACCATCTTCCTCCAAATCAATTTTATGTGTTATGGCCCACCATTGACTCTTTGATTTTTCATTTTATTTTGGCTAAATTATAAAAAATACCCCTAAACTATGAGATTTGTTTAAAAAATGCTCCTGAACTTTGAAAAGTTTCAAAAATACCCCTAAACTTTGAAAAATGTTTAAAAAATACCCTTGACGTTAATTTTTGGATGGAAACCGTTAAAGTTTTAGTTTTAAAAATACCCTTGAACTTCTAAAAAAAAATTAAAAAATACCCTTATTGAAAAATGCTTTTTATTTTTTCCTTCTCTCACCTTAAATTCCAAAGGTTTTCATCCAAAAATAAACGGTAAGGGTATTTTTGAAACATTTTTCAAAATTCAGGGGTATTTTTTAAACTTTTCAAAGTTTAGGGACATTTTTTAAACAAACCCCATAGTTTAGAGGTATTTTTTTTTACAATTTAGCCTTTTATTTTTCAGATCCTTTTCATCCTTTTCCTTTTTATCTCGCAAAAGTCTCCTAGTCTCCTCTCGTGTTCGTGTTTGCCGCCGCCGCCGGTGCTTGCCGTGCTTGTCGTCGGTGCTGTTCAATCTCTCCTCTCCCTTCTCGTGCTTGCCGCCGGTGCTGTTCAATCCGCCGGTGCGTTCACTCTCCCTACTTGTGCGCTTGCTGCCGAGTTTAAGTCGCCGCCGGGTAATTTTTTAATTGGGTCTGTTCTATTAGTTGTGGTATTTCTATTTTAGCTTTATTTGGCCGTGGGTTTTCTGGGTTTCTTCTTTGCTTTTTTAGTTTTTTCTGTTTTGTGAGCTGTGTTTGAATCTGCTTTATAATTTTTTATCTTTTGGTTCTTTGGTCTCTGGTCTTTATTTGCCGGATTGATTCTCAAGTTTTGTGATGTCTTTGTTGGTTTCTTTGGTCTTTGGGGGTTATTACTGTGATAGGATTTTGGTGTACATACTGCTAGATTTTGGTATAAATTTTCTCCCATGACCGAGAGAGATATGAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAACAAGAATCATATAAAATATGCATAAACCCATATCACCATATCTCTTTTAGAAGCCGTCGTCATCATCTCCCACAACATTTTTGGGTCCAGGAAGCCACTTTTTGGGATTTTGCATATAGAAGGCAATATCCGATACCGAACTGAAAGTAATCATATATCTTGATATTATTTAATGTTCTTCAATCCTCATCTTGGTACATGTATACAAAATATCTTTATCTTTTAAGCCCAGCATCTTCTAGGAACATTCATATTTAAGCCCAGCATCTTCTAGGAACATTCATATTTAAGCCCAGCATCTTCTAGGAACATTCATCTTTATCTTTCAGAAAGTATCTGTAGATGGGTATGTTTAGGAAAAACCCTGGACTTTTTCAAATCTGGTATTAATATTAATAAGTGTAAAAGTCTTGTATTTATGTTCGAACTATGGTAACTCTTTCTTTATCGATTAATATTAATATTTCACATGTTAGATAGAATATTTTATAACTTATGAGGAAGGGGTGTCCAAGTGGAATCAAATCGATTTTTGCTTCTAGTTATGTACATTATTGGATCTCTTGTTTCTCAAACCATGAGCTTTAATTTTCAATTTGTTTTTGATTCTTTAGGTTTCTTCTTTGTTTTTTAGTTTTCTCTGTTGTGTGAGTTGTTGTGTTTGAATCTGCTTCTTTGATGGTTGGTGTTGTTGCTTTGTGCATGCTTAAGCTTTTGTAAGTCTTGTTTTGAGAATTTTGGTTTGATTTTTATTACAGTATGACTTCGTCTTTTACAAATGAGACTTCTGAACAAAATCATAGACTTATACCCCTAATTTAGGTACGAGTAGTAAAGTAGGATTGTTAGGGAAAAGAAAACCTACTAAACCAGCTTCAGATGCTTAGGAGCATTTTATTAGAGTAGAGAGATGTGATCCTGAATTGAATATCCTATGACTGCTTGTAAATATTGTGGAGCAGGAACTTAGACCATAATTATGTTGATATGAAGTCTCTTTGTGCCTGCTTCAGATGCTTTGAAGTCTCTTTTGATATTATGGAACAAGAACTTAAACCATAATTATATTGGTCTCATGGACATTAGTGTATGAATTCATCGAAGTTTAGGGACCTGTTAGTTAAGTTTATTCTTCACCATCCTTTGTGATTCATTGTTTTTTATTTTTATCTTTAAAGTGAAAAAGTGAAGTGAAGTCCAGTAAGCAAGCAAGCAAAGGAAAAAAAAACGCGGTTGACCCAACCCGACTCGGTTCGAACCAACTCAAAACTGGGTTGGGTCGACCTGTCTGTACAACTGACTAGAAAAATTTACATCCCCAACACTCACACAACTTCTTATGCTTCTTGACGCTATTTCCTCGTTCATTTCAGTAGCCCAGTGTCGTCGCGGTGTCTCTCTCGTTCACTGTTGCCGTCGCTGTCGTCTTCCTTCCGCTCGTGCCGCGACCATCGTCGTCTTTCTTTCGTTCGTGTCACCGCAGTCTCCCTCGATTTTTTGCCCCTTGCTGTTACTGGTATTTCTCCATCTATGTCTTTCTGATTACTTGAAAAACACAAATTAGAAATTGTCTAATGAAAGAATGGAGGAGTTGTTTGATTTTCTTTTTTATAATAACAATAGCCGAATAAAAGAAGGAAACCCTAACGGCTCACGCAAGTTCTTCTTCTTCACGCTGTTTCCTCCTCCGTTTCAGCAGATTAGTGTCGCCGCCACGTCTTTCTTGTTAACTGTTGCCGCCACTGTCATCTTTCTTTCGTCCGTGACGTCGCAACCTTCCTCGATTTTCTACCCCTTGTTGTTATTGGTATTTTCCCAATCTCCATCTATGTCTTTCTGCTTAGTTGAAAAACACGAATTGGGACTTGATTAATGAAAGAATAAAGGAGTTGGTTGATTTTATTTTTTATAATAACAATACTTGAATAGTAAAAACGATGGGAACAAAAACGGGAGATTGTTCTCGAGTGCACAATTGATACATACAATGGAAGGATGGTGAGATAAATATCTCGAGGAGAAAAAACCAACAAGAGGCTTTGAGAGAGAACTCGAAGAAGAGGCCCAAAGGCGTGATACTTCAAATCTTTCCGACTATAGAAGTTGCTTATTGTGAAAGGTCTTTGCTTTCTGTAAATGGTTAAGATACAAAGAATTGGAAAAAAGCACATGGTTGAGGGATTTTGATGAGTAGAAACAATGGCCCAATTCAGATTTCAAGGAATCAATTTCTATCTAGACAATTTTTTGGGGCTTGGTTTTTTTGTATGCCCTTGTATTCTTCATTTTTTCTCAATGAAAGGTTGGTTCTTTATCAATTTTTTTTTTTGAATAGAGAGAAAAACACCCAGTATTTCAACTTCAATATTGCCAAAAGAAGTAAGAACTTGCCCATCAATGGAAACTAGCCGAATAATTAGTGACTTCCTTTTGTCATTTTTTTCTAGGAGGCATTGTTTGCTATTTTTAGCCTTGAAAAAATAGAAGAAAAATAAGAACCATGGTGGACAACGAGTGGCTATGGCAACAACAAAGATAACGAACAATGGGCGACCGACCATGAAGGGAGGAAGAAGGAAGAAGGAGGAGGAAGAAGAAACTGAGAAAAACAAAAAGAATTAAAAAAAATGATATTTGATTAAAAATAGAAAATAATTAAAAATATTTTTTAATAAAAAATAAATATCATACCAGCTCTCCATTAATTAATGGAAAATTTAAATGTGTATTTTTTTTTTAAAAAAGAAAGAATAAAATTGAAAATGAAAATAAGTTTCCACATTGAGACCATTTAAAAGAAGTATGGTGTAAAACTAAAAAGATTCCCCGCTGATTCTTGAGCTTTTGGTTGCCATTCTCCCTAATTCCTCTCTTTTTTCTTTCTCCCCGCTTCTCCTCATCGCCGGCACGTGCCCTTTCAACCTCTTCCCTTACAACACCCCCCCATGGATTCATCGCTGACTAGCGCCTTGCCTCTGCCGTTGTTTCGATACATCCATATCAGTTGTCTTTTTGCTCCCCTATACTTTCGCCCAAAACCCTTCTTTCTCTCTCTCTGGATAAAGAGTCAACTTTCATTGAGAAAAAATGAAAGAATACACGGGCATACAAAAAACAAGCCCACAAAAGGGGACCCATCTAAAGAAAGGGACCCCAATCAAGCAAATTAAGACCTAACAAATAATTACAAAGCACCTTAGAAATCAACGTGCAAAGAGATACATGAAATCTAGTTAGGGACCACACATCATCTGGGTCCCTCTCCCACTCCCTAAACACTCTATTATTCCTTTCCCCCCAAAGATTCCAAAATAAAACACACATTTCCGCTTGCCGCAAAAATCTCGCCTTCTCGCGAATTGGCAAATGGAGGAGGAACTCTTCGATCATCTCCATGTGATCTACAAAACTCATTCCGTACATCCTAAAAGCATGTCCGAAACAACCCCACACCGCACGAGCATAGTCACAACTCCAAAGAATGTGATCCAAGTCTTCCTTTGCCTTCCAAAAAAGAATGTAACAGAACGGAACAACCAAGGAGGGCATCCTTTTCAACAACCTATCACATGTATTAACTCTACCATGGATAACTTGCCACATAAAGAACCTAATCTTCTTCGGGACTTTCACCTTCCACACACGTGAGAAAATAGACTCAC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ATGCCAGTACACTCGATTTGGATTACCATATACTCTAGTGAATCTCCATCTTCATTTGATGTCCCTTATAACCACTCTCCTAGTCTCCTCTCGTGTTCGTGTTTGCCGCCGCCGCCGGTGCTTGCCGTGCTTGTCGTCGGTGCTGTTCAATCTCTCCTCTCCCTTCTCGTGCTTGCCGCCGGTGCTGTTCAATCCGCCGGTGCGTTCACTCTCCCTACTTGTGCGCTTGCTGCCGAGTTTAAGTCGCCGCCGGTAGCCCAGTGTCGTCGCGGTGTCTCTCTCGTTCACTGTTGCCGTCGCTGTCGTCTTCCTTCCGCTCGTGCCGCGACCATCGTCGTCTTTCTTTCGTTCGTGTCACCGCAGTCTCCCTCGATTTTTTGCCCCTTGCTGTTACTGATTAGTGTCGCCGCCACGTCTTTCTTGTTAACTGTTGCCGCCACTGTCATCTTTCTTTCGTCCGTGACGTCGCAACCTTCCTCGATTTTCTACCCCTTGTTGTTATTGGAAATGTCTAAGAAATTCTCGGCAACATTGAGAATTGGGGATCTAAATGATTTCATAGCGCCTTCTCAGGCTTGCATAGTTTCTCCCAAGAGGCTTAATGCCACTGCCACGAAGCTGGATAAAGTTGAGGTTTCGTCTTCTAGGAAGCAATTGAAATCAGAACCAGTTAAGATTTCTCTGAAGGATTGCTTAGCATGCAGTGGTTGTGTAACATCAGCAGAGACTGTTATGCTGGAGAAGCAAAGTTTGGATGAATTTCTTTCCAACATCGACAAAGGAAAGGTTGTAGTTGTCTCATTATCTCCCCAATCCAGGGCCTCACTTGCTGTCCATTTTGGTATCTCCCCGCTGAAGAGCCACTGGTCATACTATGAATCGAGTAATCTCAAGATACATAACAGAGCAAATCCTGGTCATACTATGTACCGAGTAATCTCAAGGTACATAGTAGAGCAACTTGTCATATGCACGCAGAGTAGCCCCGAAAGGGCAAAGCACCCCGACACACGGCCCAAAGCCTATGTGTGTGCCGAAGTGGGTCCCAAAGACCTCATATATCATAACTACACTACGGAAACACATTCACGTAAGTGTATCGGGAAATCATTGTGGGTTTTAATTAGAGATCCTTTTGAGAACCTAGTGGTGAAAGATATATTTGAGGAGTGGCTGGAGCAACCAGGTTCAGAGAAGGCCAAGAAGTATATGCACACTGAATACCACCCTGTGGTGAAAAGCTTTACGACCCAACTCCACAACTGGTTTAGGCCAATCAAAAGTTATTTGATGCTTGGCTTCTTTGGGTTTGTTGTTGCATTCGGAGAAGATGTTTATCGATCCCACAAAAAGCAGCTCAGTGTCGCCGCCTCGTCTCTCCCATTCACTGCTGCCGCCGCCGTCGTCTTTCTTCTGCTCGTGCCGCCGCCGCCGTCGTCTTTCTTCCGTTCGTTCCGCCGCAGCCTCCTTCGGTTTTCTACCCCTCGCTGTTACTGGCTGTGTAGGTCTATCCCTCTTTCTGCTCGAGCTCGGCTGGTAAAACATTTCGAGTACTTAAACCAGAAATGCCGAGTGCTCAGGAGTCCTCAGAAGTTGGAGCTTCCAGATCAATTGGCCAAAATGAACAAAATGGAAAGAATGAGCTAG MPVHSIWITIYSSESPSSFDVPYNHSPSLLSCSCLPPPPVLAVLVVGAVQSLLSLLVLAAGAVQSAGAFTLPTCALAAEFKSPPVAQCRRGVSLVHCCRRCRLPSARAATIVVFLSFVSPQSPSIFCPLLLLISVAATSFLLTVAATVIFLSSVTSQPSSIFYPLLLLEMSKKFSATLRIGDLNDFIAPSQACIVSPKRLNATATKLDKVEVSSSRKQLKSEPVKISLKDCLACSGCVTSAETVMLEKQSLDEFLSNIDKGKVVVVSLSPQSRASLAVHFGISPLKSHWSYYESSNLKIHNRANPGHTMYRVISRYIVEQLVICTQSSPERAKHPDTRPKAYVCAEVGPKDLIYHNYTTETHSRKCIGKSLWVLIRDPFENLVVKDIFEEWLEQPGSEKAKKYMHTEYHPVVKSFTTQLHNWFRPIKSYLMLGFFGFVVAFGEDVYRSHKKQLSVAASSLPFTAAAAVVFLLLVPPPPSSFFRSFRRSLLRFSTPRCYWLCRSIPLSARARLVKHFEYLNQKCRVLRSPQKLELPDQLAKMNKMERMS Homology
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94CL6 (Protein NAR1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 157.5 bits (397), Expect = 4.2e-37 Identity = 84/117 (71.79%), Postives = 97/117 (82.91%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 77.4 bits (189), Expect = 5.6e-13 Identity = 33/61 (54.10%), Postives = 45/61 (73.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4FV58 (Cytosolic iron-sulfur assembly component 3 OS=Bos taurus OX=9913 GN=CIAO3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 1.2e-18 Identity = 60/132 (45.45%), Postives = 79/132 (59.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7TMW6 (Cytosolic iron-sulfur assembly component 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ciao3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 2.6e-18 Identity = 57/132 (43.18%), Postives = 76/132 (57.58%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9H6Q4 (Cytosolic iron-sulfur assembly component 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAO3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 2.8e-17 Identity = 58/133 (43.61%), Postives = 79/133 (59.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RF36 (Cytosolic iron-sulfur assembly component 3 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=CIAO3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 2.8e-17 Identity = 58/133 (43.61%), Postives = 79/133 (59.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CNT4 (protein NAR1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012714 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 215.7 bits (548), Expect = 4.8e-52 Identity = 175/478 (36.61%), Postives = 203/478 (42.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9IEN1 (Fe_hyd_SSU domain-containing protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS52169 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 210.7 bits (535), Expect = 1.6e-50 Identity = 153/393 (38.93%), Postives = 188/393 (47.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2C9VAI8 (Fe_hyd_SSU domain-containing protein OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_09G079100 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 3.8e-49 Identity = 150/401 (37.41%), Postives = 195/401 (48.63%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KFK6 (protein NAR1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495356 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 203.4 bits (516), Expect = 2.5e-48 Identity = 107/117 (91.45%), Postives = 113/117 (96.58%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KFK6 (protein NAR1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495356 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 2.8e-15 Identity = 41/50 (82.00%), Postives = 46/50 (92.00%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 201.4 bits (511), Expect = 9.4e-48 Identity = 106/117 (90.60%), Postives = 111/117 (94.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. NCBI nr
Match: KAE8637360.1 (hypothetical protein CSA_011910 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 234.6 bits (597), Expect = 2.1e-57 Identity = 169/401 (42.14%), Postives = 203/401 (50.62%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. NCBI nr
Match: XP_022142658.1 (protein NAR1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 215.7 bits (548), Expect = 1.0e-51 Identity = 175/478 (36.61%), Postives = 203/478 (42.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. NCBI nr
Match: XP_038894944.1 (protein NAR1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 214.9 bits (546), Expect = 1.7e-51 Identity = 172/478 (35.98%), Postives = 202/478 (42.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. NCBI nr
Match: XP_034898190.1 (protein NAR1-like isoform X3 [Populus alba]) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 2.1e-49 Identity = 153/406 (37.68%), Postives = 195/406 (48.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. NCBI nr
Match: XP_024443954.1 (protein NAR1 isoform X3 [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 207.6 bits (527), Expect = 2.7e-49 Identity = 151/406 (37.19%), Postives = 193/406 (47.54%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g000010 vs. TAIR 10
Match: AT4G16440.1 (ferredoxin hydrogenases ) HSP 1 Score: 157.5 bits (397), Expect = 3.0e-38 Identity = 84/117 (71.79%), Postives = 97/117 (82.91%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 77.4 bits (189), Expect = 4.0e-14 Identity = 33/61 (54.10%), Postives = 45/61 (73.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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