Lcy10g012250 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy10g012250
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr10: 40555415 .. 40563177 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy10g012250
SyntenyLcy10g012250
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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mRNA sequence

ATGAATAATGAAGATCATAATCTTAAGGGTTCTTGTCAGCGCTTTGATGCTGTAGCGCTGTTCTTGGATGCTAATGAGAAGTCTCCTGACCTGAACAGTTCTAGACATCCAGAGAATTCTGAGGACATTGTTCATAATACTGTATATATTCCTGACCTGGCTGATGAGGGGGGAGCAGTAGACTTTAATCTTGAAAAGGATTCTGAGGGAGAACAAAAGAATGAGCAAGTCCTCTCGAATGATTCTGTATTCGAGATGGCGATGGAGGAGGATGGAATTCAGATCATTGAGAGCAGTAGACTGAAGGAGGTGAATAATGTTTCGGGTACTCTGAGTCAAAGTGAAGGTTCTAGTGGAGGATTTGTTGTTTCAACTAGAAAGAAGCTAAACTGGAAGAGGCGTGCAAGGATGGGACATATTAATGAGTCTTCAATTCAAGATCAGATGTCTAAGAAAAGGAAGTCCAGTTCTGAGCCTGAGGAAGGAAAGAAGATGATTAGACTCGAGGGAGTTTCACTGGCGTTGGTAGCTGGTTTTATCACAGAATCCGGAGCTTGGAATGAAAGTTTTCTAAATGAAGCAGTGGGTATTGATGACCTTGATATTATCAGGCGAATCCCTATAGATCTAAGGAAGTCTGACAACATTCGCAGTCAATGGGTTTTGAAATACCTGGATGAATTTGATCGTGCGAATGAGAGACGGAATATTGATAATCGGCCTTGTTCTTCCTCGGTGCGTCTCCCCAAACCTCATCACTGGTCTCTTCCCCCTGCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAATAATGAAGATCATAATCTTAAGGGTTCTTGTCAGCGCTTTGATGCTGTAGCGCTGTTCTTGGATGCTAATGAGAAGTCTCCTGACCTGAACAGTTCTAGACATCCAGAGAATTCTGAGGACATTGTTCATAATACTGTATATATTCCTGACCTGGCTGATGAGGGGGGAGCAGTAGACTTTAATCTTGAAAAGGATTCTGAGGGAGAACAAAAGAATGAGCAAGTCCTCTCGAATGATTCTGTATTCGAGATGGCGATGGAGGAGGATGGAATTCAGATCATTGAGAGCAGTAGACTGAAGGAGGTGAATAATGTTTCGGGTACTCTGAGTCAAAGTGAAGGTTCTAGTGGAGGATTTGTTGTTTCAACTAGAAAGAAGCTAAACTGGAAGAGGCGTGCAAGGATGGGACATATTAATGAGTCTTCAATTCAAGATCAGATGTCTAAGAAAAGGAAGTCCAGTTCTGAGCCTGAGGAAGGAAAGAAGATGATTAGACTCGAGGGAGTTTCACTGGCGTTGGTAGCTGGTTTTATCACAGAATCCGGAGCTTGGAATGAAAGTTTTCTAAATGAAGCAGTGGGTATTGATGACCTTGATATTATCAGGCGAATCCCTATAGATCTAAGGAAGTCTGACAACATTCGCAGTCAATGGGTTTTGAAATACCTGGATGAATTTGATCGTGCGAATGAGAGACGGAATATTGATAATCGGCCTTGTTCTTCCTCGGTGCGTCTCCCCAAACCTCATCACTGGTCTCTTCCCCCTGCTTAA

Protein sequence

MNNEDHNLKGSCQRFDAVALFLDANEKSPDLNSSRHPENSEDIVHNTVYIPDLADEGGAVDFNLEKDSEGEQKNEQVLSNDSVFEMAMEEDGIQIIESSRLKEVNNVSGTLSQSEGSSGGFVVSTRKKLNWKRRARMGHINESSIQDQMSKKRKSSSEPEEGKKMIRLEGVSLALVAGFITESGAWNESFLNEAVGIDDLDIIRRIPIDLRKSDNIRSQWVLKYLDEFDRANERRNIDNRPCSSSVRLPKPHHWSLPPA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 239..259
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 140..163

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy10g012250.1Lcy10g012250.1mRNA