Lcy09g018990 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy09g018990
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr09: 42501142 .. 42506614 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy09g018990
SyntenyLcy09g018990
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AGAACTATGGGTTACTTCCACTTCCCAAGAATATTACTTAAACCCTTAATCGAACAAAAAAAAAAGCATTATTGAAACTCACCAAAATCATCCTCCCAAAAAATACGGCTACTACTGCAACTTCGATTCGTAAGGGACGAAACAGAAGGCAGCGACAGCGATTGCAACGTTGCTGGAGCGTGAACTTCAACAGAGATAGCGTGGGTTTGTAGTTCGCAACACTTCACGGAGCTGGGTATGACGATGGTGCGGCAACCTGCAGCTGAAAGACGACGACTCAAGGATCTCCTGCTCCATGCAATCTGCTACTGTCGAAGAAGCGACGCCGATGAGGATGCGAGAGAGAGACGTGCGTGAGGGAGGGTGAGAGACGGCTGGAGAGGGAAATAAATTTCTTTTATTTTTTTCCTAGGGTTTCTTTACATAAAAAAACAAAATTCTTATAAAATAAACCCTCATTTAAAATAACCTCCTCATTTCATCTTTCCTTCTCCAATTACTCCAAAGTGATTGAGAAATCCCCAAAATTGAAAACTAAAATTTAATTTTCCTTTTAACTTTACTTAATTCGAGAACTCATGAAATCAAATAGACCTCAGAAATAATTCTCCTAATCGCAATACTAACAAAAAATTAAACTAAAAATTAACTCAAGATTGGAATAGAATTTTACCTATAAATTCGGGGCGTTACATAACCAATTGCCTAATGCTTGATCGATAGAACTTCATTGGAGTTGAAACCTATTCCAAAAAATCCAGAGTTCCGGCCGAAGGATCCTGCTGATAAAGACTGCGAGAGATTGTCTGATCAATAGAATTGCTAGAGCATCTTTTTAACAATTACAGAAGTCTTAACCAATGCATGTTTCCAATCTGTCTTCTTTATTCGTTTATATTTATGCTTTATCATTTCTTTTGTTCCAACATTATTCAAAACCCAACCAATTTATCAACCTTGAAATCACTAAAAGACTAAAACAAAATAGGTAAAGTGAGACCATTCAAGACCTCGTGGATACGATAAAATACTTATTACTTGCTGCAGATTATGTGCACTTGCATAATGTTATGGAGTAAATTCATGTCATATTTTTAATCACTCCAAAAGGCAACAGTAAATCACGTGTTAAGTTGCGTTGCATGACGCGTAATTCATGTGTTTTGGTGTGTGGCATGACGCGTAAATCATGTGCTAAGAAAGCGAGCATGGTGCAGAAACCATGTGGGGTTGCATAGTATGTTGTGTGTATACATGAAGTCGTTCTGTTGAGTCAACATGAGTCTCGTTGTTGGTTTCTCGCTTTAAGAAGCATATTATTTGTTTATTGCTTAAAAATATGTTGGATGCATGTGCCTAGCACGTTGATTGTGTTATTTGTTGCTTGATGGCTCACTGGGTGTGAGCTGCTTACTAGTACTGTGGTTGTACTGACCCCCTCCCCTTTCTCCCCCCAACATTTTCAGATTATGCAGGTGTTGATGAGTGTTATGAGCCTGGTGATGCAGATGAGAAGGCGCACGAGGAGTGACTCCACTGGCCTTGGCGTTTCTGTTATCTAGTTTTTGTTATAATTGTTATCTTACTCTTTTGGTTGTATAGGATAGTGTTTATGTTTATTTCAATCAAGGGCTTGTCTAGTTGTTTTATTTCAAGAAGTTGGGTTTAGCTATGAGTAGTTTTGTTTGAAGTTTGAACTCTTATTATTCAATAATGTTAAGTTGCTCCTAGCAAAAGAATTGAATTATTTACTAGTAAGTTATGAATGTGAAGTTGGTTGTGAACACGAGATCTGACTCCCTTGTCTGTGGAGGCTGGGTTTCTGTAGTGAGTTTATGAAGTTGTGGGTTGTTTCATATAGCAGTGTGCTTTCTTGTTTAGCAGGTGTTGTAAAAATTTTGGTTTAGTCCTATGTATGTTGTTATGCTACCGAAATTTTCGGAGCACTCGGTTAGTTTTGGTTTAGGAGTTTAGTAATGTCACTAGGATTATCTTAATAAATCCTGGGACATTACATTTAAGCTTAGTTGAAGTGATTAGCACATTAGTAAACTTTTAATTTCATCACACTCCTAGAGCCTAAAATGTAACGTCAGTAATTCAAGGTAAAAATTCAATTTCTTTAATCTTGAGTTAATTTGGTTTAATTTCGCAGATTTAGTGTAAAGTGGGAGATTTAAAAGAATGGAAAATTTGTGAAATTTTTAATAATTAAGGCTGGTATGGCATTTTTGTAAATAGATGGATGATTGAGCCAAAACCCTAGCCTTTTATATCAGTTTCTAGCCGCACGCAATCCAAGTTAAAGCAACCACCAGCTTCTTCATCTTCCTCTCTTCTTCTCCACGTGTTGCAGCCGCAAGAACAGACTTCTTCGGTTAGTTTTTTTGGTTTTCGTCTCAAGTCCTATAGCGCCAGTGTCTTCTTCAGTGAGCGTCTCAGTCCGGCGACAGTTTGTGGTCAGCGTTTGTAGGCGGCCCGGTAGGTGAGTACGTTCGTGGGTTTTTTTCCTTTCTTTTCTCTCGATCTCTCTCCCTCTAGGATTCTTTCCCTCAATTGTGGTTGATTCCGACTAGTGCAGCGGCGTACCAGCAAGCGTGTGCATGTTTTCTGATGGGGTTCAGGTGTGGGCAGTGGGATTTTGGTGCGTTTTCCGACGGGTGCTCTGTTTAGGCGCAGTCAGCGGTGGTGCGGGTCGTTGGTAGCGTTTTTCCAGAGATTTAAGAGTGGGTAAGAGTGAAAAGGTCATTCTTTGGTTGATTATTGTTGTTTGGGTGACTACCCATTGATTTTTGGTTTGTGATTTCAAGGCTGGTAGCGTGTTGGTGGTTTAATTTGTGATTTGGAGCGGATTTGAGACCCCAGTCAGCAAGTGTCATTCTGTTTTGGTAAGTTTGAGAGTTAAATCTTTTTGAAATTCCATGCCTCATGGTTGAATGTTGGTTTGTTTTAAAGTAAAATCCCAATTGACTTGAAGAATTTCTTCCCTTTGTTGTGTAGCGTGGTTAAAGGCCTTGGAGTTAAGGAATTAATTTAGTTATGTTCAAGAATATTTAAGCCAAGGTAAGTGGCTTTACTACTGGAAACTCTTAGGCTAGGTTGTGAAATTGTGTGCTGTTAGGATAGAATTTTCATGAATGATTATTTTGTGATGCATGACTCGACGACACAAGATGTAACGACGCTAATTCAAGGTGAAATTAATTTCTCCAATCTTGGGTTAGTTTGGGTTAATTTTTATTGTAGAATTAGTGAAAAGTTGGGAATTTAAATGGAAGGATTTGGTAACTTGTAATTTAATTAATTTGGGATGGCATGTTCGTAAATAAGTTGATTTTAGAGCCAAGCCCAAGCCCAAGAGTGTTTTTTAAGTTGTGCACGCAACCCTAGACTTCATCCTCTCCACCTCTTCCCTTTTGTCCTTCCCTTGTACCCGACCACAGCAGCCCCCAAGCACCCATCTTCGGCGGCAACTCCCTATGACTCTCCGACGAGCTTCGCGGCGGCGCAGCGACGGTACGACGACGGAGCAACGGTTCGTGCGCGATTGGTTGCGGCAGGTGAGTTCGCGGCTGGTTTTGGATCTATCCCGTCAGCTTCTTTCACTCGGTCTCTCTCTCTAAGTCTCTCTCTCTTTGTGCTTGCTCGGTTTCCAACAGTGGGTGCGGTGGTGTAGCGGTTTTCCGGTGGCAGCAACTTCTCCAACGAGCGGCGATGCGAATAGCAGTATTTTGGGTCATTTTTCGGCGTTTCCAGCGAGATTGAGTAGTGGGTCTTTTAGTTCCTTTGATTTCCAGCAATTTTGGCAATTGGGTAAGTGATTTTCAGTAAGATTTGATTGATATTGGAGGATTCAAAGGTTTTAATTGATTACCCATTAACCTTGGTTTTTAGTTATGTGATGTTTTAGCATTTCGAGGGCGGAATATCGGAATTATTGAAAATTTAGAACCGGTTCAGCAAGCCTTAAGTCCTCGTTGGAGTAAGTTGTGACCTCTTACATATAAGTTGGGCCTGTGGATTTAGTAAATTAAATTCTCCTAATTGTGGAATCTTATTTGGTAGAATTAAACCCTTAATCGGGGTCGTGTTTTGTATTCTTATCAAGTCATTTGGAGTTTTGAAATAAGCATTTACAAATCGAGGTAAGTGACTATATTGTTGAAATTTTTAGTTGGGAGCGTAGTCTTGATTTTTTCTAAAATTATGTGTTCATGATTGTTTTTAGCATGCATACCTTTGTATTGAAAATTTTAAAGTAAGATTATTTAAGCGTGGAAGTCTGTCATATATATTAACAATGATAAATTATACAAATTTTTAGAGTGGTGGTATCTTGAATTTTTTTTATATGATGCATAAATTTAAATGACCTTAAAGTTTCTAAAATTTAGAAAGTGTACATGAAATTGATGTACTTTAAAAGATGCCTACACAGGACTTAGGGACATGAAATTGATGTACCTGAGTCGAGGTTCGTGAAATTGACGTCCCTCCATAGGTGACACATGAAATTGATGTGTCTAGGATATGCATGAAATTGATGTATATCCCATAACTGATAAGTTTAAGATAAAATTTAGAGCTACCAAAGTAGTGGCGGATCCATAATTTTATGTTAGGGGGGGCACAAATCTGTTTTTAACTATAATATTGTATTTGTGCATAATGTACTTGTTTCTATACATAATATTCAAATGTTTAAATAACGAATTTAGTCCATAAAATTTCAAAAGTATCTAATAAGTCCCTACTCTTTAAATTTTGTGTCTAATAGGCTCCTAAACTTTATAAAGGGGCACCACTTTTAAGGGAGTTATAAGTGTTAAAGGCTGAGAAGGGTCTCTAGACGCTCTCTACCGTGGTAGAAGGTCTATGAGCAGAAGGGGCAGTCTTGTGTACTGCTAATGGGATCCAGTGGTGATCACGAAGGAACGGTCAAAGAGTTTAGAGGTGATCAGGAAGGGGAAGCAATGGAAGCGGAAGCGGTTGCAAACCAATTGGAGAGTCTGAGAATAACAACTCATGAAAGGGCAAAAATAGTGGCCATTGAAGACAATGATCTGGAAGAAGCGGACGAAGATTTAGTAGAAGCGATTCTATGCAAAATATTAACGCTAAAGACCATTAGTCCGGAGGTTTTCAAGACTTTAATGCCCAGAATATGGGGATTAGAGGGAAGAATGAAGGCAAAAACGATGGGAAAAACATCTACCAGTTTAACTTTAAATACAAAAAGGACAAAGAAAGAATTATTAGAGGAGGCCCATGGAATTTCGATAATGCTCTGATGATTTTCGAAGAGCCAAAGGGAGCCATCAAAATATCAGAGTTTGAATTTAGGTATATCAAATTATAGGTCCGTTTCCATGACTTACCCATGATTTGTTTGTGCAGGAAATGGGCTGAGGTGTTGGGAGATGCCTTAGGAGAATTTGTTGATGTTGATCTCGACGAAGAAGACAAGAGATGA

mRNA sequence

AGAACTATGGGTTACTTCCACTTCCCAAGAATATTACTTAAACCCTTAATCGAACAAAAAAAAAAGCATTATTGAAACTCACCAAAATCATCCTCCCAAAAAATACGGCTACTACTGCAACTTCGATTCGTAAGGGACGAAACAGAAGGCAGCGACAGCGATTGCAACGTTGCTGGAGCGTGAACTTCAACAGAGATAGCGTGGGTTTGTAGTTCGCAACACTTCACGGAGCTGGGTATGACGATGGTGCGGCAACCTGCAGCTGAAAGACGACGACTCAAGGATCTCCTGCTCCATGCAATCTGCTACTGTCGAAGAAGCGACGCCGATGAGGATGCGAGAGAGAGACGTGCCCGCAAGAACAGACTTCTTCGGTTAGTTTTTTTGGTTTTCGTCTCAAGTCCTATAGCGCCAGTGTCTTCTTCAGTGAGCGTCTCAGTCCGGCGACAGTTTGTGGTCAGCGTTTGTAGGCGGCCCGGTAGCGGCGTACCAGCAAGCGTGTGCATGTTTTCTGATGGGGTTCAGGTGTGGGCAGTGGGATTTTGGTGCGTTTTCCGACGGGATAGAATTTTCATGAATGATTATTTTGTGATGCATGACTCGACGACACAAGATGTAACGACGCTAATTCAAGCAGCCCCCAAGCACCCATCTTCGGCGGCAACTCCCTATGACTCTCCGACGAGCTTCGCGGCGGCGCAGCGACGGTACGACGACGGAGCAACGGTTCGTGCGCGATTGGTTGCGGCAGGTGAGTTCGCGGCTGGTTTTGGATCTATCCCGTCAGCTTCTTTCACTCGTGGTGATCACGAAGGAACGGTCAAAGAGTTTAGAGGTGATCAGGAAGGGGAAGCAATGGAAGCGGAAGCGGTTGCAAACCAATTGGAGAGTCTGAGAATAACAACTCATGAAAGGGCAAAAATAGTGGCCATTGAAGACAATGATCTGGAAGAAGCGGACGAAGATTTAGTAGAAGCGATTCTATGCAAAATATTAACGCTAAAGACCATTAGTCCGGAGGTCCGTTTCCATGACTTACCCATGATTTGTTTGTGCAGGAAATGGGCTGAGGTGTTGGGAGATGCCTTAGGAGAATTTGTTGATGTTGATCTCGACGAAGAAGACAAGAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGACGATGGTGCGGCAACCTGCAGCTGAAAGACGACGACTCAAGGATCTCCTGCTCCATGCAATCTGCTACTGTCGAAGAAGCGACGCCGATGAGGATGCGAGAGAGAGACGTGCCCGCAAGAACAGACTTCTTCGGTTAGTTTTTTTGGTTTTCGTCTCAAGTCCTATAGCGCCAGTGTCTTCTTCAGTGAGCGTCTCAGTCCGGCGACAGTTTGTGGTCAGCGTTTGTAGGCGGCCCGGTAGCGGCGTACCAGCAAGCGTGTGCATGTTTTCTGATGGGGTTCAGGTGTGGGCAGTGGGATTTTGGTGCGTTTTCCGACGGGATAGAATTTTCATGAATGATTATTTTGTGATGCATGACTCGACGACACAAGATGTAACGACGCTAATTCAAGCAGCCCCCAAGCACCCATCTTCGGCGGCAACTCCCTATGACTCTCCGACGAGCTTCGCGGCGGCGCAGCGACGGTACGACGACGGAGCAACGGTTCGTGCGCGATTGGTTGCGGCAGGTGAGTTCGCGGCTGGTTTTGGATCTATCCCGTCAGCTTCTTTCACTCGTGGTGATCACGAAGGAACGGTCAAAGAGTTTAGAGGTGATCAGGAAGGGGAAGCAATGGAAGCGGAAGCGGTTGCAAACCAATTGGAGAGTCTGAGAATAACAACTCATGAAAGGGCAAAAATAGTGGCCATTGAAGACAATGATCTGGAAGAAGCGGACGAAGATTTAGTAGAAGCGATTCTATGCAAAATATTAACGCTAAAGACCATTAGTCCGGAGGTCCGTTTCCATGACTTACCCATGATTTGTTTGTGCAGGAAATGGGCTGAGGTGTTGGGAGATGCCTTAGGAGAATTTGTTGATGTTGATCTCGACGAAGAAGACAAGAGATGA

Protein sequence

MTMVRQPAAERRRLKDLLLHAICYCRRSDADEDARERRARKNRLLRLVFLVFVSSPIAPVSSSVSVSVRRQFVVSVCRRPGSGVPASVCMFSDGVQVWAVGFWCVFRRDRIFMNDYFVMHDSTTQDVTTLIQAAPKHPSSAATPYDSPTSFAAAQRRYDDGATVRARLVAAGEFAAGFGSIPSASFTRGDHEGTVKEFRGDQEGEAMEAEAVANQLESLRITTHERAKIVAIEDNDLEEADEDLVEAILCKILTLKTISPEVRFHDLPMICLCRKWAEVLGDALGEFVDVDLDEEDKR
Homology
[Close]
BLAST of Lcy09g018990 vs. NCBI nr
Match: KAG6591872.1 (hypothetical protein SDJN03_14218, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 5.5e-04
Identity = 33/80 (41.25%), Postives = 45/80 (56.25%), Query Frame = 0 

Query: 207 MEAEAVANQLESLRITTHERAKIVAIEDNDLEEADEDLVEAILCKILTLKTISPEVRFHD 266
           ME +  + QL  L++T  E  K+V  EDND++E+DE L  A  CKILT K I+ +V    
Sbjct: 1   MEEDQFSKQLGKLKLTEEEEGKVVDAEDNDIDESDEVLENASACKILTNKIINVKVVKTL 60

Query: 267 LPMICLCRKWAEVLGDALGE 287
           +P I  C  W E+    L E
Sbjct: 61  MPKI--CNLWKEISTFELAE 78

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lcy09g018990 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy09g018990 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy09g018990 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6591872.15.5e-0441.25hypothetical protein SDJN03_14218, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Lcy09g018990 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy09g018990.1Lcy09g018990.1mRNA