
Lcy09g016260 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTAAACTGTTAAAGTGGTTCTTATTCTACTTATTCTGGTTATGTTTTGGTTATTCTATTATTGTAATTAACCTTTGCTCTTTGTTCACAATTCTCAAGTGAATAGACTGTTTTTCTAATTTGAGCAATATTTCTTCTTTCCTTTAGTTGTCAATAAAATATTTCATTTATGAGCCAAGTGAAAGCCTCCAACGGTGAAGTTGTCAATTGAAGAAATGTTGGATGATTGAGTTAGTTGAGTTGTGTATTTTGGAGCAGTGGATGGCATTTTTTTTTATTGAACTTCCTGTTTTTGCCTTTGCAATCAAGAATTTGTGAAGGAGATTTATGCTTTATTTATTTCAGAAAGTGCAATGGCTGCTTATTTATGAAGCTTCAAGGGATTGGTTGGTTAGTTCTTATACCACTTTGAATATTGTATTCAAGCTTAACTAAATAAAGTGAAATCATGAACTAAATAGTTAGATAAATACAAATAACTGACTTAGGATTGTTTATTGAAATCTTGGAATTTATTTTTTTGTATGTGTGTATAATAAAAAATCTATTCTGACACGGAAGAAGTTCAAATCTTCCACTGTTATTGAATAAATATCAGTTTTAGTTTATATTTGTAATTCACTTGCATATTTCTAGTTCTAGGTGTTGCTTCAGTTGAATTTATTGATCAAAGAGAGCTTGTGGCAGTTAGGTGTTGTTATTCCTACGATCAAGCATTTGACTGAGAAGGGAGCTAAAGTGCTTCTGTCTAGCCATTCGATAAGTGTGCTTTTGGGACTTCTTTCTTTGGCTTTTGTTTTGCTGTGTATGGATGTTGATTGATGAATCTGGAAGATGGTAGCTATTAAGCATTTGAAGCAAAGCTTCTATCTTCTATTGTTACCTTTTTCAAGCGAATTGGAATTACAGCCCCAGATGTTGGATTCAAGGTTTCCAGTCGGAAGGTATTTTTTTCTGCATCTTATGTGATCTCCAATAAGTTTAGTTCTTGTTTTAGTAGTTATTAAACATTCAATCGTGAATCAAAGAGTTTCATAGTTATAATTTGTGTAAATGCCTTATGTCTTTGGTTTGATGGTAGGTTTTGCAAGAAGTATTAAAATGCTATGGAATACCTGAAAATCTGTTTGGCAAGGTTTGCATCATCTTAGACAAGGTTAGTGATCTACAATTTCAAGTTCCATAAATTTTTATATTTTTGTGCCCTTTCCCTACGCATGTCTGAATGTAATAATGACTACTTTCTTTGTTTCCCTCTGGTTGTTAATCTTAATAACATATAGAGAAAATTCCATTGGATGAGATGAAGAAGGAACCAGTGTTTTAAAAGGCGCGCGCTCGGTGCAAGGCGCAACGTTAGCGCCTCGCATCAAGCGAGGCGCAGTGACCAAGTACGAGGCGCAGCGAGACCCCCGTACTTGGTCGTTCGGAGTGTCAAATATCATATTCAAGGCATATATTTTTTGTGGAGTATTGACATCATCATACTTGGTCATTCGGAGTGTCAGAAGGCATATTAACAATACTAAACTCACCGTTTTTTGTGGAATATTGACATTTGACTCTATGTTGGAAGACTAATATTTGAACCTTATTTATCTTTTATCTATTTTTCTTGATTAAAAACTTCATTACTTGCCATGAAAGTGTTTTATATACATGTATATATTTTTGTAAGTTTTTTTTCTATATAGTGCGCCTTAGAGAAAAAAAGCCCGCGTCTTTTTGTGCGCCTTGCGCCAAGGCCCCAGGAGGCCATTGCGCCTTAGTGCGCCTTGAGCCTTTTAAAACACTAGAAGGAACTGAAGGTCGTGGGTGTATCAGAGGAGGCTATTGAGGAGCTGTTGAAAGTTCTTTCAGTAAAGTTTTTGACAAAGTTAGAAGGTTATTTTCATAATGCTTTAGTCTTTGACAAATTAGTTGGAATGCATGTGTAACTCCAATGAGGGTGTTGAAACTGGTTGAAGTGTGATTGTTATTCTTGCATAGAAATATTTGGAGGTGGTGGCGAAGCGTTGTCTGATCTAAAGCAGCTATTTTCTCTTGCTGAAATGTTTGGGTATGTTGATTGGGTCCAATTTGATGCATCCATTGTTTGTGGCCTTGCTTATTAAACTGGTATTGTTTATAAATATTTCCTTTTGAACTCTATCTTCATATAAAATAAAAGTTAATAACTATATTCAATTCTTGCTTATTGTTTTATAGAAATAATTGGGAAATCGATCAAAGTTGTATTATTGTCTCTGGTTCTTGTATCCGTTAAATTAAGTATGAAAATTGTTATTTTTGGTCGTGCCTTTCTTATTTTGAGGATTTTAAGTGTAAGTGTTTGTAATTTTGAGGCGTTGGACATGACTTGCAAGTGCAGGACTTAATCTTACCTTTTTTTTTTGCCTAACTTTTTTTTTTAGACTACTCTATCTCTTGCTTAACTTGCAGATGACAGTCAATTACATGAATGGGCACAATAATGACATGTTTTTGCAAAGATGTGACTTTTCATCTCCCATGGTAATTTTCTTTGAAGCACTAAACTTTCCCATATATATTTGAGTTAATAATGCAATTCATTTGTTTTTCTTAGGTTCTTCGAGTTGTTGGACATATGTTTGTTATGTGAGTTCTTGTTTTGGCGTTGTATCGAACCTAATTACAATTTGTTTTTCTTAGGTTCTTCAAGTTTGATGTACGAGCAAGAATGAAAGTGGCATGTACGAGAATTTTTGTTTTTTGGTGTAGGTGTAGACTTTTAATCATAGGTGTTTAGTAATTTTGAGGCTTTTAAGTGTAAGTGTTTGTAATTTTATTCATATATCAAACTTATATGAGTAAAAATTGTATGAACAAATTTGGTTCATTGGCTTATTGAAATGGAATTTGACAAATATTTGAGTTCTATACAATTTTGCACATTTAAGATTAAGATTATTTTCTTTACAGGTTGACAAATGAAGAAAATATTGTAGGTATGCCACCAGGCAACCAACAATTTGTTTTATTAAATTATGAACAAAATGATGACGGGCAATGCCTGTCATTAAAAAAGATATTTAATGACGAACTTTTAATGACGGACATCTTTAATGACGGACATTTGGTTGAAAAATATCATTTCAATGACGGACGCCTTTTGATGACGGGCAATGCCCGTCATCAAACATCTGGTCGGTTGGAAAACACCCTTTAATGACGGACTTTTCATGACGGGCGACTTTTAATGACGGGCAATGCCCGTCATTAAACATCTGGTTGGTTGGAAAATACCCTTTGATGACGGACGACTTTTAATGACGGCCAATGCCGGTCATTAAAAGTCGCCCGTCATAAAAAGGTACGACCACACTCGTATAGAAGACGGACAGTGCCCGTCATGAAAAGTCTTTAATGACGGGCAATGCCCTTCATTAAAAGTGGTTTTTGTAGTAGTGATTTCTCACTTAAGCATTAATGGATCAATTAGTCAAAGCATGTGGTCGCTGCAGCAAAAGCATTGATAGTCTTGTCATATGATATTTTCTTTAATCTCATCGCATAGTTTATGTTTTATGCACTGTTTATTCAACCATTTTCAATCAACTCTTTTTCCTCATAATAGGATACCATGTGTACGAGGGTTTAGTCAACAAGTTATTAAAAATCTTTAACCGCCCTTCCCTGTGATTCGATCCTAGACTCTCTAGGTACTACTTGATTGTGTGGTAATTTATACTTGGGTTATCGCATTTCAGCGACAATTCTGTATTAATTAATCGACCTTCTGTCAAGCGATCAAGTTTTGGCGTCGTTGCCGGGGAAGGCAACCAAGTTTTTAATATTCTTTTTGATCTAACACTCCGTTTGGTATTATTCGGCTTGTTTCCTGTTGAGTATTTGTCTCCAGGTAAGCAAGATTGTATGCGTGTTGGTCGCCATATTGATATTGAGATCGACCCTGAGATTGATCGAACCTACCATCGAAGACGAAGAAATCGGCGTGCTCGAAAACCAGTAATTGAGGAACCAAGAGAGATTGCAGCACCAACCCCACAAAATCTGTCAGCAAACCCCATACAAACGGCTGATGATAGAGCCAGAGGAATCAGAGATTATGCAGCCTGATGTGCAAATTGCTAACCGCAAGTGTACGGGTAAAGTAATAATATAGTGTTTTCGTGTAAAACGAGTGTCGTCTTCTGGATTGGTTTTCTAGCAAATTAAGTGAAGGGATAAAAGCCCTTTCGCAGCGGAAACGAACAGAACCTTAACTCAGTTTTAATTTGAACTAAAATATCGGTACGTTGGAAAATAAAAAAACACAGCAGTAAACATAATTTAACATGCTGAATTTTAATTATAAAACATGCTTTCACCTTAGATCTAATCTAAATTGGATCCTATTGATCCAAGATCAAGAACGCTATACCTTTGTAGACGATCTTGATCCGTTTCGCCTTTTCCCTTACTATTTGCATAAAATTCCAGCAGCGAAAAAGTCTTGATCTCGCTGGAAAATTATCACGAACACCACCACCAAAGATTGCACCAGTATTCTCTTCAAGGATGTGCGTTAGGGGCTTGTGGGAGCGTGATTTCTAAGAGATGGGAAGAATTTTCTTCTCTGTATTCTTGATAGAAAATCACAGAGAATTCTTGAGAGAGTTGGAGAGAGCGAGAGCTTTTCGTGAGTGCTTGATCGATGTAACCAACTGAACCAAAAAAGATTATATTGAGGGAGTGGTTATTCAACGGATGAAAACCACCACTCCCTAAAATCTCTCCCTATCAAGCGTGAGACCTAGGTTAGTGGACGAACAATTCCATCAGTTACTTTAACTGATGGAATAATTAATTTAATAATAATATTAAATTAATTTAATTAATTAAATTAACAATTAATTTAATAATCATATAAACCCTTTATAATAATTCCACATAACCTATTGTTTTAATAAAATTTAATTAAATCAAATTTAATTAAAGTAATTAAAACTAATTATTAATTAATATAA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BLAST of Lcy09g016260 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Lcy09g016260 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Lcy09g016260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EG18 (Histidine--tRNA ligase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111433048 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 1.4e-10 Identity = 34/38 (89.47%), Postives = 37/38 (97.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy09g016260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ECF7 (Histidine--tRNA ligase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111433048 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 1.4e-10 Identity = 34/38 (89.47%), Postives = 37/38 (97.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy09g016260 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Lcy09g016260 vs. NCBI nr
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BLAST of Lcy09g016260 vs. NCBI nr
Match: XP_023544233.1 (histidine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 2.9e-10 Identity = 34/38 (89.47%), Postives = 37/38 (97.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy09g016260 vs. NCBI nr
Match: XP_022978407.1 (histidine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 2.9e-10 Identity = 34/38 (89.47%), Postives = 37/38 (97.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy09g016260 vs. NCBI nr
Match: XP_023544232.1 (histidine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 2.9e-10 Identity = 34/38 (89.47%), Postives = 37/38 (97.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy09g016260 vs. NCBI nr
Match: KAG7034545.1 (Histidine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 2.9e-10 Identity = 34/38 (89.47%), Postives = 37/38 (97.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy09g016260 vs. TAIR 10
Match: AT3G46100.1 (Histidyl-tRNA synthetase 1 ) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 9.8e-12 Identity = 30/38 (78.95%), Postives = 36/38 (94.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy09g016260 vs. TAIR 10
Match: AT5G03406.1 (Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein ) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 2.8e-11 Identity = 29/39 (74.36%), Postives = 35/39 (89.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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