Lcy08g009560 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy08g009560
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr08: 26143690 .. 26147269 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy08g009560
SyntenyLcy08g009560
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGATCCTCCATTCTCTCTCACGCTCAAAATTTCTTGACCTTCTCAGAGTGGTTCACATCGCATCTCTTAATGCTAGCAGTGGCGTTCCAATCTCAGTGGCGTCTACAAGATTTCTTGAGGAAGGCGTTCCAATCTCAATGAGGCTCAAATTTCTTGAGGAGGCGTTCCTATTTCTCTATTTCTCTCTGATTCACATTCCCCAATCCCACCTTTCAAGATTATTTGTTCTTCTTCTTTGCCTTGTTCTTCATCAGGTAAGACTTCTCAAGATACATTTCTATTTTGTGTTTGTTCCCTCTGCTTTTTTTTTGTACTGTTTGGTAGAATTTATCCACAAGTGACGGATCTCTTAATTTAAGCGGTGGCTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTCTTCCGTTCTAGTAATGTTTGATGTTCCTAATTTTCCGTCTTTTATGGCTATTCTCGTTAATCCCCAGCATTTGACTGTATGTAGCATGAGAGCCAAACCCAAGATCTCTTCGGTCAAGCCCTAGCTCAGAATATCCCACATTTCTATTCCAGGTAGGTCTTCAAATTGAAGGACTTATTGGGACTTTTTGTTTTGCTATTGTTGTTGGTAATGGTGTTGATGTTTGATTTTTGAGATTCAATCTTAGGGATTCAAGGAAATTACATCTCTCTCAAGTTTATCGAAGTGCAAGTTTGTTATGAAATTAATTGTGATTATCGATTTTTGTTTCTCTGTGCTGTTGTTGTTTGTTTTGAAAGTTTTGATCAAAATCGCCACTCTGAAAATTGCGGGGATTAGCTTTGCACTCTGAGCAAAGGAAAATGAACTAGAAGAAATTACTGTTTTTTTTTCTTTTACTAATTTGGAGAAGGAATTAGTTGATTTTGTATTATGAATAAATAGTTAGACAAATTTGAAGTTGAAGTTTAATTCTATAAAGTTTATTGTATTCTTTCAATTCTCTGTGTTTCTAAGAAAAAATTGTTGTTATGTTTGAGATTCATGTTTTGGTGAATACGTAAAACTGTACTTAACAATGAGAATTTAGATACCAAAATCTAGAAAAAATGAAATCTTTTAGGCTGATGGAATTGAAACAGTAGTCACTCCCCACCTGTTTGTCTTTTTTGCTTAAAAGCTGAAGAAACCATGGAACATCTTTTTTTGAATTGCCCGTTTGCTGTAAATGGGTGGGGAGGGTCTCAATTGTTATTGATTAAAGAAACAATAAAGACAATTAGTTAAGTGTAATCTTGAGTTTGAGCGTGAGAGATATTTGAGTTTTAAAGAAACAATAAAGGGTCAATTGTTCTTGATTCATGTTTTGTTGCCATGATATTTGAGTTTTATTATGAGGTGTTATCTTGAGTTTAGTTGGGTTGTCTTGTAGGGGTTTTTTTCTCTTCTTTTACAATTTTGAGGTAAATTAATAACTCACTAAGTATTCCTTCTAGAAAAATATCAATTTTACCTCTGTAAAGTGTAAACTACTCAGAACATTCTAGTTATCTTCCATTTAGAATAAGACTTGAGGTTGCTGTGATTGGGAAAAGTGAAAATTTATCTGGGTATTAATGCATCTTTTTACTTTCATAGTGTTATATATTCACATATTGTTGGAATAGCATTTAAGCTTAATCAGTTCCAGAAACAAATTTCTATTTGGAGCTCTCTGTCTGTTCTCTATCTTTCTCTCCAGCCACTTTGTGTTACTATTATCTTCCTTTTCTTTTATTCAATGATTAAAAATACTTTCTTTTCTTACCTAATATCTCATACTTCCTTCAATTTGAAGGAGTCTTCTTAGTGATGGTAAGTGTCCTCTACAATTTCCTTTTGTTCCTCTCAACCCCATCCCTTTGATTTCAAATCTCAGAAAACAATTGTGTCCAAATTTACGATGATGGAAAGCTAAAATTGGAGAGTTTGTACATGGTTTGGTGTATGGATTCAATTAAGCAACAAAATGAATTAGTTGTCTTGTTTGCTTAAGCACTTGTTTTGAAATTGTTTAATTGGAATGTTATGTCATTGATTTGATATTTTATGTGTCTGAAATATTGAAGAACATTTCTATAAGTAAATAGTTTCCTTGAAATTGTGTTGGGCTTCCCAAATAGAAGTGTTTGATATTTGTGATGAAGTGGGTGGATTTTTAAGTTTATATTGTTACTTACCCTTTTTATTGTTGTTGTTTCATATGTCCAATTACATCTCCATTTTTTTTTTCTTGTCTTCCTGGCTTGCAGTTTCCTAGGATAAAGTTGCTGAGCTTTTGGAGAATTTAAATGATTAAAAACCACGGTGAGTCCATTAACTTTTGGAACCTTATATTTGTTAGTACTGTCAACTCTTGCTTCTTGAGATTGTAAAAATAAGCATAAGAACGCGATGATGTATAAGATATACTATGTTCGAGCTATATAACTTTCAAATGGCTATTAACATATAACTAGAAGTGTAATGTCCAGATTCTTAATTATGTTTTCCATGTTTAGTGTTTAATGTCATCTGCTTCGCATCTTTTATTGATGTTCCATCTTCCAGGATCGCTACAGTTCCACCAACAGAAACAGTTTTGATGACTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTGATTTTCGAGTGAGTTCTGCAGTTGTTACAGTTGATAACAAGCCACAAGGAATTCTCACGTGAGTACCATCATATTTCTTCTAAACTTGGGACTTTATACTTGCATACAGTTTCAGGTATCCTGATATTTTGTCTTTTGCAGTTCAAAGGATATTTTGATGCGATTAATTAGCACAAAATCTTCAACCAAAATCCACACTTGTAGAGAAGGTAATTTCTTTCAGCTAGCATGGACTATAAAGGACAGTGTATCTCCCCCCTTCATGGATCCTGTCTTTAGTGTTCTGTTGGTTAAACTGAAAGGTGTGCTGATTTGGATTGGGGTTGGGGGCAAGATAACTACAACAGAAATGGCAAGAAAGATAGATATAAGAGAAACACTACTCTGTATCTTGTAAAATTTGTTTTTTTATTCCTAGGTTGTTTTTTTAATATTTATTTTTAGAGTAGTAATTAAACAAAAAAAATAAATGGTGAGGTTTACACACAAAACCATGAACACAAGTGCTTAGCTTTGTCTACTAAATAGAGTTTTACAACCAAAATGCTCTAACTAAAAAGGAAGGGATATACACAAAAGACATAAGATAAATGTCAATGGTAACTAATAAAAAAGGGGTTCATCAACAATTAGAGATATTGCTTCTAAGGAAATAAAAAGAACAAATTGTTGTTCAATCTGTCAGGTGCAATATGTGTTGTTAATAGCATGATTCTTAATGTCAGATTCTTCTTAATGTCATGTGCAATATGACTTCATAGATTAAAGTACATAGTTTACAACTAGAGTTGTAGTTTAATCTCTCTTCTAAGTTCTTCTTTTCCCTTATTCATTTGTTGTAATGTTTTCTATCACAATGTTATACTTGTTTTATTTCCTTGGTCTATTTTACATTATCAAAGTCGAGGTCTCCACTCTAATCTTTTCCCTTTTTTATTTGGGAACTTAGCTATTTAGGAAAGATGTCTCATATA

mRNA sequence

ATGATCCTCCATTCTCTCTCACGCTCAAAATTTCTTGACCTTCTCAGAGTGGTTCACATCGCATCTCTTAATGCTAGCAGTGGCGTTCCAATCTCAGTGGCGTCTACAAGATTTCTTGAGGAAGGCGTTCCAATCTCAATGAGGCTCAAATTTCTTGAGGAGGCGTTCCTATTTCTCTATTTCTCTCTGATTCACATTCCCCAATCCCACCTTTCAAGATTATTTGTTCTTCTTCTTTGCCTTGTTCTTCATCAGCATGAGAGCCAAACCCAAGATCTCTTCGGTCAAGCCCTAGCTCAGAATATCCCACATTTCTATTCCAGTTCAAAGGATATTTTGATGCGATTAATTAGCACAAAATCTTCAACCAAAATCCACACTTGTAGAGAAGGTAATTTCTTTCAGCTAGCATGGACTATAAAGGACAGTGTATCTCCCCCCTTCATGGATCCTGTCTTTAGTGTTCTGTTGGTTAAACTGAAAGGTGTGCTGATTTGGATTGGGGTTGGGGGCAAGATAACTACAACAGAAATGGCAAGAAAGATAGATATAAGAGAAACACTACTCTGTATCTTGTAAAATTTGTTTTTTTATTCCTAGGTTGTTTTTTTAATATTTATTTTTAGAGTAGTAATTAAACAAAAAAAATAAATGGTGAGGTTTACACACAAAACCATGAACACAAGTGCTTAGCTTTGTCTACTAAATAGAGTTTTACAACCAAAATGCTCTAACTAAAAAGGAAGGGATATACACAAAAGACATAAGATAAATGTCAATGGTAACTAATAAAAAAGGGGTTCATCAACAATTAGAGATATTGCTTCTAAGGAAATAAAAAGAACAAATTGTTGTTCAATCTGTCAGGTGCAATATGTGTTGTTAATAGCATGATTCTTAATGTCAGATTCTTCTTAATGTCATGTGCAATATGACTTCATAGATTAAAGTACATAGTTTACAACTAGAGTTGTAGTTTAATCTCTCTTCTAAGTTCTTCTTTTCCCTTATTCATTTGTTGTAATGTTTTCTATCACAATGTTATACTTGTTTTATTTCCTTGGTCTATTTTACATTATCAAAGTCGAGGTCTCCACTCTAATCTTTTCCCTTTTTTATTTGGGAACTTAGCTATTTAGGAAAGATGTCTCATATA

Coding sequence (CDS)

ATGATCCTCCATTCTCTCTCACGCTCAAAATTTCTTGACCTTCTCAGAGTGGTTCACATCGCATCTCTTAATGCTAGCAGTGGCGTTCCAATCTCAGTGGCGTCTACAAGATTTCTTGAGGAAGGCGTTCCAATCTCAATGAGGCTCAAATTTCTTGAGGAGGCGTTCCTATTTCTCTATTTCTCTCTGATTCACATTCCCCAATCCCACCTTTCAAGATTATTTGTTCTTCTTCTTTGCCTTGTTCTTCATCAGCATGAGAGCCAAACCCAAGATCTCTTCGGTCAAGCCCTAGCTCAGAATATCCCACATTTCTATTCCAGTTCAAAGGATATTTTGATGCGATTAATTAGCACAAAATCTTCAACCAAAATCCACACTTGTAGAGAAGGTAATTTCTTTCAGCTAGCATGGACTATAAAGGACAGTGTATCTCCCCCCTTCATGGATCCTGTCTTTAGTGTTCTGTTGGTTAAACTGAAAGGTGTGCTGATTTGGATTGGGGTTGGGGGCAAGATAACTACAACAGAAATGGCAAGAAAGATAGATATAAGAGAAACACTACTCTGTATCTTGTAA

Protein sequence

MILHSLSRSKFLDLLRVVHIASLNASSGVPISVASTRFLEEGVPISMRLKFLEEAFLFLYFSLIHIPQSHLSRLFVLLLCLVLHQHESQTQDLFGQALAQNIPHFYSSSKDILMRLISTKSSTKIHTCREGNFFQLAWTIKDSVSPPFMDPVFSVLLVKLKGVLIWIGVGGKITTTEMARKIDIRETLLCIL
Homology
[Close]
BLAST of Lcy08g009560 vs. NCBI nr
Match: KAG7023057.1 (Non-specific phospholipase C6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 2.0e-07
Identity = 32/45 (71.11%), Postives = 38/45 (84.44%), Query Frame = 0 

Query: 118 STKSSTKIHTCREGNFFQLAWTIKDSVSPPFMDPVFSVLLVKLKG 163
           S KSST+IHTCREGNFFQLAW+IK+ ++ P   PV +VLLVKLKG
Sbjct: 277 SAKSSTRIHTCREGNFFQLAWSIKECIASP---PVSTVLLVKLKG 318

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lcy08g009560 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy08g009560 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy08g009560 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7023057.12.0e-0771.11Non-specific phospholipase C6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
BLAST of Lcy08g009560 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy08g009560.1Lcy08g009560.1mRNA