Lcy08g008850 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCTTTATCATCCTCAGCCACTAATTTTGCGCAACTTGTCAAAATCCAATGCAACGACCTTTCTCTATTGCCTTCTTCACTTGTTTGCAGCCTCAAAAATAAAAACTCGCTCGTTTTTATTTTTTTGTTTCTTTTTTATTTTTTAAGTCGAAGCAAAATCCAGAAGAAATTATAGTGGCTGAGATTGCTCCGACGCCTCAAACTGTAATTTCCGGTGCGTTAGGTCTCATACAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAACAGAGAAGAAGAAACTACTCTGTGCTACTACTTCGCTCTCTCTGCAAAAGTTTTGATTTCTCATCTTCAGATTCTTCTTACTTTTTCGTCCAATTCACGTTCTTAATCGCCGGAAACCATGAGTTTTCTTGTGAGTTTCTGCTGATTTCACTCTCATGCATGATCGGAGTGGCCACTGTTCCTTTCCGAATTACCTCCAACCATGGCTGTCTTCGAAGGTACTGTTGTTTTTGTCTTTCTTTCTCTAGGGTTTCTTCTTAATTCTTACTCTTAGTTTGGTTGCCGAGAAAATTTTTAGAAACGGATGGAGTTCTCTTTTTGTAGATTGAATTACTTGGTGCTGCTTAAGTTAGCTGATTATTTTATTTTTTATTTTTTTAATTATTCGGTTTCTAATGTTTTCTCGGCAGCTAAATGGATAGTTAACTTGACTTTACCAGATCAGTATTGTTACGATGCATTACTGTGAGGTGGAGGAAGTAGTTTGTTGATTACTGATTTGAATTTTCTCTCTCTTTTCTACATTCTAAGGTTTTGGCGTCTTCCAGTTCGTTTTGGTGAGGATTCTGAATAAGGAATTTTCATTTTAAGTTCTTTTTCGGCGAAGTATCTCTAACTTGTTGCGGTGGCTTCTGAAAATATTTTTCTTTCAAGTTCTATTTTACTATTTCTTACAATATTAAAAATTTTCCATCAAAATCCCCTGATTCAGTTAAATACGAATTTTTTTAATTTTGTTTACATGAAAAAGAGACGGATCGCTACCGATTGCTGTCGCTTTTTTTCTATTTTGCAGTAGCATCAAGGAGCCAGGTGACAAAAGCAACAACGGCTTCATCATTTAGAATTTTTTATATCCCTAACAATGAAAGGAGGTTTGCGTTTTACCCGTTGCTCGTTAGAGAGGATTTGAAGCAGCGGCAGCTGCTCAGGTCCGTCGATGGATCCCAACTCCTCTGGAGAAGACTTGGTTTTTAAGGTGATAATCCCTTCCCCTCTCTCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGTTTAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAAGGGTTGAAAAGGAAAGGGAAAACTGTGTATAACTGAGGTCTGAAGTCGTGTATTTATTCATATGATAGACCAGGAAGCCATATACTATTACAAAACAACGAGAGCGCTGGACGGAGGAGGAGCACAATAGATTTCTAGAGGCGTTGAAACTCTATGGCCGAGCATGGCAGAGAATTGAAGGTTATATTTTGCTCAGATGTCACTGTCCCTCTTGACTCTTGTTCATTTCGTAGTATCAAACATTGTTTGGATGAATTATATACTTTGTGATATATGATGCAGTCATGCAGATATAATTACCGTACAGGTAGTTAATCGGAATTTACTTTAATTAAAAACTCGATGATCTGTGATACAAATTTATGGTTATTTTGGAGCTAATTTGATCTGGATACATCAATGAGTGCTATTAAGTTAATATTGTCCCCAAAAGGGTACCTGATTCTCCACTATATGCTTTTATATGCAGAACATATTGGAACGAAAACTGCAGTCCAGATACGAAGTCATGCACAGAAGTTCTTTTCAAAGGTCAATGGGTACCCTTCTCTACTTATTCTTATTTTACGGTTTTGCTTCTTCTTGGTTTGTGGTCCATGATTTCAATGATGCTTTTATTTTTATGAAATATTGTATTTTGGCAAACTTGTTTCCTTTTGTATTCTTTTTTTGGTCCAGTTGTTTAGTTCATAATCTTGCTTACTCATCAGTAGGGACATTCGAGCAATTCTTACAGGTAGTTCCATTTTTTTAAGGGTTGCAAGTATTTCCATTGCGATAATGGCTTAGTTTCCTTGATCCTGTATGCTTGTTTTTTTACGTACTGATTATAGATGTTGCTATATCTGTAGTATGGTTACTAACTAGAATTAGGGTCCATTTGGAATGCCTTTTAGTTTAAATGTTTTTCAAGAATGCATTTTATTTTAAACATTTTGTATAAAAATTGTTTAGAATTTAAACACTCATATGTTTGGTTACATTTCCTCATAAGTGTTTTTATACTCAAGTTATTATATACTAAAAACTCTTTTTAAAAAATTTGGTTTCAAGTGTTTCTCTCAAAATGATTTATTTCTCAATCTCATTTTTTGATAAGTTACTTTTAGTGGTTGCCAAACACTAGAATTTTTTTCAAAATGATTTTTTGTTCCAAAATTAAACACTTGAAAAGTTAAACCAAACACACCCTTAGTTTGACAACATTCACTATACTGATAAAAATGATTTATATCTCTTTGAGGCATTGACATCTGACTTTTGAGGTAAACAAAAAGGGTTGAACGAGAAGACATTTTCCTCAAAACATTCAAATCAAGTTATTGTACTGAATCCGTGGAATCCTTGGGCTCAGGATGAGAGTTCTGAAGTTTTCTGGATTGTAGGGTATTAATTACCAAACGCTTACTGAAAGCTCCAAGCTAACAGGAAAGATTGCACAGTTCAAATAGTTTAAAGAATGCGGGCACAACTTTTAGTGGCACAACACAAAGGAGGGAATGGTGATAGAATGAGTTAATAATTTCACAAACGGACAAAACCTAGGTTCTCAATTTACAATGAGGCCTTGAGGGAAGGATTCACATAAGAAGATCATCACTTTCCCATTTATGTCATGGAGTTAACTTTCAAAGGAAATATGAGTTTGACTTGTTATCTAGGACAAAAATGTTGGGGGCTAAATCATGTATTACATCAATGACGTGTAATTTGGAACTCATGAAAGCAAAGAGTTGTTTAAAGATCCAAAGTAACGTAGAGATATCAACTCTGGCTTGAGTTAGGTTTTAGTATCTCATCTTTAACTTAGAATAAATTATGGTGTGATAATCCAACGACACTGGAAGTGGAAGATAAGTGCTTAGCTTGGAGGGAGCATTTTGATTTGGCTAGTATTAAAAACTTATCTTTGGTGTTCTTTGTCTTCTTTGTCTGCTAATTATTCTTTTGACTATATTTGTCTTCATTGGGATGCATTTCTATCCGCTTGTTAATTTTTATTTTGTTTCTTTCCCCAATTTGGGGTTTGTATTTTTGAACATTTTCTGTTTCTTTTCATTAATCAATGAAAATTTTGTTTCTTGTTCAAAAAAAGATAATCCAAGGGCACGTATCAGTATTTCATGAGTGAATTAAACATATTAAAGTTGATTATCATTCTTTTCCTGGGAAAATACAACAAGGCTTAGTTTTCATAGGACATGTGAAGGTTGGAGAGTTATTATGAGACATCTTTACAAAGGGCAGTAAATGGGTCCCAAATAGAGTCTCCTTATAACAAGATGGGTATAACTAACATATATGCTCTAAGAGTGTTTTCACATGTACATTTGTACATAGAACTGTAGCTTAGTTTTACGAGTCCACTAGTTGGTTGTCCTTTATTGCAATTTTTCCTTCTTTAGTTTAGGACTCTCATGTACACCTTTGTAAATATGACTCTAGTGAACGGAATATGAATGAGTGCTTTTTCTCTCAAATCTTTGTTAGCCTGTGTACATGTGCCAGATTTTGTTATCTATTTGATATAAATTTGTCTCCTTCCAAAATTGTAGTATATATGGTAAATTCATAAATGAAAGATGGCCAATTTCAGCTCCATCACATTAGTGATGAGATGAATATATCTTCCTAACTTGTTCATGGCCTTGCTCTTGTTGTAACTTTCAGGCTCCCAGCTTTTTCTTGTTTATTTGAAATTTATTTTGGTGATGGTAAAGATTTGTTTTATAATTTTATTCTTTTGAATAAAAATGAGTTCTTAAAGAAATCTGGGGCTTGTTATATGCATCTAAAATTATAGAAGTTCAAGTAAAGTTCTTTTGTGCATGAAACGTGAGTTCAGCTAATAAGACTTTTAGTCAAAGGATGTCCTGTTTACTTTTTAATTATAATCTTTCCATGTTCCATGCCTTATTCAGTGTCATTGCTCTGATTTATTTTCATTAAACTTTCCTGATGTACCTGGTACAGTCTGCTTCCACAACGCTTTATCCTTATTGTCTTAAAATAGTCACTTTATCAGAAACCACCTCAGATTCTTACAAGGGGAGATAATTGGCGAGTACCGAGTAATTCGGATTCTTACACAATCACATAAGGGCATCTTTACACGCTGTTCATCGGCTAAAGGCAAATTTACGGATACAGTCCAACCATCCTTGGATAATGACTTATCTGAAATCACTCCATATGGACTCTAGTGACGTAGTATCATTCATGCTCATATCATCCCAATCTTAGATAAACCATCTTGGGGCTATTCTCTATAATAGAAATCTTCATTCAGTGAGAAGGAGAACAATGCTGGTAACCTATCCCTTCATAAAATGGCCAGAGACTTAACACCGTTGGATGATTCACATAGGGTGACATTGACCTAAATGTAGTGGAGTTAACACTGTGTTTTCCCCCTCCCGACAATGCATTCTTAGGTAAATCCACTCTGGCACTAATGAACATAGAAAGTGCTGAAGAGTCAATTTACTTCGCCAGACCTGCATACTTAACCACATGATCCCAATGCTTGGCTTGCTTCATCAGTTCATTGATGGGCCTCCACTCTCCAACCTACACTTCCTGGAGCTCACCATACCTGCTTGGCTTTTGAGTTTTGACGTTAAGATACGA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ATGGATCCCAACTCCTCTGGAGAAGACTTGGTTTTTAAGACCAGGAAGCCATATACTATTACAAAACAACGAGAGCGCTGGACGGAGGAGGAGCACAATAGATTTCTAGAGGCGTTGAAACTCTATGGCCGAGCATGGCAGAGAATTGAAGAACATATTGGAACGAAAACTGCAGTCCAGATACGAAGTCATGCACAGAAGTTCTTTTCAAAGTTGGAAAAAGAAGCACTTGTTAAGGGGATTCCTGTAGGACAAGCTCTCGACATAGACATTCCACCACCTCGTCCTAAGAGGAAACCAAGTAATCCTTATCCAAGGAAGACTCCTATACCAAAGTTGGGAGCAAATGACGGGAAGCTCTTGACTTTGGTGTCTTCTTCACAGAGCAAACAAATCTTGGATTTGGAGAAAGAGCCACTGAATGAGGCTACTAGTGGAGAAGAACAAGCAACTAATGAAAAGGATACTCATGACGATAATTGCTCAGAAGTATTTCCTGTATCACGAGAAGCTAATTCCTTTTCTTTGAAAAACAAATATTCTGTACCTGTGCAAGTTAAATTGAACGACTCGTGTGCTTTCAGGGAGTTTGTGCCTTCAGTTAAAGAGCCACTCCATGATAAAGGCACAGGCAAAGTTTCAGAATGGGAGATTTCAAGTGCTTCACACGAAAAATTGGTGTCTGCTGAAAAGAAAGAAGCTTTAAGCTGCGTACTGTCTGGAGATGAAATGCAAGCTGCTCATAATTATCCAAGGCATGTGCCTGTGCATGTGGTAGATGGAAGCTTGGGAACAAATGCTCAAGGGTCTTTAACAGATGCTCCGCTGCAGGAATCCACTTTTCATCCAGCAATGGAGGTTCAAGGAGAGCATAATATACTTGGGAATCCATCTGATTCTGTTTCTTTCGAACATCAAAATAATGCACCTAGGTGCATTTATCAATCATATTCACCTATTCATCCTGCTCCATTTACCTTACTTCAGCCTAACCAAGAAAATTACAAGTCACTTCTTCACATGTCTTCCACGTTCTCGAATCTTATTGTGTCTACTCTTCAACAAAACCCTGCAGCCCACGCAATAGCAAGTTTGACAGCAACATGTTGGCCCTATGTGAATCCTGAAACTTCTGTAGATTCTACCGTGTGTGATAAAGAAAGTTTCAGAACCAAGCAAATGAACCCCACCCCAAGTATGGATGCCATTGCTGCAGCAACTGTAGCAGCTGCAACTGCATGGTGGGCAGCCCATGGACTGCTACCTATTTGTGCCCCTTTTCATTCTGCCTTTGCCAATGCTGCTATATCAGCTCCTGTGGTACAATCATCAGATACCTGTCCAAATCCAGAGTCCAAGGACAAAGTAGAAAGTTCCCTACAAAATGCTGCTTTGCAAAATAAGCAGCTGGATGCAGAACAATCAGAAGCTTTGACAGCTCAACATTCAGGTTCCAAGTCACCTACTCATTCATCATCTGACTCTGAGGGTAGTGGAGGTGCAAATGCAAATGCTACGGTGAAACCTGCCCATAACGAGAAGACGCCTGCTGAGGTTGAGTTTCATGATTCAAACAAGGGGAAGAGGGGAAAACAAGTAGATCGTTCGTCGTGTGGTTCCAATACACCATCTGGAAGTGATCACGAGATAGATGCAACAGAAAAGGATGATAAAGAAAAGGAGGAGGAGACGGAGCTTGAGACAAATCGTCAAGCTACTGAGTCCAGTAATCGTCGCAGTAGAAGCATCGGTAACACAAGTGAATCTTGGAAGGAGGTTTCTGATGAGGGGCGGCTGGCCTTTCAAGCACTCTTCACTCGTGATGTATTGCCTCAAAGCTTCTCACCGCCATATGATGTAGAAAACGAGAGTAAGGAGAACGATAATGTTGAGAAAGATAGTCAGATTGTAGATAAAGATAGTGGTGCATCAGTTTTGGACCTTAACAGCAAGACTTGTGGATCTTCTAATCATCAAGGTACGGAGAGAGATACATCAACAATAGGTGTCAACAATGGAGGGGGAGAATTTCTCGCAATTGGAATTGGAATTGGAAATGGAACCCCCAAGGTTTGTCGAACAGGATTTAAACCTTACAAAAGATGTTCAGTGGAGGCAAAGGAAAAGAGAATGACAACTTCTAGCAACCACAGTGAGGAGGGAGGTCAAAAAAGACTACGCCTGGAGCAGAAAGCCTCAAATTGA MDPNSSGEDLVFKTRKPYTITKQRERWTEEEHNRFLEALKLYGRAWQRIEEHIGTKTAVQIRSHAQKFFSKLEKEALVKGIPVGQALDIDIPPPRPKRKPSNPYPRKTPIPKLGANDGKLLTLVSSSQSKQILDLEKEPLNEATSGEEQATNEKDTHDDNCSEVFPVSREANSFSLKNKYSVPVQVKLNDSCAFREFVPSVKEPLHDKGTGKVSEWEISSASHEKLVSAEKKEALSCVLSGDEMQAAHNYPRHVPVHVVDGSLGTNAQGSLTDAPLQESTFHPAMEVQGEHNILGNPSDSVSFEHQNNAPRCIYQSYSPIHPAPFTLLQPNQENYKSLLHMSSTFSNLIVSTLQQNPAAHAIASLTATCWPYVNPETSVDSTVCDKESFRTKQMNPTPSMDAIAAATVAAATAWWAAHGLLPICAPFHSAFANAAISAPVVQSSDTCPNPESKDKVESSLQNAALQNKQLDAEQSEALTAQHSGSKSPTHSSSDSEGSGGANANATVKPAHNEKTPAEVEFHDSNKGKRGKQVDRSSCGSNTPSGSDHEIDATEKDDKEKEEETELETNRQATESSNRRSRSIGNTSESWKEVSDEGRLAFQALFTRDVLPQSFSPPYDVENESKENDNVEKDSQIVDKDSGASVLDLNSKTCGSSNHQGTERDTSTIGVNNGGGEFLAIGIGIGNGTPKVCRTGFKPYKRCSVEAKEKRMTTSSNHSEEGGQKRLRLEQKASN Homology
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A0G3VTN5 (Protein LATE ELONGATED HYPOCOTYL OS=Petunia hybrida OX=4102 GN=LHY PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 2.4e-160 Identity = 378/778 (48.59%), Postives = 478/778 (61.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6R0H1 (Protein LHY OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LHY PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 1.8e-120 Identity = 317/753 (42.10%), Postives = 407/753 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P92973 (Protein CCA1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CCA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 363.2 bits (931), Expect = 6.8e-99 Identity = 303/752 (40.29%), Postives = 402/752 (53.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3H5A8 (Protein REVEILLE 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RVE7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 148.7 bits (374), Expect = 2.6e-34 Identity = 87/182 (47.80%), Postives = 114/182 (62.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4J2J6 (Protein REVEILLE 7-like OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RVE7L PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 146.0 bits (367), Expect = 1.7e-33 Identity = 77/147 (52.38%), Postives = 102/147 (69.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCB0 (protein LHY-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498835 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1234.9 bits (3194), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/735 (87.76%), Postives = 676/735 (91.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CB62 (protein LHY-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498835 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1229.5 bits (3180), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/738 (87.40%), Postives = 676/738 (91.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS79 (protein LHY OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023811 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1221.1 bits (3158), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/737 (87.38%), Postives = 669/737 (90.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9R4 (HTH myb-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G095910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1219.9 bits (3155), Expect = 0.0e+00 Identity = 638/735 (86.80%), Postives = 667/735 (90.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5M6 (protein LHY-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460772 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1182.5 bits (3058), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/736 (86.01%), Postives = 665/736 (90.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. NCBI nr
Match: XP_038874655.1 (protein LATE ELONGATED HYPOCOTYL [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1248.0 bits (3228), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/737 (89.15%), Postives = 677/737 (91.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. NCBI nr
Match: XP_008459828.1 (PREDICTED: protein LHY-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1234.9 bits (3194), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/735 (87.76%), Postives = 676/735 (91.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. NCBI nr
Match: XP_008459822.1 (PREDICTED: protein LHY-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008459823.1 PREDICTED: protein LHY-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008459824.1 PREDICTED: protein LHY-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008459826.1 PREDICTED: protein LHY-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1229.5 bits (3180), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/738 (87.40%), Postives = 676/738 (91.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. NCBI nr
Match: XP_022156983.1 (protein LHY [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1221.1 bits (3158), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/737 (87.38%), Postives = 669/737 (90.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. NCBI nr
Match: KGN46475.1 (hypothetical protein Csa_005254 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1219.9 bits (3155), Expect = 0.0e+00 Identity = 638/735 (86.80%), Postives = 667/735 (90.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. TAIR 10
Match: AT1G01060.4 (Homeodomain-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 2.6e-122 Identity = 314/753 (41.70%), Postives = 407/753 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. TAIR 10
Match: AT1G01060.1 (Homeodomain-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 1.3e-121 Identity = 317/753 (42.10%), Postives = 407/753 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. TAIR 10
Match: AT1G01060.2 (Homeodomain-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 1.3e-121 Identity = 317/753 (42.10%), Postives = 407/753 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. TAIR 10
Match: AT1G01060.3 (Homeodomain-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 1.3e-121 Identity = 317/753 (42.10%), Postives = 407/753 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g008850 vs. TAIR 10
Match: AT2G46830.1 (circadian clock associated 1 ) HSP 1 Score: 363.2 bits (931), Expect = 4.8e-100 Identity = 303/752 (40.29%), Postives = 402/752 (53.46%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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