Lcy08g002670 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAATCTCTGTTATTGGCAATGGATATCATCACCATGTCCTTGGGACTCAGTTACCCACTCTTCCTTCTGTAATGGCTTCTGCTCCGCAGGCCGTCCCCAGGCTCAAGAACCATCGCTCCAACTCCATCGCAACCGTCCCTAAAGAGCATCAAGTCCTCCTCGACTCTCGAAATGTTAAGCTCTTCAATGGAGGCCAGAAGCGCCACTCGAAGTCATACCTAGAGAGACAGTCCGCTATCACTCAAGTTAAAGACTGCTCCGAGTTGGCTCCGGCTCTTGCCAGGTTCTTCTTTTTCTTTTTGCTACGTGTATTTGGGCTTTGAATTGTGGGAATTCACCGGCTTCTTCTTTTAGTGTGTCCTAAATATGTTTTTCCATAGTCAATGTTAGTTGATTGTATAGTGAACAGGCAAGAGAGATTCTATATTTTCTGTTTTTGTCCCCGTTCTTTTTAGCTGCATTTTCGATATCTTTAAAATTTTCCATCTGGTTGTTGTTGTTGTTGGTTTTTTTGTTTTATTCTACACAGTAAAACCTGATGCGATTAATGAACACTGGAGATTCAAAATATCATATGATTGGTGGCAATTCGGAACATTGTGCTGGAATAGATTTATGCCAAATAGAAGGCTGTCCTTCCATGAATGGAAGATCATTTCTCGCCGTTGAGGGACTAAGTTGTTTAGGCTTCAAGGTATACTTGACTTCTTGAGGAGAAGCACGACCTACCACCTTCAAGTGGATGGCGAATTTGAGGTGGCCAATCGTAGTTTGAAGACATCTCCATCAAAAGTCCACCCCTTGCATGTAGTCTACGAAAGGCCACAACCTCCTATAGTTCATTGTGGGCATCAAAAGACACCAGACTCTGCCCTTGATCAAACAATTACAGGAACATGCTCAGGCCTTAAAAGACCTTAAACTCAAACTCAACCTTACACATGCCACAATGAAGAAATCAACTAATCAAGATCGGAGAAATATATAATTTGTCGTGGGTGATATGGCTGATTTAAACATTTCCCTCCTTGTTGACAATCCTTTGTCTTAAGGAATTAGGCGAAGCTTTCTCCACGCCCAAATATATTTGGCCTTTGTAAGGTGGTGGTACAGAGTGGGTCGGTTGGTGTAAAAATTGGATGTGCACCTATAGCTTTCATTGACCTAGTCTTTCATGTCTCAGAAATTTGAAAGGCCTTAGGGGAGGATATGGCTGCTCAACCAATCCTTGCCTATGCTAGCCTTGAATTTAGAAAGGATTATGGAACTTGAATGAGTCTTGGTGCCAAAGGTGAAACTACACACTCCCTCTTACATGAGTCCATATGGAAAGATCAATACCCAAAAAGGATTAAATTCTTACTTTGGGAACGAGTCTTGGTCCAATGTATGCTCCATTGGGGATGGTTTGAACACTTACTTTTGGGAGGATTCTTGGGTTGGGGAAGGACCTTTGTGCATTTTATTTCCTTATCTTTACCACTTGTCTAAGAAGAGGTTACATTCGGTGGCCTCTATCTTGTCTTCCCCTGATTCTTCTTTGTTGTTGTCCTTGGGCTTTTGTTGCCCTCTTACCGATTGTTAGACAGTTGACCTTGTTAGTATATTTTCCATATTTCAGACCAGGTAATTTATCATGGGAGGATGAATTCTCGAGCCTAGACCCCTAGACCCTCTGAAGGTTTTTCTTGTAGCTTTTTTTTCTAGATCCTTCCTGTGTCCTTTCTCCCCCCGGGTGTTTTTGCGTTCTCTTCCCTATGGAAGGTTAAAATTCCTAAGAAGGTGAGATTTTTTGCATGACAAGTTTTACATGATGAACACGATGGATCATCTCCAAAGACACTCCTCCTTTGTGATTCGTCCACAATGGTGCGTTCTTTGCAGGAATCAGGAGGAAAATCTTAGCCATTTGCTGGAGGATTTCCAGTATGCGGCGTCCATGTGGAATAACTTTTATAGTACTTTTGGGGTGGCAACAACTCGTAACAAAAGTTGTGGTTTCATGATTGAGGAGGTGCTTCTCAGCCTTTCCCTTCTGCGACAAAGGAAAGTTTTTGTGGCAAGCTTGTTTCTTTAGTATTTTGTGGGGTATTTGGCTTGAGAGAAATGATCGTAATTTTAGAGAGAAGGAGAGATCAATGGAGGAGACTTGGGATTTGATTAGATTTAACTATTCTTTGTGGATGTCTATTAATTGGGCCTTTTGTAATGACCTGTTGAGGCTCATTCTTTTTGAATGACATTCGTTTTTGTAATTAGTTTTTGGGGCTTTTTTTGGTGAGTTTGTATCATGTATGTAGTTTTGACTTGTGTTTTGTTTGTCCTTGTTTTCCCTTTCATTCTTCTTAATGAAAGTTTGGTTTCTTATAAAAAAAAAATATTTCCTTTTCTCCACGCCGATGCTTTCTTTGTAAGGAGCAAAAGATTTGGGGAGAATGTGTTAGTATCTTTTAAATGGTCAATGGCTTTGTCTCTTTTCATTCCATCAATGAAAAATTTCGTTTCTCGTTAAAAAAAAAATGGTCAACAACTTTACCTAATGATCCAAAGGGCACCCTCTTATACACACTCACAGGCCACCCTTTTAAAAAAGAGAAGAAGCTTCTTTGGATGCAGTTCATAAGAGGCTTTTTTCGAGCAACATGGAACAAGAGAAATCCAGGTCTTCCACAACAAAGAACAATTGTTTGATAGGTTTTTGACTCAAAGTGCATCTAGCAATCTCTTGGTGTAAATTGTCTACATATTTCTATTTTTATAATTATTCTACTGTTTTGTCCAATTGGAGAAATTTCTTGTAACTCTTTTGGATTGAGGTTTTCCTCCCCCATTTTGTAATTTCATACATCAATGAAATTGTTTCTTATGTAACTTTTTTTTTTTTGAAAAAAAAAGTCTTAGTGTTACAGAAGAGTAGAGTTTGACTCATAGGAAATATTAATGCAATGGAAAGATCTTTGGTGTTTGAAGGTTCATGGGAATCTTTGGAGATCATCCCACGCCAATTTCTAGAGTTCCACTTTTGGACAAGATTTCTTTTGGATATGGGAGTAATATTAGGCCCAATAGTGAATGTTAATGTTAGAAAAGGAAAAAGATTGACCATATTACTTCTGTAAGTAATGTAATGTCTTTTTATGTAGGAAAAAGATCAATTAGAAAGTAAATGAAGCTAATGGAAAATAATGGTAACTTAGTTATTGTAACTAATATTTACTAAAATAGAAAATATCAAACATGCTAAAAACATTTACATTGCCTCGTTTCTTTTCTTTTTTCGTGGGTTTTCTTCTTTTGATTTCCATTTTACGAAAGTTTGAGGTGAGAGAGAGGCATGTGTTGCCTCACATGTTATTCATTCTAAAGGTCCTACTAGGAACAATCTTTTTTCGATGATTTGGAAGGAGCACCATCCAAAGAAGATTAAAATTTTCTTATGGGAGCTTAGCCACGGTGGTATAAATACAGCTGATAGACTCCAAAGAAGAATGCCTCATTTCTTCCTATCTCCATCTTGGTGTGTTATGTGTTGTGCTAATGCGGAAGATCATATTCATCTTTTTGCTCACTGTCCTTTTGCACCTCAATATTGGTCTATAATGATGGAAGCTTTTGGATGGGATTTGGTTCTACCAGGAAATATTTTTGATCTTCTTGCTTCAATTTTTGTGGGCCATCCTTTTCATGGCAAAAAGAAAACTCTATGGTTAGCCATCAATCGAGCTTTCTTTTGGTATCATTGGTGTGAACGGAATGGTAGAATTTTCAGGGATGTCTCTTTAAACTTTACTGCTTTTCTAGATTTGGTTTTATTCAATGCTTTGTATTGGTGTAAATGCAAACACCCTTTTAGCGATTATAACCTAGCTTCTTTAATATCTAATTGGAACCTTTTCTTGTAATGATCATTTTCGGAAGTTTTAACTTCCTATTATTTCATTTATCAATGAAATTTGTTTCTCTTCTCAAAAAAATTATAGGGATCACCACGTTTGGTCTTTATAGTCTTCTTGCAGTTCTATCTTTAAATTCACTTCATCATCTCACCCAAGCATACCCCTTTAAGTTCTCTGTTTGGCCTACTATTCTTATAATTAACACAGGACCAGCTAAGCCTATTGTATGGTCTGGTCTTAAGGTTCTGAGTAGCATGTATTGTGTAAAGAGGCAATGGAGGACAAGAATCTTCTTCGGAAGTATTGTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAGACGTGGTTAAGATTCTTTCAGACTTTTATGGTGTTGTTGGCCCCAAGTTGAGATTGATATGTTGGATGAGGTCCTCTTACCTTCTTTCGGGTAGACTGGTTTCTTTGCTATTTGTTGGAGTGTTCGGCTAGATAGAAATGGAGGGATCTTTCAGGATAGGGAGGGGTCTTGGGAAGAAATTTCTAGCGTGGTTCACTTCATCAGTACCTCTTGCTGGGTGTCTTATTGCTTATGTGATTTTTTCCATTTTTACTTCTTATCACTAACTACTAAGGCTTGTCTATTTCTCTTTCCTCTCATATTATTTCATGTTTTTTCTTTTTATTATCTTTGAATGAGATAAAAATGTTTTTGGTAAATATTTTCTTATTTTGGTTGAAAAGATGGGAATCTGCCAGAAGTCATGCTTCTTTTTATCATTAAGCTGGATTAACTTTTTCTATAATCATATTTTTCTTGTGCAGATATGGTGGAATACTAAAAGCGCAAGATTTGAATGTGATACTGCGGCATTTTGGGATGTTAAGTAGGTGGCATGATCTTTCTCAGGTGCTTCTAGGAACATTAGTCCGCTTGTAATTATGTATTGTTGAATTAGGAACAAGCTGCCCAGTGAAGTGTAGTGTCAACAAGAATTTTTCACAATTACTCACAGGATATCTTCACAACTTCGGAGCTTTGTTGTAACTTCTTGGTTTTCTTAGGGAAGTATGTTTATACTCCTCAGTCCTAATCAGGATTTTTTATCTTCTGCTACTATTTTAAC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MEISVIGNGYHHHVLGTQLPTLPSVMASAPQAVPRLKNHRSNSIATVPKEHQVLLDSRNVKLFNGGQKRHSKSYLERQSAITQVKDCSELAPALARYGGILKAQDLNVILRHFGMLSRWHDLSQLFEWMQQTGKTNVSSYSSYIKFMGRGLNPLKALEIYNNIQEVSTKNNVFICNSVLNCLVRNGKFDTSVKLFQQMKNDGLCPDTVTYSTMLTGCIKVKHGYSKALELLKELQDNGLCMDSVMYGTLIAVCASHNRLDDAENFFNQMKNDGHSPNMFHYGSLLNAYSMSGDYKKADELIQDMKLTGLVPNKVILTTLLKVYVRGGLFEKSRKLLSELEALGYGENEMPYCLLMDGLAKEGSIREAKAVFDEMKEKNVRSDGYAHSIMISAFCRGGLLEEAKQLAKDFEATYDRYDIVILNTMLCAYCRAGEMESVMQMLRKMDELAISPDYNTFHILIKYFCKEKLYLLGYRTLEDMHRKGHHPEEELCSSLISSLGKIRAYSEAFSVYNILKYSKRTMCKALHEKILHILIAGRLLKDAYVVVKDNAGLISKPAIRKFAFKFMKSGNVNLINDVMKAIHGSGYKIDQDLFMMATSRYIELPEKKDLFLQLLQWMPGQGYVVDSSTRNLILKNSHLFGRQFIAEILSKQHLVSKATRS Homology
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WVV0 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g10910 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 829.3 bits (2141), Expect = 3.0e-239 Identity = 403/589 (68.42%), Postives = 490/589 (83.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S7Q2 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74850, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PTAC2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 5.4e-39 Identity = 111/454 (24.45%), Postives = 205/454 (45.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIT7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g61990, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g61990 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 162.5 bits (410), Expect = 1.6e-38 Identity = 92/392 (23.47%), Postives = 201/392 (51.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0D6 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g11690 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g11690 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 4.3e-36 Identity = 91/339 (26.84%), Postives = 176/339 (51.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIC9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g31400, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g31400 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 152.9 bits (385), Expect = 1.3e-35 Identity = 90/342 (26.32%), Postives = 184/342 (53.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IWQ9 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479891 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1205.7 bits (3118), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/660 (91.21%), Postives = 630/660 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRU4 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023788 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1203.7 bits (3113), Expect = 0.0e+00 Identity = 603/660 (91.36%), Postives = 630/660 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ERS3 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436973 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1203.7 bits (3113), Expect = 0.0e+00 Identity = 599/660 (90.76%), Postives = 627/660 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CN74 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502713 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1182.9 bits (3059), Expect = 0.0e+00 Identity = 584/660 (88.48%), Postives = 622/660 (94.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCK2 (PPR_long domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G842670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1049.7 bits (2713), Expect = 5.2e-303 Identity = 515/565 (91.15%), Postives = 544/565 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. NCBI nr
Match: XP_022980545.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1205.7 bits (3118), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/660 (91.21%), Postives = 630/660 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. NCBI nr
Match: KAG7018152.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1205.3 bits (3117), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/660 (90.91%), Postives = 628/660 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. NCBI nr
Match: XP_038903773.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1204.9 bits (3116), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/660 (91.21%), Postives = 626/660 (94.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. NCBI nr
Match: XP_023528492.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1204.1 bits (3114), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/661 (91.07%), Postives = 628/661 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. NCBI nr
Match: XP_022930554.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1203.7 bits (3113), Expect = 0.0e+00 Identity = 599/660 (90.76%), Postives = 627/660 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. TAIR 10
Match: AT1G10910.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 829.3 bits (2141), Expect = 2.1e-240 Identity = 403/589 (68.42%), Postives = 490/589 (83.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. TAIR 10
Match: AT1G74850.1 (plastid transcriptionally active 2 ) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 3.9e-40 Identity = 111/454 (24.45%), Postives = 205/454 (45.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. TAIR 10
Match: AT5G61990.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 162.5 bits (410), Expect = 1.1e-39 Identity = 92/392 (23.47%), Postives = 201/392 (51.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. TAIR 10
Match: AT4G11690.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein ) HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 3.1e-37 Identity = 91/339 (26.84%), Postives = 176/339 (51.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g002670 vs. TAIR 10
Match: AT2G31400.1 (genomes uncoupled 1 ) HSP 1 Score: 152.9 bits (385), Expect = 8.9e-37 Identity = 90/342 (26.32%), Postives = 184/342 (53.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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