Lcy08g000090 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGTACGCACTTGCCCCTCAAATTAACTCACGTCCATGGAGTTTTGGATTTGTAACTGTACATGCAAGTAGTCTATGCCTATCTAGATCACTAAACTTCAACAAATTTCGGAGAGATATACTCTATTCCTCCGTTGGAAAATTGACGAGGGCCACTGGTGAGCCCAGCTTCCGGAGGGTTGCGGACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGAGGACGACGAGGACGACGACGACGTATTTCAAGTGTTGACCTCTATTACTAGCAATTACAATGACATTGTAATTGTAGACACTCCCAAATCCAGAGTGCTGCTTCTCGATTCTTCTCGTACTACTGCTCGTATTCTCCCTTATCTTCAATTTTATCCTCTAAAAGGGAATTCATGACCTTCTAAACTGTGCCCCCATGTTGACGCAGATAATGTCCACAGCATTCTTTGCAAGGAGCAGATGTGGACAGGTTCTTACTGGGTCGGTAAATTCGGTCTCTTTGTCTCCCTCCATGCGCACACACGGACGCACGAACCTAAAAGGATATTATCCTCAACTAAAAAGCAACAATAAATTTCTGAACCATCTCTTTCGGTTCCTTTCAAAAGTGGCTACTAAGAATCTCTCTTTCCTTTTGGTTCACAAGGTTCAAAACGAGTTGCATCATTGGCAGAATTCTTCCGTCCCCGCTTCTTTTCTTTGTTGGTCTCAGCTATATCTCAACACTGCATGTTCTTCCTATCAGTTGTTATAAGAGATCGGATTTAGCATTTATGTTTTGTGTTGTTAGCTTGTTCGTGCAGACGATTCAAGCAAATCTTTTGGATGTTGAAGTTGTAATGAAGATTATTCGATACCAAAGAGGACACGCAGAATAGAATTGGACTTCAATTTTCGAAGAATTATCACTTAGAAATAGAAGCCTACACAAATGCAGTTATGCGAATTGGATGAGTTGAGTGACTAAGAGGCAGTCATTTTTCATTTCTTATAGAACATTTCGTTTCTCAAACGAGCAAGGATACTGTTTAGTGTAGAGGTAAAATTTAGAAGTTTTGACACATGGGATACAGTGTAAACCAAAATTCGGAAATTTTATACCTTATGACTCCTACAAATCTGACAACTTCTAATCCAATACTAACATGAATGCATTAAATGGCTAAAATGGTTGAGGAACTTGGAGTTAGTTAGATCAGTTTGCCTTGTGAAAAATATTTGGTCTCAAGTTATGTAGCTAGAGAAAAAGAGTCTGGTGCTGCATACGCATATATGTCAACCATATCGAAGATATGATTGATGTGTAGGTCATCAATGAATTTAACCTTGTAAGCATTAGACCTGTATCTTCGTAGGATGCGAAAGAGTCCCAGCTTTTTATTCTTTAGCTTAATAAGTGCCCATTGGAATTCTAGACTTTCTGAGATGTTACATAATTAAATCTCCTTCAGTGTAACTCTTGTCATGTCGTTTGGTATCAACACATTCCTTGCACTGGAAGTTATGTGGATGATGTGATGAAAAATGTTAAAGGGCAGCAAAGAATTCTTTAAGAATCTCTGAGATTATCCCTCTTCCTTATTCATGCTGGGTTAGAAAAGATCAAGAAGTAGTGCATATGGAATTTCGCAAAATTTTGGTGGTATCTAGACTGTTTGAGCACCACAATTGTCTTTCTTCCTCCTTTGAATGGATAAGACTCTTTTGGAAAAATTCTAGTGGTTCATCACAGGACCTTTTGCTCTTTTCTGATTGGCCACTTGCTTCTGCTTTTTGTGGCAGACCGATCTTATGCTGTGTAAGAGAATGCCATCTTGTCTTTCTTCCTCCTGTCACACACGCAATTTCACCAAATGCTATCTTGGAGATTGGTACAGGGGGCAGTGATGTGGCTGAGACATCTTCGAGTGAGATTTCGAAACCTGAATTCATTCAGCCTTATACTTCAGCTTTTCAAAGATTCCAGGACAGATATCCTTGGCTATTCCCTCTCATAAACCACTGCAACATTCCAATATTTGATTTAGCTTTTATGTGCTGTGCTACTTATGCAAATTGTCTCCCTAATTCTGGCCAATCATTAGGACAAGTAATTGCTTCTAAAATAATGAAAGCCAAAACCATACCTTCTTCCATTGCCAGTATGCACCGGCGTGTTGGTTTTCTCTGTTTCATGTTTTCAACCTCCATTGGGTTTTCTGGAAGGATTTAAGAAGCAACTTACTTTAGCTTTCTATATGGACCGATTTTATCACCTCAAGCTCATCTTTTATGGATTAATGACATCAAATCTATTTTATTAGAATTATGGTTCTAGTGGAATCATTGGATTTTTTAGGATAAGAGTAAATTTTGGTTGGAGCGTTTTTATTAGATTACATGGGGTTCCATCTCAAAACCAATTGGCAATGAGTGGAGTAACCCATCTATCTTATGTATTGGGAGGTCTCCACTAATATTTTCAATGTGGGATCCTCAACAGTTTTGATATTGCTAAGTGCAAGGCTTCTCATTGGTGCTCTCTTCCATTTTATTTGAGTCTTATTCTCTTTAATATTTGCATTAATTGGGGTGATTTTATTCACCCTACATAGGCTTCTTTGTTTTGCTTTTGCATTTTGCTTATTTCAGTCATTTTTGAGTTTGTATCTTGAACATTTTATCCTTTTCATTAACCAATGAAAAGTTTGTTTCTTGTTAAAAAAGAAATGAGAGTTCAATGCACTGTGATTCCTGTATTCATATTTCTTGGATGAGTGAAAGGTTGTTGAAATTTTCTTTAAAAACACCAAAATGAGCTTCAATATTCTATCTGCTAAAAAATTATTTCAATGTGTAATCATTGTAAAATCACTAATATTTAGTCACTTTATCCTTCTGTATTTTTATTTTTGTTGTAGTGAGAGGCGAAAGAATAGTTCACTCTGTGCGGTAGCATGACTCTGATTAGTTGTTTTCTTTATGTTGTTTATTTCTCTATTTTCTCTCCCATGTGAAGTTTGTAATTTTGAGCATGAGCCTCTTTTTCATTATATCAATGAAAAGCTTTGTTTCTTGTTAAAAAAATTGGAGTAGTGATAAAAAAAATTGTGTTTTGACATTCAATAATTCTCTTATCTGCCTAAGTTACATATATTTTGGCTAAAAAAACGTTAATTGCAAATGATGTTCTATATTTATTTTTACCGTCACCTGCTGTGTATTTTTACATCTTGTAGGATGAGTTTGCTAGCTTGCCAGCTATAATACCAAAGGGTCCAATTGCTATATTTGGCTTGGTAAACCACTTCATTCTGCAATAATGACGTGCCTTTTTGTAATAAATATGAAAAATTTCTACACCAAATTACTGATTTCATGATTGAAATTTTATACTGTCTAAACAGGGAGGGGGAACTACTGCCCATTTGATGCTTGCTTCATGGCCCTCCTTGCAGCTTGAAGGTTGGGAGATTGATGGAATCGTAAGCTAGATTTGCTTTCTTTACCTATCAGTTTCTGAAAATTCTGAAGTTGAGAAACAACCTAGATTATCTCTATTTGACTTCCCATTCTTTTCTTTCCCCTTTATGGTCGTTTAATACTGGGGAACAAAGGGAATGGGTATCCTCAACTCATATTACTTTTAGGCATTGATATCTTAAACCACCAAAAATTATTAAAATAAAGATTTGGATTTAATTATAGCATGGAGATAAGGATGCTCCCTCTTCCTTCCTCCCACTCAAACTTTATTCCCTAGCCTTCATCCGGTTCTTCTTCAGATTCTTTTTCTAAGATAAGTTCTCCTGGGTTGGTTCGTTTTGGCTTTTGTTTTGTGTTAGTCAGTGTGAAAGATGGAAAGCAGTTGTAGTATAGCCAACAAATCCTTCTTTGTTTCTTACACTCACGGATATTATCTTCCGGAAGAAAGCAAAAGGTGTCGTTCTTATTTCGTCAAACTTCATTGGTACGTTTTATTATGGTTGGAACAATCTCTTGCCTCTCTTTGGAATTGTTCTTTCAGTGCCAAGTTAAGTAAGCAAATGCATGTAGAAAATGGTTGTTTTCATATCCTTAAAAGCTCAAATCATTTTGGTTGGTTCATTGACAGTTCTTTCTGGTATGATGGTGGTGCGAAAAGTTCCATTTTGAAAACAGAGGGTGGAGGGGCTTTGGGGAAATGTTAACTTCGACAGCCTAAAAGTGGATTTGGTATTTGTATGCAAAAGGAAAGGGTTTTTGAAGCTTCTTCCGTCAGAAAGGATTTGGGGGCTCCTTCTTCTTTATCTAAGCAGGACTTTTTGCCTCTTCCAAGTTTTATTGGTGTTGAAGTTCCTTCAAAATATTTCTGGATCAGAAAAGAAAAGGAGGTGGGAAATTTGGATCTTTTTTGAAATTCTTGTTATCACAAGACTACACTCTTTCGATGACTGGAGAGAAATCTCTAAGACTCTTAAAAATGACATCTCTGAGTCTTGTTTAATTAATCCTTTTGCAGTCGACAAAGCTTTGCTCAAATTAGGCTTCAACTATTCAGAAGATTTTGAGCGAAGTCTTGGTCGTTGGAGAAAGGTGGGAGGTTTTCATATTTTGTTCGAAAAATGGTGTGCATGTAAACATGGAAGGGTGGAGATGATAACTTGTTTTGGCAGCTGGATTAAAATCAGAAATTTACCTTTTAACTTTGTGGAAAAAGGAAAATTTTGAGTTTATTGGAAAGAAATGTGAAGGTTTTATTAGAATTTCTTTAGACACTATTAACCTGTTGAATCGCTTTGAAGCCTCCATTGAAGTACCCAACAACCAATGTGGTTTTATCCCTGCAGAGGTGGTTGTCTGATTTAGTTCTTCAGATTTCTCCTTCGGTAGGTGATTCTTCCACTCCAAGACCTGAAATTTTGAACATTCTCGATTTCGATTGGTTGAATATTCCATTAGATTTTCAGCTAGCGAAGATGAATGGTCTCTTGAATTCTTGGATTCCTTTTGTGGTTTTAATTCTTTCTTGGTGGAGGCTG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MAYALAPQINSRPWSFGFVTVHASSLCLSRSLNFNKFRRDILYSSVGKLTRATGEPSFRRVADEEEEEEEDEDDEDDDDVFQVLTSITSNYNDIVIVDTPKSRVLLLDSSHNVHSILCKEQMWTGSYWDEFASLPAIIPKGPIAIFGLGGGTTAHLMLASWPSLQLEGWEIDGILIDQARDFFGLSGLEKHSDDGGILNIHIGDALDPSVRISGGYAGIVIDLFSDGNILPQLQQAGMWLDLKDRLMVGGRLMINCGGNEAANVTNNDICNEVSSTDCFWPHNSVIEVLSKAFPKQLCWKKLPKRQGGNYLALTGPFPELHSWSAVVPEPLRARVKEWRPYERLS Homology
BLAST of Lcy08g000090 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8G4L4 (Probable polyamine aminopropyl transferase OS=Bifidobacterium longum (strain NCC 2705) OX=206672 GN=speE PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 2.4e-06 Identity = 40/168 (23.81%), Postives = 73/168 (43.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D1F5 (uncharacterized protein LOC111016725 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016725 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 5.2e-161 Identity = 287/344 (83.43%), Postives = 302/344 (87.79%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGI8 (uncharacterized protein LOC103489616 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489616 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 558.1 bits (1437), Expect = 2.5e-155 Identity = 277/345 (80.29%), Postives = 300/345 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJG8 (uncharacterized protein LOC111454843 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454843 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 1.2e-152 Identity = 274/344 (79.65%), Postives = 295/344 (85.76%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2F1 (uncharacterized protein LOC111468401 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468401 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 542.7 bits (1397), Expect = 1.1e-150 Identity = 272/344 (79.07%), Postives = 293/344 (85.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GKL3 (uncharacterized protein LOC111454843 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454843 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 527.7 bits (1358), Expect = 3.6e-146 Identity = 267/344 (77.62%), Postives = 289/344 (84.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. NCBI nr
Match: XP_038876684.1 (uncharacterized protein LOC120069080 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 7.4e-162 Identity = 286/346 (82.66%), Postives = 308/346 (89.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. NCBI nr
Match: XP_022147905.1 (uncharacterized protein LOC111016725 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 1.1e-160 Identity = 287/344 (83.43%), Postives = 302/344 (87.79%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. NCBI nr
Match: XP_008447062.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489616 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 558.1 bits (1437), Expect = 5.2e-155 Identity = 277/345 (80.29%), Postives = 300/345 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. NCBI nr
Match: XP_004148295.1 (uncharacterized protein LOC101213378 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8646127.1 hypothetical protein Csa_015941 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 556.2 bits (1432), Expect = 2.0e-154 Identity = 275/345 (79.71%), Postives = 299/345 (86.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. NCBI nr
Match: XP_023553705.1 (uncharacterized protein LOC111811183 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 2.4e-152 Identity = 274/344 (79.65%), Postives = 295/344 (85.76%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. TAIR 10
Match: AT5G44600.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 5.3e-81 Identity = 148/282 (52.48%), Postives = 197/282 (69.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. TAIR 10
Match: AT5G44590.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 268.9 bits (686), Expect = 5.8e-72 Identity = 145/295 (49.15%), Postives = 190/295 (64.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000090 vs. TAIR 10
Match: AT5G63100.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 2.0e-40 Identity = 109/296 (36.82%), Postives = 161/296 (54.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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