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Lcy07g011640 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACTTATCACAACTTCTCTAACACCACAGCACCGATAATGGCCGCTCCTCTCTTCGAAAGAGCTGCAATCAAAAGGCCAATCGACAGACTGTTGGACGCTGCAATTTTCCTCCTCCTCCTCTCCCTCCTCGGCTACCGCCTCCGTTTCCTCTGCACCGACGGCTTCTACTGGCTCCAATCCACCGCCTTTCTCTGCGAGTCCTGGTTCACTTTCACCTGGTTTCTTCACATCGCCGTCAAATGCAACCCCGTTCGTTTCACAACCTATCCCGACCGCCTTCTCAAACGGTAACTAACTGAAAAAACTGTGGAGTGTTTTTTTTTTTTTGGGAGTTGGTTTGGTGATTATTGTTGGTGGAAATTGAAACAGGGTTGAGGAGGTTCCTCCGGTGGATATGTTTGTAACGACGGCAGATCCGTCGTTGGAACCGCCGATAATTACTGTGAATACGGTGCTGTCTCTGTTGGCCGTTGACTATCCGGTGGATAGATTGGCTTGCTATGTCTCCGACGATGGATGTTCTCCGGTTACATTCTATTGTCTGGGTGAAGCGGTTGAATTTGCGAAGATTTGGGTTCCGTTTTGTAAGAAGAATGGGATTCGGCTTAGAGCGCCGTTTCGGTACTTTTCAAGTGGGTTAGCCGATGAGTCCGTGGAGTTTCAACTAGAGTGGAAGAGAATCAAGGTAAATGAAACAAAATTTTATAGACCTTGTTAATTTCTTGTTGTCCACTGCTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGTTAAATTACAAGTCGGTTTGTATCAATTTGGTCCCTGAATACTAAAATTTGTCTAAAAGATCCATGAACTTTTAATGTTGTGTGTAATAGATTCATGTTATATTCAAGATTTTTAAAAATTAACCAATCTAGTAAATATAAAATTGAATTTTATGCTTTTTGGGAGTTCAAACTTTCAATTTTATATCTAGTAGACTTGTGAATTTGAAAAAAATGTCGAATAGGTCAACAACCTATTAGACACAAAAGTGAAAGTTTGAGGACCTATTGACAACATGTGGAATTTTGGAAAGAAATATTTCCTTGCAAAGAATTTTTACCTATTTATTTTGTTTTTGAAAATGAAAGAAAGTTCAAATATATATGGGAAAAATACCTTTTTGGTCTCCAAGTTTTCAAAATAGAAATTTTTAGTTCCTGAGTTTAAAGAAATAAGTCCTTAAACCCCAATTATATATATATATATATATCATATTCGGTATTATTCTTAAATGTTTTATCTTTTAGGTTTTACTACAAATTTAGTACCTGAACTTTCATAGTTATATCAATTAGGTCCTTAAACTTTAAAAAGTATCTAATAGGTCTTTGAACTTTAAAATAGCTAATAAGTCCCCGAACTTTCAATTTTGTGTCTAATAGGTCCCTGACATATTCAATATTTTTAAAAATTAACCAAACTACTATATATAAAATTGAATTTTATGTCTATTAAGACTCTAAGTTTCTAATTTTATATCAAGTAAGTTTGTGAATTTTAAAAAATGTAAAATAGGTCAAGGACTTATTAGACACAAAATTAAAAATTAGGGGACCTATTGGACACAAAAGTGAAAGTTTAAGGACCTATTAGATATTTTTTTAAAGTTCAAAGACCTATTGAAAACAAAATTGAAAGTTTGAGGACTTAAAGTTGAGAGACTAAACATGTAATTTAACCCATCTTTTTTTTTTTTTTGACAAATAATAAAGGAAGATATGATAACAACGAAAAGTTTTAACATCTTCATAGTATTAGAAATTTTCTCCACAAAAGGTTGAGAAGAGTTTTCTTTTTCTTGATTTCAAAAAGTGAACACATTGTTTTTTTTAGTGTCCCCGTCGACAAAAAGCACTATTGAAAATTTATTGCTATGCCAATCACTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGTTGGAGTACGAAAAACTGTGCCAGAAGATCGAGGAAGCAAATCAAACATTGGACTCACGTGACCTTGCCGGAGACCTCGCAGTTTTCTCCCGTACAGACTCCAAAAATCATGCTCCAATTATCAAGGTCAGGCTGCAGTTTTTGATAATTATTTGAGTTGTTTTTTGAAAATTATACTTATACCACTACTTGCACGTATAAGTTTCTTTGTTTTACTATCTATATTTTTCCTTGTTCTCAAAAACCATGTCAAGTCTTGGAAAAAAAAAATTAGTTTTCAAAAACAAAGATGAGAAACATGGAAGGAAATTTGGGAGAAAATCAAGCATAATTTTCAAAAACCAAATGGTTATTAAAATATTGCAGAAATCTAGAGAATATAGGTGATGATTTACTCAATAATTCACTGTGTAATAATCAATGAACAGTACACCACATATATAGAAAGAAAATGGACAGATGGAGCACTTAGAGAGGCCAATGCTATAACTAACTTTACAATAAGAAAAACCAGAAAAATAGCCCTGATAAACTCATGATAAAAGACATTTTATCATCCCCCGCAAGCGAAACTGGGCGAGAGAGGACCGTGAGCTTGGTACGCAGACCTTGAAACCGAGCAGTAGCTAATGGTTTAGTGAGGATGTCAGCGAGTTGATCCTCTGATGGAACAAAGCGTACAAGAAGCTGCTTTCGCATCACTTTTTCTCTAATAAAGTGATGATCTATTTCAATGTGCTTGGAACGACTATGAAGAACAGGGTTAGCTGCAAGATAAGTAGCACTAATGTTATCACAAAGTAATAAAGGTGGAGAAGGTGAAGCAAAACCGAGTTCAGACATGAGAGACTGTATCCACACGATCTCGGCAGTGGCATTTGATAATCCGCGATACTCAGATTCAGCGCTTGATCTAGATACCACCTTTTGCTTAGCTGAAGACCAAGAGATGAGATTCGGGCCAAGAAAAATGCAATACCCACTGGTACTTCGACGATCATCTGGACAATTTGCCCAGTCCGCATCAGTGTAACCAGTCAGAGATAACGGACCTGAGTTGGAGAAAGACAGACCAAGCTGACTTGTTGTTTTGAGATAACGAAGTATGCGCTTTACCAAGTTCCAATGGATTGATGTTGGAGCATGTAAGAACTGGCAGGCTTTGTTTACAGCAAAACTCAAGTCAGGACGGGTGATGGTACAATATTGGAGCACACCAACAAGGCTCCGGTATTGCTTTGGGTCAGGTAACAGATCACCATCTCGTGCAGAAAGTGTAGTGCCAGCAGCCATAAGGGTGTCCATGGCTTTGCAAGAGAACATGTCTGCTCGGGTTAGGAGATCCTGGATGTACTTGTGCTGACAAAAAGAATCTGCATCTCTAGAAACTTCAATGCCGAGAAAATAAGACAGATTTCCCAAGTCCTTGAGTGCAAATAACTTATTTAAAGAGTCAATGAACTGCTGAATAAACATAGAATCATTCCCAGTGACTATTATGTCATCCACATAAATTAAAACAGCAGTAAAAATGGAGTTCTTTTTGAAATAAAACAGGGAAGTGTCTGACTTAGAAGCTGAAAAACCCCATTGCAACAAGCAGGAACTAAGCTTTAAGAACCACTCCCTAGGACTTTGTTTCAAACCATATAAAGCCTTATGTAATTTGCAAACGTGATGAGGTCTATCTTTATCAACAAAATCAGGCGGTTGGACCATGTAAACATCCTCGTGAAGATCACCATTGAGGAAGGCATTATGGACATCAAGTTGCTTGATTAACCATCCAAAACGCACGGCTAAGGCTAACAAAATTCTGATGGTGGCTGGTTTAACTACTGGAGAAAAAGTTTCAAAGTAGTTAATTCCATGAATTTGATCAAAGTCACGAGCGACAAGCCTTGCCTTATACCTCTCAACAGACCCATCCGGTTTCAATTTAATACGGTACACCCATTTACAACTTACAAGTTTATAGTCTGGAGAGTTTGGAACAAGAGACCAAGTTTGATTTGGCACCAAAGCCTTGTATTCTTTGTCCATGGCATCTCTCCATTCAATACTCTTAATCGCCGTTTTGAAACAAGTCGGTTCAACCAAGGGCAGGGTGGGACTAGGGGATGAGGTGGCCAACCAACATTTAGGTTTAAAAATGCCAGCTTTGGAGCGTGTAACCATCGGATGAGCATTGGTTGGAACAGGATTGGGCGGTAAGGGAGATGGTGCTGGTGTATTTGGAGAAAGAGATGATGAGACGGATGAGGAGATAGATGAGGCTGGGATGATCGAAGGTGTCATGGGATTGGGAGAAGAAGAGGGTGACTGTTGGTGAACCAAAAGAGGAGGTAATGGCGCAAATCCTGGGGGAACAAACAAAGACACAGAGGATGAGGCGGAAGCAGATGGATTAAAAGGAGAAGAGACTTTTTGAGAATCAGAAGCATGAGACAACTGTACAGGGGATGCATCAACCGAAGGTGATGGAAAACAGGAGGGTGGAAGAGCAAAGGGAGTAGGTTGAAAGAAAGAATGATCAGAAGGATTGGACTTGACAGGACCAAAAGTGAAGGAACGATTAGTACAGGGAAAGGCAGTTTCATTGAACACAACATGCCGTGATACAAAAAGGCGACCTGAAATAGGATCTAAACATAAATACCCCTTGTGATTTGAGCTATATCCCACAAAAAGACATTCAGTAGAACGAAATAACAGCTTATGAGCATTGTAAGGCCTAAGGGATGGAAAACATGCGCAACCAAAAGCTTTCAAAAGAGAGTAATCTGGGATTTTGCCATAAAGCTTCTGGTAGGGAGATTGCAATTGAAGAACAGCAGTTGGTAACCTATTTATAAGATGAACTGCGGTTTGAAAAGCAAAACTCCAAAAGGATAAAGGCAGACCTGAATGCGCAAGTAAAGCAAGACCAATTTCTACAACATGACGGTTTTTTCTTTCAACCCGACCATTTTGTTGTGGTGTGTAAGGACAAGAAATACGATGATGGATACCATTAGTTGAAAGGAATGAGGAAATATTACGAAACTCTCCTCCCCAATC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ATGGCCGCTCCTCTCTTCGAAAGAGCTGCAATCAAAAGGCCAATCGACAGACTGTTGGACGCTGCAATTTTCCTCCTCCTCCTCTCCCTCCTCGGCTACCGCCTCCGTTTCCTCTGCACCGACGGCTTCTACTGGCTCCAATCCACCGCCTTTCTCTGCGAGTCCTGGTTCACTTTCACCTGGTTTCTTCACATCGCCGTCAAATGCAACCCCGTTCGTTTCACAACCTATCCCGACCGCCTTCTCAAACGGGTGGAGGAGCTTCCTCCGGTAGATATATTCGTGACGACGGCGGATGCAGAGCTGGAGCCGCCGATAATAACCGTAAACACGGTGCTATCTCTGTTGGCAGTGGATTATCCCGCCGACAAATTGGCTTGTTACGTCTCCGACGACGGCGGCTCTCCGGTCACCTTCTATTCCCTCTCCGAAGCTCTGAATTTCGCGAAGATTTGGGTTCCTTTTTGCAAGAAGTACAAGATTCAAGTTAGAGCTCCCTTTAGATACTTTTATAATAATAATAATAATGAAGATCTTGTCTCCGGTGGCTCGCCGGAGTTCCGACATGACTGGATGAAAATGAAGGATGAGTATGAGAAGCTCAGTCAGAGAATTGAGAAAGCTGCCCTACGTGACCTGACCCGAGAGCTGCCCGACTTTTCCAATATAAAATCAAATAATCACCCTCCAATTATTAAGGTGATTTGGGAGAACAAGGAAGGTCTTCTTGATGGATTGCCTAATTTAGTTTATATATGTAGAGAAAAGAGACCAAAACATCAACATCATTATAAGGCTGGAGCCATGAATGTTTTGACGAGAGTGTCTGGATTGATGACAAATGCTCCTTATATGATGAACGTAGATTGTGATATGTTTGTGAATAACCCTAAAATTCTCTTACATGCAATGTGTCTCCTTCAAGATCCGACCATTGATAAAGAACATGCTTTTGTTCAATTTCCTCAAACCTTTTACAATGGACTTAAGGACGACCCCTATGGGAACCAATTTCATGTGGTGATGGAGTTTATTATTCGTGGAACAACAGGGCTTCAAGGTCCTTGCTATATGGGAACAGGATGTATTCATAGACGAAAAGTCTTGTATGGTCAATCTCCAGATGGTACAAATATTTTTGGAAGTAATCTCGACGATGAATTATACAAAACATTTGGAAAATCAGAGAGTTTGAAGAAATCAGCCCTTCATGCTTTAAGAGGCATTGCACATTATCCAAATCACTCCATAGAAGCATTAAAGGAAGTTGCTACTTGTGATTATGAATACCATTCTTATTGGGGTGCAAAGGTGGGTTGGCTGTATGGAACTGCAACAGAGGACTTGTTAACTGGAATGACAATACACAAAAAGGGTTGGAAATCAGCTTTTCTTTTACCAAATCCAGAGGGCTTTTTAGGGTGTGCCCCTTCAGGAGGGCCAGCTTCTTTAACACAGCAAAAGAGATGGATTACAGGGCAGCTTGAAGTTTTGTTCAGCAGAAGATGTCCCATTTTCACTCTTATCTTTGACAAGCTCCAATTTAGGCAATGCATGTTCTATATGTGGATCTTTCTTTGGGGCGTTCGTTCTATTCCCGAGCTTCTCTATACTCTTCTTCCTGCTTATTGTCTCATCGCCAACTCTCGGTTCTTGCCCGATGTACAAGAACCAGTCGCATGCATACCACTTTTACTTTTCGTCATCTACAACTTCCAACAACTACTACAATATTTGGAGGTCGGGCAGTCGGTGAGGACTTGGTGGAACAACCAAAGAATGGGAAGAGTAAACACAATGTGTGCATATTTATTTGGAGTTATAGGCATTGTGCTTAAGCTTTTAGGTTTATCGGAAACGATGTTTGAGGTAACGAGGAAGGGATCGTCTTCTTCGAATGACGATGGCGAGATCGAGGAGGATTCAGGTCGATTCACATTCGACGATTCTCCGTTGTTTGTGCCAGCCACGACCATTATGATGATACAATTGGCAGCACTTTCAATCGTTTGGTTGAGATCAATAATGGAGGAAAGCCATGTTGAAGAGTTTGGTGTGGGGGAGATGATGTGCAGTTTGTGGTTGGTTTTGTGCTTTTGGCCATTTTTGAAGGGTATGTTTGCAAAGGGAAGATTTGGGATTCCATGGCTAACGTTGTGCAAGTCTGGTGCTTTGACATTATTGTTCGTGTTCTTTGTGTTGAAGAACTACGAAGTGAGATTTTAA MAAPLFERAAIKRPIDRLLDAAIFLLLLSLLGYRLRFLCTDGFYWLQSTAFLCESWFTFTWFLHIAVKCNPVRFTTYPDRLLKRVEELPPVDIFVTTADAELEPPIITVNTVLSLLAVDYPADKLACYVSDDGGSPVTFYSLSEALNFAKIWVPFCKKYKIQVRAPFRYFYNNNNNEDLVSGGSPEFRHDWMKMKDEYEKLSQRIEKAALRDLTRELPDFSNIKSNNHPPIIKVIWENKEGLLDGLPNLVYICREKRPKHQHHYKAGAMNVLTRVSGLMTNAPYMMNVDCDMFVNNPKILLHAMCLLQDPTIDKEHAFVQFPQTFYNGLKDDPYGNQFHVVMEFIIRGTTGLQGPCYMGTGCIHRRKVLYGQSPDGTNIFGSNLDDELYKTFGKSESLKKSALHALRGIAHYPNHSIEALKEVATCDYEYHSYWGAKVGWLYGTATEDLLTGMTIHKKGWKSAFLLPNPEGFLGCAPSGGPASLTQQKRWITGQLEVLFSRRCPIFTLIFDKLQFRQCMFYMWIFLWGVRSIPELLYTLLPAYCLIANSRFLPDVQEPVACIPLLLFVIYNFQQLLQYLEVGQSVRTWWNNQRMGRVNTMCAYLFGVIGIVLKLLGLSETMFEVTRKGSSSSNDDGEIEEDSGRFTFDDSPLFVPATTIMMIQLAALSIVWLRSIMEESHVEEFGVGEMMCSLWLVLCFWPFLKGMFAKGRFGIPWLTLCKSGALTLLFVFFVLKNYEVRF Homology
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q339N5 (Cellulose synthase-like protein H1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CSLH1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 1.2e-199 Identity = 364/747 (48.73%), Postives = 478/747 (63.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80891 (Cellulose synthase-like protein B4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 648.7 bits (1672), Expect = 8.2e-185 Identity = 356/765 (46.54%), Postives = 482/765 (63.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX83 (Cellulose synthase-like protein B3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 640.2 bits (1650), Expect = 2.9e-182 Identity = 345/762 (45.28%), Postives = 479/762 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80899 (Cellulose synthase-like protein B2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 1.7e-174 Identity = 348/767 (45.37%), Postives = 474/767 (61.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23386 (Cellulose synthase-like protein B6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB6 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 607.1 bits (1564), Expect = 2.7e-172 Identity = 347/768 (45.18%), Postives = 472/768 (61.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FVZ4 (cellulose synthase-like protein H1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448620 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1151.7 bits (2978), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/743 (75.24%), Postives = 633/743 (85.20%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1K9 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495986 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1037.3 bits (2681), Expect = 3.0e-299 Identity = 506/740 (68.38%), Postives = 586/740 (79.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JAM8 (cellulose synthase-like protein H1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484067 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1027.7 bits (2656), Expect = 2.4e-296 Identity = 496/742 (66.85%), Postives = 588/742 (79.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FY73 (cellulose synthase-like protein H1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448396 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1026.9 bits (2654), Expect = 4.1e-296 Identity = 499/742 (67.25%), Postives = 588/742 (79.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LN39 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G416190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1023.5 bits (2645), Expect = 4.5e-295 Identity = 497/742 (66.98%), Postives = 581/742 (78.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. NCBI nr
Match: XP_038902591.1 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1174.8 bits (3038), Expect = 0.0e+00 Identity = 570/745 (76.51%), Postives = 635/745 (85.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. NCBI nr
Match: XP_023512253.1 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1167.9 bits (3020), Expect = 0.0e+00 Identity = 568/746 (76.14%), Postives = 637/746 (85.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. NCBI nr
Match: XP_038902592.1 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1162.9 bits (3007), Expect = 0.0e+00 Identity = 565/742 (76.15%), Postives = 631/742 (85.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. NCBI nr
Match: XP_022944069.1 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1151.7 bits (2978), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/743 (75.24%), Postives = 633/743 (85.20%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. NCBI nr
Match: KAG6570895.1 (Cellulose synthase-like protein H1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1149.0 bits (2971), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/743 (75.37%), Postives = 629/743 (84.66%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. TAIR 10
Match: AT2G32540.1 (cellulose synthase-like B4 ) HSP 1 Score: 648.7 bits (1672), Expect = 5.8e-186 Identity = 356/765 (46.54%), Postives = 482/765 (63.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. TAIR 10
Match: AT2G32530.1 (cellulose synthase-like B3 ) HSP 1 Score: 640.2 bits (1650), Expect = 2.1e-183 Identity = 345/762 (45.28%), Postives = 479/762 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. TAIR 10
Match: AT2G32620.1 (cellulose synthase-like B ) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 1.2e-175 Identity = 348/767 (45.37%), Postives = 474/767 (61.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. TAIR 10
Match: AT4G15290.1 (Cellulose synthase family protein ) HSP 1 Score: 586.6 bits (1511), Expect = 2.7e-167 Identity = 334/763 (43.77%), Postives = 458/763 (60.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g011640 vs. TAIR 10
Match: AT2G32610.1 (cellulose synthase-like B1 ) HSP 1 Score: 564.3 bits (1453), Expect = 1.4e-160 Identity = 326/761 (42.84%), Postives = 462/761 (60.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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