
Lcy07g000290 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGAAATACAAACGTCCTCCCCCAAAAAGCTGTAAAAATTAAAGTGCTCTCTACTCTCTCTAAAAAATGGCAGAAATGCACCCCATATTCTTACAATTATATAGATGGGTAGAACATGATGTGGGTAGGTTCCATGACCCTCAAATAGGAGGCAGAAAGAACCCTGAAGAAGAAGATGGAAGAGAAAAGGGCGGAATAAAATTCCCAACCTTTTTATTTTACAACACATCACCAACATAAATAGTTATTTATTTCAAACAAGATGTCACAGATCATTAACAGCAGGGATGAAAACCAACATTTTATAAAAGTTTAGGGATTAAAATGGACAATTTAAAAATTTAAAGATTAAGATATAATAAAGTTGAAAATTTAGGACCAAAATATGATTTAAACCTTATTTAAACTATCAAATAGTATCCACAATCCAATAAGAGCATAGCTCAACTGGCATAAAGTGGTATTGATAACCACGAGATCTGTTGTTCGAATCCCCCACCCCACATATTTTAAAAAAAAAAAAAAATACAACTTGAATCAAAGTGAGCATGGCTGGACTGCAATTAACATATACAGCCTCGTCCCACCCAAAATGTGGTTGAACCAAAAAAAAATCACAAACCCTACTTGTCTGCTTCCCTCCCTCTCTTTTCAAATTTCACGCCTTCTCTACCCTCCATCTCTTACTAGCGCTCAGTGCCGCTGCCGCTCGCCTTTCTTGCCTTGTGGTGTTGCTCGCTTTGATCTTCTTCCTCTCTCGATCTCGGATCTCGGGTACTCTTGTCAATCCCTATCTCTGGCTTTCTTGCCCAAGTTCATTTTTCCTTCATTGCATTGACGTTTTGGCTGGCCGTAGAAATTTCTTCATCTGACTTCATTTGTATCTTTCCACTGACGCTTGTCTTCTTCTTCACGGGTTCTCGCTTAATTGTTGCGGCGTCAGTAATTGTTGGTTTTACATGGCTGGTTTTCTATTTTTCTTTTTCCTTTCTTTTACCGCTTTGCGAAGTATTTTCCTCTTATGGGTTTGATATTAGAAAGCAATGTGAAAGTGGGGCGTGAATGAGATTGAAGACTTGCTGAACAAGGATTTTTTATTTTCTATAAATCGAATCGGCGGCGTAAGCCTGTTAAGGTCGATAACAATGATTCAAACTAGTTGGGTTTCATGTTTTCCTTTTCCTTCTAGGTCTTAATTTTGTTTATATAGCATTGCAGCAGTAAAATCAGTGGAGTTGCATTTGGTGTAGCAAGTTAACAAAATATTATGTCAAGGAATCCTTGAGCCAGAAGTTCAAGGACATCATATAATGGGGTAGCAACACACAAGGTTGTAGAGCTTGGGGTTTGGGTTTATGGTCGAGGGTTGAAGGTTTCAATTCAAAAAATGAAAAAGTAATGCCTATTGCAGTCATCCAACCTTTTCTTTTTGATGGCTTTTGGTGTTCGAATATCTATGTTCTTTTAGCAGCTTCTTAAATATTAGAAAAGATGGTGTTTTTGCAGAATTTAAAGGTATTCGTTGTATAAAAACCTTCAGTAGAACTTGTGATGTAGTCTTGAGGTACCAAGAAGGGAAAATAGTTATTGTATGTTGTTACAAGAATTGAAGCTTGTCTATGCTTTTATTTCCTCTCAAATTCAAAGTAGGCTTTATTATAATTTATAACAAAAGAACAGGGTGTGAATTGGCTTTCCATACTCTTGCTTCAACTCTAATGCTTGGTACATTTGGTTGTAAACTTATGAGATCCTGCTGTTGCATCTCATATTCTTTCTTGTTTTTCTCAAGATAATTGTCAGCATTACACATCATTACTTTTGTGCAAAAAGTTTGTAATGCTCAGTTTGCATTCAATAGGAATTTGCAAAAGAGGCTTGTTAATTCATCCTTTTGACATTGCATATGAATAAATGAAACATAATCCTCGTAGTCATTTGCTCTTAGACCTTTGTTGTGAACTTGAAAATAGTAATTTGGATGACAAATTTTGCTTCCAAATTAGTTTAACTTATTGATCGGCATGTATTGTCTTTATCGGATTGATATTATGAAGAACTAGAAACACTAACGAGCTAGCAGCACTTATTTAATGATAGTAGTCTATTTAGTCAAATTGGTCAAACATTCATTACCAATTTTGTTTAGCAAAAAATCAAAACAGAAATCTTTAAATCCTTGATTTTTTTTTGAGAAAAGATCAACTTTCATTGAGAAAAAATGAAAGAATACAAGGGCATCCAAAAAAACCAGCCCCCGAAAGGGAACCCCAATAAAGGAAGGGGCTCCAACCTTTAAATCCTTGATTGAAATCAATGAATAATAATCAGTCAAATTGGTTGAGCATTTGCTTGATGTTAGTAATATGTAACCGTTATCTGTACACAGATTTAATAGCGGTCTAATCTTCTCTGCTTTTCTTCAGGCACAATTAGAGGGTCTTGGGAATGTCATTGAAAGACGTCCATACTAGAATGTGCTAGCATGGAAGAACTATTTTTTCTCTCTCCTATAATCTCAAGTGTCATTAGCTAATAGGTCTGATTGAATATTTTCAAGTCCTATGTGGGTTCTCACAGTCTAGGGGTTTCACCTTTAGTTGTCTATTTTATTAATATGACTCTTTTTCATTTTTTTTCCCTTTTCATTCTTTCTGAAAGAAGGAGAATATTCATTTTGTTCAGGTTTTGGTAGGATGGAGATTATGTGTTTTCATACTTTTATCGGAAGCTTAGGTGTAGGGGCAATGTAAATGAATTAGTTATGTATCTAAGATTGTGGGGCCAATATAAACTGAATTAACTATTTATCTAAGATTCTTGATGTATTATTTTTTTATATCGTTAATTATTTTTTTATTTTTTTTGTAATGTTAGCTCATATGAACTAACTTGTTTTTGCTAATTAATGAGGTTGTATTAAACATAAGTTTATGAATGATTATCAGTAGGATACTTTTTCATTTTTTTCAATGTAAGCCAGTTTATCATAATTCATAAATGAAAAAAAGCAGGATGATTTTATCGTCAGTGGAAAAGTGAAGTTTCAAATGCTTGTTGCTCTTTGTACAGGAATACGTCACATTTGGTACGAGATAGGGAGTTTTCTTTTGTCATCCACCAAGGTAAGTATTTAAAGACTTGGGTTAGAGTTGGCGTGTGACTATAAGTGTTCTTGAAATTCTCTCAATTCCTTTCTGTTATAGTGGTTTAGGATGTTAGGTGTTTAGTGTTACTTATGAAGAAATCCCTACAAATTACCTCACCTCCCGTTTTATCTGTTTTTCCTTGCTTGAAATTGGCATGGGCTAGGGTTTAGAACTTAAGTTTCAAATGCTTGTTATCTTTTTCAGAAATACGTCACATTTGGTACGAGACAAGGAGTTATTTTTTTCATGCACCAAGGTAAGTGTATAAAGCCTTGGGTTAGAGTTGGCATGTGATGTGACTATAAGCGTTCTTCGAAATCCTCTCAATTCCTTTCTGTTACAGTGGTTTAGGATGTTAGGTGTTTAGTGTTACTTATGAAGAAATCCCTACAAATTACCTCGCCTCCTGGTTGATCTGTTTTTCTTTGTTTGAAATTGGTATGGGCTAGGGTTGAAAACTGATGTTGTTCCGACTCACTTGTACTTTATGCTCGTGGGTTTTCCTTTTGTTTATGTTTTCTCAATTCCTGTTTCAGGTGGTTTTCTTTCTTTATTTGTGGGATTGTTGTTGGTTAGTATACGACATGTTTTTTTTTTGCCCCACCTGCATAGTAGTTGTAGTTGGGCTTTGTTTATCTTTCATATACTTCAGTTATTTAGATGTGGATGCTAGGGTAGAAACATCAATTTGCAATCTGGAATTTATGATCACGGGTAAAGTATCTTGCAGCCACTTGAAGATATTGCGAGCTTGGACTAGCCTGGCCAATTGATTATTTTCTTCCTATTGTGCCCCACCAAAACCATACATTCTGTATTTCCTCCACTGTCATGAAGCTCGTTAGGTTTGCCGTTTTCTTTTATTTCCTTATATTCTAATTTTGAAATTCTTTTATCTTGATTTATTCACTGTTCGTGGCATTGAGGGGTTGTTTTATGTTAAGAAACTGGTTTTGGTAAATGGACAGGTTTTTAATGAAGCTCAACAATGAGACTGTCTCAATTGAACTCAAAAATGGAACTGTGGTCCATGGCACTATCACAGGTCTCCATCTCTATTTCACTCACAACATGATTTGCATAAATCCTAGATTTGATTCTGTTAAACCCTAGATTTATGAACTTGCAGGCAAAATTTTTTTAAACTTCAACTGCAATTCTGTTTTCTTCTTTATACTCAACTAATGTCAGAAGTTGTCTAACATTTTGGTCCAAAGAGATAATTGGATTTTGAATTCTATGGCCAATTTTGAGTGGTTTATGATGTAGCATAGTGATGTAAACAAGCTGGTGGGTTCTTATTAATGATGAAAAGATGCTGAAAGAATACAAAACCAGCCCCTTATATAGGCTGAAAAACTAACCAAGGGTGAAACTTTAAAGAGTTAAACTAACTACCAGCTTTAATAAGCTGTAAAAAATAAAAGGGGCTGCCCTTTGCCCAAAATAAAAGATAAAACTAACCAAGAAAGGTAAAAATAAAGACCTCTTGGATTTACACAAGAATTACACAAGAAAGGGCAAGAACTTTCAAGAAAGGACAAGATGTCCTACATCAAACCCTTCCCCCTTAGAAAAGAACTCGTCCTCGAGTTATGTTTGGAGAGTAAAGTCATCTGGAGCAAAGTAAGAGTATAAATTAGCCACATTAAAGGTGTTGCTGATGCGAAGGTTTGTAGGAAGATCAATGCGATAAGCGTTGTCTCCAATGCGCTCCAAAATAGAAAATGGACCAAGCTTTCTGTTTGTTAGTTTGTTGTGATGACCAGCTGGTAGTCGTGACTTGCGAAGGTGAACCATCACTAAATCACCCACTTGAAACTCCTTAAACCGTCGGTGAG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BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SY09 (Small nuclear ribonucleoprotein SmD1b OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SMD1B PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 3.0e-50 Identity = 102/110 (92.73%), Postives = 108/110 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SSF1 (Small nuclear ribonucleoprotein SmD1a OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SMD1A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 197.6 bits (501), Expect = 1.5e-49 Identity = 99/110 (90.00%), Postives = 107/110 (97.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3ZC10 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=SNRPD1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 6.5e-37 Identity = 82/110 (74.55%), Postives = 95/110 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P62314 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 6.5e-37 Identity = 82/110 (74.55%), Postives = 95/110 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4R5F6 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Macaca fascicularis OX=9541 GN=SNRPD1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 6.5e-37 Identity = 82/110 (74.55%), Postives = 95/110 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVC4 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024391 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 1.7e-51 Identity = 110/110 (100.00%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LD16 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G851900 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 1.7e-51 Identity = 110/110 (100.00%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C0D0 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495011 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 1.7e-51 Identity = 110/110 (100.00%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K070 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491270 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 211.5 bits (537), Expect = 3.7e-51 Identity = 109/110 (99.09%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EXE6 (Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437383 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 211.5 bits (537), Expect = 3.7e-51 Identity = 109/110 (99.09%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. NCBI nr
Match: XP_004150106.1 (small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Cucumis sativus] >XP_008454659.1 PREDICTED: small nuclear ribonucleoprotein Sm D1-like [Cucumis melo] >XP_022155676.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Momordica charantia] >XP_022157762.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Momordica charantia] >XP_022157763.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Momordica charantia] >XP_038896755.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038897023.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b isoform X1 [Benincasa hispida] >KGN59890.1 hypothetical protein Csa_002314 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 3.4e-51 Identity = 110/110 (100.00%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. NCBI nr
Match: XP_022931093.1 (small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Cucurbita moschata] >XP_022995872.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Cucurbita maxima] >XP_023533992.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Cucurbita pepo subsp. pepo] >KAG7036369.1 Small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 211.5 bits (537), Expect = 7.6e-51 Identity = 109/110 (99.09%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. NCBI nr
Match: XP_022963993.1 (small nuclear ribonucleoprotein SmD1b-like [Cucurbita moschata] >XP_023553601.1 small nuclear ribonucleoprotein SmD1b-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >KAG7011241.1 Small nuclear ribonucleoprotein SmD1b [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 210.7 bits (535), Expect = 1.3e-50 Identity = 108/110 (98.18%), Postives = 110/110 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. NCBI nr
Match: GFP82007.1 (small nuclear ribonucleoprotein sm d1 [Phtheirospermum japonicum]) HSP 1 Score: 210.3 bits (534), Expect = 1.7e-50 Identity = 108/110 (98.18%), Postives = 109/110 (99.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. NCBI nr
Match: XP_022771087.1 (small nuclear ribonucleoprotein SmD1a-like [Durio zibethinus]) HSP 1 Score: 210.3 bits (534), Expect = 1.7e-50 Identity = 108/110 (98.18%), Postives = 109/110 (99.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. TAIR 10
Match: AT4G02840.1 (Small nuclear ribonucleoprotein family protein ) HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 2.1e-51 Identity = 102/110 (92.73%), Postives = 108/110 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. TAIR 10
Match: AT3G07590.1 (Small nuclear ribonucleoprotein family protein ) HSP 1 Score: 197.6 bits (501), Expect = 1.1e-50 Identity = 99/110 (90.00%), Postives = 107/110 (97.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. TAIR 10
Match: AT3G07590.2 (Small nuclear ribonucleoprotein family protein ) HSP 1 Score: 197.6 bits (501), Expect = 1.1e-50 Identity = 99/110 (90.00%), Postives = 107/110 (97.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. TAIR 10
Match: AT4G02840.2 (Small nuclear ribonucleoprotein family protein ) HSP 1 Score: 191.8 bits (486), Expect = 5.8e-49 Identity = 102/120 (85.00%), Postives = 108/120 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g000290 vs. TAIR 10
Match: AT1G20580.1 (Small nuclear ribonucleoprotein family protein ) HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 2.1e-06 Identity = 33/112 (29.46%), Postives = 60/112 (53.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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