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Lcy06g021880 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAGTAATCGCTTTCTCCACCGCATAGCCTTTTTACAAATACCTCATTCTCCACTCCCAATGTCCAAACAAAACAACCACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTCTGTTCCTCTGTTTTCGTCTCTGAATTCCTTGGATGGATCTTCAATGGCTTCTCGATTTCCTTCAAGGAATGACGAAGCCCTTTCTCGCCACTGCCATTGTCGCCGTCGCCGTCGTCCTCTCTTACTTGCAGAAGCTCGGCCTCGAAGGCGAAATGATCTACGCCATTTTCAGAGCCTTTCTCCAGCTCTCTGTTATTGGCTTCGTTCTTCAGTTCATCTTCAACCAGCAGAACCTCGCTTGGATCCTCCTCGCCTATCTCTTCATGGTAATTTCTCGCTTCCGTTTTATGCCTGCCAACTGTTTGATGTTTGGTTCCTCAGAAAATTTTATGCCCACATCAATGGGAATTGTATTTCTTTTCCGATCGGACAATACTTGATTGCATATCGAGATTTTTTCACACACATCGTTAAAATGTTAACAATTAGGGGAGTCAAAAAAAGGGTAAAATTATCAAAAATACCCCTGAACTAAGGGTTGGTTTCAATTATACCCTGAACTTTCAAAAGTTTTATTTTAATCTTCGAAAACGACCCTCGAAGACATTTTTCGTTAAATTTATGGACGGAAAAATTCAACGAAAAAATGCATGCACGAGTTATTTTGAGACAAAGTTCAAACTTTGTGGACTAAAACGAAACTTTGAAAGTTCATGTGTATAATTGAAACCAAACTCATAGTTTAGGGGTATATTTGATAATTTAACCAAAAACTTCTCATTTTCTATCATTTTTTTCCTTAATTGTCAATATTTTAATAGAGTGGTAGGAGATCAACGTTATGCAGCCAAGCAAAATATTTTTATTTCAATCAAAGTTTTAATTAAGTTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGTTGCATATCGATATATAGACATTTTTTTACACGCCACTATTAAAATGTTTTTTTTTTAATTTTACTATTAGAAATACCTATATATGACTAGGTAAAATTATTGAAAAGTTTGAATCTCTATTTTTATTTCATTTTAACCAAGTAAACAAGTTGACTTCTAGAGAGTTCTCTTTTTTTTGGGGGGCTAAATTATAAAAAAAATGCCCTTAAACTATGGGATTTGTTTCAAAAATGTCTCTGAACTTTCAAAAGTTTAAAAAATACCTCTGAACTTAAAAAAATGTTTCAAAAATACCCTTGTTAATTTTTTTTTTTTTTGTTATGAAAACCATTAAAAACTTCAGTTTCATTAATACTCTATAACTTTCAAAATATTTAAAAAAATAATCTTATTAGAAAATGTTTTTTTTTTTCCTTATCCCACCGTAAATTCTTCTTCTATGAAAATTAATGAGAAGTTTTACCTATTTTTCATATATTCATACATTAGGAGTTTTTCTTCTCTTTCAACACATCATTCCAAGAGCTTGACTAGATTTTCGGCAATGGTATTTTCGAAACATTTTTAACAGTTTTAACTGTTTTTCATCCAAAAATTAACTACAAGGGTATTTTTTAAATGTTTTGTAAAGTTTAGGGGTATTTTTGAAATTTTTTAAAGTTCAGGGACATTTTGAAACAAATTCCATAGTTAGGGGCATTTTCTATAATTTAACCTTTTTTTGTTGGAAGAGAAGTTTTTATTTTCTTTTTTTTATAATGGGTTTCGCGTGGTTATCTGGTTTTGTGGGTGTCACGCTCATGAACTCTTTTGCGAAAATAGAGAGAATGTTTTCGGGATAATTTTGACAAATAATTGAGGTGGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTGACAAATATGACGTGATAATTTTGCAAGCTTCTTTTGATATTAACAGAAAATCATTTTGTAAATAGTTTTTTCTAGAAAAAATAATAATAATTATTATCCTGGGTGGATTTTATTTTCTGGTGTGTTTTTGTAATATTTGTATTACTTTCGCCTGTATATTTTAAGATTCTTTTTTTTTTTTAATTTGTTGATTTTAAGAATTAATTAGTGTTGAGAAAAAGTTGACTTTTTGATGGTCAACATGGGCTGAGCGTGACTATGTGCAGAGTTTATGAATTGGTTATAAGGATGGTCTATAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTGAAAAAAATCATAGTCTATAGTTAAATTTTGGGGAATTTAAAATTTTGATTATTTCAAAAGTTTTTCTTAAGGCAAATTATAAATTTGATTATTATGATTTTAGCTTAATTTTAATTTTATTAGTTTAGTTTGTGTTTAGTTTGAATTTAGTCTTTGTACCTTGGACTAAATCTTATAAATCATTTTTGTTGCTACAATTCAAATACATGATTATTTAGGTCCCGTTTGATAATCATTTGGTTTCTGGTTTTTGAAAATTATGCTTGTTTTCTCTCAATTTTTCTACCATGGTTTTCATCTTTGTCAAGGAAACATTTGAATTCCTAGCTAAATTCCAAAAACAAAACCAAGTTTTTGAAAACTATTTTTTTTAGTTTTCAAAAATTGGCTTGGTTTTTGAAAACATGAAAAGAATGTATTAGGAAAACAAAGAAATTTGTAGGTGAAAGTAGTGTTTATAGGCTTAATTTTCAAAAACCAAAAACAAAAAATCAAATGGTTATCAAACGGGAACTTATTTATTTGACTATGAGCATGTGATTTGCTTTCAATTATGTTGCTAATTAACCAAATTAAGATATATGCAAAATATATATATATATATATATAAATAAAGCGAGTTAGGATTTTTTGTGGGTAAAAATGGTTTATAGACAATTTGTGAGTTCTAACCAAACCTCATCATCCAAATTGAAAACTTTTTATTTAAGATAGAAACCAAATTGAAAATTAAGTTCAAAACACAATGTCTAGGATCCTGTTTGATAACCATTTGGTTTTTTAAAATTATGCATGTTTTCTCCTAAATTCCAACTTTCATCCTAGTTAAGGTTGCATTTGAATTCCTAACCAAATTTTAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAAACTATTTTTTTTTTTTCAAAATTGGACTTGGTTTTTGAAAACAAAGTAGAAGAGTGATACTAAAACCAAAAAACTTATAGGTGGAAGCACGTGTGTATAAGTTTAATTTTCAAAAACAAAAAACCAAAAACCAAATGGTTATCAAACGGGGCCTAAATATTTTAATTCTTGTTCCATTGGTAAGTATATCCATTTTTGGATTTGAAATTCGTGGTTAAGTAACAAATTTATTCTCTTTGAACACATTTTCAATGGGATCCTTGTAGTTTTAAAAGTTTCAATTTAGTTCTTGTCACTTGGATTTGATTATTTTCAATTTGGTTCATATATTTCTTTTTATTTTTGCTCAACCCAAAACCTTAAATACAATTAACCAAATAGAAATCATCATCTCATTTTCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAAAAACAAAACAAAAAAATGTAAATCAATTTAGGAAACTTGACTAGACTATACAAATCGGATTTGACTTTTTTTTTTTTTACAACAAATCAAATTTGACTTAGACAATAGAAATCAAATTTAATATTTTTCAAAGCACATAAATCGAGTTGAAACCAAACTCAAACTATAGGGATCAAATTTATAATTTTTTTAAAAATAAATGGGATCAAAATTATAATTTAGTCAAAATCAATTAACTTTATAATTGCTGCTGCAGGTGACGGTTGCGGGATACACAGCAGGGCAGCGTGCGAAGCACGTGCCTCGAGGAAAATTGGTCGCCGGAGCTTCAATTTTGGCCGGAACTTCAGTGACTATGGTGATGCTTGTGGTGTTAAAAGTCTTCCCCTTCACTCCAAGGTACATAATCCCGGTCGCCGGAATGATGGTCGGAAACGCCATGACTGTCACCGGCGTCACCATGAAGAGACTCAGAGACGATATCAGAACTCAATTCAGCCTCGTAATTTCTCTCTCCCTCATACTTTTGATTTTGCATCTAACAAATATGCGAACGTTCAATTTTGTATTTCATATGTTCTTGAATTTTTAACGTCGTGTCTAATAGAATTCTAATATTTTAATTCTTATTTTTGAAAAGTCCATAAATTTAAAGATAGAAAGTGTCTAATGGAACCTATCAAATATAAAATTGAAAGTTTTGAAATTTGTTAAATGCTTTGTAAAGTTTAAACACTTATAATAATCCGATTAGTAAACTTGAAATTTAACCTTTGAACCTTTTCTTTTTCTTTTTATTTATATCAAACACTTTTTGTGGAATTGGAAATTAATATTAGTACAAGATCTTAATTAGAATTCTGACCCCGAAAATGGGTTATTCGTACAAATTTTTCTAGACTTTTATATGAAATGGAGGGAAGCCATATTTTAGTAGTTTGAATATGAGTTGGTTTGGTTCAAAACCATGTTAAATTATGACTACGTTTAAAAGCTTAAACAAATGTTTGTGTATTTTAATATTTAAGTTACAAGTTTGATTTATAAGCTTTGTTACCCAAAGTTTTTAATATATGTTCTTAAATTTTCAATTGTGTTTAATTAAAATTTCAACATGAGCATAGCTTAACTGACATAATTTTTATAACGACTAAAAGGTTTGTGGTTTAAGTCTCCCACTCTCACATGTATTATTGTCGATAATCTATTAGACACAACGTTTCGAATTTAATAATGAATCTAATACTTTAACCACCATCTATTATTCAATTCAGGTGGAGACGGCGTTGGCTCTAGGAGCAACGCCGCGGCAAGCGACGCACCAGCAAGTGAAGAGAGCATTGGTGCTGGCATTGTCGCCGGTGGTCGACAACGCGAAGACGGTGGGGCTGATCTCGCTCCCGGGGGCGATGACGGGGCTGATAATGGGCGGAGCGTCTCCGATCGAAGCCATTCAGCTGCAAATTGTGGTGATGAATTTTCTGATCGGAGCTTCGACGGTGAGCAGTATAATGTCCACTTACCTCTGCTGGCCTTCCTTCTTCACCGCCGCCTACCAGTTGGAAACGGCCGTCTTTGCCTCCGCCTGATTTCCTTTGCCTTTCTCATTTCAGTTTTTCATTACTTTTTAGAGTTCAAATGTAAATTCAATTAGGCTAGTTTTTTGGTTTTTGTTTATAAACTTTAGTTTAATCCATAAATGGGCTAAAGTTTCGATTTAGTCTCTATGATTTGAAAATTTTTATTTTAGCGAATGATATGTTTTACTAATAATTTAGATTTGAA CAAGTAATCGCTTTCTCCACCGCATAGCCTTTTTACAAATACCTCATTCTCCACTCCCAATGTCCAAACAAAACAACCACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTCTGTTCCTCTGTTTTCGTCTCTGAATTCCTTGGATGGATCTTCAATGGCTTCTCGATTTCCTTCAAGGAATGACGAAGCCCTTTCTCGCCACTGCCATTGTCGCCGTCGCCGTCGTCCTCTCTTACTTGCAGAAGCTCGGCCTCGAAGGCGAAATGATCTACGCCATTTTCAGAGCCTTTCTCCAGCTCTCTGTTATTGGCTTCGTTCTTCAGTTCATCTTCAACCAGCAGAACCTCGCTTGGATCCTCCTCGCCTATCTCTTCATGGTGACGGTTGCGGGATACACAGCAGGGCAGCGTGCGAAGCACGTGCCTCGAGGAAAATTGGTCGCCGGAGCTTCAATTTTGGCCGGAACTTCAGTGACTATGGTGATGCTTGTGGTGTTAAAAGTCTTCCCCTTCACTCCAAGGTACATAATCCCGGTCGCCGGAATGATGGTCGGAAACGCCATGACTGTCACCGGCGTCACCATGAAGAGACTCAGAGACGATATCAGAACTCAATTCAGCCTCGTGGAGACGGCGTTGGCTCTAGGAGCAACGCCGCGGCAAGCGACGCACCAGCAAGTGAAGAGAGCATTGGTGCTGGCATTGTCGCCGGTGGTCGACAACGCGAAGACGGTGGGGCTGATCTCGCTCCCGGGGGCGATGACGGGGCTGATAATGGGCGGAGCGTCTCCGATCGAAGCCATTCAGCTGCAAATTGTGGTGATGAATTTTCTGATCGGAGCTTCGACGGTGAGCAGTATAATGTCCACTTACCTCTGCTGGCCTTCCTTCTTCACCGCCGCCTACCAGTTGGAAACGGCCGTCTTTGCCTCCGCCTGATTTCCTTTGCCTTTCTCATTTCAGTTTTTCATTACTTTTTAGAGTTCAAATGTAAATTCAATTAGGCTAGTTTTTTGGTTTTTGTTTATAAACTTTAGTTTAATCCATAAATGGGCTAAAGTTTCGATTTAGTCTCTATGATTTGAAAATTTTTATTTTAGCGAATGATATGTTTTACTAATAATTTAGATTTGAA ATGGCTTCTCGATTTCCTTCAAGGAATGACGAAGCCCTTTCTCGCCACTGCCATTGTCGCCGTCGCCGTCGTCCTCTCTTACTTGCAGAAGCTCGGCCTCGAAGGCGAAATGATCTACGCCATTTTCAGAGCCTTTCTCCAGCTCTCTGTTATTGGCTTCGTTCTTCAGTTCATCTTCAACCAGCAGAACCTCGCTTGGATCCTCCTCGCCTATCTCTTCATGGTGACGGTTGCGGGATACACAGCAGGGCAGCGTGCGAAGCACGTGCCTCGAGGAAAATTGGTCGCCGGAGCTTCAATTTTGGCCGGAACTTCAGTGACTATGGTGATGCTTGTGGTGTTAAAAGTCTTCCCCTTCACTCCAAGGTACATAATCCCGGTCGCCGGAATGATGGTCGGAAACGCCATGACTGTCACCGGCGTCACCATGAAGAGACTCAGAGACGATATCAGAACTCAATTCAGCCTCGTGGAGACGGCGTTGGCTCTAGGAGCAACGCCGCGGCAAGCGACGCACCAGCAAGTGAAGAGAGCATTGGTGCTGGCATTGTCGCCGGTGGTCGACAACGCGAAGACGGTGGGGCTGATCTCGCTCCCGGGGGCGATGACGGGGCTGATAATGGGCGGAGCGTCTCCGATCGAAGCCATTCAGCTGCAAATTGTGGTGATGAATTTTCTGATCGGAGCTTCGACGGTGAGCAGTATAATGTCCACTTACCTCTGCTGGCCTTCCTTCTTCACCGCCGCCTACCAGTTGGAAACGGCCGTCTTTGCCTCCGCCTGATTTCCTTTGCCTTTCTCATTTCAGTTTTTCATTACTTTTTAGAGTTCAAATGTAAATTCAATTAG MASRFPSRNDEALSRHCHCRRRRRPLLLAEARPRRRNDLRHFQSLSPALCYWLRSSVHLQPAEPRLDPPRLSLHGDGCGIHSRAACEARASRKIGRRSFNFGRNFSDYGDACGVKSLPLHSKVHNPGRRNDGRKRHDCHRRHHEETQRRYQNSIQPRGDGVGSRSNAAASDAPASEESIGAGIVAGGRQREDGGADLAPGGDDGADNGRSVSDRSHSAANCGDEFSDRSFDGEQYNVHLPLLAFLLHRRLPVGNGRLCLRLISFAFLISVFHYFLEFKCKFN Homology
BLAST of Lcy06g021880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: C0PC98 (Uncharacterized protein OS=Zea mays OX=4577 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 3.9e-21 Identity = 70/149 (46.98%), Postives = 88/149 (59.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy06g021880 vs. NCBI nr
Match: ACN31793.1 (unknown [Zea mays]) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 8.0e-21 Identity = 70/149 (46.98%), Postives = 88/149 (59.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy06g021880 vs. NCBI nr
Match: XP_038980165.1 (uncharacterized protein LOC108511366 isoform X1 [Phoenix dactylifera] >XP_038980166.1 uncharacterized protein LOC108511366 isoform X1 [Phoenix dactylifera] >XP_038980167.1 uncharacterized protein LOC108511366 isoform X1 [Phoenix dactylifera] >XP_038980168.1 uncharacterized protein LOC108511366 isoform X1 [Phoenix dactylifera]) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 1.4e-09 Identity = 39/83 (46.99%), Postives = 53/83 (63.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy06g021880 vs. NCBI nr
Match: XP_021302747.1 (UPF0014 membrane protein STAR2 isoform X2 [Sorghum bicolor]) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 1.6e-08 Identity = 51/115 (44.35%), Postives = 66/115 (57.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy06g021880 vs. NCBI nr
Match: XP_021302748.1 (UPF0014 membrane protein STAR2 isoform X3 [Sorghum bicolor]) HSP 1 Score: 69.3 bits (168), Expect = 5.9e-08 Identity = 47/95 (49.47%), Postives = 58/95 (61.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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