Lcy06g013860 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy06g013860
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionULP_PROTEASE domain-containing protein
LocationChr06: 23765048 .. 23780362 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy06g013860
SyntenyLcy06g013860
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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mRNA sequence

ATGGTCATAGGTGATGATTGTGCATTACTGATTCCTATGAACGATGAACTACAAACGTTGCATCAAGCGATTTGCGATGCTTTCGATGCAACAAGAAGATACACTAACGACCAATATGCACCAACCTATCTTGGGAAAGGAAGCATCAATATTTTTCATCGCGAAGACATCATGCAATATTGTGAGAATGTTGAGATAGGTTACTTATTCATACTCACGTACATTACGTACCTCTGGACTGTACTTGATCCCGAGATAACAAACATGGGGTTGAGAATGTGGCAAGCTAAGCACTCGCTTCCGCAATATCGATCTGTTATTAGTTGGAAACTAGTGAAGTGCCCCAGTCAATCAGGTTCGATAGAGTGTGG

Coding sequence (CDS)

ATGGTCATAGGTGATGATTGTGCATTACTGATTCCTATGAACGATGAACTACAAACGTTGCATCAAGCGATTTGCGATGCTTTCGATGCAACAAGAAGATACACTAACGACCAATATGCACCAACCTATCTTGGGAAAGGAAGCATCAATATTTTTCATCGCGAAGACATCATGCAATATTGTGAGAATGTTGAGATAGGTTACTTATTCATACTCACGTACATTACGTACCTCTGGACTGTACTTGATCCCGAGATAACAAACATGGGGTTGAGAATGTGGCAAGCTAAGCACTCGCTTCCGCAATATCGATCTGTTATTAGTTGGAAACTAGTGAAGTGCCCCAGTCAATCAGGTTCGATAGAGTGTGG

Protein sequence

MVIGDDCALLIPMNDELQTLHQAICDAFDATRRYTNDQYAPTYLGKGSINIFHREDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWTVLDPEITNMGLRMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQSGSIEC
Homology
[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UJP3 (ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold431G00090 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 5.1e-10
Identity = 40/92 (43.48%), Postives = 49/92 (53.26%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWT------------VLDP----------EITNMGL 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT+ W             VLD            I N+GL
Sbjct: 339 REDLLHYCGMVEIGYMCILAYITFHWMLHVIDLRENCVYVLDSLWSKVNEDIHGIINVGL 398

Query: 114 RMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQSGSIEC 124
           + WQAKH L +YRS   W+ VKCP Q  S+ C
Sbjct: 399 KTWQAKHDLQRYRSTPKWRPVKCPRQLDSVGC 430

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SR27 (ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold500G00110 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 5.1e-10
Identity = 40/92 (43.48%), Postives = 49/92 (53.26%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWT------------VLDP----------EITNMGL 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT+ W             VLD            I N+GL
Sbjct: 29  REDLLHYCGMVEIGYMCILAYITFHWMLHVIDLRENCVYVLDSLRSKVNEDIHGIINVGL 88

Query: 114 RMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQSGSIEC 124
           + WQAKH L +YRS   W+ VKCP Q  S+ C
Sbjct: 89  KTWQAKHDLQRYRSTPKWRPVKCPRQLDSVGC 120

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VAW3 (ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold468G001580 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 5.1e-10
Identity = 40/92 (43.48%), Postives = 49/92 (53.26%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWT------------VLDP----------EITNMGL 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT+ W             VLD            I N+GL
Sbjct: 26  REDLLHYCGMVEIGYMCILAYITFHWMLHVIDLRENYVYVLDSLRSKVNEDIHGIINVGL 85

Query: 114 RMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQSGSIEC 124
           + WQAKH L +YRS   W+ VKCP Q  S+ C
Sbjct: 86  KTWQAKHDLQRYRSTPKWRPVKCPRQLDSVGC 117

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C398 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007859 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 5.1e-10
Identity = 43/125 (34.40%), Postives = 52/125 (41.60%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWTVLDPEIT-------------------------- 113
           R DIMQYC  +EIGY  ILTYI YLW V + EIT                          
Sbjct: 470 RNDIMQYCTMIEIGYSCILTYIAYLWDVYEYEITKKFLIVDPATISPYVKSQEYRFRNLA 529

Query: 114 -----------------------------NMGLRMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQS 124
                                        N  L++WQAKHS+ +YR+   WK +KCP Q 
Sbjct: 530 NRLEMVNLEQLVLIPYKSGKIQEDYQRVINTSLKIWQAKHSIQRYRTNTIWKSIKCPCQM 589

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VAM1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold301G00250 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 1.5e-09
Identity = 35/70 (50.00%), Postives = 42/70 (60.00%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWTVLDPEITNMGLRMWQAKHSLPQYRSVISWKLVK 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT             GL+ WQAKH L +YRS   W+LVK
Sbjct: 171 REDLLHYCGMVEIGYMCILAYIT-------------GLKTWQAKHDLQRYRSTPKWRLVK 227

Query: 114 CPSQSGSIEC 124
           CP Q  S+ C
Sbjct: 231 CPRQLDSVGC 227

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. NCBI nr
Match: KAA0063045.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold468G001580 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.1e-09
Identity = 40/92 (43.48%), Postives = 49/92 (53.26%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWT------------VLDP----------EITNMGL 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT+ W             VLD            I N+GL
Sbjct: 26  REDLLHYCGMVEIGYMCILAYITFHWMLHVIDLRENYVYVLDSLRSKVNEDIHGIINVGL 85

Query: 114 RMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQSGSIEC 124
           + WQAKH L +YRS   W+ VKCP Q  S+ C
Sbjct: 86  KTWQAKHDLQRYRSTPKWRPVKCPRQLDSVGC 117

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. NCBI nr
Match: KAA0056183.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold431G00090 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.1e-09
Identity = 40/92 (43.48%), Postives = 49/92 (53.26%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWT------------VLDP----------EITNMGL 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT+ W             VLD            I N+GL
Sbjct: 339 REDLLHYCGMVEIGYMCILAYITFHWMLHVIDLRENCVYVLDSLWSKVNEDIHGIINVGL 398

Query: 114 RMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQSGSIEC 124
           + WQAKH L +YRS   W+ VKCP Q  S+ C
Sbjct: 399 KTWQAKHDLQRYRSTPKWRPVKCPRQLDSVGC 430

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. NCBI nr
Match: XP_022136079.1 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X3 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.1e-09
Identity = 43/125 (34.40%), Postives = 52/125 (41.60%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWTVLDPEIT-------------------------- 113
           R DIMQYC  +EIGY  ILTYI YLW V + EIT                          
Sbjct: 470 RNDIMQYCTMIEIGYSCILTYIAYLWDVYEYEITKKFLIVDPATISPYVKSQEYRFRNLA 529

Query: 114 -----------------------------NMGLRMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQS 124
                                        N  L++WQAKHS+ +YR+   WK +KCP Q 
Sbjct: 530 NRLEMVNLEQLVLIPYKSGKIQEDYQRVINTSLKIWQAKHSIQRYRTNTIWKSIKCPCQM 589

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. NCBI nr
Match: KAA0032486.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold500G00110 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.1e-09
Identity = 40/92 (43.48%), Postives = 49/92 (53.26%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWT------------VLDP----------EITNMGL 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT+ W             VLD            I N+GL
Sbjct: 29  REDLLHYCGMVEIGYMCILAYITFHWMLHVIDLRENCVYVLDSLRSKVNEDIHGIINVGL 88

Query: 114 RMWQAKHSLPQYRSVISWKLVKCPSQSGSIEC 124
           + WQAKH L +YRS   W+ VKCP Q  S+ C
Sbjct: 89  KTWQAKHDLQRYRSTPKWRPVKCPRQLDSVGC 120

[Close]
BLAST of Lcy06g013860 vs. NCBI nr
Match: KAA0065352.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold301G00250 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 3.1e-09
Identity = 35/70 (50.00%), Postives = 42/70 (60.00%), Query Frame = 0 

Query: 54  REDIMQYCENVEIGYLFILTYITYLWTVLDPEITNMGLRMWQAKHSLPQYRSVISWKLVK 113
           RED++ YC  VEIGY+ IL YIT             GL+ WQAKH L +YRS   W+LVK
Sbjct: 171 REDLLHYCGMVEIGYMCILAYIT-------------GLKTWQAKHDLQRYRSTPKWRLVK 227

Query: 114 CPSQSGSIEC 124
           CP Q  S+ C
Sbjct: 231 CPRQLDSVGC 227

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lcy06g013860 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy06g013860 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7UJP35.1e-1043.48ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN... [more]
A0A5A7SR275.1e-1043.48ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN... [more]
A0A5A7VAW35.1e-1043.48ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN... [more]
A0A6J1C3985.1e-1034.40uncharacterized protein LOC111007859 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 G... [more]
A0A5A7VAM11.5e-0950.00Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold... [more]
BLAST of Lcy06g013860 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0063045.11.1e-0943.48uncharacterized protein E6C27_scaffold468G001580 [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0056183.11.1e-0943.48uncharacterized protein E6C27_scaffold431G00090 [Cucumis melo var. makuwa][more]
XP_022136079.11.1e-0934.40uncharacterized protein LOC111007859 isoform X3 [Momordica charantia][more]
KAA0032486.11.1e-0943.48uncharacterized protein E6C27_scaffold500G00110 [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0065352.13.1e-0950.00uncharacterized protein E6C27_scaffold301G00250 [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of Lcy06g013860 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy06g013860.1Lcy06g013860.1mRNA