Lcy06g012560 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy06g012560
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr06: 16446610 .. 16456986 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy06g012560
SyntenyLcy06g012560
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

CTAAGCTCATTTTCTTTTTCCACTCTCTCTTTTCCATTCACCCGATAGTCTGCTTCCCCACCAACACATCTTCTTCTTCCTTCTTGCCGTGGAAACAGACTGCCGGCGCACAACCTCCGACCGCTCCTCCGGTGAAGTGTAGCGGCGACATTCGCGAGCAGTTCGACGACGTCCTCGGTAGCGTGCAACAGAGGGGACTCCGGCGAAGGTGTTAACAGCATTTTCCGGCGAGTTTCAGGAGCTGCAGCGGTTTGTTTTCACGAGTTTCCGGCGAGCGTACGGTGTAGGCGCGACAGCAGCGTTTTGGGCGGGATTTTCAGCGTTTCCAGCAAGTTCTCAGCGTGGCAAGCTTTCCCTTCAAATTCCGGCAATTCAAGCCGTGGGTCTTCGAGTTTCAGCATCTTTGAGCAATTTCGGCTTTGGACAAATGTTTTGCATCAAGGTTTGGAGTTGATTTTGTGTTTATTCAAATACCCATTGATGCTAGCTTTCAAGTTCAAGGTACCCCTGGCATATGGTGATTTGTTCGTCAATTTGGAGTGAAATTGGAAGCCCGGACAGCAAGCGTTTGTTCTGTTTTTTTTGGCTTCCTTGAAGCCGTGGAGCTTCGGAGTTAATTTAGAATTCATGAAGCATTATTTGGCTAAAGTGGTACTGGATGACATCAGGCGAGTGGCGTGAGTAGTGACTTGGCTAGGCTATGGGATGCAGCTACAAATCATGTTCCTAGAAGTCTAGGATCGAGTTTCCTAGTTTCATGCTTGCTGATGTTTTAAAATTTCAACTTTGTGAAATCTGTCTATCGCGTTTTAACTATTCTATTATCGTAAAATGACTTATGGTTTTGGGTCCAGTTTATTAAACAAAAGATTTTTACTTATGACCTCTTTCGCTTTAAAGTTTTTTTTTTTTTAAAAAAGTTTCAGAAGTTTTATGTTTTCATGCATGTAGTAGCGACCCTCAACATGTTTTTAGCTTCCTTTTAGCTAGGTCGTTACAAATACAATTTTTCTGCCGATTTTCATTTTGTCATCCTCTTTTAGAATTTCTTCCGGTTATCTGCATGTTGTAATTCTAGTTTAGAATTTCTTATCATGGTTATTTGCATTTTTTCATCCTCGGTTATAATCTCATCCTCTGTAGAATGTCTTCTAGTGATTGCATCTTGTAATTCTAGGTTAGGATTTCTTATTATGGTAATGTGCGTTTTAGAATTTCGGTTGGTAAGAATTATTTTATTTGTCCAGTGCAAATTAAATTTCACTTCTAAGTATACTTAGATAATTCCAAAATAGTTTTAGTTGTTGAAACCTAAATTCTCTTGAAACTGACTAGATAATTGTAAATTTACAATCATTTGATTTGCATAGATAGAGTGAAATTGAGTGAGGTGAAAGAAAAAAACGTTAATAAAGTCAAAGCAAACAAGGGAGATAGTGACTTTATAACATTAATCTCACGATATAAAGCAAAATATTGAGTATTTAAAAGTTTAGTATTAGTAATACTAAACTGATTTAATATTTTAGGATGAATTTGGACTTGAATTTGCGGCCGCCGGAGTTCGAGGATATAAAATTTGGAATTAGGCCTAGCTCCTCCTGCACCTTCTGCTCCTGCTCCCTGCACTTATTCTACTCCTTTTGTGCCTCTGCCTACTCGTCCCCCTTTGCCTTTTGTGCCTCTGCCTCCTCGTCCACACGCTTCTTTGCCTTTTGTGTCTCTGCCTCCTTGTCCCCACACTTCTCTGCCTTTTGTGCCTCTGCCTCCTTGGTAGGCTCCCCAGAGGCACAAAAGGCAAAAGCACCCAGGGACGAGGAGACAGACGCACAAAAGGCAGAGAAGGGTGGGGACGAGGAGGCAGATGCACAAAAGGCAAAGAAGCGTGGGGACAAGGAGGCACAAAAAGCAAAGAAGCGTGGAGACGAGGAGGTAGAGGCATAAAAGGAGTAGGAGAAGTGCAGGGAGCAGAAGGTGCAAGAGGAGCTAGGCCCAATTCCAAATTCATATCCTCGAGCTCCGACGGCCGCAAATTCAAGTCCAAATTCATCCTAAAATATTTAATGAGTTTAGTATTACTAATACTAAACTTTAAAATACTCAATATTTCGCTTTATATCGTGATATTAATGTTATAAAGTCACTGTCTCCCTTGCTTTGACTTTATTAACGCCTTTTTCTTTCACCTCATTCAATTTCACTCCATCTATCCAAGTCAAATGACTGTAAATTTACAATTGTCTAGTCGGTTTCAAGAGAATTTAGGTTTCAGCAACTAAAACTATTTTGGAATTATCTAAGTATACTTAGGAGTGAAATTTAATATGCACTGGACAAATAAAATAATTCTTACCGGTTGAAATTCTAAAATGCACATCACCATAATAAGAAATTCTAACCTAAAGTTACAAGATGCAATCACTAGAAGTGACGCCCCGTGCATTTCGGGTGTTATTTAGATTCCATGTAGTTTGTCGAATGAAAATATAAATCTTATTTGGACTTGTAATATGAAATATATAATTAAATACCAAGGTGTTGGGAAATCAAGGTGAATGTGAAATTAATTTCTCCCTAAAGCTTGATATATTTTTAAGCCAGCGTTGGTTGCAAAAGAGGTTAAGCGTTGAAATTCTCACACTGAATGTGAAGAGAATTGGCTGGGAAGATCTATATTTGGCCCGAGCCCGTCGCAACCCTTTTCGTGCGGATCTCTCCCTCTCACCGCGGTCTCTTTCTCTCTCTTGGTGTTTGTGTGGAGGCTGTTGATCCACACCGTCGCCGCCGTCAACCTCTGTCGCTGGAGAAGCCGCCGCCAGCCCATGGGTCGCACGTGAAGGCTCTTCACGCCGCTCTCTCTCTCTCTCGCTTCGCTTCGGATTCGTGCGCGTCTAGCAACCCGGGCCTCGTCTTCTCGCGTTTTCATCTCTGTCCACCGAGTATTTTGGTCTCGGATCCCTCTGTTCGCGTCGTCTAAGTGTTCGATTGGGTTCGAATCACTTAAGCTTGAATACCCAGTGCCCAAGGAGCGTTCTAGCTCACTGTTTGAGGTTTATATAACCCGTCTAGCGTGGAATCAGGTCTGTTTGGGTGTGCAGCGTGGCGCGTAATTCACGTGTTTGGTTTTGTGTAGCATGATGCGTAATTCACATGTTGGTTGTTGGTTGTTGCTTGTGATCTAACAAGTGTGAACTACTTACAGTACCACGGTTGTACAAATACCCCCTCCCCCATCTCCCCCCAACATTTTAGATGTTGCAGGTTTGGAGAATGAGTTAGACCATGGTGGTGAGGAAGAGGAGAACTTCGAGGAAGATACCTAGGATGTTTGGGTTTTCCCATTTTGTTTATGTTTTGGTTAGGTTAGCTCTGGTTTAGTTGAAACATTGTTATTTCTGTTATGGTGAGAGATTCACCTGAGTTGTTTATGTTTTTATGCACTTGAGGTTTAGCCCTGTTGTTAGTCTTATTAAAAGAATAAAAGCTGACTTAGTAGTATGTTCTGTTGCGTGTTTTAGTTGAATGCATGACGCTACGAGACCTGACTCGTATAGAGAAGCTAGGTTGTGAAAACTGCTTGTAGTTTGGTGGAGTTTGGTTTTGGGAATGTTT

Coding sequence (CDS)

ATGAATTTGGACTTGAATTTGCGGCCGCCGGAGTTCGAGGATATAAAATTTGGAATTAGGCCTAGCTCCTCCTGCACCTTCTGCTCCTGCTCCCTGCACTTATTCTACTCCTTTTGTGCCTCTGCCTACTCGTCCCCCTTTGCCTTTTGTGCCTCTGCCTCCTCGTCCACACGCTTCTTTGCCTTTTGTGTCTCTGCCTCCTTGTCCCCACACTTCTCTGCCTTTTGTGCCTCTGCCTCCTTGGTAGGCTCCCCAGAGGCACAAAAGGCAAAAGCACCCAGGGACGAGGAGACAGACGCACAAAAGGCAGAGAAGGGTGGGGACGAGGAGGCAGATGCACAAAAGGCAAAGAAGCGTGGGGACAAGGAGGCACAAAAAGCAAAGAAGCGTGGAGACGAGGAGGTAGAGGCATAA

Protein sequence

MNLDLNLRPPEFEDIKFGIRPSSSCTFCSCSLHLFYSFCASAYSSPFAFCASASSSTRFFAFCVSASLSPHFSAFCASASLVGSPEAQKAKAPRDEETDAQKAEKGGDEEADAQKAKKRGDKEAQKAKKRGDEEVEA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 89..137

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy06g012560.1Lcy06g012560.1mRNA