Lcy06g011960 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview


Name	Lcy06g011960
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description	Gag protease polyprotein
Location	Chr06: 14794716 .. 14812531 (-)
RNA-Seq Expression	Lcy06g011960
Synteny	Lcy06g011960

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS

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mRNA sequence

TAAAAAAAAAAAAAAAATGAAAAATGGTCTGCAAAGAAACCTATGCAAGAGAGAGGGACCAAAAGGGGAAAAAACAAAAGGAAAAAAAGGAGAGAAGCTTGGAGAAATGATAATTTCAGGAGTAAGATAAGGCGTTTTAAGTTATTCTTGAAGAGGAAAACCAAGTTAAAGAAGCTCAAAACTTTGGGTCAAACGGAGATCGGGACGGCCTATGACCCGAATTTCTCTCATCAATAGTACAGTGAGAGTGGTTTGTTTTATAAATTATTTTATGTTATAGTACTATTATTATGAAATTCGAAAAAACCATAGTTAAGCATGATTCTAGAGAAATGTTTTGAGTTTCATTGGTTTTATGGTTTTAGCTGGAATATGTGTTTCTGGAACATTTTGAGATATCATGCGATTATTTGAGAATTCTGGAATGTCTTATGATTCATGTAAAAATTGCTCGAGCTTACGAAATGTTATTTTGTAGTGAGAAATTGGTTTTAGATAAGCTTGTGGATAATGAGTTTTATGTTGAAAAGTAGTTTTCAAATCACTAGATCCATGTACCCTTGTTGATTACCCATGTAATGACGGCAATTAAGGTAAACCTTGTTTCTCTTTTATTTTTTGAGTATAATTGGGCTAAGTTAAGGGTTTTGTTATGTGGTATAACTGAATGGCTTTTTGGTAAATGAACTAATGTTTGAAGCTTGCCCTAAATCCCCTTTTTGATTTTTGTTTGTCGTAGCCACTATTCCCCTTTCCCCCTCTCGATTTTTTTCGGCCTCAAGCAACAGCTCTTGCAATTTTCTTCTTCTTCTCCTTGCACCGTGAACTCCCAGCCGCCGTCAGCCCTTCTTTTTCTTCTTCTTTGCGAGTCCCTTCTTTGTCATCTCCACCGCCCAGCCGTGACCGTGCAACGCTCGACCTCCGGCGGTTTGCTTCGTCCCCTCCGGCGTGTTCGCAGGTCTGCAGCGGTGGCCTTCGTCTCTTCGACCAGCAGCGTGGGTGTGATCGAGTTAGCAGTTTCTCCGGTGACAGCACCATTAGGCGCGACCAGCAACTGTTCAGGGGCGTTTTCTGAGTTTCCCGATGTTTTTAGGTTTTCGTGGCATTCGGGATTGTATTTGTCGTGTTGGAGCAAAATTTGAGGGCTTGGACAACAAGCTTAGTTTCTTTTATACTATGCCTCCACGTATTCGAGGTCGAGGACGGGGTCGTGGACGTGGTAGGGGTGGGTCAGATGCCTGCACCCCCAGCACCGGCACAGACACCCTGACGCTAGAAGCCCTTCAAGCTCTCATGAGCAACATTACTGCCAATCAGACAGCTCAGAGAGTGGTAGGGGCACTTGACCCAGCTGATTATGCGGCAGCCCTTCGAGCAGCCACGTTTATGGGTATGTCGGCTGCGAGTGCAACCCTGGTGGCCAAGAAGCCAGAATCCAGCACAGGTCAGAAGAGGAAGTTTAATCGCAGTTTCTCCAAGCCGCAACAGAACTCCCAGAATCGACGGTCCCCGCATCAAAGAAATGATGGCAAGGAAAAGCCCTTGTGTCCTAAGTGTGATCATCGTCATGAAGGCTCTATGCATTCATTTATATCTGATGTGTTTGTTAAGCATGCCCGGATAGAGTTAGAGCCATTAGGTTTTAACTTATCAGTTTCTACCCCGGCTGGAGTAGAGTTGTTAGCTAGAGAGAAGGTTAAAACCGGTCAGGTATTAGTGTCAGGTCGTCTGTTAGATGTGACACTAATCGTGCTAACGATGAGAGATTTTGATGTTATCCTGGGCATGGACTGGTTAGCTGAGAATCATGCCATCATTGATTGCCATCAGAAGGAAGTATTATTCAAGCGTCTAGAAGGAGCGAGCTTCAAGTTCAAAGGGATCAGATCAGAGACTGTTCCTAAGGTGGTATCTGCGATAAAGGCAAGGAGGCTCGTGGATCGAGAAGTGTGGTGCTTTTTAGCCAGTGTGTCAGATACTCGAGTTGAAAAAGTGGGAATAAGCTCTGTACCAGTGGCGTACCTGACATACAATCATCGCGTCGTGACAACTTATTTTGGAGGGAATTTTGATGCAAGAATCGTGAGCGCGAACCGAGACTTCCTCACCGAAAGCGAAAACAGCGAGAGCATGAACCATGAACCCACAATCCATCAACGAGAGCGAGGAATGGAATCGAGAACCCTCGAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTTTTAGGTTTTCGTGGCATTCGGGATTGTATTTGTCGTGTTGGAGCAAAATTTGAGGGCTTGGACAACAAGCTTAGTTTCTTTTATACTATGCCTCCACGTATTCGAGGTCGAGGACGGGGTCGTGGACGTGGTAGGGGTGGGTCAGATGCCTGCACCCCCAGCACCGGCACAGACACCCTGACGCTAGAAGCCCTTCAAGCTCTCATGAGCAACATTACTGCCAATCAGACAGCTCAGAGAGTGGTAGGGGCACTTGACCCAGCTGATTATGCGGCAGCCCTTCGAGCAGCCACGTTTATGGGTATGTCGGCTGCGAGTGCAACCCTGGTGGCCAAGAAGCCAGAATCCAGCACAGGTCAGAAGAGGAAGTTTAATCGCAGTTTCTCCAAGCCGCAACAGAACTCCCAGAATCGACGGTCCCCGCATCAAAGAAATGATGGCAAGGAAAAGCCCTTGTGTCCTAAGTGTGATCATCGTCATGAAGGCTCTATGCATTCATTTATATCTGATGTGTTTGTTAAGCATGCCCGGATAGAGTTAGAGCCATTAGGTTTTAACTTATCAGTTTCTACCCCGGCTGGAGTAGAGTTGTTAGCTAGAGAGAAGGTTAAAACCGGTCAGGTATTAGTGTCAGGTCGTCTGTTAGATGTGACACTAATCGTGCTAACGATGAGAGATTTTGATGTTATCCTGGGCATGGACTGGTTAGCTGAGAATCATGCCATCATTGATTGCCATCAGAAGGAAGTATTATTCAAGCGTCTAGAAGGAGCGAGCTTCAAGTTCAAAGGGATCAGATCAGAGACTGTTCCTAAGGTGGTATCTGCGATAAAGGCAAGGAGGCTCGTGGATCGAGAAGTGTGGTGCTTTTTAGCCAGTGTGTCAGATACTCGAGTTGAAAAAGTGGGAATAAGCTCTGTACCAGTGGCGTACCTGACATACAATCATCGCGTCGTGACAACTTATTTTGGAGGGAATTTTGATGCAAGAATCGTGAGCGCGAACCGAGACTTCCTCACCGAAAGCGAAAACAGCGAGAGCATGAACCATGAACCCACAATCCATCAACGAGAGCGAGGAATGGAATCGAGAACCCTCGAATAG

Protein sequence

MFLGFRGIRDCICRVGAKFEGLDNKLSFFYTMPPRIRGRGRGRGRGRGGSDACTPSTGTDTLTLEALQALMSNITANQTAQRVVGALDPADYAAALRAATFMGMSAASATLVAKKPESSTGQKRKFNRSFSKPQQNSQNRRSPHQRNDGKEKPLCPKCDHRHEGSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIVLTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARRLVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPVAYLTYNHRVVTTYFGGNFDARIVSANRDFLTESENSESMNHEPTIHQRERGMESRTLE

Homology

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T9Z4 (Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold270G003090 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 7.0e-39
Identity = 88/148 (59.46%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS  FV HAR+E+EPL   LSVSTP+G  +L++EKVKT Q+ ++G +++VTL+V
Sbjct: 419 GSSHSFISSTFVLHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECMLSKEKVKTCQIEIAGHVIEVTLLV 478

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M DFDVILGMDWLA NHA IDC +KEV F     ASFKFKG  S T+P+V+SAI+A +
Sbjct: 479 LDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVTFNPPSRASFKFKGEGSRTLPQVISAIRASK 538

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV DTR   V +SS PV
Sbjct: 539 LLSQGTWGILASVVDTREADVSLSSEPV 566

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T9B7 (Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold270G00730 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 1.6e-38
Identity = 87/148 (58.78%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS  FV HAR+E+EPL   LSVSTP+G  +L++EKVK  Q+ ++G +++VTLIV
Sbjct: 366 GSSHSFISSAFVSHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECMLSKEKVKACQIEIAGHVIEVTLIV 425

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M DFDVILGMDWLA NHA IDC +KEV F     ASFKFKG  S+++P+V+SAI+A +
Sbjct: 426 LDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVTFNPPSMASFKFKGGGSKSLPQVISAIRASK 485

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV DTR   V +SS PV
Sbjct: 486 LLSQGTWAILASVVDTREADVSLSSEPV 513

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U7V9 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold55G00950 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 1.6e-38
Identity = 89/148 (60.14%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS  FV HAR+E+EPL   LSVSTP+G  LL+REKVK  Q+ ++G +++VTLIV
Sbjct: 390 GSSHSFISSAFVLHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECLLSREKVKACQIEIAGHVIEVTLIV 449

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M DFDVILGMDWLA NHA IDC +KEV F     ASFKFKG  S+++P+V+SAI+A +
Sbjct: 450 LDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVTFNPPSMASFKFKGGGSKSLPQVISAIRASK 509

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV DTR   V +SS PV
Sbjct: 510 LLSQGTWGILASVVDTREADVSLSSEPV 537

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7STC8 (Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold184G00010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 2.0e-38
Identity = 87/148 (58.78%), Postives = 111/148 (75.00%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS  FV HAR+E+EPL   LSVSTP+G  +L++EKVK  Q++++G +++VTLIV
Sbjct: 539 GSSHSFISSAFVLHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECMLSKEKVKACQIVIAGHVIEVTLIV 598

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M DFDVILGMDWLA NHA IDC +KEV F     ASFKFKG  S+++P+V+SAI+A +
Sbjct: 599 LDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVTFNPPSMASFKFKGGGSKSLPQVISAIRASK 658

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV DTR   V +SS PV
Sbjct: 659 LLSQGTWGILASVVDTREADVSLSSEPV 686

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SIJ5 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold34G003210 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 2.0e-38
Identity = 85/148 (57.43%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS VFV+H  +E+EPLG  LSVSTP+G  LL++E++K  +V ++ R+LDVTL+V
Sbjct: 411 GSSHSFISSVFVRHVGLEVEPLGSVLSVSTPSGEVLLSKEQIKACRVEITNRMLDVTLLV 470

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M+DFDVILGMDWL+ NHA IDC  KEV+F    GASFKF+G     +PKV+SA+KA +
Sbjct: 471 LDMQDFDVILGMDWLSANHANIDCFGKEVVFNPPSGASFKFRGAGMVCIPKVISAMKASK 530

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV D R  +V +SS PV
Sbjct: 531 LLSQGTWGILASVVDVREPEVSLSSEPV 558

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. NCBI nr
Match: KAA0038411.1 (gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 1.5e-38
Identity = 88/148 (59.46%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS  FV HAR+E+EPL   LSVSTP+G  +L++EKVKT Q+ ++G +++VTL+V
Sbjct: 419 GSSHSFISSTFVLHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECMLSKEKVKTCQIEIAGHVIEVTLLV 478

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M DFDVILGMDWLA NHA IDC +KEV F     ASFKFKG  S T+P+V+SAI+A +
Sbjct: 479 LDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVTFNPPSRASFKFKGEGSRTLPQVISAIRASK 538

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV DTR   V +SS PV
Sbjct: 539 LLSQGTWGILASVVDTREADVSLSSEPV 566

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. NCBI nr
Match: KAA0038231.1 (gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 3.2e-38
Identity = 87/148 (58.78%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS  FV HAR+E+EPL   LSVSTP+G  +L++EKVK  Q+ ++G +++VTLIV
Sbjct: 366 GSSHSFISSAFVSHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECMLSKEKVKACQIEIAGHVIEVTLIV 425

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M DFDVILGMDWLA NHA IDC +KEV F     ASFKFKG  S+++P+V+SAI+A +
Sbjct: 426 LDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVTFNPPSMASFKFKGGGSKSLPQVISAIRASK 485

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV DTR   V +SS PV
Sbjct: 486 LLSQGTWAILASVVDTREADVSLSSEPV 513

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. NCBI nr
Match: KAA0051368.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 3.2e-38
Identity = 89/148 (60.14%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS  FV HAR+E+EPL   LSVSTP+G  LL+REKVK  Q+ ++G +++VTLIV
Sbjct: 390 GSSHSFISSAFVLHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECLLSREKVKACQIEIAGHVIEVTLIV 449

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M DFDVILGMDWLA NHA IDC +KEV F     ASFKFKG  S+++P+V+SAI+A +
Sbjct: 450 LDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVTFNPPSMASFKFKGGGSKSLPQVISAIRASK 509

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV DTR   V +SS PV
Sbjct: 510 LLSQGTWGILASVVDTREADVSLSSEPV 537

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. NCBI nr
Match: KAA0025998.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 4.2e-38
Identity = 85/148 (57.43%), Postives = 110/148 (74.32%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS VFV+H  +E+EPLG  LSVSTP+G  LL++E++K  +V ++ R+LDVTL+V
Sbjct: 411 GSSHSFISSVFVRHVGLEVEPLGSVLSVSTPSGEVLLSKEQIKACRVEITNRMLDVTLLV 470

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M+DFDVILGMDWL+ NHA IDC  KEV+F    GASFKF+G     +PKV+SA+KA +
Sbjct: 471 LDMQDFDVILGMDWLSANHANIDCFGKEVVFNPPSGASFKFRGAGMVCIPKVISAMKASK 530

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L+ +  W  LASV D R  +V +SS PV
Sbjct: 531 LLSQGTWGILASVVDVREPEVSLSSEPV 558

[Close]

BLAST of Lcy06g011960 vs. NCBI nr
Match: XP_038889237.1 (uncharacterized protein LOC120079128 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 4.2e-38
Identity = 87/148 (58.78%), Postives = 109/148 (73.65%), Query Frame = 0


Query: 164 GSMHSFISDVFVKHARIELEPLGFNLSVSTPAGVELLAREKVKTGQVLVSGRLLDVTLIV 223
           GS HSFIS VF++HA +  +PL F LS+STP+G  +LA EKVKT QV V+ R+LDVTLI+
Sbjct: 20  GSSHSFISAVFMRHAMLNSKPLQFLLSISTPSGEIMLATEKVKTCQVEVANRVLDVTLII 79

Query: 224 LTMRDFDVILGMDWLAENHAIIDCHQKEVLFKRLEGASFKFKGIRSETVPKVVSAIKARR 283
           L M +FDVIL MDWLA NHA IDC  KEV+F    GASFKFKG+ +  +PKV+S +KA R
Sbjct: 80  LDMHNFDVILDMDWLATNHASIDCSCKEVIFNPPTGASFKFKGVGTVVLPKVISTLKASR 139

Query: 284 LVDREVWCFLASVSDTRVEKVGISSVPV 312
           L D+  W  +ASV DTR  KV ++S P+
Sbjct: 140 LFDQGAWGLMASVVDTREIKVTLTSEPI 167

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lcy06g011960 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lcy06g011960 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5A7T9Z4	7.0e-39	59.46	Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffol...	[more]
A0A5A7T9B7	1.6e-38	58.78	Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffol...	[more]
A0A5A7U7V9	1.6e-38	60.14	Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold55...	[more]
A0A5A7STC8	2.0e-38	58.78	Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffol...	[more]
A0A5A7SIJ5	2.0e-38	57.43	Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold34...	[more]

BLAST of Lcy06g011960 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAA0038411.1	1.5e-38	59.46	gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAA0038231.1	3.2e-38	58.78	gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAA0051368.1	3.2e-38	60.14	pol protein [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAA0025998.1	4.2e-38	57.43	pol protein [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
XP_038889237.1	4.2e-38	58.78	uncharacterized protein LOC120079128 [Benincasa hispida]	[more]

BLAST of Lcy06g011960 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR021109	Aspartic peptidase domain superfamily	GENE3D	2.40.70.10	Acid Proteases	coord: 163..264 e-value: 4.6E-13 score: 51.0
None	No IPR available	PFAM	PF08284	RVP_2	coord: 164..257 e-value: 5.0E-24 score: 84.6
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 37..58
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 112..158
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 112..142
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 344..369
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 143..158
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 350..369
None	No IPR available	PANTHER	PTHR24559:SF330	RNA-DIRECTED DNA POLYMERASE HOMOLOG	coord: 164..310
None	No IPR available	PANTHER	PTHR24559	TRANSPOSON TY3-I GAG-POL POLYPROTEIN	coord: 164..310
None	No IPR available	CDD	cd00303	retropepsin_like	coord: 164..239 e-value: 2.69107E-9 score: 51.9536

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lcy06g011960.1	Lcy06g011960.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0006259	DNA metabolic process
molecular_function	GO:0004518	nuclease activity
molecular_function	GO:0003676	nucleic acid binding
molecular_function	GO:0016779	nucleotidyltransferase activity
molecular_function	GO:0008233	peptidase activity