
Lcy05g017660 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGTGACAGAGTCAAAGTATTCATGTACCCCCGTAACATTTGAGGTTTGAGGTGACTAGCTTCTTTATATGTTGGAAACAAATTTTGATTTTTTTCCTCTATTTTTTATCCCTGGTATGTTTTGATGCTATTACGACTTCTGTCTGTCTTTGGAGTCAAAGCGAATTAGTTTAGTTTTCTAACTTAGTTGGTAGTCCATCAATGTGGGATGGCTGCATGCCTTTGCCAAAAGGTCTCGTCATTAGAAGGTCCGTTGCTTGCATTCATTTGATATAGCTCAGTTAAAATTTTGCATTTGATAAAATAGATCCTTTCTTTTAACCAAGTATTTATGGGTCCATAACGCTTTTGTTATCTCCTTTACTTTGGATCTTCTTCAAACTACCAAATGTTGTCCCCAGTTTGTAAATTGGTGATAGAAAGGGTTGAAGGATGGGTGGGTAGTAAAAGATGGAGAATGCAGCTTGTGAATTTGGATGCATTTTTTCGATGAATAGTTTAGGGTTATTTGACAGAAGTTATATGAATTGACAGGCAGTTGCCTCTGTTTTAACGGTTTTACTAATCATGTTTTGACCAATTAATCAATCCTAAACTATTTGTTTGCCATTGGTCATTGTCGTGTTTTTCTTATTGGTAGTTTTTTGTATTGTCGTTGGCAATGTTTGAGTTTTAGGAAGAAAAATTTTATAGGTTGGGCCAACCTTTGTTTTGTTTTTTTAATCAAATTATAAGTTTGATTTTGGTTCTTAAACTTTTAGACTTTCAAAGATGTGTGTAGTTACATTCTATAGCTTAAAAAGTTTAGATCCTACTCTTTTAGGGTTGTGTCTATAAATATATTTAACCATAAACATTAAAGAAATAAATCATTCAAAATCTCAACCATCCTATTCGCTTTGTAACGAAACATGAATTGCTACATTACAATACATAATGTGAATACAAAATTCACATTGTCGCCTAGAAATGGAATCAGGTGGATCTAAAAATGAACATACAAAACCTTTCAGATTTGAGAATTGTTAGCTTGATGTGCCCAAGTTTGTAGATGGTGTCCCTTGGGTGAAAAATATTGAATGGCAATCTTAAGCCCAGTCGTCGTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTAGGTAAAGGTATTAAATCTGTTCTTAAAGACTTTCAGTTGGCCAACCTTTGGTTTCTTCGATTTGGGGGGAACTGTTGGTTTGCTTTGTTTTTTTCTTCTTCCTTTCTCTTTTTTCTTTCTTTTTCTTTCTTCTTTTTTACTTTTTTCCAGAGAGAATTTTGTCTCAAGGAACTATGGGACTCAATTTGACCTTTTGCATGTATCTTTTGTTCTTTGTCTAGTGTTTTCTCTCTTACCTCTCTAGAAATTATGATATTACACATATTATGACCATCTGGGAGTCCTTTTATGTTCAATTGCTTTGCTGGTTTCTAAAAGCTACATATTCTTGATGCTCGATAAATGTAGGACGAAGGCCATCTCTCTCGTCGTTTATTTACTTAGATATGATATTCTAACTCTGGTTCTTCCATGTATTCATCCTTCAAAGCCATTATTTTTCCCTTTTATATATATATATATATATATATATATAAACTTTGCAAGTGCATTCATTCTCTCTTGATGTTATTCTTGTGAACACGTGTAGAATTGTTACATTTTACACAACAGAGCCTCCAGCTTGTGAGCCTGTGTTGTCACCTATATGGCTGAGTTTTTAAATGCTGCCTGACTTCACGCATAAATATTTTATAATCTTTATGTACATTAATTATTATGGACCTTAGAATGTTGATTATGTCTTGTGCATGTTATTTTTGTTTTTCTATTAATGGAAATTCTTTTCATTCCTGTTGGGCTTCTTGTCCTTCATGCTTCCTGCATTGTAAGTGTTCTGTATAGATGTTGAAACATTAAGCTTCAACTGTTTCTCTTTTATTTGGCTAGATAAATTTATGATTAGCTATATAATTAATACATCTATGTACAGTAAAATACAACCTTATCTAGAACCTTATCTAGAGAGAGACCTATGGAGCATCTGTTGGTGGGCGTTGTAGGGATAGGAGAAGAAGACAAGAGCCTACAACCTTACCCATGCTTTTAAATGTTTTCTACTACGATTTGGTGGACGTTGTTTGGTATGTCCTCATGCATCTTTTAGTCTTACTTCTCTATCTATTCAACTCATTCTTTTACTTAGTAGTATTAAGTGATAATTCAACTCATGCTTTTTCTGTTTAGGAAATGCAAAGGGACGTTTGATAACCAATTGGTTTTCTGTTTTTAAAAAACAAGTTTATTTGGAACATGTGTTGTTTATATAAATATTAATATGAATTATAAGAAATTATTTGATTTTACTTTTATAAAGAAATATGAAACGAAGAATAATTGTCATTTGTTTTTTAGGAAACAAAAAACCAACCTACACTATCCAACATGTTTGGTTTTTTGTTTTCAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAGAGATTGTTTCCGAACCAAGAACGAAAAACAGAATATGGAAAAACCAAAAACTAAAAATCAAAATGATTATGAAAAGTTGCCTTAGTTTTCTACTTTTAGAGCATTCTTTTTATGTTGGAACTCGAGTTGATGTGATATTTGTTGCCTAGAAATTTCTATGCCAAGGATTTTGTTGCATTGAAGCTAAAGCTCACCTGTGTAGATTGTGAGCTTAAACTGTATGATTTTTTTTTTTTAAATTAAATTGGTGAGGGTGGGCATTTTAATTTTGTTCATATATGCGATGTGGTTTGCAAAATTGACTGTTTAGGCATATTTGTGGCATTAGATCAATTTGTAAAAGCTCATTTGGGTATAGGTTATGTATGTAATTTTTTTTAAGATCCCAACTCAAGTAACCGACTTGTTGCTGCCTCAATTTCAAAGTAAACTCAAGGCTCGTCATTCACATCTCAAAGTTGTAAGCACAAATGTTTATAAGAGTTAGAAGTAGCGGAAGGTATGATCAACAGTTGTGGCCCAAAAGGAAAAGATATTGAAGACCAAGATATGTCTTGGATTTAAATTATTGTAATTTAATTAATTATCAATTTCATACGATATGCCAAATATGCCGGCATATCTTGGTCATACCTTCCGCTACTTGGCATATCGTACGAATTTGATAAATATTTAAATTACAATAATTTTTAGGGTTTGGGGTTTGGGGTTTAGGGTTTAGGGGTTAGGGGTTAGGGGTTAGGGGTTTGGGTTTCAATCCATATAATGATCTCTGGAACTTTATTGAACATAATTCTCGAGAATTTGATTTATATGTCTCAGGTACCTTAAATCTTTCTGGGATTCTCATATAAATATTATTATCGAAAGATTCATATAAGTATGCTGCGACAACATCCATGAGATGCATGTCCAGACTTTCATACATAGTCAGACTAATTAAAAATCTTAGTGTTATTACATCTACCACTGGAGAATACGTCTCCTCATAATCAATACTAGGTCTTTGTGAAAAGTCTTGTGCAACTAATCTTGCTTTATATCTTGTAATCTCATTATTTTCATTTCTTTTTCTCACAAATACCCATTTGTATCCCACAGGTTTGACAGGTGTTTGGAATACTGGTCCAAAAACCTGACATTTTGAAAGTGAATTTAATTCTGCCTTGATTGCTTCTTTTCACTAAATCCAATATTTTCTATGTCGACATTCTTCAACAGATTTTGGTTCAGGACCCTCATTCTCATATATAATATCAAGAGCAACATTATATGCAAAAATGTTGTCAATAATTACATTAGTTCGGTTCCATTTTTTTTCTTGTCATGATAGTTTATGGAAATCTCATTATTATCTTCAGGTATTTCACCTTCCTCACCATTCATGTCATGAATTTCTTCATGGGTATTTACATCCTTAACCAAGTCTTTTTGACTATTAATTATTTTTCGTTTTCGAGGATTTTTATCTTTGGAATCCATTGGTCTACTACGCTTCTGACGGGTTCCAGATTCATTAATGACAACATGTTGCGTTGGGATATCAATTTTTGATGGGACATTTGTGTATGTGACTTAGTCACTTTCTTTGCATCTATAAATGCATCTGGTGCCAAAGCGAGCTTAGCTCAGCGGTAATTGGCATGTACCCTTGACCATGAGGTCAGAGGTTCGAATCCCCCCACCCCCAAATGTTGATGTATTAAAAAAAAAATAAATGCATATGGTAATTGATTTGCTATATTTTGGAAATGAATTATTTTCTGAACTTCAAGTTCATATTGATCTTGGGGATCTAAATGAGACAATAATGATGCATTCCATATAATTTTTTTCCAACTTCTTAATTCCTCTCCCTAATATTGGAAAATTTGTCTTATTAAAATGACAATCATCATCATATGGCTGATGGGTTTGCCTCGATTTTTGTCCCTTTCATAATTTCAAGCTAATCTTTTTTTTTTTGGGCTAAATCTTTGAATTTTGTTACGCATTTGATTTTTTGTTGTTGAATTTGTTATGCAGACTTTCGTGTCACTTTTTCATAAAATAGATTTTGTTGGGATACTGTGTGTTTCTTTTTTTTATAAGAATGCATCATTCCTTGTATTGGTTTATTGTTAGATAGCCATAGCTTCCAAATGCCAGTTACTTCTTGATCAGTGTAAATTCACTTTCGTTTATTAGTTTTTTCTTTTCTTCCTCCGAATAATCTTGGAAGGGAGGAGAAATGTGGTTTTTCTTCTATATTTTGATAAGTTAGAATGAGAAGGTTCCATAATTATCAGTACACTTGTTTTAATTTTAATGGTGTGTATGTATATATCTTTCATCATTGGGTTGTTGGGCCACATTCATTACATTATGTTCGCGGTTTTTTTCAGGAGGCTTCACCCATAAAAAATTCGAACTCTAAGAGACAACAAAGGTTTTAAATTATTTTAGTTTTTGATTTATAAGATTAGAGCAGTCTGTTTTAAGTGGTATCCCTATTTATTTCT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VTESKYSCTPVTFEGGGLEIGNLRIRNKALLAKWLWRFYSDSNTLWHRIIVSKHGPHPSEWVTGGIKGTFRNPGREISRELPSLASFIHCSVGNGEDTYFWEDRWVGDRPLCVTFPRLYHLSSMKNHSVAEVLIHSGSSLSYCFGFARPLSDSETTDLVTLISLIGEIAFSTTRKDIRVWSPDPSLGFSCRSFFRCLLDPVSSEPSIFSLLWKVKVPKKVQFFIWQVIHGRVNTLDRLSRKIPSLFGPFVAFFAGWWRKTSIICYGTALLLGQCEMSSLARSGCSLPGIEASERRSRSSFPILPLGSKESFCGKRGFVLLFGGCGISVFRHEIVHFISRLLESSFQARDRALYQSQDGVEHRHEIVRQMALRHVFMHLIAPLYFHDSELSSIYLMSLVFILMDRVGTWIKAVSTAGVCLQAYTKKHPSEEGLLSSFYTVLVGSSIRLLLAQEESPC Homology
BLAST of Lcy05g017660 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C2F6 (Putative ribonuclease H protein At1g65750 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g65750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 79.0 bits (193), Expect = 1.6e-13 Identity = 64/242 (26.45%), Postives = 109/242 (45.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DFI2 (uncharacterized protein LOC111019624 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019624 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 221.1 bits (562), Expect = 9.6e-54 Identity = 105/232 (45.26%), Postives = 149/232 (64.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5E4FU33 (zf-RVT domain-containing protein (Fragment) OS=Prunus dulcis OX=3755 GN=ALMOND_2B035216 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 199.1 bits (505), Expect = 3.9e-47 Identity = 102/233 (43.78%), Postives = 136/233 (58.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5XV38 (zf-RVT domain-containing protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_ppa019854mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 1.5e-46 Identity = 102/233 (43.78%), Postives = 136/233 (58.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5X4S0 (Reverse transcriptase domain-containing protein (Fragment) OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_ppa021750mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 1.5e-46 Identity = 102/233 (43.78%), Postives = 136/233 (58.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5WPQ5 (Reverse transcriptase domain-containing protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_ppa016677mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 1.5e-46 Identity = 102/233 (43.78%), Postives = 136/233 (58.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. NCBI nr
Match: XP_022151711.1 (uncharacterized protein LOC111019624 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 221.1 bits (562), Expect = 2.0e-53 Identity = 105/232 (45.26%), Postives = 149/232 (64.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. NCBI nr
Match: VVA30963.1 (Hypothetical predicted protein, partial [Prunus dulcis]) HSP 1 Score: 199.1 bits (505), Expect = 8.0e-47 Identity = 102/233 (43.78%), Postives = 136/233 (58.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. NCBI nr
Match: BBN69274.1 (TatD related DNase [Prunus dulcis]) HSP 1 Score: 196.1 bits (497), Expect = 6.8e-46 Identity = 100/233 (42.92%), Postives = 136/233 (58.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. NCBI nr
Match: CAN75156.1 (hypothetical protein VITISV_042643 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 180.3 bits (456), Expect = 3.9e-41 Identity = 96/234 (41.03%), Postives = 131/234 (55.98%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. NCBI nr
Match: CAN73503.1 (hypothetical protein VITISV_008255 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 5.0e-41 Identity = 96/234 (41.03%), Postives = 131/234 (55.98%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g017660 vs. TAIR 10
Match: ATMG00310.1 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein ) HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 3.6e-05 Identity = 31/96 (32.29%), Postives = 50/96 (52.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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