Lcy05g017050 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview


Name	Lcy05g017050
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description	Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1
Location	Chr05: 26063189 .. 26095700 (+)
RNA-Seq Expression	Lcy05g017050
Synteny	Lcy05g017050

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGAAACAGTGGCAAAGTGAGGGTCGCAGCAGAGAGTCCAACCTCAACGGAGGCTGTTATTATGCCCTTTTGGGACTGAGTGACAACCCAAATCGAGTGCTGAGACAATTTGGAATGCGACAAATGGTGCCGCCATATTGGGATACAGTCATGGAGTTACATCAGTTGGACTTGCGAGGTAAACACGATCACGATTGGCGACAACATCATGCAACATTTATATCACTGTGGCGTGCACGTCATGATCATTATGTCTTGGGCAACATAGTTCTATGTGAGCAATACGTCACGAACATAACTGACATCATTCAACAAACTAGGAGGCTGACCGTTGCTGACACTGATCAGACACGTGCTTGTCGTAGACGTCGTCGGCAACATGAGGCTGCAGACATTCCACAGCAGAACGAAGATGGAGAACCTCCTATAGTTGATGATGACACTTCAGCTCTTCGTGTACAATCATTGGCAGATCAAATAGACATTGCTTCAAGTTCTGATCATGGTGACATAACTCAACAAGATATTGATGATGTGATTCATCATTAA

Protein sequence

MKQWQSEGRSRESNLNGGCYYALLGLSDNPNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRARHDHYVLGNIVLCEQYVTNITDIIQQTRRLTVADTDQTRACRRRRRQHEAADIPQQNEDGEPPIVDDDTSALRVQSLADQIDIASSSDHGDITQQDIDDVIHH

Homology

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LNG5 (Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MAIL3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 4.0e-08
Identity = 27/58 (46.55%), Postives = 34/58 (58.62%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRARHDHYVLG 88
           P+RVLRQFG+ Q +P   D    LH +D RGK ++DW   H+  I LW AR    V G
Sbjct: 360 PDRVLRQFGLHQTIPAPCDNEKALHAIDKRGKSEYDWSARHSRHIGLWEARVSSVVSG 417

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TPE7 (Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold236G003010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 1.6e-12
Identity = 57/161 (35.40%), Postives = 73/161 (45.34%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRARHDHYVLGNI 89
           P+RVLRQF M QM P    T   LHQ+DLRGKHD DWRQ HA  I +W +R+D  V  + 
Sbjct: 126 PDRVLRQFNMLQMPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRQIHAEHIGVWNSRYDFRVEAST 185

Query: 90  V----------------------------------------------------LCEQYVT 139
                                                                +C++   
Sbjct: 186 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHNIEALGQICDRTTE 245

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TSW1 (Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold201G00240 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 6.2e-12
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 338 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 397

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 398 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 457

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BUF5 (Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold298G001440 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 6.2e-12
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 420 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 479

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 480 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 539

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TI34 (Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold75G00540 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 6.2e-12
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 773 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 832

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 833 TSEPTISENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 892

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BQW5 (Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold29G00920 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 6.2e-12
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 287 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 346

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 347 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 406

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. NCBI nr
Match: KAA0043956.1 (serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 3.4e-12
Identity = 57/161 (35.40%), Postives = 73/161 (45.34%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRARHDHYVLGNI 89
           P+RVLRQF M QM P    T   LHQ+DLRGKHD DWRQ HA  I +W +R+D  V  + 
Sbjct: 126 PDRVLRQFNMLQMPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRQIHAEHIGVWNSRYDFRVEAST 185

Query: 90  V----------------------------------------------------LCEQYVT 139
                                                                +C++   
Sbjct: 186 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHNIEALGQICDRTTE 245

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. NCBI nr
Match: TYK03303.1 (serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK12342.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.3e-11
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 420 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 479

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 480 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 539

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. NCBI nr
Match: KAA0042980.1 (serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.3e-11
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 773 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 832

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 833 TSEPTISENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 892

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. NCBI nr
Match: KAA0051993.1 (serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.3e-11
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 381 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 440

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 441 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 500

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. NCBI nr
Match: TYK01398.1 (serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.3e-11
Identity = 59/163 (36.20%), Postives = 72/163 (44.17%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRAR--------- 89
           P+RVLRQF M Q  P    T   LHQ+DLRGKHD DWR+ HA  I +W +R         
Sbjct: 287 PDRVLRQFNMLQTPPAISYTDQRLHQIDLRGKHDQDWRRIHAEHIGVWNSRYDFRVEAPT 346

Query: 90  ---------------------------------------------HDHYVLGNIVLCEQY 139
                                                        HD   LG I  C++ 
Sbjct: 347 TSEPTVSENYFVWYRSITRRFITQEGAFYHCMYDFVDEVQTFSVEHDIEALGQI--CDRT 406

[Close]

BLAST of Lcy05g017050 vs. TAIR 10
Match: AT1G48120.1 (hydrolases;protein serine/threonine phosphatases )

HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 2.8e-09
Identity = 27/58 (46.55%), Postives = 34/58 (58.62%), Query Frame = 0


Query: 30  PNRVLRQFGMRQMVPPYWDTVMELHQLDLRGKHDHDWRQHHATFISLWRARHDHYVLG 88
           P+RVLRQFG+ Q +P   D    LH +D RGK ++DW   H+  I LW AR    V G
Sbjct: 360 PDRVLRQFGLHQTIPAPCDNEKALHAIDKRGKSEYDWSARHSRHIGLWEARVSSVVSG 417

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9LNG5	4.0e-08	46.55	Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form homolog OS=Arabidopsis thaliana...	[more]

BLAST of Lcy05g017050 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5A7TPE7	1.6e-12	35.40	Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucu...	[more]
A0A5A7TSW1	6.2e-12	36.20	Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucu...	[more]
A0A5D3BUF5	6.2e-12	36.20	Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucu...	[more]
A0A5A7TI34	6.2e-12	36.20	Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucu...	[more]
A0A5D3BQW5	6.2e-12	36.20	Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 OS=Cucu...	[more]

BLAST of Lcy05g017050 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAA0043956.1	3.4e-12	35.40	serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumi...	[more]
TYK03303.1	1.3e-11	36.20	serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumi...	[more]
KAA0042980.1	1.3e-11	36.20	serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumi...	[more]
KAA0051993.1	1.3e-11	36.20	serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumi...	[more]
TYK01398.1	1.3e-11	36.20	serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumi...	[more]

BLAST of Lcy05g017050 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G48120.1	2.8e-09	46.55	hydrolases;protein serine/threonine phosphatases	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 162..182
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 121..146

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lcy05g017050.1	Lcy05g017050.1	mRNA