Lcy05g016850 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTAAAGTCCTTTCCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTTTTTTCAAAGTTCTTCGTTTCTCTCTCTCTTGGCGTTGCTGGCAAATAAATTAATATTTTCCACTACTAAATATTGACCTTTTTGCTCTACAGCTTCTGCTATTTCCTTCTCCAATGGCGGCCATTTCACTAGACTCCGCGTCGGCCGTCTCTCTCAGACCCACGTCTTCCCGATTCCCCTTCAAAATCCCAAGTTTCTCCAAATCTTCATCACTACCATATTCTTCCGTTTTCAAATCCCATAGCTATAATCATGACATCAGGAAACCGGCTCTCTCTGTCAAAAGCATTGCTGAAACGACTTCCAGTCACTCGTTTTCTAGAAAGAATTCTCCTACTTCGAAGATTGTATCCGGGTATGCATTGATTGTTCTTTTATTTATTTTATTTTTATAATTTGATGTTTGTTTTCCGGTCGCTATTTTATCTAGCATGATCTGTGTAGGGATTTGCTTTCGTGTTGCCATCTAGTCGTTGTTCTCTTCTAGCTAAGAGTTTAGGTTTCTAGTACAAGTTTGACCAACATGGGGAAGATTTGAGGAATTGGAGCCGGCCGCAAGTGTAAATCATCCCATTTGCACTTGGAAGGCAGAGGTGGCCAGGTAAAAGGGATATAAGAAGTCTCCATATTAGGAATGGGTGGAAAAATGCGTTTGTATGATCATTTAATGCTATAAGGATCACGCAAGAGAAAATTGGAATTTTAAGCCAAGCAGTCAATCTCCGCTATTAGATTATCTGCTAGTGTTTAATTGAGTAATAATGGGAAGGAGATTTCTGCTTGTGTAACCCGTGATGGATGGTTGAATTATAATTAAAGAAAATGATGAGTTACTGATTGATTGATTTGGACCTAAGTGTTATGGGGGGAAATATTCCTGATGTTCGATTCAAGGTTGTGAAGGTTCATGGAGTGACTTTTAGGTCTAAGGAAGAGAATTCAAGGTCCTAGACTTTGTGAGAGGTTACTTGATTGATATCGTACTTTTCTTTCTTTTTTTTTTATTTTATTATTTTTTTTCGGCTTGAGTCACATTACGAGCAGAAGCAAAAGTCAAGAAATGTGAAATGACTAAACTCAATCATCTACTATCTACCAAATACTAAAGAAATGGTAAAGGAATTGGAGAAATTCAAGTAAACTGAAATTAAAACAACTGTATTGGAGATGTGAGATACGCAAAAATGATGAAGTTTTACCTAGTTCAAATTCTCTAAAATTCTGATTCAACAAAGCTAACTTTCTTTTTTGCTTTCTAACCTCATATTAAAACTATTCAGCAAACACTCTTAAAAAACACATATTCAGCAAACAGAATGTCAATTCCTTCCCATGTAACTCCAATAAAATAACCGTGGCAAGATGGAGCATGCAAGAATCAAATATTAAGCTTTTAAATTTCTTTACAAGTAGCCCATCGTTATCTTAGTGGTTTTGTAAGACCCTTTTTATTTGAGCCGATGCAAAACACTAGTAATACGTCTCAGTTGATGGAACTTGAATTGAGTGGAGTAGTATATCTTTCATTTTTCCTGGTGGAGCAATATCTCCAGGCGGGAATTTGATAGATCTCCTACTAAATATGTTTATAAGAGAAAGAGAGTTAGGAAGGAGCGGGTAGAAGTCGTTATAGTTGGTTACGTGTGGTCCTGTATTCTGTTATAAATAGTTAATGATACTATATAGCCTTGGATGTATCTAGATAGAGGCAACTTTTGACTAGTAACTTGTTGGAAGGATAGGAACGAAGAGATAGGGGAGCTCTCTAATTCTCCTCTTGACTTATACTTTTGTCCTAATTGATAAATAAACCATCCAGATTCTATCAATTTGGTATCAAAGCAGTTCGTGATTGAGAATGGCAACTAGAATGGAATCTAGAGTGGAGAATCTTGAAGGAAAAATGGCTTAATTGAGTAAGAAAACGGTTGGAGTTAAAAAAGAAATTTCTGGAATTCGTGGATCGATTAAATCCGAGGTTGAAGAAGTAGTAGTGAAGAACGTTGAGGAAGTAGTGACAAAGAATGTTGGAGAAGCAATGAAGGAAGGAATGCTAGCGATCATAGCTCGAATTAAAAGATTGAAAATCGGAGAAGGAACTGCTTCAGTTGAGAAATCGAAGGAGAAGAAAATGAACGAGAAGAATAGTACGACGCTGGATGTTGGAGGAAGCAGTGGAGAAGTGCAAACTCACCTGAGTAAAGCTTTGGTGCCAATATTCGGTTTACGATCACGGAAACTGAATTTCGGTTTTCGGACGAGGAAATCCCTATGAATGGCTACATCAGGTGGAACGATACTTTTTTGTCAATCGCCTTGCTGAATTGGAAAAGTTAGGGGTTGTCGTACTTTATCTTGACGGTGTAGCTCTTAAATGGCACCATTGGGAAGAAAGACGTCGATCGATCAGAAGTTGGGATGAATTTTGTCGTCTACTCTTGTGAAGGTTTTTGCCAACGAAGGAAGATACGCTTCACGCGCGATTCCTTGCCCTAAAACAAGAATCAATCGTAGTTGACTATCGAGAAAAATTTGAGGAATATTCTGCTCCCTTAGATAATCTAGATGACGATACTTTAGAAGGGAAATTTATTGATGGATTAATTGAAGATATTAAAGTAGAAATGAAAATCAGCAAACCTGTTGTGTTGAATCTTAAAATGGAAATGGTCCAAAAAATTGAAGACAAATTACTACGTTCAGAGGCAAAACGAACAGGAGCTTCCTTGAGTTCTAAAGTAGTGGGCCAAAATAATAATACTAGTAGCAAGCCTACTGTTTGTGGGGCTGGCACAAATGCTTGCATGATTTCGGTAAATTTGAGTCGACTTTGAGTTGAATTCAAGAAAGGAGCTGGGAAACTTCCTAAAACTTCTTTCGAGCGATGAACAAAATCAGAGTTCCAAAGTAGGAGAGAAAAAAGTCTATTTCAAGCGTGAGGAAAAATTTACTCTGGGTCATTAGTGTAAAAAGAAAGAATTACAGGTCATGATAATACATGATGCAGAATTTGAAGAAGTCGATGGTGGAGAAGAAGTAGCCATGCAAGTTGTAGAGATGGTCGATGAAGAAGATGTTGAGGAATCGTTTGAGCAGGTAGCAGAATTGGCCTTGAACTTGATGGTGGGGCTCGGTTCTCCTAAAACATTGAAGGTTAAAGGATTGATTGGTTCTTGGGAGGTAGTAGTGTTGATTGATAGTTGTGCTACCCATAATTTCATAGCTCTTGCATTGGCTTAGGAACTTAAGCTTCCTATAAGTGAAACTGATGGCTATGGAGTAGTGCTGGATACTGGATCGTCTATAAAAGGAACGAAAATCTACTGAGACGTGGTAGTTTCGTTGGGTCCCATTACCATTATCCAAGACTTCTTACCTCTACCTTTGGGTAGTGCATATGTAATTCTGGGAGTACAATGGCTGGCTACCTTGGGAGGTGTTAGGACTAACCACAGAGTTTGGTAATGACCTTCATGTTGGGAAAATTTGTTGTCATTTTAAAGGGAGATCCTGCTCTTGTTCGCTCTTAGGTTACTTTGGAATCTTTAATTAAATCCTTGAAGCTGGAGAAACAAGGATTTTTAGTTGAGTTAAATGTACTTCATGATGGAGAAGTAAAGTCTTGAGATATCTGGGAGGAAGTACCGGAAGAAGTTCGGGCTGTATTGATCAATCACGCTTCTGTTTTTCAGCCATTGCTTGGGCTGCCGCCGACTCGTGAAGCTGATCACGAAATTAAGTTGTTTCCTAGTATTGCTCTGATTAATGTTCGACCTTATAGATATCCTCAGTTCCAAAAGGATGAGATAGAGAAGTTGGTTGAAGCGTGGATTGGAGGTGGTTTATTGATTGAGGCTATCGGAGGTTACTCAAATACACCTTGTGTTCCATGTGCCTTAGTTATGCAAAGCTATTGGTAATTCGTTTCCGATGATTCCTTTTCCTCCTAATTTATCTCCAGACATGTTGACTAAGGTGGTTCCAGTAGAATTGTTGGGATTGTGTCAATCAACCGCTGATTCTACTAAGCTCATAGTTTTAATTCGATGGGTAGAATCGGATGTATCAGAAGCAACGTGGGAGGACGTTGTTTAGCTTGCTACATAGTTTCTTGAATTTCACCTTGAGGACAAGGTGGTGCTTTGGGGGCTGGGTAGTGATAGACCTATTAAATATGTTTATGTTAGGATACCAGTTCACGAGCTTTTATTTACAGTCAAAATGGAAATACAAACTCCAGTTCGAGATGGTGATGTCTCCTTTGTCTCTCCTATCTTCACAGATAAGAGAAAGATTACAGAAAGTATTTTTCATAAACCTATTTCCCCCACAAAAGATACATTTTATACTACCCAAAATATGATAACCCTCACCGCTAAACCCACCGACTGCCCCTTAATATTTACATTAGACAAAAGAAACACATATTACTTCCCAGTAACTGCCTACATAGATGGTGAATTCCCTCTACCCCTACACATATGTATGAATAATTGGGGGTCTAACAATACCCCCGGGGGTATAAGCCACCTTGTCCTCAAGTGGAAAGGTTGGAAACTGCTGTCGGAAGTGCTCCAGGGATTCCCAAGTACCTTCAAATTCTGGTAGACCTTTCCATTGTACTAGTAGCTCCCACTCATTTGTAATTGGGTTAGTGTGGTAAGCCATAACGTCTTCTGGTTCGGCTATCCATTCAAAATCATCTGTGAGCATAGGTGGAAGTCTTTCAACATGCTCATGGCTTCCCATTGCCTGCCTGAGCTGAGAGACGTGGAAAACAGGATGGATCGTTGCCTCTTCGGGTAGATCTAAACGGTATGCCAGGGAACCGATCCTTTCCACAATGCGATAAGGTCCGAAATATTTTGGAGAGAGCTTCTCATTCCTTCTGTGAGCTATCGATGTCTGGCGGTAGGGGCGGATTTTCAAATATACCCATTCTCCTTCTTCATAC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ATGGCGGCCATTTCACTAGACTCCGCGTCGGCCGTCTCTCTCAGACCCACGTCTTCCCGATTCCCCTTCAAAATCCCAAGTTTCTCCAAATCTTCATCACTACCATATTCTTCCGTTTTCAAATCCCATAGCTATAATCATGACATCAGGAAACCGGCTCTCTCTGTCAAAAGCATTGCTGAAACGACTTCCAGTCACTCGTTTTCTAGAAAGAATTCTCCTACTTCGAAGATTGTATCCGGGGTGAGACGGCATACAATTTCTGTGTTTGTTGGCGATGAAAGTGGAATGATTAATCGTATAGCTGGTGTTTTTGCTAGAAGAGGATATAACATCGAATCACTTGCTGTTGGCCTGAATAAGGACAAGGCTCTTTTCACCATAGTTGTCTCAGGAACTGAAAAAGTGTTAGAACAAGTTATTGAGCAGCTCCACAAGCTTGTGAATGTTCTGAAGGTTGAAGATCTCTCCAGTGTGCAGCAGGTGGAACGTGAGCTGATGCTTATAAAAATAAATGCTGACCCTGCGTACCGTGCTGAGATTAAGAGGTTAGTGGAGATCTTCAGAGCAAAAATTGTAGATATCTCGGATGATTCTGTAACAATTGAGGTGACTGGGGATCCCGGAAAGATGGTTGCTTTTCAAAGAAATTTAAGCAAATTTGGAATTAGAGAAATTGCTAGAACTGGAAAGATTGCTTTGAGGAGAGAAAAGCTGGGTGCATCTGCCCCGTTTTGGCGATACTCTGCAGCTTCTTATCCAGATCTAGAACAAAAGCTTCCTGTTAATGCACCCATGGGAACTGAAAATAAAGCATTCAACAGTGCACTTAGTGAATCCAATCCGTCAGGAGATGTATATCCCGTGGAGCAGTCGGATGACTCCACTATCAAACCAGTTCTCGATGCTCACTGGGGAGTACTCAATGATGAAGATATGGATGGTCTTCGTTCACATACTTTATCTTTGCTTGTAAATGATGCTCCAGGGGTCCTTTATATTATCACTGGACTTTGTGCAAGAAGAGGATATAATATTCAGAGTTTAGCTGTTGGTCATGCTGAAGTTGAGGGCATTTCACGCATAACAACTGTTGTTCCTGGTACCGATGAGTCAATCTACAAGTTGGCGCAGCAACTTTATAGGCTGGTTGATGTTCACGAGGTACGGGATTTGACCCACATTCCATTTTCCGAGCGGGAGCTGATGCTGATTAAAATAGCTGCAAATTCTTCTGCTAGACGTGATGTGCTTGATATTGCCCATATATTTAGGGCCAGGGCAGTTGATGTCTCTGACCATACCATAACTCTAGAGCTCACAGGAGATTTGCATAAGATGGTTGCACTCCAGAGATTGTTAGAGCCTTATGGCATTTGTGAGGTAGCAAGAACGGGACGAGTAGCGTTGGAGCGTGAATCGGGAGTAGACTCAAAATATCTTCGTGGATACTCTTTTCCTCTGTAA MAAISLDSASAVSLRPTSSRFPFKIPSFSKSSSLPYSSVFKSHSYNHDIRKPALSVKSIAETTSSHSFSRKNSPTSKIVSGVRRHTISVFVGDESGMINRIAGVFARRGYNIESLAVGLNKDKALFTIVVSGTEKVLEQVIEQLHKLVNVLKVEDLSSVQQVERELMLIKINADPAYRAEIKRLVEIFRAKIVDISDDSVTIEVTGDPGKMVAFQRNLSKFGIREIARTGKIALRREKLGASAPFWRYSAASYPDLEQKLPVNAPMGTENKAFNSALSESNPSGDVYPVEQSDDSTIKPVLDAHWGVLNDEDMDGLRSHTLSLLVNDAPGVLYIITGLCARRGYNIQSLAVGHAEVEGISRITTVVPGTDESIYKLAQQLYRLVDVHEVRDLTHIPFSERELMLIKIAANSSARRDVLDIAHIFRARAVDVSDHTITLELTGDLHKMVALQRLLEPYGICEVARTGRVALERESGVDSKYLRGYSFPL Homology
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YZ7 (Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g31810 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 620.9 bits (1600), Expect = 1.2e-176 Identity = 339/492 (68.90%), Postives = 394/492 (80.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SMC2 (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Nicotiana plumbaginifolia OX=4092 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 570.1 bits (1468), Expect = 2.4e-161 Identity = 299/392 (76.28%), Postives = 333/392 (84.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFF4 (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 1.6e-160 Identity = 301/434 (69.35%), Postives = 357/434 (82.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9MS98 (Acetolactate synthase small subunit OS=Galdieria sulphuraria OX=130081 GN=ilvH PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 2.4e-44 Identity = 91/164 (55.49%), Postives = 126/164 (76.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55141 (Acetolactate synthase small subunit OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=ilvH PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 2.4e-44 Identity = 94/156 (60.26%), Postives = 126/156 (80.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY73 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439566 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 850.5 bits (2196), Expect = 3.4e-243 Identity = 443/488 (90.78%), Postives = 464/488 (95.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I8P8 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472463 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 841.6 bits (2173), Expect = 1.6e-240 Identity = 441/488 (90.37%), Postives = 463/488 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPI4 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491925 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 832.4 bits (2149), Expect = 9.7e-238 Identity = 436/495 (88.08%), Postives = 459/495 (92.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5Y0 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017604 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 798.1 bits (2060), Expect = 2.0e-227 Identity = 430/490 (87.76%), Postives = 448/490 (91.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KL76 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G013280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 740.3 bits (1910), Expect = 5.0e-210 Identity = 382/413 (92.49%), Postives = 392/413 (94.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. NCBI nr
Match: XP_022932952.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] >KAG6571736.1 Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 850.5 bits (2196), Expect = 7.1e-243 Identity = 443/488 (90.78%), Postives = 464/488 (95.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. NCBI nr
Match: XP_023554791.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 847.0 bits (2187), Expect = 7.9e-242 Identity = 443/488 (90.78%), Postives = 464/488 (95.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. NCBI nr
Match: XP_022973872.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 841.6 bits (2173), Expect = 3.3e-240 Identity = 441/488 (90.37%), Postives = 463/488 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. NCBI nr
Match: KAG7011462.1 (Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 840.5 bits (2170), Expect = 7.4e-240 Identity = 443/503 (88.07%), Postives = 464/503 (92.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. NCBI nr
Match: XP_038886845.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 835.5 bits (2157), Expect = 2.4e-238 Identity = 440/489 (89.98%), Postives = 462/489 (94.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.1 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 620.9 bits (1600), Expect = 8.5e-178 Identity = 339/492 (68.90%), Postives = 394/492 (80.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.2 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 567.8 bits (1462), Expect = 8.6e-162 Identity = 292/386 (75.65%), Postives = 333/386 (86.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. TAIR 10
Match: AT5G16290.1 (VALINE-TOLERANT 1 ) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 1.1e-161 Identity = 301/434 (69.35%), Postives = 357/434 (82.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. TAIR 10
Match: AT5G16290.2 (VALINE-TOLERANT 1 ) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 1.1e-161 Identity = 301/434 (69.35%), Postives = 357/434 (82.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g016850 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.3 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 2.5e-161 Identity = 318/492 (64.63%), Postives = 373/492 (75.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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