Lcy05g015750 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGAAGGTTATTGCATTTATTTTAACTTTGCAGCCTGATGTCCGTCAACCCTTTCTCATCATCTCAACTTCCACTACACTTGGTTTCTGGGATGATGTGTTATTTCGTTTTGCACCATCTTTCAGTGTTGTAGTTTATAAAGGAAACAAAAATGTACGGAAAAACATTAGAGATCTAGAGTTTTACCAAGGAAATTGCCCAATGTTTCAAGCTCTTATTTGCTCCCCGGAAGTAATGATGGAGGTAATGCTCTGCCCCTCTAGTTGATAATTATATTGGAGAAATTATTGCATTCTTATGAAATGACTTTGTTTCTCACCTGATAGTATGGCTTTAATCAGATTCCTTTTAACCATAACTACTTTATTTACTTTAGGCAATATCGTCATAAATTTCTTTTTTTTTACTTTTATTTTGGATAAATATCCTACAAAAGCTTTGAAACTTTCATTCAATATCATACTTCTCTGCAGGATCTAGATGTGTTGGGCTGCATAAACTGGGAAGTAATAGTTGTTGATGAGTGTCAACGCCCAGCAATTTCTTCACATTTTGAAAAAATGAAGATGCTAAAGGCAGATATGTGGCTTCTTGTTCTTGCTGATCAGCTAAAGGTTTGTTCTCGTGGGTGTTCTATTATATTAACTTCTCACCATTTGATTTATGATTTACGCTAATACTTTTTAACTTGGCAGGATATCAAAGATGATTATCATAATCTTCTCTCTCTACTTGACACGAATGACCAAGTTCAAAGTGAAGATACTCTGGAGACCAATGATGGTGATAATGTCAGCAAACTTAAGGAGAGATTATTACATCATACTGCATATACTTGCACTTCTAAATTTGTTGAGTATTGGGTTCCTGCACGGATATCAAATGTGCAACTTGAGCTTTATTGTGCCGCCCTACTTTGTAACTCTGCATTGCTTTGCTCATCATTCAAAAGTGATTTGCTTGACAACATCCATGACATGCTCGTTTCAACTAGGAAGGTTGATTCTTGAACTCTGGCATCATTTCTCACTTGAACCTTTAAAAACGTCCATTTTATGCTGCTTACCTTTTTTTTGTAATGGAAAATTATTGTTTCTCATTGAAGTTAAGTTGAAAGTTCAGCTATATGTCATTGTGAGTTATTTTATTTGTATGTTCTGCAGTGTTGTGTTATTTATTTATTTCTAATGGAAAATAACTGTAATGATGATAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAATATTCACATAAAGGGCCAAACCGGAAGAGGGAATAATAACTTATAATAGAAGTAATTGAACCCCAAATATAAAATAAAGATAACAGTTGTCATGGATTGGTCTAGTGGTCCATAAGGGCCATTGTAAATATTTAAAGGCTTAGAGGGGAATGACTTTAAATTATGGTGGTCACCTACTTATGATTAATATCCTACAAATTTCTTTGGCAACTAAATATAATAGGGTTAGACAGTTATCCCTCAAGCATAGTCGAGGTGTGTGGAAAGTCGAGGTGTGTGGAAGTTGGTTTTGACTCTTGCAGATCAAGAGAAAAAGAAAAATTTCAAAATAAATTTTAATGAAACAACAATTTTTAATTTTTTTTTTTATGGGAAACAAAGAACATTAAGTTGCGTGGACTCCATCTTTCTGCCTATGGAAAATAAAGTTGATGATATTGAGGTTGAAGATTCTTTTCTTGAAGACCTAGGTTCTTTATTTCAGGGATGTGACAAGAAACTCTTCATCTTCCATCCTTAGTGTGTAGTCATTTGCATCTTTTATTGAAGTTTGTGGTCTTGAGTTACGTGAAATTCCTCACTTAGTTTCAGATGACATTTGTGTTTGGAGTTCTTAAATGGTTGCTGTTAGGTGCTTAATTCTTTGTTTTGCCGTTTGGTCTTTGGAGCTTCCCTAGGACTTCGGTGGTGTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGTTGGCCTTTAGTGTGTTTACTGTGGGTTGTCTCTAGGTTTGTAACTTTGTATGTAGTTTCTTAGGCTCTGTTTTAGTTAGTTTTCTTTGATGTCTTTGTTATTTGTTTGCTGACTTTTTTTTGTTTTTTTCATGGTCTTTTTGAATTTTCTCTTTGGGTTTTTGTTCCTTTTTGGTTGTTTTTTTGGTTCCTTTGCTTTTCATTTGTCCTTGTGGAATTTGTATCGAAAAGTTTCGTTCTTGTTTAAAAGAAAGGGAACAAACAGCCCAAAGGCGATGAGAGGTCCCTAGGCCTAATTCAGAGGATAAAAACTAAAAAGCCTCCAATCTAAATTGATGAGCTTGTGCTGTGTGTTACAAAAAGAAGTCTGTACCTCACTGCAAGTGGAGGCAGTGAACTGTACATTTTCACAAAACAATCAATTGTCGAAGACTTATCGGAGAACATCCTGCTATTTCTTTCTTTCCATAAGGCCCAAAAAAGTGCTCTACTAGTGTTGGTCCATAGAATCTTAGCTTTTTCTTTAAACCATCAACCAAAGAGAATTTCATTAAGACCTTCAAATGGGAGGTTTTCTCTAAGCCAGTCGAAGTCGGGGGTTTGGGTATTGGGAACCTAAGATTACGTAACAAAGGCCTTCTGTCGAAGTGGTTGTTGCATTTCTTCTTTGAGCCAGACGCCCTGTGGTATAGGGTTTTTGAGTAAGTATGGACCTCATCCTTTTGAATGGGTTCCAAGTTGTAGGCTTAAGGGTTTTAGCAAAAACCTCCATACTGTGATTGCCTCAAGTTTTCCTTTATTCTCTAGCTATATCCAGTGCGCTATCAGGGACGATTCTAAAACTTACTCTTGGGAGGGTTCCTAAGTGGGGGAGTGACCCTTATGTTTCCTATTTCCTCATCTCTACCATTTATCTGAGAAGAGGTTGCATCTGGTGGCCTATATTTTGTCTTCCTCCATCTCCTCCTTGTATCTTTCATTGGGCATCATCTTACTGATCGTGAGATGGTTGACCTTGCTAATCTCCTCTCCATCCTACAAAATTAGACCATTCATCATGGGAGGAGTGACTCTCAGGTTTGGCCTCCTAAACCCTCTTAGGGTTTCTCTTGGTAGCTCTTTCTTTCAAATTCTTTGTGCCTCTCCTCCCTCTCAGGGTGTTTCTGCTTTCTTTTTGCTTTGGAAGATTAAAATTCTTAAGAATTTTAGATTTTTTGTTGGGTAATTTGTACATGGAAGGGTGAACACGCAAGGTTGTCTCCATAGACATTCATCTTTTACATTACGCCCTTAATGGTGCGTTCTTTGTAGGAATCATTAAGAGACCCTTAACTATATGTTGGGGGAATGCTCGTTCATGTCTTCTCTTTGAATTTGTTTTTTTAGTTTTTTTGGAGTTTCCTCGTTCACAATAGAGGTTGTAGTACCATGATCGAGGAAGTGCTTCTCAACTCTTCGTTCCGTGATGAAAGAAAAATCTTATGGCAAGCTTGTTTCTTTGCTACTTTATGGGGTATTTGGCTAGAAAGAAATTGTTGTATCTTTAGAGGGAAAGAGAGATCAGAGGAGGAGATTTGGGATTTCATTAGTTTGAACGCTTCCTTATGGACATCCATTAATTGGGCTTTTTGTAATTACTCTTTGGGGGTCATTCTTTTGGGTTGAGATTCTTTCTTGTAATTAGTTGCTGGGGTCTTGGTCTGTAGTTTTGCTTCTTGTTTTGGACTTGTTTTTTGTATGTCCTTGTTCTCCCTTTCATTCTTCTTAATGAAAGTTTGGTTTCTTCTCAAAAAGAATAATAATAGTAATAAATAACAATAATAAAAAATAAAAACTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTATAGGAAACATAAACCATTTCATTGATGTATGAAATAGATACAAAAGGAAGACTTATCATGAGTAGTTACATAAGATATTTCCAATGAGATAAGAGGGAGGATAAACTAGAATTACAGGGTGAGAGTGACTACTCCAAAAAAGAGCTAGATATGATGTAGACCCCATGAAAGCATAAAAATTATTTGACTTATCGTGAAGATTCTGGCGTTTCGCTCCAACCAAATGTTCCAAAAGAAGCATATATAACATTGTGCCACAAGAGTTTCTTCTCCTTTTTGAAAGGATGCCCAATAAGAGAAGTTTTTAAGAGGGTAAAGATGTCACCCGGTCTAGCAATGTTTTTGGGAGGGCACCACAAAAATTGAATGTTTTTAGGATAGAACACCAACTCTTGTAGGCAAACTGACAAAGAAGGAAAAGGTGGCTGTTGGACTCAGAGTTGCTGCTGCATAGGAGACACATGCCAGGGGAGAGATCCATACGAGGGTGTCTGCTTTGCACTCTGTCTAGAAGAAATTAACCTGTCTTGGACTTTTCCCCTCCCAAATTAAATTAGAAAGAGTCTGATGGAGAAAACAGTAGCTTCCATGAAGTAAATTGGCAGCAGATTTGGTAGATAACACTCCAGAAGCCTCTGGGTTCCAACAAATATGATTGGCCTCTTCATTTGGCTTGATTCCCTCAAAGATTGATACGAGATTGATCAAATCTTCCAATTCTCTATTGAAAAGCCCTCTTATAAGGTTTAGGTTCCAAACTTCTCTTTCAGCAGACCAACAATTTTGGATAGAAGCACCTTTGGAGTTGGCAATGGCAAAAATGGAAGGAAATCCTTCACAAAACGGTCTTAGCGACGCCCACTTATTCTACCAAAATTTAATCTTTCTCCCATTTCCAATTTTAAATTAAATAAATCTAATATTGCTTTCAAAAAAGCCTCTCATTTTACAGATGTTCTTCCTAGGGCTGAATTTATGTCGTTTGGTGCTATCATATTTGGGAGCCAATTATGGTCACAAGAACCAAATTTACTTTCTATGTCAGTCTTCCATAAAGCATTATCAGGTTGCACAAATCTCCACAGCTATTTTGATAACAAGGCCGAATTGTGGTGCATGGGTGTGGGGATTTTAATATATCTCAGTGGATTCATGAAAGATCTCCTTTGGAAAGACAAACTAAGAGTAT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Match: Q9M658 (Helicase protein MOM1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MOM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 2.2e-106 Identity = 451/1627 (27.72%), Postives = 733/1627 (45.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4KBP5 (Protein CHROMATIN REMODELING 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CHR4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 187.6 bits (475), Expect = 1.3e-45 Identity = 145/464 (31.25%), Postives = 229/464 (49.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8TDI0 (Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 164.9 bits (416), Expect = 8.9e-39 Identity = 135/447 (30.20%), Postives = 218/447 (48.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2A8L1 (Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Chd5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 164.9 bits (416), Expect = 8.9e-39 Identity = 135/447 (30.20%), Postives = 218/447 (48.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S775 (CHD3-type chromatin-remodeling factor PICKLE OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PKL PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 1.2e-38 Identity = 142/505 (28.12%), Postives = 240/505 (47.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GCT4 (helicase protein MOM1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452784 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2831.6 bits (7339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1511/1903 (79.40%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GC12 (helicase protein MOM1 isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452784 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2831.6 bits (7339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1511/1903 (79.40%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GC13 (helicase protein MOM1 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452784 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2831.6 bits (7339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1511/1903 (79.40%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KDL3 (helicase protein MOM1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493379 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2827.0 bits (7327), Expect = 0.0e+00 Identity = 1509/1902 (79.34%), Postives = 1615/1902 (84.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K931 (helicase protein MOM1 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493379 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2827.0 bits (7327), Expect = 0.0e+00 Identity = 1509/1902 (79.34%), Postives = 1615/1902 (84.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. NCBI nr
Match: XP_023523644.1 (helicase protein MOM1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2838.9 bits (7358), Expect = 0.0e+00 Identity = 1512/1903 (79.45%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. NCBI nr
Match: KAG7036831.1 (Helicase protein MOM1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2831.6 bits (7339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1511/1903 (79.40%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. NCBI nr
Match: KAG6607145.1 (Helicase protein MOM1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2831.6 bits (7339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1511/1903 (79.40%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. NCBI nr
Match: XP_022949441.1 (helicase protein MOM1 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2831.6 bits (7339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1511/1903 (79.40%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. NCBI nr
Match: XP_022949439.1 (helicase protein MOM1 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022949440.1 helicase protein MOM1 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2831.6 bits (7339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1511/1903 (79.40%), Postives = 1620/1903 (85.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. TAIR 10
Match: AT1G08060.1 (ATP-dependent helicase family protein ) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 1.6e-107 Identity = 451/1627 (27.72%), Postives = 733/1627 (45.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. TAIR 10
Match: AT1G08060.2 (ATP-dependent helicase family protein ) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 1.6e-107 Identity = 451/1627 (27.72%), Postives = 733/1627 (45.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. TAIR 10
Match: AT5G44800.1 (chromatin remodeling 4 ) HSP 1 Score: 187.6 bits (475), Expect = 9.1e-47 Identity = 145/464 (31.25%), Postives = 229/464 (49.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. TAIR 10
Match: AT2G25170.1 (chromatin remodeling factor CHD3 (PICKLE) ) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 8.3e-40 Identity = 142/505 (28.12%), Postives = 240/505 (47.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g015750 vs. TAIR 10
Match: AT4G31900.1 (chromatin remodeling factor, putative ) HSP 1 Score: 152.5 bits (384), Expect = 3.3e-36 Identity = 161/621 (25.93%), Postives = 289/621 (46.54%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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