Lcy05g015220 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy05g015220
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr05: 18919077 .. 18924131 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy05g015220
SyntenyLcy05g015220
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGCATCACCAAGCTCCTCAACTCTTCTTCTTATTTTCATTTCGTTCGGCCAACACTTATCTTCCTCATCTCCGATGTTGTCTCCAAGCATTCTCCGACAAGCGGCGCCATGACGGCGGTTTAGGGCAGTTCGTCGATGTGGGTTTGCAGCAGTTTTTCGACATGGTTTTGGGTAAGTTTCTCGCAAGTTTCTCATCCTCTAGGCCTGATTCCTTTCCCTCTTTCGTTCTAAATCTCTCACCCTCTGTTTTCGCTCATTTTTTTTTTTGACGAGTTTCAAGCATGGAAGGGGTTCATTTTTGCGTGTTTCCAGCGGGTGTACAGTTTATGCACAGATAGCAACATGGTGGCTCTTTTTTGGGCGTTTCTGCCAAGCTTTCGGCATGGGTAAGTTGGATTGAAGGTTATATTGGTTGGTTATCATGTTTAATCGAATACCCACTCATTTTTGTTTTCATTCAACAAACTTTTCCCTTCAATTTTGACGATTCAAAGCAGTGTGTCTTCGAGTTTCAGCGTCTTTAAGCAACTTCGACATTGGGTAAGTGTTTTACATCAAGGTTTGGGGTTGATTTTAGTGTTTATTCAATTGTCCGTTAATGTTAGCTTGCAAATTCAAGGTACCCATAATATTTGGAGGTTTAATCGTTGATTTGGAGTGATATTGGAACTCGGACAACAAGTTGTGTTTTGTTTTTGGGTAAGTTTTGGGTGTTAAAGCACCCACAAATTTAATTGGCTCCTAGTTGAATGTTTGTGTTAGAACCCCTATTGATTTGAGAAGTTTATCCCCTTTTGTGTAGCTTGATTAAGGACCTTGGAGCTAGAGTACTATTCATTTGGATTTAATCAAGCTAAGCAATCTATTTGGCTAAGGTAAGTATCCATTGGATCAAGTTTTATGTTTGGACCGATTTAATCGAAAGGTTATTATATTAGCATGATTTGGATTTAAGTCTAAGTTTTGTCCTTGAATTTAATTAAGCATGAATGGTTCATCTTGAAGCATGAAAATAGTATGAGAGTGATTTGGTTGTATGAATTTTCCCCTTTTGTGTAGCTTGCTTAAAGCCATGGAATTAAGAAATTTGTCAAAGGATTATCAAGATTAATTAAGCCAGCGTAAGTGGCTTTACTGCTGGAATGCTTAGGCTAGGTTGGAAAATTGTGTGATGATAGGATAGAACTTGCATGAAATTCTATGAATGTGAAACATGAATCATGAATTTATTGAATGTGTAGACCATGATTTCATTTAGAGGAAAAACTATGAAATTATCTCGTGCTTATGCATGATTGAGGATATATATGTTGCATTCTATGAGTGTATGATGTTTTGTTATGGGACTCATGCATATGTATGTTTCATGATATTAAAAGAACCATGTTCATGACAATTACCCTTAGAGGAAATTGATGTACAGAGAGGAACCTGAGGTACTGTAGGCGAGATTCGACTCTACTAATTAGGTGTCAACTGACTATTAGATGGGGCACATTCTCGAAAGGATGCTTATTGTATCTCTTAGTTGGGAGAGGAACTCGAGGTAACTTAGGCGAGAGATTCGACCCTTCTAACTAGGTGTCAACTGACTATTAGATAGGGCACATTCTCTAGAGGATGCCTACTTACCTCTTAGTTGGGAGAGAAACAGAGGAAGGGTAATTGTCCATGTTAAGGCCTTAAAAGAAATTCATAATTAAGAGGAAAGAGGAATAAGGTCCCACTAGAAATGCATGAACCATGATCACTAGAAAAGTATGAACCATGATCACTAGAAAAGCATGAACCATGTTGTATGTGTTTGCATATCTTGACCCCAGTAGTGGGGTTACTTACTGAGTATTTTAAATACTCATTCTTTCCATGAATGTTTTTTTTTTTCAGGTAAAGGCAAGGGTGTGTGATGGCTGTTGATGAGAATCTATTATAGGCAGCCATGGGAGATTAGGACACATGAACTTCACGTTTTCTTCCGCTTTATGAACTATGTTTTACATTCTGTTGGTTTATGAACTTGTTTCGAGAACTCCTTAGAGGCCATGTTTGCTTTTGGTTTGAAAGTTATTTGAGAATATTTTGTGACTTTAAAGTTAGGGATCCCGAATAAAGGTTTTTACTTAAATTTGAGTTTTTGTTTCAAAATATTTTATTTCGAAAGGCAGCCATAGCATCACTACTACAAAAATAGCTTTTAATGACGGACGGAAAAAAATTCACGAACCTTTTAATGACGGACGAAAAACGCGCGGCCTTTTAATGTCAGACACGCATTTTTATAAAATTTCGGACCTTTAATGACGGACATTGCCCGTCATGAAAAGAGCCCGTCATTAAAAGAGTCCGAAAAAAAAAAGATTGGATTAAAGGATCTAGAAAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAACAAGCCCTAGAAACCTCCTTCTCTTTCTCTCCTTCTCTTTCTCCTTCCCATGCGGTCATCCCCCAATCCCATGCGGTCATCCCCCAATCCCATGCGGTCATCCCCCCAATCGCCTCTTCTTCTTCTTCGGCAGCGTGAGAACCCCTCCCCTCTTGATTTTTCTTCTCCCTGAGACCGCCGCTCGATCCCTTCAGCCACTCCCTTCTTCTTCATCTCCGGCAACACCTCCGACGACATTGTGAGTAACGTGCGTGAGATACCCAGCCAGGCGCGAGTTCAAGCGGTAGAGTCCCGTTTAGGCGTGATTTCTTCTTCCCTTGGTGTGCTGCGGCGTAGTGGTTGATCGAAACCTCAAATCCATCACAGCTCCGGCGACGACCTCTGAACAACACCTCCGACGAACTTGTGCAACAACCCACGGATCGAGACTCATCTCTGCGCGTGGTTCAGACTTCCAGCGGGCTTCAACTCCGATTTTCCTCCTCTTCGGTAAGGATTATCACTTACCCGTTCGTATTCGACCCTAGAACTAAGCTACCCACTCCCTAAAAATGTTCTATTCTATGGATCCGACGCCATTTTTAAATGATTTTTTTGATAGTAAACAATGGAGTACATGACAGGTAAAGTTAATTTCTGTTGTCAAGATTTTAACGGATCCACCATTATGCGTCAAGTATTGTTCTTCTTTCTCCAGTTCTCCTTCCGGCCTCGCGGCAGCCGTCTTCCTCGCTCAACTGCCCTCTTTTTCTGGTTTGTTGCGTGATGTAATCTGGTGAGTTTTTAAGATGATAGATGTTTGAATTAAAAATTTCAATGTTAATTTGGTTTGAATCTTGATTTGATTATGAATTGGATTTAATATGAATTCTTCTACGGGTTTGTTTTTGTAAATTTCGGTGGTTATGGAAGTTTAAAATTATATATCTGTATATAATTGTTCCAATTTGATGAACTCTGGAGTTGGATTTTCTGGTGTACATATGTTTTTCTTGCTTAATTTCATTCTTCTAGATCTGAAACAAAGTAGAAGTAAGACATTGGGAACATCAGGAATGAAGATGGCAGCGGCATTAGCAACCATAGGAGAAGGGTGATAGTGATATAGAAAAAGGGAAAACAGAGAGGATCAGCCATTAAGGAAAAACATATATAAATATAAGGATTAACCTGCTAACTAAATCTGATTCAAAACTTGAAAATAAATCACGCATCATGGTACGATATGAAATTTTACATCACAACTATAACAACTATAACAACAATCCAACCCGTGCATGTTTAAGCTCCTACGACCACCAAACAGCGAGGATTTGAGGTTGTTCAGTGAGTGGTGGTAAGTGGCAGCGAGTCGTAGGCCCTCTCATACGCAATTAAATGTTTTAAACTATTCCTTAACCCTTGGGTATCATGTGTTTTAGGTTCGGGGCGATATTGGAGGGTCCGAATAAGGTTAAGGGTGAATTTTGAGCATTTTTCGGTAAGGGACAACAAGTATAATGTTCTTTTTGAATGTGCGTATATGCTGTGAATTAGTTTCTAAGCTTTGGGTACTCTTTGTGGTAGGTTCCAGTTTGATTTTTGTGTGTCCGAATAAAATTCAAATCAACTTGTAGGGCCGTTCTTTGAACCATTAGGAGTGCGTTAGGACGTTATACATTCAATTCCATCCTTTCTCCCCTTAATCTATTGTGACTTTCATATGCAGTATATTTAATTCATTTTTAAGTTGGAGTTGCCACAAGGTGAGATTTAGTTGCAAGTTATTGTTATGTTGCATTGTCATTACGATAAACTCACTTGTATCTTATATTTTGCGATCTTAAAATCACATTGTTGGAACTTGATTTTGTTTTCAAAACAAGTTTCTATTCATTCTTGGTTGAAATGCTCTAAAAGTGTTTACTACTTATTTCATAACTTTGGACTTGTTCTACAGATATGTAGATTAATTGCTTAATATAGGCCCACAATACCTCTACTGTCATGCGGTTTTTCTGTTATGTCCATTGCTAAATATACAAGTTAGTGAGTCTTGATATCATTGTTATTTCAAAGGTTCTTTGATTGGTTTGATCACTTCAAGTCCGGTAGTTTAAAAGCTTCTTCTTGGTGTTCTTTTTCAAATCCTTTTGATGAGTTTTCTTGAGATGTTTTTCCCTTTTGTTTTCTTTGTTGTTCTTTGTTTCACTAATATTTGGAGTTTGTATCCTTTGGGCATTAGTCTCTTTTCATTTATTCAATGAAAATTTTTGTTTCTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAACTAAGATTCCTCTTGATGGCAAATTTGATGAAGTGTCAATGGAGATGCTCTAACTTAGGAGTTGATGTGTCACTCATTTTTTTCTTTCTTATAACCTTTCCTCTGTTTAACCTTTTCCTCTTCCTTGGTGGATTTCAAAGTAACGTCCTTAGTTTCCATTTTCAAATAATAAATCAGTTTTTTAGCCTTGTTTGATTGGCGGGTATTGAAGAACTCATGATATTGCCTACATTTAGTTTTGAATATTCGTATCGCTCCACATTATGTTCTTTATCTGTGATGAATGCTTATGCTTGCATTCTTTTGGCAGGTTCAACTGGAGCCAACAACTTCATGGGCTTTGGTGGTTCAAAGAAGTGTATCCGGGTCATTAA

mRNA sequence

ATGCATCACCAAGCTCCTCAACTCTTCTTCTTATTTTCATTTCGTTCGGCCAACACTTATCTTCCTCATCTCCGATGTTGTCTCCAAGCATTCTCCGACAAGCGGCGCCATGACGGCGGTTTAGGGCAGTTCGTCGATGTGGGTTTGCAGCAGTTTTTCGACATGGTTTTGGCCACTCCCTTCTTCTTCATCTCCGGCAACACCTCCGACGACATTGTGAGTAACGTGCGTGAGATACCCAGCCAGGCGCGAGTTCAAGCGTGGTTGATCGAAACCTCAAATCCATCACAGCTCCGGCGACGACCTCTGAACAACACCTCCGACGAACTTGTGCAACAACCCACGGATCGAGACTCATCTCTGCGCGTGGTTCAGACTTCCAGCGGGCTTCAACTCCGATTTTCCTCCTCTTCGGTAAAGTTAATTTCTGTTGTCAAGATTTTAACGGATCCACCATTATGCGTCAAGTATTGTTCTTCTTTCTCCAGTTCTCCTTCCGGCCTCGCGGCAGCCGTCTTCCTCGCTCAACTGCCCTCTTTTTCTGGTTTGTTGCGTGATGTAATCTGGTTCAACTGGAGCCAACAACTTCATGGGCTTTGGTGGTTCAAAGAAGTGTATCCGGGTCATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCATCACCAAGCTCCTCAACTCTTCTTCTTATTTTCATTTCGTTCGGCCAACACTTATCTTCCTCATCTCCGATGTTGTCTCCAAGCATTCTCCGACAAGCGGCGCCATGACGGCGGTTTAGGGCAGTTCGTCGATGTGGGTTTGCAGCAGTTTTTCGACATGGTTTTGGCCACTCCCTTCTTCTTCATCTCCGGCAACACCTCCGACGACATTGTGAGTAACGTGCGTGAGATACCCAGCCAGGCGCGAGTTCAAGCGTGGTTGATCGAAACCTCAAATCCATCACAGCTCCGGCGACGACCTCTGAACAACACCTCCGACGAACTTGTGCAACAACCCACGGATCGAGACTCATCTCTGCGCGTGGTTCAGACTTCCAGCGGGCTTCAACTCCGATTTTCCTCCTCTTCGGTAAAGTTAATTTCTGTTGTCAAGATTTTAACGGATCCACCATTATGCGTCAAGTATTGTTCTTCTTTCTCCAGTTCTCCTTCCGGCCTCGCGGCAGCCGTCTTCCTCGCTCAACTGCCCTCTTTTTCTGGTTTGTTGCGTGATGTAATCTGGTTCAACTGGAGCCAACAACTTCATGGGCTTTGGTGGTTCAAAGAAGTGTATCCGGGTCATTAA

Protein sequence

MHHQAPQLFFLFSFRSANTYLPHLRCCLQAFSDKRRHDGGLGQFVDVGLQQFFDMVLATPFFFISGNTSDDIVSNVREIPSQARVQAWLIETSNPSQLRRRPLNNTSDELVQQPTDRDSSLRVVQTSSGLQLRFSSSSVKLISVVKILTDPPLCVKYCSSFSSSPSGLAAAVFLAQLPSFSGLLRDVIWFNWSQQLHGLWWFKEVYPGH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy05g015220.1Lcy05g015220.1mRNA