Lcy05g006320 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCAGCCTTAGCAAAAGAGAGTGGGAATGACGAGGATATGGCAGAGATGATTGCTTTAGAAATGAGTTCTTTGTCCAGTGAACTCAAAGATATTGAGGAGAAGCTTAAGGTGCTTTTGGTTCATAAACATGATTTTTACATGTGTGTATATTCTGGATAAGAACAAATTTTTATTAATGTTAATGTGTTTTCTTTGTTTAATTTCTTTAGCAATATTCATTCATACTTGTTATTTTCTCTTCTTGTTAAAGTTGGTAGAATTATTTATTTGCTAAAACAAATAAGTAGTGACATTATAACTTGGGTTTTTTTTTACTGATGGTCAGATTTTACAAGCAAATACCTTGCTTACAAGTTATATCTTACATTTCTCTGAATTGAATCTGAAGACGTTATGTTGCATTTTTCTTCATTAGGTGATGTTGCTTCCATCCGATCCTCTTGATGCCAGAAATATTATGCTTGAAGGTCAACTTCCTCAGTTTCCTCTGAAATTTTATGCCATCTGAATAATGAAAAATTTTAGCATACATTTTCCAAAGGTTGCATAGATATACTTGTTGCACAATTAGAATTCTGCCAACATAAACTGCTAAGTTTATGCCTTTTCTTTATCCTGATTAAAATTTGTAATTTCCTCCTGCCATGCAGTCCGGGCAGGTACAGGGGGTGATGAAGCTGGAATTTGGGCTGGTGATCTTGTAGGTACATGCTTCTTTTATCCTTAAAGAACTACGGATAAAGTGTGCACATAGTTTTTTTTTTGGTTGCCCATACAATAGCAGAACAAGAAAAATATTGGTTATGAAAGAACATCACTTGATATCTTTGTAAGAAATATCATGCCAAATAAACACATTCTTTGTGGTGTGACCTATGCTCCTATTTTCTCCTTGAGTGTTGATAGGCTTAGATAACTTACATGTTCCAAAAGTTCTTCCATTCTTGTTCCGCTTTGATTTTACTCGGCCCTTTCTCCTACGTATTTTTCTCTGTTGTCACTTCTCCTCTCATACTTTCCAATTACATAACAGGTCCGTATGTATCAGAAATACAGTGAGCGGAATTCTTGGAAATTTTCCCCTGTTTCAAGTTCTGAGGTATATGTTCTGGGACATACCATAAGAAGTAAACATCTAGTGCTTTCCGTATGTCTAAAAGAACTGTTCACTTTTTAGGCTGAAAAAGGTGGATTCAAAACTTATGTGTTGGAAATCAAAGGAAATCGTGTCTACCGTAAATTAAAATATGAGTCTGGTGTTCACCGGGTTCAACGAGTTCCTCAAACAGAAACACAGGGACGTGTGCCTACTTCAACTGCTACAGTAGCTATCATGCCAGAGGTAAACTATTTCATGAATTTACTGTTGAATTTTGTTATAAAATTGCCTTGATTCTTGTCAAAGAAGAATTGCATGCCTCAATCAGACTAACGTCTAGAAGAAGAAGAACATTACGTGAATTTGTTAATTTCATCCTGGACAGTTGACTAACGTTAATTCTTGGAGTTTCCTTCTTTTTCCCCTTCCCTTTGTACATCCCTGATCTATTTCTTGTGATCTGTCATTATCAGTATAGTATTCAAGATTTTCAGCTTTTGACAATTATAATGTGGAAAAGTCGTATCTCTGCTTTAAAAATCCCTAGATGATGGATTAATGTGGGATTACTAATTAAAATGTTCTGACATATCGCACCAATGCCTCAACATGAAGATCTGATCACATAACTGTAGATTTATTCTTTATATTTATTTAGTTGATATTGGTAGTGTCTATACTGTTTCTCTGTAGGAGTACTAATGATTTGGATATGATAACTTCTCCAAATTTGGCTTTGTTGTCCTCTGCATTCACATCTTGATCAGCTATACTTTATCTTGATTGGTTGAGTTTATGCTATAACTGCATTTAGGCAGATGAAGTTGAGGTAGTGATTGATCCAAAAGACATTGAACTAACACCTGCAAGATCTGGGGGTGCAGGAGGTATAAATCTACATAATTGATTCAAATATTACTTTCAATTAGCTCTCTGTATCTATTCTCATAAAACCAAGAAAAATGATTGAATAACCTTTGTATTTATTTTTGGTTCTCGATGATTATACAGGGCAGAATGTGAACATGGTGGAGACAGCAATTGATCTTTTCCACAAGCCAACAGGAATCCGCATTTTTTGCACTGAAGAAAGGACTCAACTCGAGAACAAGAATCGGGCTTTTCAGTTGCTGCGAGCCAAACTGTTAGTATCCATTACATCATAAATATTTGCCATTTTATCATATACCTCATGTGAACTTCATTCATACAATTCCTGTATTTTTTTTTCTGGAAACAAATAATTGAAGGAACTTCACGACCATTGTGATGATTTTTCTCAAATAATTTAAGGATCTTTTTTGCCATTTCTATGTACCAAGAGAATTTGGTTGGTCATGGTACAGGTGAAAAAATGCAAAACCAAACAAACTGATATTGGACAGTTGGAGTTCAGTTTTGCACAGCCCTTACGACTGAGGCATTAAAAAGCCCTAATTCTGTTTTTATTTTTCTCATGCCCAACCCCCCATCGCCCATTGTTCATACCCAGCCCAGTCCAACCCCCCTCCCCCTCCCCCACTTTTTGTTCATGCTTGTCCTTGCGTATTCAGGCTTAGCCTATCACTACCCATTTTCCAGCCACCTCCAATCCAGCCAGTCAGTCGGCAAGCTCTTTTGTGCTGAGAAAAAAAATAGAGTTAGTCTTTTATGTCCTGCCCCAACCAACCGTCAACTTTAGGTCACCTCTACCCTAACCTAAGCTGATTTTCACCCCTGGTCATTGGTTCCTTAACTCTCCTATTTAATCTCTCTGCATGAATCTTTCAAAAAGAAAAATTACATTTTTCTAATATTTACTAACTTGACTCTTATTGTGGACGGTGATATTTTTGCTGAATTCATTGTCATGTAAATGCATGAAGTTAATCCCCCTCCCCCCTCTTGTTCTTTTCAATTATGAGATCAAAGTGAGTGAGCAGCAGGAGATGATCAGGAATCAACGAAAATCACAGGTATTATTATTTTTTTCTTTCTAAATTCTTTTTAGCATTTATTCATATTTAGCAAAATGTCCTTTTCGTAAACTCTTGCATGTTCTGCATTTAGGCTGTATATGAGCTGCTTTCATCAGACAATAGTTTCTGAAGTTATTGCAGTTAGTTTGTCATGGTATTATTTCGCCTTGGAAACGAGAGCTGTTATTCTCCATTTTTTCAAGTCCTTCCCAGTCTAGAGTAATTTCTAACTAAGCACACAATTTCTTTGGTAACATTACTGCAAACAGACATGTACACAACGCAAGATACAATTTGGTTGGAATGTCAAAAACTGGAATTCTTTTAAACTCCACAATCCCATACCTAGTGATCTTCGGTGCACTAATATGAATATTCTAGAGCAGGTTAATTATATCTTAGGAATCTTTTGTTAACCTTTTTTTCCCTTTCTGTTGTAATTAAGAATCTACTTCATCATATCGCTAAAAGTCATTGATTTTTTTGTTCAATTTACAATATGCTACGTGTGAACTGTCAATCTGAAAGCTAGTAGTTGTCACATCAATGCAATGTGATTGTACAAGCAGATGGGGTTATCCTCCTAAAAGCAAACAAGGATAAGTTGTTCTTCAATTTCAGTGTTTTCATTACCTTGTTATCCTCTTTTCTTTCTCCTTACAGATACGTCAAAATCATCTGCTAGAGCCTGTTTGAATGATGAAACTTCATGTGTACCATTGCTAGGGGTCGTTGCAACTTGAATCTCTTAAACACAAATTCTTTTCATTAGTGTATTTCTGTTCTGAAAGGTTCTGTTGCAGGTTGGTACAGGTGCTCGTGCTGAGAAAATTCGGACCTACAATTACAAGGTAGATATTAGTTTTTTTTCCGACTTGAAAAAGATGAAAAGAAATATAGCTCGTGTCATAAAGCAAGCTATCCGTGTGGTACCACAAAGATGTTGAAGACCAAGAAAGATTTGAAAAAATATAAAGAAGTGCATGTAGACATAAAACCTTGATTACGAGAAGATTGTACTGGGAGTGCTTTTTAAACGTATTTTCAAATAATTAAAATCTATAAGCAAATTTCAATGTTAGTAATTTTTTAAGTAAATATTAATCATTCAGAAAAATATTAGAACCCAAACAATGAAGTATTAACTTGTATTGAACATTATATAAAAGGATTTGAAACACCGTTTATGTCACGTACTCACAAATTGACATAAGAACCATGCATACCTCTGCCTCTAATGAAACTGAACTTGTGAAACTATTATCTCCCATCTAGCTCAAGCCGGAAATGAAGCAGCATATCATAACTCATAGAAATGAATCATAAATCATAATAGACTTGTGATTTCTATAGAAGTCATTAACTTTTGGATACTTATTTTAGGATAATAGGGTTACCGATCACCGGTTGAAGATGAACTTCGAGCTCACATCCTTTCTCGAGGGCGATATAGAGAATGCAGTTCAGGTAATGTTCTCTCTCTCATCTTTTTCACATTTCAACTATCATTTGAATAGACAAGCAAAAAAACTTCTTATCCTCCCATTTTTTCAATCAAGGCATGTGCTGTCATGGAACAAAAAGAACTCCTGGAAGAACTGGCTCAGTCTGCTGTGGCTCCAGCCACTTGAATTTCTACCATTTCTTGCCAATAGTTGGGCCCTCATAAGTCATAACACAAATTTCTTTGAACCACATCAAATGCTTATATGAGATAAGGTAAAAATCATTCACCATTATTCATGCTTTTTTCTGCACATGGCCCTGCTATGTATGATATTACACGTACTGAGATTATACCAATTAGAGATGGATTTTGGCGTCAGTGATCTAAAAGTAGAGGGAGAAAAGAAAATTAACCCCACCTCCATTAGAATTAGACTATGATGTTGATGTGACTTTATGAAATTTATTACATATTTGTATCCATGAAT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ATGTCAGCCTTAGCAAAAGAGAGTGGGAATGACGAGGATATGGCAGAGATGATTGCTTTAGAAATGAGTTCTTTGTCCAGTGAACTCAAAGATATTGAGGAGAAGCTTAAGGTCCGTATGTATCAGAAATACAGTGAGCGGAATTCTTGGAAATTTTCCCCTGTTTCAAGTTCTGAGGCTGAAAAAGGTGGATTCAAAACTTATGTGTTGGAAATCAAAGGAAATCGTGTCTACCGTAAATTAAAATATGAGTCTGGTGTTCACCGGGTTCAACGAGTTCCTCAAACAGAAACACAGGGACGTGTGCCTACTTCAACTGCTACAGTAGCTATCATGCCAGAGGCAGATGAAGTTGAGGTAGTGATTGATCCAAAAGACATTGAACTAACACCTGCAAGATCTGGGGGTGCAGGAGGGCAGAATGTGAACATGGTGGAGACAGCAATTGATCTTTTCCACAAGCCAACAGGAATCCGCATTTTTTGCACTGAAGAAAGGACTCAACTCGAGAACAAGAATCGGGCTTTTCAGTTGCTGCGAGCCAAACTGTTAATCAAAGTGAGTGAGCAGCAGGAGATGATCAGGAATCAACGAAAATCACAGGTTGGTACAGGTGCTCGTGCTGAGAAAATTCGGACCTACAATTACAAGGATAATAGGGTTACCGACCACCGGTTGAAGATGAACTTCGAGCTCACATCCTTTCTCGAGGGCGATATAGAGAATGCAGTTCAGGTAATGTTCTCTCTCTCATCTTTTTCACATTTCAACTATCATTTGAATGGACAAGCAAAAAAAAAATTCTTTTCCTCCCATTTTTTCAATCAAGGCATGTGCTGCCATGGAACAAAAAGAACTCCTGGAAGAACTGGCTCAGTCTGCTGTGGCTCCAGCCACTTGAATTTCTACCATTTCTTGCCAATAGTTGGGCCCTCATAA MSALAKESGNDEDMAEMIALEMSSLSSELKDIEEKLKVRMYQKYSERNSWKFSPVSSSEAEKGGFKTYVLEIKGNRVYRKLKYESGVHRVQRVPQTETQGRVPTSTATVAIMPEADEVEVVIDPKDIELTPARSGGAGGQNVNMVETAIDLFHKPTGIRIFCTEERTQLENKNRAFQLLRAKLLIKVSEQQEMIRNQRKSQVGTGARAEKIRTYNYKDNRVTDHRLKMNFELTSFLEGDIENAVQVMFSLSSFSHFNYHLNGQAKKKFFSSHFFNQGMCCHGTKRTPGRTGSVCCGSSHLNFYHFLPIVGPS Homology
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX79 (Peptide chain release factor APG3, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=APG3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 3.4e-100 Identity = 201/282 (71.28%), Postives = 226/282 (80.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8DMG9 (Peptide chain release factor 1 OS=Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1) OX=197221 GN=prfA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 1.0e-80 Identity = 166/281 (59.07%), Postives = 198/281 (70.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7KI17 (Peptide chain release factor 1 OS=Gloeothece citriformis (strain PCC 7424) OX=65393 GN=prfA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 6.7e-80 Identity = 164/277 (59.21%), Postives = 195/277 (70.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B0JYC5 (Peptide chain release factor 1 OS=Microcystis aeruginosa (strain NIES-843) OX=449447 GN=prfA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 295.8 bits (756), Expect = 5.7e-79 Identity = 158/275 (57.45%), Postives = 195/275 (70.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7K205 (Peptide chain release factor 1 OS=Rippkaea orientalis (strain PCC 8801) OX=41431 GN=prfA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 1.3e-78 Identity = 162/281 (57.65%), Postives = 196/281 (69.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KZW8 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497823 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 413.3 bits (1061), Expect = 9.0e-112 Identity = 227/283 (80.21%), Postives = 236/283 (83.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5U4 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460751 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 413.3 bits (1061), Expect = 9.0e-112 Identity = 227/283 (80.21%), Postives = 236/283 (83.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DC40 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019348 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 410.6 bits (1054), Expect = 5.8e-111 Identity = 226/278 (81.29%), Postives = 234/278 (84.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VLD6 (Peptide chain release factor APG3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold411G00120 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 1.1e-109 Identity = 224/278 (80.58%), Postives = 232/278 (83.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRZ7 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492855 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 1.1e-109 Identity = 224/278 (80.58%), Postives = 232/278 (83.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. NCBI nr
Match: XP_023514061.1 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 414.5 bits (1064), Expect = 8.3e-112 Identity = 228/283 (80.57%), Postives = 236/283 (83.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. NCBI nr
Match: XP_022959786.1 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_023004558.1 peptide chain release factor APG3, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 413.3 bits (1061), Expect = 1.9e-111 Identity = 227/283 (80.21%), Postives = 236/283 (83.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. NCBI nr
Match: KAG6593177.1 (Peptide chain release factor APG3, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 413.3 bits (1061), Expect = 1.9e-111 Identity = 227/283 (80.21%), Postives = 236/283 (83.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. NCBI nr
Match: XP_022151413.1 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 410.6 bits (1054), Expect = 1.2e-110 Identity = 226/278 (81.29%), Postives = 234/278 (84.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. NCBI nr
Match: XP_038876731.1 (peptide chain release factor APG3, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 410.2 bits (1053), Expect = 1.6e-110 Identity = 227/278 (81.65%), Postives = 232/278 (83.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. TAIR 10
Match: AT3G62910.1 (Peptide chain release factor 1 ) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 2.4e-101 Identity = 201/282 (71.28%), Postives = 226/282 (80.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. TAIR 10
Match: AT2G47020.1 (Peptide chain release factor 1 ) HSP 1 Score: 159.5 bits (402), Expect = 4.5e-39 Identity = 83/189 (43.92%), Postives = 124/189 (65.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. TAIR 10
Match: AT2G47020.2 (Peptide chain release factor 1 ) HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 1.9e-29 Identity = 60/130 (46.15%), Postives = 89/130 (68.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. TAIR 10
Match: AT5G36170.1 (high chlorophyll fluorescent 109 ) HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 2.3e-27 Identity = 76/212 (35.85%), Postives = 117/212 (55.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g006320 vs. TAIR 10
Match: AT5G36170.2 (high chlorophyll fluorescent 109 ) HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 2.3e-27 Identity = 76/212 (35.85%), Postives = 117/212 (55.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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