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Lcy04g002300 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGTTCTTCAAGCAAGGAAATCCAGATAATGTTGCCGACTTGGAGAAGCAAACCTTCTACCGATTTATTCAAAAAACATACATTTTTCATCACATTTCTCTTGCAGCCTTCTTCTATATAATTGGAGGAGTACCACTTATCTTGTGGGGAATGGTAACATGAAATCACTTCCCATTTATTCCCAGCAATGTTTACTATATAATTTTTATATATGTAAACTTTATCTTAAAAAACGTAACGACGATTTTTTTATGCACAATAGAAAGTATAACTTTTATGATGTGGAAATTAGATTTTCACGAAACTAGTAAATTAAGGCTCCGTTCGATAACTATTTCGTTCTTGGTTTTTGGTTTTTGAAATTTATGCTTGTTTTCTCGCAAATTCCCTACAATGGTTTTCATCTTTGTTAAGGATCTATTTGAATTTCTAGCCAAATTCTAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAACTACTTTTTTTTTGTTTTCAAAATTTGATTTGGTTTTTGAAAACAAAGAAGAAGGTAGATACTAAGACAAAGAAACTTATAGAGGGAAATAAGTGTGTATAAATTTTTCAAAAACCAAAAACCAAGGCCCCGTTTGATAACCAATTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTATGCTTGTTTTCATCTAATTTCCCTACCATGGTTTTCATTCTTGTTAAAGAGACACTTGAGTTCCTAGCCAAATTCCAAAAAAAAAACAAGTTTTTGAAAACTAGTTTTTCTAGTTTTCAAAATTTGACTTAGTTTTTGAAAACATAGAAATGAGGTAGATAGCAAAATAAAGAAACTTGTAGGTGCATGTAGTGTTTTTAAGCTTAATTTTTAAAAATCAAAAACCAAAAACCAAATGGTTATCAAACGGGGTCTAAATGATTATCAAACGGGGCCTAAGTGTTTTCGTAAACATAACTTATTTTTCTTTCGTATTTTTTTTTTCTTTTCCATAGATTTAAAGCTTATTTGTTATAATTAAGCATGATATAAGGAAATTTGAAAGAATATATTTAATTTCTAACATACATGCAAATATGATATCAAGGAAATATTAATTTTTAAAAAGTAATTTCAAATATATAATATGTTAGTTAAAAACAATTAATTTCAATGTTTGATTATGATAATCAATAAATTTTCAATGTATGTTATAAAATTATTGAGTGATTTACTGAATTATTTTTAATCAACAATAATCGCATAGCAATTATTTTTCATTGAGTCTATTATAATTTACTTACTAAAGTTCCTTTTTAAAAAAACTATTTACAGTGTGTTCGGATTGTGGTGACCTTACAAGCAACTTTGATGGTGAATTCAATATGTCATATATGGGGAAATCGACGATGGAATACTGGCGATTCGTCTAAAAATAATGGGTAATATGCTTTTTTCCTTTCTCTAAATTAGGGTTTGAATAGAGTTTAAATGTTGATTTTGGGAATTTTTAATATTATCAAATTTTAAACTTATATTTAAAATCTAATAATTTCAAAACATATTGTAAGAATATCCATATCACGAGCTCATCCCTATAATAAAAGATCAATTTATTTTTCAAAAAAAAAAAAATCAATTTATACCCTGTTAAATAATAAACTAATTTATTTTACTATTAAATTGGAAAAAAATTTATACCTTTGAACTTTGCAAATTGAATCGATTAAAATCCTAAACTATTAATTGTATTAATTAAAACTTTCGTTAGGATTTAGACCCTTCATCACAATTTAATTTCAAAATCTCTAAATTTTCTCTAGTTTATCGTGTATTGGTTTGAGATTTTAATTGATTTTTTTATTTTTTTGAAGAGGTTTTAATTGATTGAACCAAAGGTTAGGAGTATAAATGAATTGTTTTCTATTTGAATTATTAAAAGAAAAAGGGAAAAATACACTTTTTGTCCTTGAGATTTGAGTTAGGTTTCATCTTCAGCTCTGAGTTTTCAAACTCGATAATTTAGTCCCTGAGGTTTGGATTTCGTTTCATTTTGGTCCATACATCCAATTTTCCGTTAATTACTAACGAATTGCTGACGTGTCACTATTTTTTAATTTTTAAAATAAAAATATATTAAAATTATATATATATATTTTCTTCTTCTTCTTCACCACCACCGCCGGCCGTCGCCACCGTCGCGAACGTCATTCCCCCCTTTTTTCTCTCTTTTTTCTCCCTTTTTCTTCTTCTTCTCGACAGTTCGATGCCGGTAGGTGGTGGTGGTGAAGAAAAAGAAAGGTGAAGACGAATAAGAGAGAGAATAAAAAAATATTTTTTTTATTAATTTAATATTATTTTATTTATTTATTTTTTGTTAAAAATAGGTGCAACGTCAACATTCCATTAATGTTTAACGGAAAAATGGACGGAGGGACTAAAATGAAATGAAATCCAAACCTTAGGGACTAAATTGTCGAGTTTGAAAACTCAGAGACCAAAATGAAACCTAACCAAAACCTCAAGGACCAAAAGTGCATTTTTCCCAAAGAAAAAAAAAGTTAATACATTGGACCCCGTTTGATAACCATTTGATTTTTTGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAAGCTTATAAATACTACGTCCACCTCCAAGTTTCTTAGTTTTTTTTTAATACCTTCTTCTTATGTTTTCAAAAACCAAACCAATTTTCTAAAACTAAAAAAAGTAGTTTTCAAAAACTTGTTTCTGTTTTTGGAATTTGGCTAGTAGTTCAAATGTGTTCTTGACAAACATGAAAACCATGGTAAGTAAATTGGGAGAAAACAAACATAATTTTTAAAAACCAAAAACAAAAAACCAAATAGTTATCAAACAGAACCTTAATTATTGATAAGACTTATATCCAATTGACACTCGACCTAGAAAAAAAGTTGGTACGTCATTTTCTTTTAACCATTTAATAAAAACACATATCCAATTGACACTGAACGTACCAAATCTAGAGTCAAACACATATCCAATTGACACTGAACGTACCAACATCTAGATCTTTCCAATGAATGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGAATGTGGTTAAGGATATTTTTTTTTTCTTTTTCCTTTTCTTCTCTTTTTTTTCTCCTTAATATTGCTTTTTTAAGAAATCAAACAAGTAATTACATTTTTTTTAAAATGTTTTAAACAAATTGAATTTTATATTACAATTTATTTTCTTTTCTTGAAGTCATTGAAATTTATTTAAGTACTAATTATTTAAACACTTTCTATTTATAAAGTAAAATAAAATTAATAGTACTCAGATTAAATTTAACTATTATAGTTTTTTGAAGTAGAATTAATTTGAATTGAAACATCCATTTATCTATCCTGGATCAATCTATACGTGAGTTAAAAATAAAATATGTAAATAGTTAATACTTAATTAAATTTCAATTGCTTCAAGTAAAGAGAATAAATTTTAATATAATATTAAATTTCTTTGAAACATGAAAAAAATGTAATTACTTATTTGAAAAAGAGAATAAATTATAATATAATATTATTCCATTGGTTTAAAACATTAAAAAAGTATAATATTAATAATAATAAAAAAATGTCTATCAAAAGATTTTCGTTTATAGCAATATATAACAAGAAGAATAATAATTTAAGAGACGAAAATAAAATAAAATATAATTAGAATTTTTGATGTTGGTATTTTGTCTTTTGATTTGAAGGTGGGTGGGTTTAATTACGTTTGGAGAAGGATGGCATAATAACCACCACGCATTCGAGTATTCAGCGAAGCATGGTCTTGAATGGTGGGAGATTGACTTTGGTTGGTATTTCATAAGGTTTCTTCAAGCAATAAGACTGGCCACTGATGTCAGATTACCCTCTTCAAAACTTCACCCAAAAGGACCAAAAACCAACACTCCATCATCTTCCAAACCCTATAATTAATTAAGATAGGATCATTCAACAATAACGGTTATATATAGTGTTGCTTTTCTTATTTTCAAATTTCTATCCGTATTTGAGAAATGTTTAATAGTGAATTAGTTGTGTAATTTGTGTGAGGTGAATATTATCCAAATATTATATTAATTTATCATATTACTACGGTATGATTGTATACGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAGTTTTTCTTATTTTTCGATGTTTTTTGTAGTGATCTTTTATATTAATGCTAGTAAGTAGACTCGTGCGATGAACATGGTTAAAAAATTTTGTAAACTAAACTTTAATTCAAAATTTAAATTTAATTTGGAACATATATATCTTGTTTTATGTTAATTTACATTGATGCCAACATCGTAATGGTAGAGGTTTTGCTTTGATACCAATTGTTCACACGTAACTTCGAAGATGAGACACGTGGAATAAATATGTAGTTGTATTGATGTTTGTATGTGTGTGGGTGTACAATCTCTAACTTTGATCCTCTGATTCTCGCTCTTGTGAGAATGTGTTTCACTCGAAGGCTGGAACGCTTGATCTCGAGTTTGAAACTTCAATCGATTCCTTGGAGTCTTGGAGTCTTGAAGTCTTCAAGTCTTGGAGTCTTAAAGTCTTGAAGTCTTGGGGTCTTGAAGCCTTGGAGTCTTGAAGATCAACTTTGGTCTTCAAGGAGTTTTTAAGTCTTGAAGAATGCTTGTGTAACGCCCTAGGTTTTTCAACCACTAGCCTAGCGACGCTACTTCAACTCTAAACCACTTACCACGACTCTATGCCATTTAAACCAAGTGCACTGAAAATTTCGACAGCATAACGGCGTAAAACTAGCTAATCCAAAAATTTTAAACACCTGATAAACAAATCAAACACTTCTAAATGCTCCCAAAACCAAACTCCACCAAACTACAATTCAAATTTCACAACCTAACTTCACTATATGAGTCAGGTCTCGTAGCAACAAGTGTTAAACTAAAACATGCAACAAAACATATTTCTAACTCTTTATTAAGACCAACAACTAAAATA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ATGTTGTTCTTCAAGCAAGGAAATCCAGATAATGTTGCCGACTTGGAGAAGCAAACCTTCTACCGATTTATTCAAAAAACATACATTTTTCATCACATTTCTCTTGCAGCCTTCTTCTATATAATTGGAGGAGTACCACTTATCTTGTGGGGAATGTGTGTTCGGATTGTGGTGACCTTACAAGCAACTTTGATGGTGAATTCAATATGTCATATATGGGGAAATCGACGATGGAATACTGGCGATTCGTCTAAAAATAATGGGTGGGTGGGTTTAATTACGTTTGGAGAAGGATGGCATAATAACCACCACGCATTCGAGTATTCAGCGAAGCATGGTCTTGAATGGTGGGAGATTGACTTTGGTTGGTATTTCATAAGGTTTCTTCAAGCAATAAGACTGGCCACTGATGAAAACCATAACAGGAAGTTGAGATATAAAGTTGCGAGGTACCCTGGATTTGAGGATTTTGTCAACCACCAACCCACCGGAAGGTTCAGTAATGGTCGACTCGCCACTGACTATATTGCTTCATATGTGGGCATCAAGGAATTTATTCCTCCTCATTTAGACCCAAATCTTGAGATCAAGGACCTATTAACAGGAGTTAGTTTTGTGTCGTCTGGTTCTGGATTTGACCCACTTACCTCTGCCATACCTAATGTTATTCCAATAAGAAAGTAA MLFFKQGNPDNVADLEKQTFYRFIQKTYIFHHISLAAFFYIIGGVPLILWGMCVRIVVTLQATLMVNSICHIWGNRRWNTGDSSKNNGWVGLITFGEGWHNNHHAFEYSAKHGLEWWEIDFGWYFIRFLQAIRLATDENHNRKLRYKVARYPGFEDFVNHQPTGRFSNGRLATDYIASYVGIKEFIPPHLDPNLEIKDLLTGVSFVSSGSGFDPLTSAIPNVIPIRK Homology
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q949X0 (Palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 2.9e-48 Identity = 83/131 (63.36%), Postives = 100/131 (76.34%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FV68 (Icosanoyl-CoA 5-desaturase (Fragment) OS=Limnanthes douglasii OX=28973 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 184.1 bits (466), Expect = 1.7e-45 Identity = 86/148 (58.11%), Postives = 104/148 (70.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVZ3 (Probable lipid desaturase ADS3.2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS3.2 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 1.1e-44 Identity = 76/131 (58.02%), Postives = 99/131 (75.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DOW2 (Acyl-CoA C20 Delta5-desaturase OS=Anemone leveillei OX=212809 GN=AL10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 179.1 bits (453), Expect = 5.6e-44 Identity = 77/148 (52.03%), Postives = 105/148 (70.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DOW3 (Acyl-CoA 5-desaturase AL21 OS=Anemone leveillei OX=212809 GN=AL21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 2.0e-41 Identity = 75/146 (51.37%), Postives = 104/146 (71.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQF3 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022855 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 229.9 bits (585), Expect = 1.0e-56 Identity = 103/151 (68.21%), Postives = 121/151 (80.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DJP0 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021101 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 3.1e-53 Identity = 96/136 (70.59%), Postives = 110/136 (80.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQF8 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022861 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 216.9 bits (551), Expect = 9.0e-53 Identity = 95/137 (69.34%), Postives = 109/137 (79.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQG5 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492609 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 216.1 bits (549), Expect = 1.5e-52 Identity = 94/137 (68.61%), Postives = 111/137 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E0E4 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024778 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 215.7 bits (548), Expect = 2.0e-52 Identity = 94/145 (64.83%), Postives = 114/145 (78.62%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. NCBI nr
Match: XP_038893002.1 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 1.2e-59 Identity = 107/136 (78.68%), Postives = 118/136 (86.76%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. NCBI nr
Match: XP_022155827.1 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 229.9 bits (585), Expect = 2.1e-56 Identity = 103/151 (68.21%), Postives = 121/151 (80.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. NCBI nr
Match: XP_022153644.1 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 6.4e-53 Identity = 96/136 (70.59%), Postives = 110/136 (80.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. NCBI nr
Match: XP_022155832.1 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 216.9 bits (551), Expect = 1.9e-52 Identity = 95/137 (69.34%), Postives = 109/137 (79.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. NCBI nr
Match: XP_008451259.1 (PREDICTED: palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 216.1 bits (549), Expect = 3.2e-52 Identity = 94/137 (68.61%), Postives = 111/137 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. TAIR 10
Match: AT3G15850.1 (fatty acid desaturase 5 ) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 2.0e-49 Identity = 83/131 (63.36%), Postives = 100/131 (76.34%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. TAIR 10
Match: AT3G15870.1 (Fatty acid desaturase family protein ) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 8.0e-46 Identity = 76/131 (58.02%), Postives = 99/131 (75.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. TAIR 10
Match: AT2G31360.1 (16:0delta9 desaturase 2 ) HSP 1 Score: 165.2 bits (417), Expect = 6.0e-41 Identity = 70/136 (51.47%), Postives = 93/136 (68.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. TAIR 10
Match: AT1G06080.1 (delta 9 desaturase 1 ) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 4.3e-39 Identity = 63/133 (47.37%), Postives = 92/133 (69.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy04g002300 vs. TAIR 10
Match: AT1G06120.1 (Fatty acid desaturase family protein ) HSP 1 Score: 152.9 bits (385), Expect = 3.1e-37 Identity = 68/133 (51.13%), Postives = 89/133 (66.92%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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