Lcy04g000220 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy04g000220
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionTranslation factor GUF1 homolog, chloroplastic
LocationChr04: 451567 .. 533668 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy04g000220
SyntenyLcy04g000220
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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mRNA sequence

TGCCAACAATTAACAAACAAACACACAGTGAAGGCTCCGTCACAACTAAGAACCGCAATGGCGGCAGAGCTTTCTTTCGCGCCTCTCTTATCCACATGCACTCAACATCGTCGTCTTTTCCAATCAAGAGGAAGCAGCCTCTTCCACTTCCCCACACTTCCACTTCCACTTTCTCCCTCCCTCTCCACTTTCCCTTTCTCTTCTTCAACTGCAACATCGAGAGCCAAGGTCCTTTGTCAGACTGCTGGAACACATCTATTCGATGCTCAATACGCTGCTGAAGCCGGTCAGAATCGACTGTTGAAGGTTCCTATATCGCACATCAGAAACTTCTGCATTATTGCGCACATTGATCATGGTAAATCAACTTTGGCGGATAAATTGCTTCAGATGACCGGTACCGTTCAGACGCGAGAAATGAAGGATCAGTTTCTTGATAACATGGATTTGGAGAGAGAAAGAGGCATCACAATTAAACTACAGGCAGCCCGAATGCGTTACATGTATAAGAATGAAGCATATTGCTTGAATTTGATTGATACACCAGGTCATGTTGACTTCTCTTATGAGGTTTCTCGATCTCTTGCTGCCTGTGAGGGTGCTCTCCTTGTTGTTGATGCTTCCCAGGGTGTGGAGGCACAAACACTGGCAAATGTCTATTTGGCTCTGGAGAACAACCTAGAAATTATTCCCGTTTTAAATAAAATAGATCTTCCGGGTGCTGATCCACTCCGTGTTACAAAGGAGATTGAAGAGATTGTGGGTCTTGATTGTAGCAATGCAATACAATGTTCAGCAAAGGAGGGGATAGGTATAACTGAAATTTTAAATGCAATTGTTGAAAGAGTTCCTCCACCTCGTAATACTGCTGATAGGCCACTCAGAGCATTAATATTTGATAGTTATTATGATTCATATAGGGGTGTGATAGTTTATTTTCGAGTTGTTGATGGGAGAATAAAGAAAGGTGATAGAATATATTTCATGGCTAGTGAAAAGGATTATTTTGCTGATGAAGTTGGAGTCTTATCTCCCAATCAGTTGGAAGTGGAGGAACTTTATGCTGGAGAGGTTGGCTATCTTTCAGCTTCTATAAGATCAGTAGCTGATGCAAGAGTTGGGGACACCATTACTCACTATGGTAGAAAGGCCGAAGACTCACTACCTGGATATGAGGAAGCCACTCCAATGGTATTCTGTGGCCTTTTTCCAGTCGATGCAGACCAATTCCCAGAATTACGTGATGCTCTTGAAAAGCTGCAACTTAATGATGCTGCGTTGAAGTTTGAGCCTGAAACATCAAGTGCAATGGGTTTTGGCTTCAGATGTGGTTTCTTGGGTCTTCTCCACATGGAAATCGTTCAGGAAAGACTTGAAAGGGAATACAATCTGAGCCTGATAACTACAGCTCCAAGTGTTGTATATAGAGTTAACTGTGTAAACGGTGATACTGTAATTTCTCCTCTATCCTAAGACTTATGCTTCATTATCTTATGGTAGTTGGAAGAATGAAAATAGTCTTACTTACTACTTGCTGTAATTGTGAGTCTAGAGCTACATGTGATCTAAATAGTTCTCTGCAGAGGTGTTTAAAGAACTTGATGACCTAAAAATATTGATTATCCGAAACCAAAACCTTGGTTGGGTTGCATTATAAGCCTGTTTGGTTTGGTTTTGGTTTGAGTAAGTTGAACGAAAGTAGGTTGGGTTAAGCTCAATTCTAAAATTAGTTTGGCTGAACCAATCTAAATCTATTATTATTATTTTTTTTTAATGAGGAACAAAACTTTTCATTGAAAAAATT

Coding sequence (CDS)

ATGGCGGCAGAGCTTTCTTTCGCGCCTCTCTTATCCACATGCACTCAACATCGTCGTCTTTTCCAATCAAGAGGAAGCAGCCTCTTCCACTTCCCCACACTTCCACTTCCACTTTCTCCCTCCCTCTCCACTTTCCCTTTCTCTTCTTCAACTGCAACATCGAGAGCCAAGGTCCTTTGTCAGACTGCTGGAACACATCTATTCGATGCTCAATACGCTGCTGAAGCCGGTCAGAATCGACTGTTGAAGGTTCCTATATCGCACATCAGAAACTTCTGCATTATTGCGCACATTGATCATGGTAAATCAACTTTGGCGGATAAATTGCTTCAGATGACCGGTACCGTTCAGACGCGAGAAATGAAGGATCAGTTTCTTGATAACATGGATTTGGAGAGAGAAAGAGGCATCACAATTAAACTACAGGCAGCCCGAATGCGTTACATGTATAAGAATGAAGCATATTGCTTGAATTTGATTGATACACCAGGTCATGTTGACTTCTCTTATGAGGTTTCTCGATCTCTTGCTGCCTGTGAGGGTGCTCTCCTTGTTGTTGATGCTTCCCAGGGTGTGGAGGCACAAACACTGGCAAATGTCTATTTGGCTCTGGAGAACAACCTAGAAATTATTCCCGTTTTAAATAAAATAGATCTTCCGGGTGCTGATCCACTCCGTGTTACAAAGGAGATTGAAGAGATTGTGGGTCTTGATTGTAGCAATGCAATACAATGTTCAGCAAAGGAGGGGATAGGTATAACTGAAATTTTAAATGCAATTGTTGAAAGAGTTCCTCCACCTCGTAATACTGCTGATAGGCCACTCAGAGCATTAATATTTGATAGTTATTATGATTCATATAGGGGTGTGATAGTTTATTTTCGAGTTGTTGATGGGAGAATAAAGAAAGGTGATAGAATATATTTCATGGCTAGTGAAAAGGATTATTTTGCTGATGAAGTTGGAGTCTTATCTCCCAATCAGTTGGAAGTGGAGGAACTTTATGCTGGAGAGGTTGGCTATCTTTCAGCTTCTATAAGATCAGTAGCTGATGCAAGAGTTGGGGACACCATTACTCACTATGGTAGAAAGGCCGAAGACTCACTACCTGGATATGAGGAAGCCACTCCAATGGTATTCTGTGGCCTTTTTCCAGTCGATGCAGACCAATTCCCAGAATTACGTGATGCTCTTGAAAAGCTGCAACTTAATGATGCTGCGTTGAAGTTTGAGCCTGAAACATCAAGTGCAATGGGTTTTGGCTTCAGATGTGGTTTCTTGGGTCTTCTCCACATGGAAATCGTTCAGGAAAGACTTGAAAGGGAATACAATCTGAGCCTGATAACTACAGCTCCAAGTGTTGTATATAGAGTTAACTGTGTAAACGGTGATACTGTAATTTCTCCTCTATCCTAA

Protein sequence

MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVLCQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTVISPLS
Homology
BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5B4D2 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VITISV_013255 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 741.9 bits (1914), Expect = 4.5e-213
Identity = 382/470 (81.28%), Postives = 417/470 (88.72%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAEL-SFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVL 60
           MAA++ S A L+S    H        S+ F+F     P SP LST   S   +   A V 
Sbjct: 1   MAAKINSLAALVSLQASHHH----HXSTPFYFS----PFSPHLSTTLTSRRRSLRSAVVA 60

Query: 61  CQTAGTHL---FDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTV 120
             TAGT      D   AA +GQ+RLLKVPIS+IRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTV
Sbjct: 61  QSTAGTQSKAPSDVDLAAVSGQDRLLKVPISNIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTV 120

Query: 121 QTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSL 180
           Q REMK+QFLDNMDLERERGITIKLQAARMRY+++NE YCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSL
Sbjct: 121 QKREMKEQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYVFENEPYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSL 180

Query: 181 AACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVG 240
           AACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGA+P+RV++EIEE+VG
Sbjct: 181 AACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGAEPVRVSQEIEEVVG 240

Query: 241 LDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRV 300
           LDCS+AI CSAKEGIGITEILNAIV+R+PPP +TA+RPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV
Sbjct: 241 LDCSDAIHCSAKEGIGITEILNAIVKRIPPPCDTAERPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRV 300

Query: 301 VDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGD 360
           +DG IKKGDRIYFMAS+KDYFADE+GVLSPNQL+ +ELYAGEVGYL+ASIRSVADARVGD
Sbjct: 301 IDGTIKKGDRIYFMASKKDYFADEIGVLSPNQLQADELYAGEVGYLAASIRSVADARVGD 360

Query: 361 TITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSS 420
           TITHYGRKAE+SLPGYEEATPMVFCGLFPVDAD+FP+LRDALEKLQLNDAALKFEPETSS
Sbjct: 361 TITHYGRKAENSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADKFPDLRDALEKLQLNDAALKFEPETSS 420

Query: 421 AMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           AMGFGFRCGFLGLLHMEI+QERLEREYNL+LITTAPSVVYRVNC+NGDTV
Sbjct: 421 AMGFGFRCGFLGLLHMEIIQERLEREYNLTLITTAPSVVYRVNCINGDTV 462

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9RHQ5 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Ricinus communis OX=3988 GN=RCOM_1767360 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 730.7 bits (1885), Expect = 1.0e-209
Identity = 368/445 (82.70%), Postives = 404/445 (90.79%), Query Frame = 0

Query: 29  FHFPTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVLCQTAG-------THLFDAQYAAEAGQNRL 88
           F+  T  L LS +   +  S +   SR ++LCQT G       + + D Q+AA+ GQ+RL
Sbjct: 22  FYHTTNSLSLSKTHHLYA-SRNAVVSRLRLLCQTTGSTQSTPTSGVSDLQFAAQVGQHRL 81

Query: 89  LKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKL 148
            KVPIS+IRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQ+TGTVQ REMK+QFLDNMDLERERGITIKL
Sbjct: 82  SKVPISNIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQVTGTVQQREMKEQFLDNMDLERERGITIKL 141

Query: 149 QAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVY 208
           QAARMRY+Y+N+ YCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVY
Sbjct: 142 QAARMRYVYENKPYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVY 201

Query: 209 LALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIV 268
           LALENNLEIIPVLNKIDLPG++P RV +EIEE++GLDCSNAI+CSAKEGIGI +ILNAIV
Sbjct: 202 LALENNLEIIPVLNKIDLPGSEPDRVIQEIEEVIGLDCSNAIRCSAKEGIGIIDILNAIV 261

Query: 269 ERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEV 328
           ER+P PRNTA+ PLR LIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG IKKGDRIYFMAS+KDYFADE+
Sbjct: 262 ERIPSPRNTAEMPLRTLIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGSIKKGDRIYFMASKKDYFADEI 321

Query: 329 GVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFC 388
           GVLSPNQ++VEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHY R+A+ SLPGY+EATPMVFC
Sbjct: 322 GVLSPNQMQVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYNRRAQSSLPGYKEATPMVFC 381

Query: 389 GLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLER 448
           GLFPVDADQFPE+RDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLER
Sbjct: 382 GLFPVDADQFPEVRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLER 441

Query: 449 EYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           EYNLSLITTAPSVVYRVNCV+GDTV
Sbjct: 442 EYNLSLITTAPSVVYRVNCVDGDTV 465

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9GHA6 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=POPTRDRAFT_815670 PE=3 SV=2)

HSP 1 Score: 729.2 bits (1881), Expect = 3.0e-209
Identity = 365/413 (88.38%), Postives = 385/413 (93.22%), Query Frame = 0

Query: 54  SRAKVLCQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMT 113
           +R  + CQT       A +AA AGQ+RL KVPI +IRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMT
Sbjct: 48  TRLHLRCQTTTGTPSAADFAAAAGQDRLRKVPIKNIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMT 107

Query: 114 GTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVS 173
           GTVQ REMK+QFLDNMDLERERGITIKLQAARMRY+Y+NE YCLNLIDTPGHVDFSYEVS
Sbjct: 108 GTVQKREMKEQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYVYENEGYCLNLIDTPGHVDFSYEVS 167

Query: 174 RSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEE 233
           RSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGA+P RV KEIEE
Sbjct: 168 RSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGAEPDRVCKEIEE 227

Query: 234 IVGLDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVY 293
           ++GLDCSNAI CSAKEGIGITEILNAIVERVPPPR+TA  PLRALIFDSYYD YRGVIVY
Sbjct: 228 VIGLDCSNAIHCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRDTAAMPLRALIFDSYYDPYRGVIVY 287

Query: 294 FRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADAR 353
           FRV+DG IKKGDRIYFMASEKDY+ADE+GVLSPNQ++VEELYAGEVGYLSASIRSVADAR
Sbjct: 288 FRVIDGNIKKGDRIYFMASEKDYYADEIGVLSPNQMQVEELYAGEVGYLSASIRSVADAR 347

Query: 354 VGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPE 413
           VGDTITHY RKAE SLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQF ELRDALEKLQLNDAALKFEPE
Sbjct: 348 VGDTITHYSRKAEQSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFSELRDALEKLQLNDAALKFEPE 407

Query: 414 TSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           TS+AMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRV+CV+ D V
Sbjct: 408 TSNAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVHCVDDDIV 460

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FNM5 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g08650 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 704.1 bits (1816), Expect = 1.0e-201
Identity = 358/443 (80.81%), Postives = 400/443 (90.29%), Query Frame = 0

Query: 32  PTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVLCQ-TAGTH------LFDAQYAAEAGQNRLLKV 91
           P+L    S S+S F   S+    + ++LCQ TAGT       +  ++ AA +GQ+RLLKV
Sbjct: 25  PSLRRLSSISVSGFRRHSN---RKLQILCQATAGTEPQSGLSVSGSKLAARSGQDRLLKV 84

Query: 92  PISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAA 151
           PIS+IRNF IIAHIDHGKSTLADKLLQ+TGTVQ R+MK+QFLDNMDLERERGITIKLQAA
Sbjct: 85  PISNIRNFSIIAHIDHGKSTLADKLLQVTGTVQNRDMKEQFLDNMDLERERGITIKLQAA 144

Query: 152 RMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL 211
           RMRY+Y++  +CLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL
Sbjct: 145 RMRYVYEDTPFCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL 204

Query: 212 ENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERV 271
           ENNLEIIPVLNKIDLPGA+P +V +EIEE++GLDCS AI CSAKEGIGITEIL+AIV+R+
Sbjct: 205 ENNLEIIPVLNKIDLPGAEPEKVLREIEEVIGLDCSKAIFCSAKEGIGITEILDAIVQRI 264

Query: 272 PPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVL 331
           P P +TA +PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG++KKGDRI+FMAS KDYFADEVGVL
Sbjct: 265 PAPLDTAGKPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVIDGKVKKGDRIFFMASGKDYFADEVGVL 324

Query: 332 SPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLF 391
           SPNQ++V+ELYAGEVGY++AS+RSVADARVGDTITHY RKAE SLPGYEEATPMVFCGLF
Sbjct: 325 SPNQIQVDELYAGEVGYIAASVRSVADARVGDTITHYSRKAESSLPGYEEATPMVFCGLF 384

Query: 392 PVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYN 451
           PVDADQFP+LRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYN
Sbjct: 385 PVDADQFPDLRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYN 444

Query: 452 LSLITTAPSVVYRVNCVNGDTVI 468
           L+LITTAPSVVYRVN VNGDT +
Sbjct: 445 LNLITTAPSVVYRVNSVNGDTTL 464

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9F2U5 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os02g0157700 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 666.4 bits (1718), Expect = 2.4e-190
Identity = 342/443 (77.20%), Postives = 380/443 (85.78%), Query Frame = 0

Query: 32  PTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVLCQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRN 91
           P  PLP +P        + +A  R +V+C  A           +AGQ+RL KVP+S+IRN
Sbjct: 26  PAAPLPSAPPRP----RALSAAPRGRVVCPAAPAS--SPASTTDAGQDRLQKVPVSNIRN 85

Query: 92  FCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYK 151
           F IIAHIDHGKSTLADKLL++TGTVQ REMK QFLDNMDLERERGITIKLQAARMRY+  
Sbjct: 86  FSIIAHIDHGKSTLADKLLELTGTVQKREMKQQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYIMN 145

Query: 152 NEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEII 211
           +E YCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALEN+LEII
Sbjct: 146 DEPYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENDLEII 205

Query: 212 PVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTA 271
           PVLNKIDLPGA+P RV +EIEEI+G+DCSNAI+CSAKEGIGITEIL+AIV ++PPP+NTA
Sbjct: 206 PVLNKIDLPGAEPDRVAQEIEEIIGMDCSNAIRCSAKEGIGITEILDAIVTKIPPPQNTA 265

Query: 272 DRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEV 331
             PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRVVDG IKKGD+I FMAS K+Y ADE+GVLSPNQ++V
Sbjct: 266 ISPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVVDGSIKKGDKICFMASGKEYVADEIGVLSPNQMQV 325

Query: 332 EELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQF 391
            ELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITH  ++AE +LPGY +ATPMVFCGLFP+DADQF
Sbjct: 326 SELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHSSKRAECALPGYSQATPMVFCGLFPIDADQF 385

Query: 392 PELRDALEKLQLNDAALK--------FEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREY 451
            ELR+ALEKLQLNDAALK        FEPE+SSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREY
Sbjct: 386 EELREALEKLQLNDAALKAVTRFSMQFEPESSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREY 445

Query: 452 NLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           NL+LI TAPSVVY VN  +G+TV
Sbjct: 446 NLNLIITAPSVVYHVNLADGETV 462

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EAZ6 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432406 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 876.3 bits (2263), Expect = 5.7e-251
Identity = 447/467 (95.72%), Postives = 455/467 (97.43%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLST-FPFSSSTATSRAKVL 60
           MAAELSFAPLLSTCTQHRRL QSR S+LFH PTLPLPLSPSLST    SSSTATSR KVL
Sbjct: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLLQSRRSTLFHCPTLPLPLSPSLSTSSSSSSSTATSRGKVL 60

Query: 61  CQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120
           CQTAGTHLFDA+ AAEAGQ+RLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR
Sbjct: 61  CQTAGTHLFDAKCAAEAGQDRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120

Query: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180
           EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRY+Y+NEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC
Sbjct: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYVYENEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180

Query: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDC 240
           EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVT+EIEEIVGLDC
Sbjct: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTQEIEEIVGLDC 240

Query: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300
           SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG
Sbjct: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPSPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300

Query: 301 RIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360
           RIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT
Sbjct: 301 RIKKGDRIYFMASGKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360

Query: 361 HYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420
           H+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG
Sbjct: 361 HFSRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420

Query: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNG+TV
Sbjct: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGETV 467

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HRW4 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466184 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 4.8e-250
Identity = 446/467 (95.50%), Postives = 451/467 (96.57%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLST-FPFSSSTATSRAKVL 60
           MAAE SFAPLLSTCTQHRRL QSR S+LFH PTLPLPLSPS ST    SSST T+R KVL
Sbjct: 1   MAAEFSFAPLLSTCTQHRRLLQSRRSTLFHCPTLPLPLSPSPSTSSSSSSSTPTTRGKVL 60

Query: 61  CQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120
           CQTAGTHLFDA+ AAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR
Sbjct: 61  CQTAGTHLFDAKCAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120

Query: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180
           EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC
Sbjct: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180

Query: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDC 240
           EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVT EIEEIVGLDC
Sbjct: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTHEIEEIVGLDC 240

Query: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300
           SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG
Sbjct: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPSPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300

Query: 301 RIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360
           RIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT
Sbjct: 301 RIKKGDRIYFMASGKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360

Query: 361 HYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420
           H+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG
Sbjct: 361 HFSRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420

Query: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNG+TV
Sbjct: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGETV 467

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMN9 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491317 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 865.5 bits (2235), Expect = 1.0e-247
Identity = 438/466 (93.99%), Postives = 450/466 (96.57%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVLC 60
           MAA+LSFAPLLSTCTQH R FQSR +  FHFP+LP+PL  SLSTFPFSSSTAT+R KVLC
Sbjct: 1   MAAQLSFAPLLSTCTQHLRPFQSRTNIHFHFPSLPIPL--SLSTFPFSSSTATTRGKVLC 60

Query: 61  QTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTRE 120
           QTAG H FDAQ A EAGQ+RLLKVPISHIRNF IIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTRE
Sbjct: 61  QTAGAHFFDAQNAVEAGQDRLLKVPISHIRNFSIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTRE 120

Query: 121 MKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACE 180
           MKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACE
Sbjct: 121 MKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACE 180

Query: 181 GALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCS 240
           GALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL+NNLEIIPVLNKIDLPGADPLRV KEIEEIVGLDCS
Sbjct: 181 GALLVVDASQGVEAQTLANVYLALDNNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVMKEIEEIVGLDCS 240

Query: 241 NAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGR 300
           NAIQCSAKEGIGI EILNAIVERVPPPRNTA+RPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRVVDGR
Sbjct: 241 NAIQCSAKEGIGIVEILNAIVERVPPPRNTANRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVVDGR 300

Query: 301 IKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITH 360
           IK+GDRIYFMAS+KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITH
Sbjct: 301 IKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITH 360

Query: 361 YGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGF 420
           +GRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETS+AMGF
Sbjct: 361 HGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSNAMGF 420

Query: 421 GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV
Sbjct: 421 GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 464

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVN5 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024873 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 845.5 bits (2183), Expect = 1.1e-241
Identity = 434/469 (92.54%), Postives = 441/469 (94.03%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAK--- 60
           MAAEL  AP LSTC QHRR  QSR +SLFH P LPLP SP L    FSSST T+R +   
Sbjct: 1   MAAELCLAPPLSTCAQHRRPLQSRRNSLFHLPALPLPFSPLL----FSSSTTTTRTRGRV 60

Query: 61  VLCQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQ 120
           VLCQTA T LFDA+ AA+AGQNRLLKVPISHIRNF IIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQ
Sbjct: 61  VLCQTAQTPLFDAERAAQAGQNRLLKVPISHIRNFSIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQ 120

Query: 121 TREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLA 180
           TREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLA
Sbjct: 121 TREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLA 180

Query: 181 ACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGL 240
           ACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRV KEIEE+VGL
Sbjct: 181 ACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVMKEIEEVVGL 240

Query: 241 DCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVV 300
           DCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVV
Sbjct: 241 DCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVV 300

Query: 301 DGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDT 360
           DGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEV ELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDT
Sbjct: 301 DGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVGELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDT 360

Query: 361 ITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSA 420
           ITHY RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSA
Sbjct: 361 ITHYVRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSA 420

Query: 421 MGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           MGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNC+ GDTV
Sbjct: 421 MGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCITGDTV 465

BLAST of Lcy04g000220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P3ZVQ8 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Ziziphus jujuba OX=326968 GN=LOC107415760 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 753.4 bits (1944), Expect = 5.5e-214
Identity = 394/478 (82.43%), Postives = 425/478 (88.91%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSF-APLLSTCTQHRRLFQS--RGSSLFHFPTLPL--PLSPSLSTFPFSSSTATS- 60
           MAA+LS  A LLST T   + +++  R +S   F  LPL    +P  S F  SSS +   
Sbjct: 1   MAAKLSSQALLLSTTTTIPQCYKTEPRATSFLPFTLLPLYPSKTPHFSKFHHSSSQSFKL 60

Query: 61  --RAKVLCQTAGT----HLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADK 120
             ++ V C+ AGT     + D ++A + GQ+RLLKVPIS+IRNFCIIAHIDHGKSTLADK
Sbjct: 61  GPKSSVFCRAAGTQSPAEVSDIEFATKIGQDRLLKVPISNIRNFCIIAHIDHGKSTLADK 120

Query: 121 LLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDF 180
           LLQMTGTVQ REMK+QFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYM+KNE  CLNLIDTPGHVDF
Sbjct: 121 LLQMTGTVQKREMKEQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMFKNEPCCLNLIDTPGHVDF 180

Query: 181 SYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVT 240
           SYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADP  V 
Sbjct: 181 SYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPDCVI 240

Query: 241 KEIEEIVGLDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYR 300
           +EIEE+VGLDCSNAI CSAKEGIGITEILNAIVER+PPP+ TA++PLRALIFDSYYD YR
Sbjct: 241 QEIEEVVGLDCSNAILCSAKEGIGITEILNAIVERIPPPQATAEKPLRALIFDSYYDPYR 300

Query: 301 GVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS 360
           GVIVYFRV+DGRIKKGDRIYFMASEKDYFADE+GVLSPNQL+V+ELYAGEVGYLSASIRS
Sbjct: 301 GVIVYFRVIDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEIGVLSPNQLQVDELYAGEVGYLSASIRS 360

Query: 361 VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAAL 420
           VADARVGDTITHY ++AEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAAL
Sbjct: 361 VADARVGDTITHYFKRAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAAL 420

Query: 421 KFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           KFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV
Sbjct: 421 KFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 478

BLAST of Lcy04g000220 vs. NCBI nr
Match: XP_038889419.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 878.2 bits (2268), Expect = 3.1e-251
Identity = 445/466 (95.49%), Postives = 453/466 (97.21%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVLC 60
           MAAELS APLLST TQHRRLFQSR ++ FHF    LPL PSLSTFPFSSSTAT+R KVLC
Sbjct: 1   MAAELSSAPLLSTSTQHRRLFQSRTNTHFHFHFPSLPLPPSLSTFPFSSSTATTRGKVLC 60

Query: 61  QTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTRE 120
           QTAGTHLFDAQYAA+AGQ+RLLKVP SHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTRE
Sbjct: 61  QTAGTHLFDAQYAAQAGQDRLLKVPTSHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTRE 120

Query: 121 MKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACE 180
           MKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACE
Sbjct: 121 MKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACE 180

Query: 181 GALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCS 240
           GALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRV KEIEEIVGLDCS
Sbjct: 181 GALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVMKEIEEIVGLDCS 240

Query: 241 NAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGR 300
           NAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADR LRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGR
Sbjct: 241 NAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRSLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGR 300

Query: 301 IKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITH 360
           IK+GDRIYFMAS+KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITH
Sbjct: 301 IKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITH 360

Query: 361 YGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGF 420
           YGRKA+DSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGF
Sbjct: 361 YGRKAKDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGF 420

Query: 421 GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV
Sbjct: 421 GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 466

BLAST of Lcy04g000220 vs. NCBI nr
Match: KAG6595718.1 (Translation factor GUF1-like, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 877.9 bits (2267), Expect = 4.0e-251
Identity = 448/467 (95.93%), Postives = 455/467 (97.43%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLST-FPFSSSTATSRAKVL 60
           MAAELSFAPLLSTCTQHRRL QSR S+LFH PTLPLPLSPSLST    SSSTATSR KVL
Sbjct: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLLQSRRSTLFHCPTLPLPLSPSLSTSSSSSSSTATSRGKVL 60

Query: 61  CQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120
           CQTAGTHLFDA+ AAEAGQ+RLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR
Sbjct: 61  CQTAGTHLFDAKCAAEAGQDRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120

Query: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180
           EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMY+NEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC
Sbjct: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYENEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180

Query: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDC 240
           EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVT+EIEEIVGLDC
Sbjct: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTQEIEEIVGLDC 240

Query: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300
           SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG
Sbjct: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPSPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300

Query: 301 RIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360
           RIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT
Sbjct: 301 RIKKGDRIYFMASGKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360

Query: 361 HYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420
           H+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG
Sbjct: 361 HFSRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420

Query: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNG+TV
Sbjct: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGETV 467

BLAST of Lcy04g000220 vs. NCBI nr
Match: XP_022925039.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 876.3 bits (2263), Expect = 1.2e-250
Identity = 447/467 (95.72%), Postives = 455/467 (97.43%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLST-FPFSSSTATSRAKVL 60
           MAAELSFAPLLSTCTQHRRL QSR S+LFH PTLPLPLSPSLST    SSSTATSR KVL
Sbjct: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLLQSRRSTLFHCPTLPLPLSPSLSTSSSSSSSTATSRGKVL 60

Query: 61  CQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120
           CQTAGTHLFDA+ AAEAGQ+RLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR
Sbjct: 61  CQTAGTHLFDAKCAAEAGQDRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120

Query: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180
           EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRY+Y+NEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC
Sbjct: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYVYENEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180

Query: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDC 240
           EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVT+EIEEIVGLDC
Sbjct: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTQEIEEIVGLDC 240

Query: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300
           SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG
Sbjct: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPSPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300

Query: 301 RIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360
           RIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT
Sbjct: 301 RIKKGDRIYFMASGKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360

Query: 361 HYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420
           H+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG
Sbjct: 361 HFSRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420

Query: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNG+TV
Sbjct: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGETV 467

BLAST of Lcy04g000220 vs. NCBI nr
Match: XP_023518730.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 876.3 bits (2263), Expect = 1.2e-250
Identity = 446/467 (95.50%), Postives = 453/467 (97.00%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLST-FPFSSSTATSRAKVL 60
           MAAELSFAPLLSTCTQHRRL QSR S+LFH PTLPLPLSPSLST    SSST T+R KVL
Sbjct: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLLQSRRSTLFHCPTLPLPLSPSLSTSSSSSSSTPTTRGKVL 60

Query: 61  CQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120
           CQTAGTHLFDA+ AAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR
Sbjct: 61  CQTAGTHLFDAKCAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120

Query: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180
           EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC
Sbjct: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180

Query: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDC 240
           EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVT+EIEEIVGLDC
Sbjct: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTQEIEEIVGLDC 240

Query: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300
           SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG
Sbjct: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPSPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300

Query: 301 RIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360
           RIKKGDR+YFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT
Sbjct: 301 RIKKGDRVYFMASGKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360

Query: 361 HYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420
           H+ RKAEDSLPGYEE TPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG
Sbjct: 361 HFSRKAEDSLPGYEEVTPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420

Query: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNG+TV
Sbjct: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGETV 467

BLAST of Lcy04g000220 vs. NCBI nr
Match: XP_022966535.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 9.9e-250
Identity = 446/467 (95.50%), Postives = 451/467 (96.57%), Query Frame = 0

Query: 1   MAAELSFAPLLSTCTQHRRLFQSRGSSLFHFPTLPLPLSPSLST-FPFSSSTATSRAKVL 60
           MAAE SFAPLLSTCTQHRRL QSR S+LFH PTLPLPLSPS ST    SSST T+R KVL
Sbjct: 1   MAAEFSFAPLLSTCTQHRRLLQSRRSTLFHCPTLPLPLSPSPSTSSSSSSSTPTTRGKVL 60

Query: 61  CQTAGTHLFDAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120
           CQTAGTHLFDA+ AAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR
Sbjct: 61  CQTAGTHLFDAKCAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTR 120

Query: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180
           EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC
Sbjct: 121 EMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAAC 180

Query: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDC 240
           EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVT EIEEIVGLDC
Sbjct: 181 EGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTHEIEEIVGLDC 240

Query: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300
           SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG
Sbjct: 241 SNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERVPSPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 300

Query: 301 RIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360
           RIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT
Sbjct: 301 RIKKGDRIYFMASGKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTIT 360

Query: 361 HYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420
           H+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG
Sbjct: 361 HFSRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMG 420

Query: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTV 467
           FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNG+TV
Sbjct: 421 FGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGETV 467

BLAST of Lcy04g000220 vs. TAIR 10
Match: AT5G08650.1 (Small GTP-binding protein )

HSP 1 Score: 704.1 bits (1816), Expect = 7.4e-203
Identity = 358/443 (80.81%), Postives = 400/443 (90.29%), Query Frame = 0

Query: 32  PTLPLPLSPSLSTFPFSSSTATSRAKVLCQ-TAGTH------LFDAQYAAEAGQNRLLKV 91
           P+L    S S+S F   S+    + ++LCQ TAGT       +  ++ AA +GQ+RLLKV
Sbjct: 25  PSLRRLSSISVSGFRRHSN---RKLQILCQATAGTEPQSGLSVSGSKLAARSGQDRLLKV 84

Query: 92  PISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAA 151
           PIS+IRNF IIAHIDHGKSTLADKLLQ+TGTVQ R+MK+QFLDNMDLERERGITIKLQAA
Sbjct: 85  PISNIRNFSIIAHIDHGKSTLADKLLQVTGTVQNRDMKEQFLDNMDLERERGITIKLQAA 144

Query: 152 RMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL 211
           RMRY+Y++  +CLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL
Sbjct: 145 RMRYVYEDTPFCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL 204

Query: 212 ENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSNAIQCSAKEGIGITEILNAIVERV 271
           ENNLEIIPVLNKIDLPGA+P +V +EIEE++GLDCS AI CSAKEGIGITEIL+AIV+R+
Sbjct: 205 ENNLEIIPVLNKIDLPGAEPEKVLREIEEVIGLDCSKAIFCSAKEGIGITEILDAIVQRI 264

Query: 272 PPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVL 331
           P P +TA +PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG++KKGDRI+FMAS KDYFADEVGVL
Sbjct: 265 PAPLDTAGKPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVIDGKVKKGDRIFFMASGKDYFADEVGVL 324

Query: 332 SPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLF 391
           SPNQ++V+ELYAGEVGY++AS+RSVADARVGDTITHY RKAE SLPGYEEATPMVFCGLF
Sbjct: 325 SPNQIQVDELYAGEVGYIAASVRSVADARVGDTITHYSRKAESSLPGYEEATPMVFCGLF 384

Query: 392 PVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYN 451
           PVDADQFP+LRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYN
Sbjct: 385 PVDADQFPDLRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYN 444

Query: 452 LSLITTAPSVVYRVNCVNGDTVI 468
           L+LITTAPSVVYRVN VNGDT +
Sbjct: 445 LNLITTAPSVVYRVNSVNGDTTL 464

BLAST of Lcy04g000220 vs. TAIR 10
Match: AT5G39900.1 (Small GTP-binding protein )

HSP 1 Score: 402.5 bits (1033), Expect = 4.6e-112
Identity = 199/400 (49.75%), Postives = 274/400 (68.50%), Query Frame = 0

Query: 69  DAQYAAEAGQNRLLKVPISHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDN 128
           D++ +++     L K P   IRNF IIAHIDHGKSTLAD+L+++TGT++    + Q+LD 
Sbjct: 46  DSRQSSKEPTIDLTKFPSEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRLMELTGTIKKGHGQPQYLDK 105

Query: 129 MDLERERGITIKLQAARMRYMYKNE-----AYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGAL 188
           + +ERERGIT+K Q A M Y  K E      Y LNLIDTPGHVDFSYEVSRSL+AC+GAL
Sbjct: 106 LQVERERGITVKAQTATMFYENKVEDQEASGYLLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLSACQGAL 165

Query: 189 LVVDASQGVEAQTLANVYLALENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSNAI 248
           LVVDA+QGV+AQT+AN YLA E NL I+PV+NKID P ADP RV  +++ +  LD  + +
Sbjct: 166 LVVDAAQGVQAQTVANFYLAFEANLTIVPVINKIDQPTADPERVKAQLKSMFDLDTEDVL 225

Query: 249 QCSAKEGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKK 308
             SAK G+G+  +L A++ER+PPP   ++ PLR L+FDS+++ Y+GVI Y  VVDG + K
Sbjct: 226 LVSAKTGLGLEHVLPAVIERIPPPPGISESPLRMLLFDSFFNEYKGVICYVSVVDGMLSK 285

Query: 309 GDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYGR 368
           GD++ F AS + Y   +VG++ P       L  G+VGY+   +R+  +AR+GDTI +  +
Sbjct: 286 GDKVSFAASGQSYEVLDVGIMHPELTSTGMLLTGQVGYIVTGMRTTKEARIGDTI-YRTK 345

Query: 369 KAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFR 428
              + LPG++    MVF G++P D   F  L  A+EKL  NDA++    ETS+A+G GFR
Sbjct: 346 TTVEPLPGFKPVRHMVFSGVYPADGSDFEALGHAMEKLTCNDASVSVAKETSTALGMGFR 405

Query: 429 CGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNG 464
           CGFLGLLHM++  +RLE+EY   +I+T P+V Y     +G
Sbjct: 406 CGFLGLLHMDVFHQRLEQEYGTQVISTIPTVPYTFEYSDG 444

BLAST of Lcy04g000220 vs. TAIR 10
Match: AT2G31060.2 (elongation factor family protein )

HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 1.1e-31
Identity = 122/407 (29.98%), Postives = 186/407 (45.70%), Query Frame = 0

Query: 87  SHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARM 146
           + +RN  +IAH+DHGK+TL D+LL+  G     E   + +D+++LERERGITI  +   +
Sbjct: 57  NRLRNVAVIAHVDHGKTTLMDRLLRQCGADIPHE---RAMDSINLERERGITISSKVTSI 116

Query: 147 RYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALEN 206
            +   NE   LN++DTPGH DF  EV R +   EGA+LVVDA +G  AQT   +  AL+ 
Sbjct: 117 -FWKDNE---LNMVDTPGHADFGGEVERVVGMVEGAILVVDAGEGPLAQTKFVLAKALKY 176

Query: 207 NLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSN-----------AIQCSAKEG----- 266
            L  I +LNK+D P     R   E+E +V    +N            +  SAKEG     
Sbjct: 177 GLRPILLLNKVDRPSVTEER-CDEVESLVFDLFANCGATEEQLDFPVLYASAKEGWASST 236

Query: 267 ---------IGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRI 326
                      + ++L+A+V  V PP+   D P   L+     D Y G I+  RV  G +
Sbjct: 237 YTKDPPVDAKNMADLLDAVVRHVQPPKANLDEPFLMLVSMMEKDFYLGRILTGRVTSGVV 296

Query: 327 KKGDRIYFM-----ASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGD 386
           + GDR+  +      SEK   A  V ++      +  + A   G +       A + +G 
Sbjct: 297 RVGDRVNGLRKTDSGSEKIEEAKVVKLMKKKGTTIVSIDAAGAGDIICMAGLTAPS-IGH 356

Query: 387 TITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSS 446
           T+     +   +LP  E   P +       D+    +    L   ++ D  L  E ET+ 
Sbjct: 357 TVA--SAEVTTALPTVELDPPTISMTFGVNDSPLAGQDGTHLTGGRIGD-RLMAEAETNL 416

Query: 447 AMGF------GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYR 458
           A+         +     G L + I+ E + RE    L  + P V+Y+
Sbjct: 417 AINVIPGLSESYEVQGRGELQLGILIENMRRE-GFELSVSPPKVMYK 450

BLAST of Lcy04g000220 vs. TAIR 10
Match: AT2G31060.3 (elongation factor family protein )

HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 4.0e-31
Identity = 122/409 (29.83%), Postives = 186/409 (45.48%), Query Frame = 0

Query: 87  SHIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTREMKDQFLDNMDLERERGITI--KLQAA 146
           + +RN  +IAH+DHGK+TL D+LL+  G     E   + +D+++LERERGITI  K+   
Sbjct: 57  NRLRNVAVIAHVDHGKTTLMDRLLRQCGADIPHE---RAMDSINLERERGITISSKVSPF 116

Query: 147 RMRYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLAL 206
                +K+    LN++DTPGH DF  EV R +   EGA+LVVDA +G  AQT   +  AL
Sbjct: 117 VTSIFWKDNE--LNMVDTPGHADFGGEVERVVGMVEGAILVVDAGEGPLAQTKFVLAKAL 176

Query: 207 ENNLEIIPVLNKIDLPGADPLRVTKEIEEIVGLDCSN-----------AIQCSAKEG--- 266
           +  L  I +LNK+D P     R   E+E +V    +N            +  SAKEG   
Sbjct: 177 KYGLRPILLLNKVDRPSVTEER-CDEVESLVFDLFANCGATEEQLDFPVLYASAKEGWAS 236

Query: 267 -----------IGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDG 326
                        + ++L+A+V  V PP+   D P   L+     D Y G I+  RV  G
Sbjct: 237 STYTKDPPVDAKNMADLLDAVVRHVQPPKANLDEPFLMLVSMMEKDFYLGRILTGRVTSG 296

Query: 327 RIKKGDRIYFM-----ASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARV 386
            ++ GDR+  +      SEK   A  V ++      +  + A   G +       A + +
Sbjct: 297 VVRVGDRVNGLRKTDSGSEKIEEAKVVKLMKKKGTTIVSIDAAGAGDIICMAGLTAPS-I 356

Query: 387 GDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPET 446
           G T+     +   +LP  E   P +       D+    +    L   ++ D  L  E ET
Sbjct: 357 GHTVA--SAEVTTALPTVELDPPTISMTFGVNDSPLAGQDGTHLTGGRIGD-RLMAEAET 416

Query: 447 SSAMGF------GFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYR 458
           + A+         +     G L + I+ E + RE    L  + P V+Y+
Sbjct: 417 NLAINVIPGLSESYEVQGRGELQLGILIENMRRE-GFELSVSPPKVMYK 454

BLAST of Lcy04g000220 vs. TAIR 10
Match: AT5G13650.1 (elongation factor family protein )

HSP 1 Score: 132.1 bits (331), Expect = 1.2e-30
Identity = 120/406 (29.56%), Postives = 186/406 (45.81%), Query Frame = 0

Query: 88  HIRNFCIIAHIDHGKSTLADKLLQMTGTVQTRE-MKDQFLDNMDLERERGITIKLQAARM 147
           ++RN  I+AH+DHGK+TL D +L+     +  + M+++ +D+ DLERERGITI   +   
Sbjct: 81  NVRNIAIVAHVDHGKTTLVDSMLRQAKVFRDNQVMQERIMDSNDLERERGITI--LSKNT 140

Query: 148 RYMYKNEAYCLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTLANVYLALEN 207
              YKN    +N+IDTPGH DF  EV R L   +G LLVVD+ +G   QT   +  ALE 
Sbjct: 141 SITYKNTK--VNIIDTPGHSDFGGEVERVLNMVDGVLLVVDSVEGPMPQTRFVLKKALEF 200

Query: 208 NLEIIPVLNKIDLPGADP-LRVTKEIEEIVGLDCSNAIQC----------SAKEGIG--- 267
              ++ V+NKID P A P   V    E  + L+ ++  QC            K G+    
Sbjct: 201 GHAVVVVVNKIDRPSARPEFVVNSTFELFIELNATDE-QCDFQAIYASGIKGKAGLSPDD 260

Query: 268 ----ITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIY 327
               +  +  AI+  VP P    D  L+ L  +  YD ++G I   R+  G ++KG  + 
Sbjct: 261 LAEDLGPLFEAIIRCVPGPNIEKDGALQMLATNIEYDEHKGRIAIGRLHAGVLRKGMDVR 320

Query: 328 FMASEKDYFADEVGVLSPNQ----LEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHYGRK 387
              SE       V  L   +    +  + + AG++     ++  + + ++G+TI    + 
Sbjct: 321 VCTSEDSCRFARVSELFVYEKFYRVPTDSVEAGDI----CAVCGIDNIQIGETIA--DKV 380

Query: 388 AEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFP----------ELRDALEKLQLNDAALKFEP-E 447
               LP  +   P V    F V+   F            LRD L +    + A+K E  E
Sbjct: 381 HGKPLPTIKVEEPTVKMS-FSVNTSPFSGREGKYVTSRNLRDRLNRELERNLAMKVEDGE 440

Query: 448 TSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVN 460
           T+      F     G LH+ I+ E + RE    ++     +  RVN
Sbjct: 441 TADT----FIVSGRGTLHITILIENMRREGYEFMVGPPKVINKRVN 470

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
A5B4D24.5e-21381.28Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT... [more]
B9RHQ51.0e-20982.70Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Ricinus communis OX=3988 GN=RC... [more]
B9GHA63.0e-20988.38Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN... [more]
Q9FNM51.0e-20180.81Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 G... [more]
B9F2U52.4e-19077.20Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica O... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1EAZ65.7e-25195.72Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=... [more]
A0A6J1HRW44.8e-25095.50Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LO... [more]
A0A1S3BMN91.0e-24793.99Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103... [more]
A0A6J1DVN51.1e-24192.54Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN... [more]
A0A6P3ZVQ85.5e-21482.43Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Ziziphus jujuba OX=326968 GN=L... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038889419.13.1e-25195.49translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Benincasa hispida][more]
KAG6595718.14.0e-25195.93Translation factor GUF1-like, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma sub... [more]
XP_022925039.11.2e-25095.72translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita moschata][more]
XP_023518730.11.2e-25095.50translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
XP_022966535.19.9e-25095.50translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita maxima][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT5G08650.17.4e-20380.81Small GTP-binding protein [more]
AT5G39900.14.6e-11249.75Small GTP-binding protein [more]
AT2G31060.21.1e-3129.98elongation factor family protein [more]
AT2G31060.34.0e-3129.83elongation factor family protein [more]
AT5G13650.11.2e-3029.56elongation factor family protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR000795Translational (tr)-type GTP-binding domainPRINTSPR00315ELONGATNFCTcoord: 91..104
score: 58.25
coord: 134..142
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coord: 210..219
score: 43.86
IPR000795Translational (tr)-type GTP-binding domainPFAMPF00009GTP_EFTUcoord: 88..265
e-value: 2.4E-54
score: 183.8
IPR000795Translational (tr)-type GTP-binding domainPROSITEPS51722G_TR_2coord: 87..268
score: 60.388336
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e-value: 6.7E-192
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IPR006297Elongation factor 4PANTHERPTHR43512TRANSLATION FACTOR GUF1-RELATEDcoord: 77..466
IPR006297Elongation factor 4HAMAPMF_00071LepAcoord: 84..471
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NoneNo IPR availableGENE3D2.40.30.10Translation factorscoord: 270..369
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NoneNo IPR availableGENE3D3.30.70.870Elongation Factor G (Translational Gtpase), domain 3coord: 370..451
e-value: 8.0E-41
score: 139.8
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR43512:SF4TRANSLATION FACTOR GUF1, MITOCHONDRIALcoord: 77..466
NoneNo IPR availableCDDcd01890LepAcoord: 90..267
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NoneNo IPR availableCDDcd03699EF4_IIcoord: 275..360
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NoneNo IPR availableCDDcd16260EF4_IIIcoord: 377..452
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IPR004161Translation elongation factor EFTu-like, domain 2PFAMPF03144GTP_EFTU_D2coord: 289..359
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IPR027417P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolaseGENE3D3.40.50.300coord: 86..269
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IPR027417P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolaseSUPERFAMILY52540P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolasescoord: 83..285
IPR005225Small GTP-binding protein domainTIGRFAMTIGR00231TIGR00231coord: 90..260
e-value: 1.6E-20
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IPR031157Tr-type G domain, conserved sitePROSITEPS00301G_TR_1coord: 127..142
IPR035647EF-G domain III/V-likeSUPERFAMILY54980EF-G C-terminal domain-likecoord: 376..454
IPR009000Translation protein, beta-barrel domain superfamilySUPERFAMILY50447Translation proteinscoord: 249..371

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy04g000220.1Lcy04g000220.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0045727 positive regulation of translation
cellular_component GO:0009507 chloroplast
cellular_component GO:0005743 mitochondrial inner membrane
cellular_component GO:0005759 mitochondrial matrix
molecular_function GO:0003924 GTPase activity
molecular_function GO:0005525 GTP binding
molecular_function GO:0043022 ribosome binding