Lcy03g004550 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAAAAGAGAATGGGTTTTTGAAGGTGGGAATGGTTAAAATTCCAGAATATAGGGAAAAAGAGGTGAACAATTTTTCACTGAAGACTTTGTTGAGCACGTAGTTTTTCATCTTCAAGTGGTTTATGACTTTGTTTTGATTTTGAGTCAATTGTATGCTTCATTGGCAGATTAAATTGTTGATTTCTCACAGGTACTGGACAATCTTCCTCATGATCTTATTTACTAAGAAAATCAAGTTTCCTCGTGGATGGAAGTATGGGTATAAAAGAAACTTGATAGGTATGCAAACATTATTTATGCTTGCTGGCATTTAGTTCTTACTGTGATTTCCTAGTTCACTTATTTCATTTATATGTGATATGATTGAATGCTTGACGAAATATAGGTCTTTTTAGCAACTTTCACTTTGATTATTGGCCTAGTCATTTTCAGCCCACCTGCATATTCTTATTTCTGAAGCAATATATATTGTTAGCCCTTGCTATTCTAATTCTCTAGATGTGGCTTAAGCTATCCTAAGCAAGTTGTTTGGCTTATTTTTAATTGTAATGATTTTTAATTAATTGCTTTAGACTTTAGTTACTTACTTGATGTGAGGATAGCTGGTGAAAAAGCACAATTAGTTTCAACCAATGTATGTCCTTTCTTTTACTCAATGTGGATTGAGAATCGTTGCAAGTATCTTCTCAACGATAGGTCTTATGTTTTAAAAATTTCAAAACCAGTACATAGAAAGATTATAATTTCAGTTGTTTTCTTTTATGTTTTAATGTGCAAGCAGTTGGAAGCAACTCAGACTATGAAAACGCAAGCCTGGAGTTCAAGAACTTAAAATTGGACTCATTTTTCTAACTTTCCTATTATTAGAACTTCTTAATGTATAATTTAAAGGGGCTTTTAGGGCAGAGACACCAACTGTTGTCTTCTTCTTCTTCATTTTTGTTTTCCTAGTCTTGTCATTTTCACAATGAAAAGGTACTTAATAATTTTGGTTGACTTGCAGAGTGATGCTAACATCTTTTTCCCCACAGCCTTTCTATTATTGGAACAAATTGACAATTATTGTTCTGGATGGCTGAAACGATAAAACGCCAAAGATAGGGAAAAAGAAGCGAACAATAATTGTAAGTTGCACAATCTCTTATGTGATCATTGTGTGGGGTGCAAAGGGAAATTGTTACTAAAAGCACATAAAGTGGTTTGGAGGTTTTCTTTTGTGGAGAAGGTACATCGTCATCTAATGTAGAAAGGAATCCAAAACAAATTTTGTGCCATTTCTATATTTTTGAAGTTTGACATCATTTTTTCAGGCAAAATGCTTGGAAATAGGAGAAACAGTTGGGATGGCTTTCATCCTTAATTCTTTTCTCTGTTCATGGTGGAACTACGTATCTAAAACTATGCCATGGAAATTGCAAGTTGATCCTCTAACTCATCAGGTTAAGTTTTGTGACTTTGGAAGCGCAAAAGTACTGGTATGCTCTATGTCTGATTCTCTATCATATCAAATTTTCTAGTTGACATAATTTATCAGTATATTCATATACTATGCATAAGACTGAGAGTTGGAACTTGGAAGTAATAGCAAACGTTTGTTGTTCAAGCCAATAGTTTTTTAACTATCAACTTTTCCGGAGAGAAAATTTAGTCCATTATCTAACTCATCTCCACTCGATGTATGATTAGAAAGAGAAAATAAAATAAGATTTATATATCAACAAAATTAAATAAAGTGTTCTACAAATATCATCTACCCCTTCACTCAATTATTTTCCAATCCTTTGGTCTTTTTTTGGTGTGAAATTTATTAATTTTTCTTTCAAAACTCATATTACATACTGGTATGTTATTTATTTCAGTTATGTTATTTGTATATTGGTATGTGTGAAGTATCTTCCTTTCCTGAATGATATATGAATTTCCAAACTGTGCAGCATTGTGAATTGTGTTTAAAGATGAGGATTCAAAAAAGAAATCTAGCCATTCGATGAAGAGGATGAAGGTTTCGACCTAGAAGAGAACAACAAAAAGCCCAAATGACTGCGGAGTTTAGGGAACTTGTTTTGGAAGAGAGAGAGAGAGAAATCTAGCCATTTTCGAATTTCTTGGGCATAGAAATTGGTTTGGTCCAACTGGGCCATTGAAGAGATGGAGAGAAATTTTATTTTAGGGAAAGGGAAAAAGGATTGGATAATGGGGAAAAGAGATTTGTTGTTTATGATGCATTTTCTTTTTCTGTGTTGTGTGTATGTGTTAATGTCGTTTGCAGATGATGTTGTGGATAGTGGTATGGTAGCTTAGTACTTTTAATGTTGATCAATGAAAAGTGTTCTATTGGTTATTACTCAAATATATGAATTGGCTTAATTTGTAGGTACAAGCCCAAACAGTATGGACTGAGATGAACAAGGTTGAGAGAGGGATTGTTGAAATTATTGCTCAGTACAGTATTAAATGGCTAGTTATGGGTTTAGACGCAAAAAGGTACAATCTGAAGTATACATAATATATTGTTATTATAGCTTTCCAGGAAATTGGACTTTTTGCTACTGTTCAGTGGGAACATATTCACAGTAACATTTTAATGTTGTCTGGGGGATTTGTTTATTCAAGTCTGAAAAAGCCTAATTAGTGTGGACTGTGGAGGATGCTTACATTACATGAAATTTCATGCTTTTATAAATATAAAATACATGTATTTCTATTTGTTTTAAAGATTGGTCAAGTCTTAAGAATAGATGACTGAGGCGAGTATATGACTTTCTGACTTATGCATCTTGACAGTAGTTTTATTTCTTTGAATTGATAATGCATAACATAGAATGCACTTCAGAAAACTGAATGGTTTTTACATTTTGGAATGTAAATATCTACAATATTTTCCTAAAAGAAAACGGATGAAATGACTATTCATACTAAAATGTAATTACCATGCTCATTCAAGTTGAAAACTCTATACTATGTTTTGTATCAATATGATGGTATTTTCTTTCATGGCTAGATTGAACCACTGTTTCTACCACTATTTCTGGTGTTTACACGTATTTTGTCCTTTGCACGTATCCTGAAAGAGAGTTACGACACCACTATTTCTGGTGTTGACACTTGTATAGATTTGTTTTTCCTTCTGTTGTTGGTGAATGTTGAAGATGTGTTTCTTTGTGGTTTGTTTGAAATTGGGACTTCAGATGGGAAATTTTGGGGGGTTTTGTTTGGTTGTGTAGGCTGTAAAAGGAGGGGATGGATGATTTATTTGTGCAGGGATTTTTGGGGAGAAAGTTGTGGTCTTTTGTGTATGCTTTGTTTATAACTTTCTTATGTGTGTAAATGACTTGCCTTTCTCTTGCTCCAATGGTTATAATGCTAGCATTATTAGCCCTACACTTGGCTTCAATGTCAAGACTATCACCTATCAGAAGTGAGCTTCCCTGTTTGTTCTTGTTGACATGTTTTCAATTCATTATTATTTCTGGATTGAGATTTTCTTTTAAGTTCCGGGATCTGGTATGCACACTGTTCACTCTTTAGTCGCTAATTGGCTACAGAAAATAAGTGGAAATGAACATGAATACCTTGTATGGGCCATTCAAGTTTTCTTTTTCTGAGAACTTTGGGTGATGACACCAGAGAAATCTCATCTCCCCTAATTCATTAGCTGTTTTTAATGGATTCCAAGTTTTAGGACCTTGATCATCTACTTCTGATTTGATTTTTTTCTTATTCTTGTGGTAAATCTTTCTAGTTCGAGTATTTGAATCTTGAAGCCATGGACTGAAGATATTTGAAATGCTGTCACATGTTCCTATTGATGGTTATGTGTATTAGAAAAATGTTTTGAAGTGATAATGGAGCACTAAAGTTGTAAACATGTAGCTCAGCACCCTATCAAGGTTAGAATGCAAAGTATTTCATTATTTTTTGTTTATGACATATCTCTATCTAATATCGTGTTAATTTAAGAAGTTCTTGCAAAGAGCTTTATAATTTTTCCGTCATTAAAAGTCGATGGATAGTTATAGTTTTTCCGTCATTAAAAGTCTGTCACTTATTAGTTTTTCATGTTAAAACTAACTTGCTTAGTTTTAGGATATTTGGGGTCTTGTTGTGAACCTGAAGTGTTGTGATGCTGTAGTTGGGTGATTTTTTTTTCATATAGAAGTGTGTTTCTCTTGTTTAACAAGTTTAAAAATTTTTGGGTTAGTCATATGTATGTCGTTATGCTGTCGAAATTTTAGAGCAACTGGTTAGAATTAGGATAGATGCTTTAGTAATGTCTCTAGGTTAAGTATAGAAACCTTGAGCATTACAAGTTCTCTGAAGGGGTTAAACTTGATATCTTGAAGTATGTAAGTTTTTGTAGTTTATTGGGTTTTCTAACAATTTTTTTCGATACTCATCGAGATTGGTTTTTAATCATAGGTGGTTTATTGGGTTCTTCAAGTTTGATGTACGAGCAAGATTATGGTGACAAGAATGAAAGTGGCATGTACGAGAATTTTTGTTTTTTGGCGTAGGTGTAGACTTTTAATCATAGGTGTTTAGTAATTTTGAGGCTTTTAAGTGTAAGTGTTTGTAATTTTATTCATATATCAAACTTATATGAATAAAAATTGTATGAACAAATTTGGTTCATTGGTTTATTGAAATGAAATTTGACAAATATTTGATTTCTATACAATTGTGCACATTTAAGATTAAGATTACTTTCATTACGGATTGACAAATGAAGAAAATATTGTTGGTATGCCATTGGACAACCAATAAATTTTTTTATTAAATTATGAACAAAATGATGACAGGCAATGCATGTCATTAAAAAAGATATTTAATGACGGACACCTTTAATGACGGACATTTTTTTGGAAAATACCCTTTCAATGACGGACTTTTGATGACGGACGGCTTTTAATGACGGGCATTGCCCGTCATTAAAAATGTCCTCAGTTGGAAAATACCTTTTAATGATGGACTTTTGATGACGGACGGCTTT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BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39012 (Shaggy-related protein kinase iota OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK9 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 48.1 bits (113), Expect = 1.1e-04 Identity = 21/28 (75.00%), Postives = 23/28 (82.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LWN0 (Shaggy-related protein kinase GSK1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=GSK1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 4.2e-04 Identity = 20/28 (71.43%), Postives = 22/28 (78.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39010 (Shaggy-related protein kinase zeta OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK6 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 4.2e-04 Identity = 20/28 (71.43%), Postives = 22/28 (78.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39011 (Shaggy-related protein kinase eta OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK7 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 5.5e-04 Identity = 20/28 (71.43%), Postives = 22/28 (78.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5Z7J0 (Shaggy-related protein kinase GSK4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=GSK4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 7.2e-04 Identity = 18/28 (64.29%), Postives = 23/28 (82.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V4D6 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold89G005320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.6e-09 Identity = 29/37 (78.38%), Postives = 33/37 (89.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C0H8 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold143G00730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.6e-09 Identity = 29/37 (78.38%), Postives = 33/37 (89.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CGH6 (U-box domain-containing protein 32 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 1.3e-08 Identity = 35/50 (70.00%), Postives = 40/50 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CHF8 (U-box domain-containing protein 32 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 1.3e-08 Identity = 35/50 (70.00%), Postives = 40/50 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HZC6 (U-box domain-containing protein 32-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 2.9e-08 Identity = 33/41 (80.49%), Postives = 37/41 (90.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. NCBI nr
Match: KAA0062160.1 (shaggy-related protein kinase eta [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.5e-09 Identity = 29/37 (78.38%), Postives = 33/37 (89.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. NCBI nr
Match: TYK04880.1 (shaggy-related protein kinase eta [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.5e-09 Identity = 29/37 (78.38%), Postives = 33/37 (89.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. NCBI nr
Match: XP_022140911.1 (U-box domain-containing protein 32 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 2.7e-08 Identity = 35/50 (70.00%), Postives = 40/50 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. NCBI nr
Match: XP_022140910.1 (U-box domain-containing protein 32 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 2.7e-08 Identity = 35/50 (70.00%), Postives = 40/50 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. NCBI nr
Match: XP_022968334.1 (U-box domain-containing protein 32-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 6.0e-08 Identity = 33/41 (80.49%), Postives = 37/41 (90.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. TAIR 10
Match: AT1G06390.1 (GSK3/SHAGGY-like protein kinase 1 ) HSP 1 Score: 48.1 bits (113), Expect = 7.9e-06 Identity = 21/28 (75.00%), Postives = 23/28 (82.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. TAIR 10
Match: AT1G06390.2 (GSK3/SHAGGY-like protein kinase 1 ) HSP 1 Score: 48.1 bits (113), Expect = 7.9e-06 Identity = 21/28 (75.00%), Postives = 23/28 (82.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. TAIR 10
Match: AT2G30980.1 (SHAGGY-related protein kinase dZeta ) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 3.0e-05 Identity = 20/28 (71.43%), Postives = 22/28 (78.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. TAIR 10
Match: AT4G18710.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 3.9e-05 Identity = 20/28 (71.43%), Postives = 22/28 (78.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g004550 vs. TAIR 10
Match: AT4G18710.2 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 3.9e-05 Identity = 20/28 (71.43%), Postives = 22/28 (78.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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