Lcy03g003400 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy03g003400
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr03: 14024033 .. 14033432 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy03g003400
SyntenyLcy03g003400
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCATCGATGGAGAAGTTCATCAGTTGCGAGATGGAAAGAACTAGGTAATGTTGAGTTACTGTATTATTTATATGTATATACTCTTAAGTACATAGAGATGCTAGAGGTATGTATATACATTCATATGCGAGCAATTGATAGGATCGTTGAGTATGATGCTTGTTTGTATATACACATATATAGATATATGTTGTTGTACTTATTGCATATTTGTATACAATTACTTTCGTGCTTCCATGTATTGTAGGACTAAACGCCCTAGTTGTAACGCCTCAGGCCCAGGATTCGAAATTCGGCTTCGGCACCTCAGGCCCCGACATTCTCCTGCGACCTGGCCACGCCATCATACTCGTCTTAAACTGCTTCCAAGAGTGAAGACTGTCCCCACAAACCAACACGGGGTCCTTTTAGCATGCTTTGTCCTCACTCACATGCTTCCTAGGAAAATTCCCAAGAGGTCACCCAACATAGAACTTCTCCAAGCCAAGCACGTTTAACTTCAAAGTTCCTATGATTGAGCCACCGAAAAGGAAGGTGCACCTTGTTGGTATAAGTAGTATCTATCAATTCTTTTAAGCTTTTCTTGAACATACTTTCATGTCCTCAGGATCCCTCTCATTCGGATGTGATCTCGGTTCATTCATGTACCCCTCCTAACTCGGGTGTTACATGCCCACCAGCTTCCGCCTTGGTTCGTCCCCGAACCACATCCTACTGGGAGAGGTTTCGCTCTGATACCATCTGTAACGCCCCAGGCCTAGGATTCGGAATCCGGATTCGGCACCTCACGGCCCCAGCATTCCTCTACATCCCCTACGACCTGGCGACGTCATCATACTTGTCTGAAACTACTTCTAAGAGTGAAGACTATCCCCACAAACCAACACGGGGTGGCTTGATGAGAAGAAAGTCGGTTGAAAGAAGTGCCTTGGGAAAAAAAAGGTTGAGACCAAGGTCAATCATCCAAAATGACTAGGCGAGAAACTTTCGAGGACGAAAGTTTTTAAAGGTGGGGAGTCTGTAACGCCTCGCGTTTAAAAATTATGCCATTTTGGATTAATTGGGTTTGAATTCTAATTTGGAAAAAATTAGAATTTATTTACAGCCTTCAGTTGATATTTTAAAGTCAATTGAGATTTTTCCCCTCCTCGTGTGTTACAGGCTGATTGATTTAGTCGGTTAAGTCTTTGCAGGTTAGTGGGCAGTTTAGTAGCGTCTTTTTCGTTAGTGGGTGGTTTTGGAATCGGTTAGGTTTTAAACAAAAAAAAAAGAAAAGAACGAAAGGAAATCAATCTCACTCTCTCTCTCTCCCCCTTCATCTCTCGCGCGTTCTTCCCCCCCTGCGTTTTCTCCTTCTTCTCCGGCAGCCTCTCTCTCCCTCGCGTGGCCGTCTCCGCAGCTTACCCCCACCGCCGTCGGTCTCGCCTCGCACAGCATGCCGCCGATCTCCCCACGCCGCCGCCTTTCCCCTTCGTTTTCTCCCTTTGGCGAACAGAAACCGCGAGCGCCGCCCACTGATGACATGCAAAAATGTCATCATTTTCCTATTATTTTTAGCTAGTTTTGTGCATGAATTGTGTACTTTCATGCTATTTTATGTTTAAATTTCAGAAAACCGAGCCAAGGAAGCAAAACTGGAATTTTGAGAGAATTTGGATGATTTTTGGGGACTTTTTGAGCAATTTGGAGAAGTTCATTGTAGATCCAAATCCAAAGAGCCAAGAAGAATGAGTTAGAAGCTCCAATTCATGAATTCCAAAGCCTTAATTATCAAGTTTGGTCAAGAGAAGAGCCCAAAATCCATTACAAGAAGCATTTGGGCCAAAAGAAAGTTGGAGGCCCAAAACTTGAGTCAAAATCGGGCCATTCTAGAAGATCCAGGGCCTAGCGTCGCGATGCTAGGCTGAAGCGTCTCGACGCTTGCCAGCTGCGCGGAAAGATCCAGAAATGGGGTAGCGTCGCGACGCTGCGACGACTTGGAGCCCAAGAAAAGATGACGTCAGAGCGTCGTGACGCTACGCCTGCTGGGAGCCTATAAAAGGGGTCATTTGCATCCAAGTTTTGTGTGCCAATTTGTGGGTTTTCACCCCATTCTAGAATCCACACTAAAATTGGGGATTTTTGGGAGAGTTTTGGAGCTTTGTTGAAGATCTTTGGAGCTCAGGATCGATGGAGGTCGGCGCGGGATCGAGGAGATCAACACTTTTATGAGCATTTCTCTTCCCTTTTCCTTTATGTTTTAGTTTCTAGAATTGTTGTGATTAGGAATTATTGGATTTTAGTGATTATGGGTAGTTAATTCCTAAATTCTATGAGATTGATTTAGATGTTGAACCTTTGCTTGATTAATGAATTTATTTGGTTTAATTGTCATTATTGTTCATTTGTGCATTTTGTCCGTAATGCTTTTAATCAACTGATCACTGATTAAATGAATCGTTACTAAGTGGAGACTCGACGGAGAGAAGCTTAGACTAGAACTGAATGCATGACTAATGTTATTTACCCGAGTGACACGGGATTGACTAAATAACGTTAGAGGTTGTATTGAAGGGTCGTAATACCATACTAAGTAAATAAAGAAGAGACCGAAAGGAGATTCTTTATTGAAAGGTATGAGATAGGAGGAGACCGACAGGAGAGTCCTTGTCATTAGGCTTCTAGACTTATGAATCAAATGATTAGTTAATCCATATTAGTTAATTGATTAAGCATTAAAGGTCCAATTGATGAAATCAACCACTCTAGAATTATCCCTCCAAATTGTGTCTCCATTTATATTTTGCTTTCTAGATTAGCTTTTTGTTATTCTTTTCGGCATTAGATTTTGTTCTCTAAATAAAGCTAAGCAAGATTATTCGCGGTAATTAATTGAATAAATCCAATCCCTGTGGAGACGATACTCTATACTCAAAATCACTATATTACTTGTGACGACCCGTACGCTTGCGGTGTAAAAATCGTCCCAACACCCACCCGCCGTCTTTCTCTTCCTTGCGCTGCTGCTGCTCGATCCCGTGCGCGATCAGTCCCTCAAGGTCGATTCTCCCTCTCTTCCTTGTTTTTGGTTGCAACAGACCAAGCTTGTGAGAACCCACGACGTTTTCTCCGTCTTTAATGGTGGACTGCAACATTCAGTGAAATTACTTGCAAGGTTGGTCGATACCCACGCGATTCCAGCGGCTTTTGTAGGTGAGTTCACACTCTTTGATGTTCTTTTCTCTTGTTTCAGTCACTCACGAGTTTGATTCGTCAGATTCAAGTTCAACCTATGCACTTTTGGCAAGAATTCAAGCTAAAACCCCATTTTCCAACATTACCCACTCCAATTTGGACCCGAAATCACCCGGTTTGGTGTCCCACACTCCGAACAGCCCCAAATTGGATTACCCATAGCCTTTGGAGCTTAGTTTTGCAGTGTTGGATATTTTTGAACATCAACCAGCACGTGTTCAAGTCTTTTGGTAAGATTTAAGATTGTTTCGTGCTCTTAGACCTTTGGAATTTAATTGGTTTGGAGTAAGAATAGCCTATAACCATTGGGTATTCTCTAATTCTCAGTTTTGACCCAATTTGATTGTTAGACAGCATGTGTTTGAGGTCGTTTGGGTGCTGATCGGTAAGTTCCAACGACCTTAAAGTCTCTAGAAATTGTCATAGTTAGCTTTGAAATAGTTTTTAACCTTTGGGTGTCCTCTAGTTTCAGTTTAGTATCAATTCGGGCTTGGATCAAGACTTATTTAAGGGATTTTAGTGCTGATTGGTTAACTTCCAGCAAAGTTTGTGCCCCTGTTCGGTAAGTTTCAGCATCTTTCAGCATGTTTTAGGTCCCTTTAAATCTATGTTAAGTGTTGGGAAGGTTGTTAGGTTGTTCCCTAACCTTTAGAAGGTCTCTATTGTGTTCGTAGGTCCGTTTAGAGCATATTCTACTATTTTCCAGCAAGCGATAGTTGGTTTAGGGGCGCTATCTAGCTTGGGTAAGTAGTTTCTACCTGGATGAGTCTGTCTGTTTGTTTGAGCATGTTGATTGTTTTGCTTGTCTTGTTATCATACGTTGTGTTGAATATGTGTATGTAGCTCGCTATGTGAATACGCACGTTGCTTTGTGTGACTCTTAAGCATGTTACTTTGTTTATTTCCATAAGCATGAGATACGGTTGTCAGTTGGCTATGTTGCATAAGAGTCGTGTCTGCATAGCGTGTGTTCATTGGGGAGAGGCGGAGCATGACGCGTAAATCATGTGCTGGGTGTGTGTGCGGAAATCACGTGTGGGTGTGAGTGTGGAGTGTGACGCGGAAATCACGTGTGAGTGGCGCTGCGCATGGCGCGTAATAATACATGTGTTGGGTGGGTTTGCGGAGCGTGACGCGGAAATCACGTGTGGGTTGTGAGTGCGGAGCGTGACGCGGAAATCACGTGTGAGTGTGCGGGCATGGCGCGGAAACCATGTGGGGTTGCATAGCATGATGTGTGGATTCATGTTGTCATCCCATTTTGCATGAAGCATGTGTTGGCACTGTTGTTTTCGTGTTTACGAGTTTGTTGGTTTGTTTATCGCTTTACAAGCATGACGTGTGTGTGGACAGCATGTTGTTGTGGTTGTTTGTTGTATGGTGGCTCACCGGGTGTGAGCTACTTACCAGTACTGTGGTTGTACTGATACCCCTCCCCTTTTCTTCCCCCCAACATTTTCAGATTATGCAGGTGATGAGCTTTATGTGCCCGGTGATGTAGATGAGGAGGTTCACGATGGATGACCACAGGATTTTGTGTATTTGATATTTTCTTTCTGTTGGATAGGGTAGTTCTTTTACTTGGTTGTTGATAGGTTGATTCTTTAGCTTGCATATAGGTTGGATTGGTTTTCTTTTAGCTGTTGAGCTTGTGTAGAATTTCTTGTTTTCGATAGGTTGTAAATATGCTAATGTTAAATAAAGTTGAACTGTTTCTAGAAAGTTAAGAGTATGCTTGCACTAGAAGAATTTAGGTCCTGTTGTTGGTTGAAGATGCGAGATCTGACTCGTATTCTAGTATGAAGTTGTTTCTGTGGAGTTATGGGGTAGAATGGAATGATATAGAAGTGTTGTTTTGAGTTTAACAGGTGATTAAAAATTTTGGTTTCGTCCTATGTATGTCGTTATGCTGCCGAAATTTTCGGAGCTCTCGGTTAGTTTGAATAGGAGTTTAGTAATGTCACTAGGTTAGATTTTATTAAAACCTAGGGCGTTACACTAGCGGAAGCGATTAGATCGATCTCGCAATTTAATTCCATTTGTGAAAAACCACTGCATTGGCAAAATAGAAAACTACAGAACAATTCTACAGTGTAATAATAGATTAAGCATGCTGAGATTTTTGGTGTTTAATTCTACAGAAAAGGGAATTGAGACTTACTCTCATTATAGACTTAGAATAAACACCAATATGCTTCTGGGATGGATCACGAACTCTCTGCAATTCCTCTATATATTTGCAGGGACCAAAAATGTAGTGAACACTACCAGTAGATTGCGTCCCTATCTTCTGAGTTGTTGAGGCAAAGGATTGTGGGATCCTTACTTCTTGAGTTTTTGGAATTAGAATTTCACTAGAATGATGTGAAAATTCTTGGAGAGATTTTGGGAGAGAATTTTTCTACTGAACTCTTACTGTTAAAAGATACAAAATGCTTTTTCAAAAAATAAATAAATAAATAATACAAAATGCCAGAAGTCTCTCGTCCATCTTCCTCCAGGCGTGTGTATCAATTGGAGAGAGAGATGATAACATCGGAGTGACCCACGTATTTGCTGGGAGTTACATATGACTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAATTAATTTAATTAATAATATATTAATATATTAATTAAATTAAATTAACTAGTTTTTCTTCACGTGCTTTGCACGTGACTTATCCTTTTAAAAACTAAATTTAATATTATGAATTTGTCAATATGTATTATACAATTTTGTTATCAAATATTTAATGTTAATTAACTATGTATACTTTATTCAAATATTTATTCTTTTCATTCAAAAAGACAATTCAATTGAAATTCTAATATATACTAAAATGCAAATCTTCCTAAAAAATTGTAGAAAAATATCAAGACTTTTCTTTAGGGAAAAATATCAACAAGTTTTGAATAATTACCATTCAATTACTCAAATAAACATGTCTATGCAAATGAGAATGTGCGAATATTAAAATATTCAGATTCATTGCTACTAATCAATAACGGAAATCAATTGTTATTAATAAAAAAAAATAAAAATAGCAATTGGAGTACCTAAACCATGTTGATACTCTCACACATTCAAATAAATCTACTGTACTTCGTGTTCTTCCATGGAAAAATAACAAAAAAAAACAATTTAATATTAAAAAATCAAGTTTAGGTTTAATATTAAAGAAAAAACATAATATAACTAAAAATAAAATATGTAAATTTTAAGTATTGCGAACCTTTAGAATTGTAGAAAAAAACATTGTGAAGAAGAAAAATTATGGTGTATATATTGTATAATTTTGTTAAAAGAATAAACTTACCTTTTATCAAATGTTGAACGTTGCTCAACAACACTATTTGAAAAAATTGAACGGTTAGTGCTTTATTGCATATTTAGAGAAACCTGAAAAAATATAAAAATCTTGAGAGAGAAAATCATAAATCATAAATCATCATAAAAAAGAAGAAGGATAAAAAAAAGAATTTCAAGATGTTGCTCCAAAAGAGTCGAAGTGAGTCTTTTATACTTGTAGGAAATGAAGGGGTTATAAAACCTCTTAAAATTCTAAAACCTTTCAAGTTCTATAATTGAATATAATTAAATGATAATAAATAAAATTGTTCATATTCCAATGTTTTAAATGTTTTTTTTTTCGTCAAAATTTTTTTTGAATGAATTTAGTAATAAAATCAAAGTGGGTGCAAATTAAATTTCAAAAGCAATCTCTTAAAATTCTAAAACCTTTCAAGTTCTATAATTAAATATAATTAAATGATAATGAATAAAATTGTTCATATTCCAATGTTTTAAATGATTTTTTTTTTTGTCAAAAAAAGTTTTAAATGAATTTAGTAAAATCAAAGTGGGTGCAAATTAAATTTCAAAAGCAGTCTTAATGGTTTTCTAAGAAAAAAAAAATAATGAACTTATGATTAAAATGAAAAGCCACTAGTCGTAATCTATCCTAAAGCAAAAATTCACAAATTAAAAATATAAAAAACAAAAGTCAAATGCATGCATTTTCTTTAAATTGATTATCGATTAATTAATATTAAATTATTTTAATTCTAATTTATAATAACACAATTTATTGAGAGCCATGTTATTATATTAAATTAAGGGTATATTAGGAATTTAGCAAAAACTAAAGGATAACATTGTCCAAAATAAGTTTCTTCCACATATATATTATAGATTATAGATTATAGATTATAGATTATAGATAATTAATTAAATCTTATTTAATTAATAATTAATTAAATCTCATTAAATTAATTCTTTCATTCAAATCATATTTAAATTAATAATCTCTCACATAACCTATATTTTTAATTAAATTTAATTTAATTAATTAATCAATTCACCAATTAATTAATTATTAAATATTGCATATTTGATTTTTTTTTTTTTGAAAAAAAATATTGCATATTTAATTTAAGGGAAAAATACACTTTTGGTCCCTGAGGTTTTGGTTAAGTTACAGTTTGATCCCTGAGTTTTCAAACTTAACAAAAATACCCATGAGGTTTGAGATAAGGAGCACTTTGGCCCTGCCGTCTATTTTTCTGTTAAATCTTAACGGTTGCTGACGTGGCACTATTATTTTAATTAAAAAATTAATTTTTTTAATTTTTTTAAATAAAAAATAATAAAATACTATTATTTTATCTCTTTTTTTTTTAATTCTTTATCCTCTCTCTCTTATTCTTCCTCTTCCCCCATCTTCTTCTCAACCATCTTCTTCTCCAACTCCGGTGGCCGGTGGCCACCGCCGGCGAGATTTTTTTTTTCTTCTCTTTCTTTCTTTCTCTCTCCCTTCTTCCCCTTCCATTTCTTCCCACAGACTCCCTTTTCCCTCATTTTCCCAAAAATTTTGTTCCGACTTCGCCATTTTCATGGCTTCCCCATCACTTTGACGTGAATCCCACGCTCCGCCGTCTGATCGTTCCCTTTCAACGTCGACGGCGATGTCGCCCGGAATCATGTCGATCACTGATTTCACCTACTGGCTGTCGGAGCACCCCGCCATCGTCGGATTTCGGTGGAGCCACACCCATTCATGGGGCTCCACTTGGTCCTTCCTCTTCTCTTCCATCGCCTTTTACCTCGCCTTCTCCACCGTCGTCCATCTCTTCCTCAGCCTCCTCCTCCGCCCCGGCCGCCCTGTCCCTCTCGGGCCCATTCCAGCCATCCATTGCCTCTCCATGGCTCTCATCTCTGCCCTCATCTCCGCCGGGATCCTCCTCTCCTCCGCCGCCGAGATTCGTGACACACGATGGTTCAGGCGGCGTTCCAAAACCCCCTTCCAGTGGCTCCTCTGTTTCCCCTTGGGCACTCGCCCTTCCGGCCGCGTCTTCTTCTAGTCGTACATCTACTATCTATCCCGATTCTTCCATATGTTCCTTACCATCTTCACCATTCTTCGGCGACGGCGGCTCTCCTTCTTCCAGCTCTTCAACCATTCGATTTCGACGTTTATGTCGTTCCTGTGGCTCGAATTTTCACAGTCTTTTCAGGTTCTGGCGATTCTGTCAACTTTGCTGGTGTACGCAGTGGTTTACGATACAGATTCTGGACGGCGATTGGATTGCAAAGGTCTTGTTTCCCTTTCGTGATGAACTGTCAATTCTTCCTGTTGGGTTGCAATTTGGCCTACCATGTGGGCGTTTTGATGCTGCACTTTATGAAAGGTGGGTGCAACGAAATTGGAGCTTGGGGTTTCAATACGGTGCTCAACGGAGCGATTTTGCTGATGTTCTTGAACTTCTATCTCAAAATTCATCTGGGGAAGTCGCAGGATTCTGTAAAGATGATCAAGCTCGATCAGTCCTGTTCTGGGCCCTCCCTCCTCCCGTTTCGATGATATGGATGGAAGCCATGGTGACATCGATTCGTTTCTCGAAACTATCGTATTCCACCCAAACTTGCATCGGTTTGCCGCTGATTAGCTTCAAATTCCTGAATTTTCCGTCGACCCAATACCCCGCCGACGCTGCCCGCACTGACACTAAGCTGTTAATGTTAATTCCGACATGGTTGTCATTAATGTCTTCAAGGTCCAGATTCCATATCGTGTCGAGCTCGACGATGAAGATGTGA

mRNA sequence

ATGCATCGATGGAGAAGTTCATCAGTTGCGAGATGGAAAGAACTAGGTAATGTTGAGTTACTGTATTATTTATATGTATATACTCTTAAGTACATAGAGATGCTAGAGACCAAGCTTGTGAGAACCCACGACGTTTTCTCCGTCTTTAATGGTGGACTGCAACATTCAGTGAAATTACTTGCAAGGTTGGTCGATACCCACGCGATTCCAGCGGCTTTTGTAGACTCCCTTTTCCCTCATTTTCCCAAAAATTTTGTTCCGACTTCGCCATTTTCATGGCTTCCCCATCACTTTGACGTGAATCCCACGCTCCGCCGTCTGATCGTTCCCTTTCAACGTCGACGGCGATGTCGCCCGGAATCATGTCGATCACTGATTTCACCTACTGGCTGTCGGAGCACCCCGCCATCGTCGGATTTCGGTGGAGCCACACCCATTCATGGGGCTCCACTTGGTCCTTCCTCTTCTCTTCCATCGCCTTTTACCTCGCCTTCTCCACCGTCGTCCATCTCTTCCTCAGCCTCCTCCTCCGCCCCGGCCGCCCTGTCCCTCTCGGGCCCATTCCAGCCATCCATTGCCTCTCCATGGCTCTCATCTCTGCCCTCATCTCCGCCGGGATCCTCCTCTCCTCCGCCGCCGAGATTCGTGACACACGATGGTTCAGGCGGCGTTCCAAAACCCCCTTCCAGTGGCTCCTCTGTTTCCCCTTGGGCACTCGCCCTTCCGGCCGCGTCTTCTTCTAGTCGTACATCTACTATCTATCCCGATTCTTCCATATGTTCCTTACCATCTTCACCATTCTTCGGCGACGGCGGCTCTCCTTCTTCCAGCTCTTCAACCATTCGATTTCGACGTTTATGTCGTTCCTGTGGCTCGAATTTTCACAGTCTTTTCAGGTTCTGGCGATTCTGTCAACTTTGCTGGTGTACGCAGTGGTTTACGATACAGATTCTGGACGGCGATTGGATTGCAAAGGTCTTGTTTCCCTTTCGTGATGAACTGTCAATTCTTCCTGTTGGGTTGCAATTTGGCCTACCATGTGGGCGTTTTGATGCTGCACTTTATGAAAGGTGGGTGCAACGAAATTGGAGCTTGGGGTTTCAATACGGTGCTCAACGGAGCGATTTTGCTGATGTTCTTGAACTTCTATCTCAAAATTCATCTGGGGAAGTCGCAGGATTCTGTAAAGATGATCAAGCTCGATCAGTCCTGTTCTGGGCCCTCCCTCCTCCCGTTTCGATGATATGGATGGAAGCCATGGTGACATCGATTCGTTTCTCGAAACTATCGTATTCCACCCAAACTTGCATCGGTTTGCCGCTGATTAGCTTCAAATTCCTGAATTTTCCGTCGACCCAATACCCCGCCGACGCTGCCCGCACTGACACTAAGCTGTTAATGTTAATTCCGACATGGTTGTCATTAATGTCTTCAAGGTCCAGATTCCATATCGTGTCGAGCTCGACGATGAAGATGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCATCGATGGAGAAGTTCATCAGTTGCGAGATGGAAAGAACTAGGTAATGTTGAGTTACTGTATTATTTATATGTATATACTCTTAAGTACATAGAGATGCTAGAGACCAAGCTTGTGAGAACCCACGACGTTTTCTCCGTCTTTAATGGTGGACTGCAACATTCAGTGAAATTACTTGCAAGGTTGGTCGATACCCACGCGATTCCAGCGGCTTTTGTAGACTCCCTTTTCCCTCATTTTCCCAAAAATTTTGTTCCGACTTCGCCATTTTCATGGCTTCCCCATCACTTTGACGTGAATCCCACGCTCCGCCGTCTGATCGTTCCCTTTCAACGTCGACGGCGATGTCGCCCGGAATCATGTCGATCACTGATTTCACCTACTGGCTGTCGGAGCACCCCGCCATCGTCGGATTTCGGTGGAGCCACACCCATTCATGGGGCTCCACTTGGTCCTTCCTCTTCTCTTCCATCGCCTTTTACCTCGCCTTCTCCACCGTCGTCCATCTCTTCCTCAGCCTCCTCCTCCGCCCCGGCCGCCCTGTCCCTCTCGGGCCCATTCCAGCCATCCATTGCCTCTCCATGGCTCTCATCTCTGCCCTCATCTCCGCCGGGATCCTCCTCTCCTCCGCCGCCGAGATTCGTGACACACGATGGTTCAGGCGGCGTTCCAAAACCCCCTTCCAGTGGCTCCTCTGTTTCCCCTTGGGCACTCGCCCTTCCGGCCGCGTCTTCTTCTAGTCGTACATCTACTATCTATCCCGATTCTTCCATATGTTCCTTACCATCTTCACCATTCTTCGGCGACGGCGGCTCTCCTTCTTCCAGCTCTTCAACCATTCGATTTCGACGTTTATGTCGTTCCTGTGGCTCGAATTTTCACAGTCTTTTCAGGTTCTGGCGATTCTGTCAACTTTGCTGGTGTACGCAGTGGTTTACGATACAGATTCTGGACGGCGATTGGATTGCAAAGGTCTTGTTTCCCTTTCGTGATGAACTGTCAATTCTTCCTGTTGGGTTGCAATTTGGCCTACCATGTGGGCGTTTTGATGCTGCACTTTATGAAAGGTGGGTGCAACGAAATTGGAGCTTGGGGTTTCAATACGGTGCTCAACGGAGCGATTTTGCTGATGTTCTTGAACTTCTATCTCAAAATTCATCTGGGGAAGTCGCAGGATTCTGTAAAGATGATCAAGCTCGATCAGTCCTGTTCTGGGCCCTCCCTCCTCCCGTTTCGATGATATGGATGGAAGCCATGGTGACATCGATTCGTTTCTCGAAACTATCGTATTCCACCCAAACTTGCATCGGTTTGCCGCTGATTAGCTTCAAATTCCTGAATTTTCCGTCGACCCAATACCCCGCCGACGCTGCCCGCACTGACACTAAGCTGTTAATGTTAATTCCGACATGGTTGTCATTAATGTCTTCAAGGTCCAGATTCCATATCGTGTCGAGCTCGACGATGAAGATGTGA

Protein sequence

MHRWRSSSVARWKELGNVELLYYLYVYTLKYIEMLETKLVRTHDVFSVFNGGLQHSVKLLARLVDTHAIPAAFVDSLFPHFPKNFVPTSPFSWLPHHFDVNPTLRRLIVPFQRRRRCRPESCRSLISPTGCRSTPPSSDFGGATPIHGAPLGPSSSLPSPFTSPSPPSSISSSASSSAPAALSLSGPFQPSIASPWLSSLPSSPPGSSSPPPPRFVTHDGSGGVPKPPSSGSSVSPWALALPAASSSSRTSTIYPDSSICSLPSSPFFGDGGSPSSSSSTIRFRRLCRSCGSNFHSLFRFWRFCQLCWCTQWFTIQILDGDWIAKVLFPFRDELSILPVGLQFGLPCGRFDAALYERWVQRNWSLGFQYGAQRSDFADVLELLSQNSSGEVAGFCKDDQARSVLFWALPPPVSMIWMEAMVTSIRFSKLSYSTQTCIGLPLISFKFLNFPSTQYPADAARTDTKLLMLIPTWLSLMSSRSRFHIVSSSTMKM
Homology
BLAST of Lcy03g003400 vs. NCBI nr
Match: GFP80990.1 (elongation of fatty acids protein 3-like, partial [Phtheirospermum japonicum])

HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 1.1e-04
Identity = 41/56 (73.21%), Postives = 42/56 (75.00%), Query Frame = 0

Query: 132 RSTPPSSDFGGATPIHGAPLGPSSSLPSPFTSPSPPSSISSSASSSAPAALSLSGP 188
           RST PSS FGG TP HGAP GPSSS PSP TSP PPSS  SS+SSSA AA  L GP
Sbjct: 4   RSTLPSSAFGGTTPNHGAPRGPSSSPPSPSTSPPPPSSTPSSSSSSATAAPPL-GP 58

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GFP80990.11.1e-0473.21elongation of fatty acids protein 3-like, partial [Phtheirospermum japonicum][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 123..176
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 196..234
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 126..140

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy03g003400.1Lcy03g003400.1mRNA