Lcy02g014510 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy02g014510
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionBHLH transcription factor
LocationChr02: 40709331 .. 40748078 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy02g014510
SyntenyLcy02g014510
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGAATTGGACTGCGGCATTGAATTCCCATTCTCATTTGATCAGGCAGATGAATTATTTCCACTTCCTTCTCTTTCCTCTTTTGACCTTCCCATTCCTCAGCCTCCATTCATCTCTTCCAAGGACAACACTGACAATAATCCCTCCAAAAAGCCCAAAAATGCCCGCCGCCGAAAATCTCCCAACGCTTCCGACGACGTCGTCGACGACGACAACCCCAACGAACACAAAAAGAAGAAGATCATCCATAGAGATGTGGAGCGCCAAAGAAGGCAAGAAATGTCCACTCTTTACGCCAGTCTTCGCTCGCTTCTCCCTCTTGAATATCTCAAGGGAAAACGGTCAATATGTGACCACATGCTAGAGGCAGTGAAGTACATTCGATATATGCAGAACAAGATCCAACAACTGTCTGATAAACGAGACGAGCTGAAAAAGCTTTCCGACAAAAATCCAGTTGTTGGCACAGTGGAAACACTTAATTCCTCAACGAGGGACTCGGTGGTGGTGCGGCCAACAAATGGATCAAGAGGAGTTCGAGTTCTTTTAGACACTGCCACCCAACACAGGCTCCCTGTTTCCAACATTCTTCAAGCTTTAGCTGCTGAAGGGCTCGAAATCATCACCTGCATTTCTTCCAAACAAAACAATAGGTTCATTCACACCATCGAATCCCAAGTTGTCGATAATTCTGGCTCTTGTCGAAGCATCGACGTGTCCGAGCTGCAACATAAGTTAACGAATTTGGAATATTTTCCTTTAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGAATTGGACTGCGGCATTGAATTCCCATTCTCATTTGATCAGGCAGATGAATTATTTCCACTTCCTTCTCTTTCCTCTTTTGACCTTCCCATTCCTCAGCCTCCATTCATCTCTTCCAAGGACAACACTGACAATAATCCCTCCAAAAAGCCCAAAAATGCCCGCCGCCGAAAATCTCCCAACGCTTCCGACGACGTCGTCGACGACGACAACCCCAACGAACACAAAAAGAAGAAGATCATCCATAGAGATGTGGAGCGCCAAAGAAGGCAAGAAATGTCCACTCTTTACGCCAGTCTTCGCTCGCTTCTCCCTCTTGAATATCTCAAGGGAAAACGGTCAATATGTGACCACATGCTAGAGGCAGTGAAGTACATTCGATATATGCAGAACAAGATCCAACAACTGTCTGATAAACGAGACGAGCTGAAAAAGCTTTCCGACAAAAATCCAGTTGTTGGCACAGTGGAAACACTTAATTCCTCAACGAGGGACTCGGTGGTGGTGCGGCCAACAAATGGATCAAGAGGAGTTCGAGTTCTTTTAGACACTGCCACCCAACACAGGCTCCCTGTTTCCAACATTCTTCAAGCTTTAGCTGCTGAAGGGCTCGAAATCATCACCTGCATTTCTTCCAAACAAAACAATAGGTTCATTCACACCATCGAATCCCAAGTTGTCGATAATTCTGGCTCTTGTCGAAGCATCGACGTGTCCGAGCTGCAACATAAGTTAACGAATTTGGAATATTTTCCTTTAGATTAG

Protein sequence

MELDCGIEFPFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPNASDDVVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNLEYFPLD
Homology
[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9STJ6 (Transcription factor bHLH126 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH126 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 1.0e-25
Identity = 75/182 (41.21%), Postives = 120/182 (65.93%), Query Frame = 0 

Query: 70  DDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRY 129
           DDN    KKKK++HRD+ERQRRQEM+TL+A+LR+ LPL+Y+KGKR++ DH+  AV +I+ 
Sbjct: 37  DDN---KKKKKLLHRDIERQRRQEMATLFATLRTHLPLKYIKGKRAVSDHVNGAVNFIKD 96

Query: 130 MQNKIQQLSDKRDELKKLSDK----NPVVG-TVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLD 189
            + +I++LS +RDEL + + +    NP  G T   +  S   +V+V+P      V V  +
Sbjct: 97  TEARIKELSARRDELSRETGQGYKSNPDPGKTGSDVGKSEPATVMVQPHVSGLEVVVSSN 156

Query: 190 TATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQH 247
           ++    LP+S +L+ +  +GLE+++  +++ N+R +HTI+ +V  NS  C  ID+  LQ 
Sbjct: 157 SSGPEALPLSKVLETIQEKGLEVMSSFTTRVNDRLMHTIQVEV--NSFGC--IDLLWLQQ 211

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FLI0 (Transcription factor bHLH120 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH120 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 115.5 bits (288), Expect = 8.6e-25
Identity = 78/203 (38.42%), Postives = 122/203 (60.10%), Query Frame = 0 

Query: 47  NPSKKPKNARRRKSPNASDDVVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLP 106
           NPS  PK  R +         +  +     K+KK++HR++ERQRRQEM+ L+ASLRS LP
Sbjct: 2   NPSNNPKKTRHQSH-------MPQERDETKKEKKLLHRNIERQRRQEMAILFASLRSQLP 61

Query: 107 LEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKK-LSDKNPVVGTVETLNSSTR 166
           L+Y+KGKR++ DH+  AV +I+  Q +I+ LS +RDELK+ + D   + G+     SS  
Sbjct: 62  LKYIKGKRAMSDHVNGAVSFIKDTQTRIKDLSARRDELKREIGDPTSLTGSGSGSGSSRS 121

Query: 167 D--SVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTI 226
           +  SV+V+P      V V    +     P+S +L+ L  +GLE+I+ ++++ N R ++TI
Sbjct: 122 EPASVMVQPCVSGFEVVVSSLASGLEAWPLSRVLEVLHGQGLEVISSLTARVNERLMYTI 181

Query: 227 ESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKL 247
           + +V  NS  C   D++ LQ KL
Sbjct: 182 QVEV--NSFDC--FDLAWLQQKL 193

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FLI1 (Transcription factor bHLH36 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH36 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 110.5 bits (275), Expect = 2.8e-23
Identity = 75/181 (41.44%), Postives = 118/181 (65.19%), Query Frame = 0 

Query: 79  KKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRYMQNKIQQLS 138
           +K++HR+ ERQRRQEM++LYASLRSLLPL ++KGKRS  D + EAV YI+Y+Q KI++LS
Sbjct: 2   EKMMHRETERQRRQEMASLYASLRSLLPLHFIKGKRSTSDQVNEAVNYIKYLQRKIKELS 61

Query: 139 DKRDELKKLSDKNPVVGT--------VETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQHR 198
            +RD+L  LS +  ++G+        VE +  S ++ VVVR      GV ++L +     
Sbjct: 62  VRRDDLMVLS-RGSLLGSSNGDFKEDVEMI--SGKNHVVVRQC--LVGVEIMLSSRCCGG 121

Query: 199 LP-VSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNL 251
            P  S++LQ L+  GL ++  ISS  ++R ++TI+++V D       ID++EL+ +L  +
Sbjct: 122 QPRFSSVLQVLSEYGLCLLNSISSIVDDRLVYTIQAEVND---MALMIDLAELEKRLIRM 174

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LN95 (Transcription factor bHLH55 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH55 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 4.7e-23
Identity = 76/196 (38.78%), Postives = 118/196 (60.20%), Query Frame = 0 

Query: 64  SDDVVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEA 123
           S+ +  DD P   K K+  H+++ERQRRQE ++L+  LR LLP +Y+KGKRS  DH+LEA
Sbjct: 63  SEIMKGDDEP---KNKRAKHKELERQRRQENTSLFKILRYLLPSQYIKGKRSSADHVLEA 122

Query: 124 VKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVG--TVETLNSS-------TRDSVVVRPTN 183
           V YI+ +Q KI+++S+KRD +K+        G  ++ +L SS       T  +VVVRP  
Sbjct: 123 VNYIKDLQKKIKEVSEKRDRIKRSITHPSSRGEFSIRSLASSTCSCVGDTNIAVVVRPC- 182

Query: 184 GSRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQALAAEG-LEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGS 243
              G+ +++    +H   +S++LQ LA E    I++CIS++ +  FIHTI S+V +    
Sbjct: 183 -LIGLEIVVSCCNRHESCLSSVLQLLAQEQCFNIVSCISTRLHQGFIHTIASEVEEGI-- 242

Query: 244 CRSIDVSELQHKLTNL 250
              +  SELQ K+  +
Sbjct: 243 --EVYFSELQEKIIKI 249

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9STJ7 (Transcription factor bHLH118 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH118 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 108.6 bits (270), Expect = 1.0e-22
Identity = 66/169 (39.05%), Postives = 108/169 (63.91%), Query Frame = 0 

Query: 79  KKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRYMQNKIQQLS 138
           +K++H+++E++RRQEM++LYASLRSLLPLE+++GKRS  D +  AV YI Y+Q  I+ ++
Sbjct: 2   EKLVHKEIEKRRRQEMASLYASLRSLLPLEFIQGKRSTSDQVKGAVNYIDYLQRNIKDIN 61

Query: 139 DKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQ 198
            KRD+L  LS ++      +  N  + + VV+RP     G+ ++L      + P S++LQ
Sbjct: 62  SKRDDLVLLSGRSFRSSNEQEWNEIS-NHVVIRPC--LVGIEIVLSIL---QTPFSSVLQ 121

Query: 199 ALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLT 248
            L   GL ++  I S  N+R IHT++++V D       ID+++L+  LT
Sbjct: 122 VLREHGLYVLGYICSSVNDRLIHTLQAEVND----LALIDLADLKDTLT 160

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H558 (transcription factor bHLH118-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459679 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 5.7e-80
Identity = 167/246 (67.89%), Postives = 201/246 (81.71%), Query Frame = 0 

Query: 10  PFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPNASDDVVD 69
           PFS+D  +ELFPLPSLS  D+P+PQ P IS  DN + + ++KPKN RR+K P  S D + 
Sbjct: 8   PFSYDLGEELFPLPSLSCIDIPVPQFPSISPLDN-NKSGTQKPKNGRRKKPPANSSDDIG 67

Query: 70  DDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRY 129
           D NPNEHKKKKI+HRDVERQRRQ+M++LYA+LRSLLP EYLKGKRSICDHMLEAVKYIR+
Sbjct: 68  DMNPNEHKKKKIMHRDVERQRRQDMASLYATLRSLLPHEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRH 127

Query: 130 MQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQH 189
           MQ++IQ L +KRDELK++SDKNPV   VETL+SS RDSV+VR  N S GV+V+L+TATQH
Sbjct: 128 MQSRIQVLCNKRDELKRVSDKNPVATMVETLDSSKRDSVLVRARNESGGVQVVLNTATQH 187

Query: 190 RLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNL 249
            LPVSNIL+ LA EGLEI++ IS+K N+ FIHTIE Q + +S    SIDVSELQHKL NL
Sbjct: 188 NLPVSNILRDLATEGLEILSYISTKVNDSFIHTIECQTLVDSNHTPSIDVSELQHKLMNL 247

Query: 250 EYFPLD 256
           EYF L+
Sbjct: 248 EYFLLN 252

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUZ3 (transcription factor bHLH118-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023734 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 8.2e-79
Identity = 169/253 (66.80%), Postives = 198/253 (78.26%), Query Frame = 0 

Query: 3   LDCGIEFPFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPN 62
           ++C I+ PFSFD  D+LFPLP LS  D+P+PQ P + S+       + KPKN RRRK P 
Sbjct: 1   MNCRIDSPFSFDVVDDLFPLPPLSCMDIPLPQLPSVVSRPAA----ALKPKNCRRRKPPP 60

Query: 63  ASDDVVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLE 122
            S    D  NPNEHKK+KIIHRDVERQRRQEMSTLYA+LRSLLP EYLKGKRSICDHM E
Sbjct: 61  VSS---DHSNPNEHKKRKIIHRDVERQRRQEMSTLYATLRSLLPFEYLKGKRSICDHMHE 120

Query: 123 AVKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVL 182
            VKYIR+MQ ++Q+LSDKR+ELKKLS ++   GT ETL++S RDSV VRP     GV+V+
Sbjct: 121 TVKYIRHMQRQVQELSDKREELKKLSGEDSDAGTAETLSASKRDSVAVRPR--GEGVQVV 180

Query: 183 LDTATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSEL 242
           LDT TQHRLPVSNIL+AL A GLEI+ CIS+K N+RF+HTIE+ V D  GS R+IDVSEL
Sbjct: 181 LDTGTQHRLPVSNILEALLAVGLEIVGCISTKINDRFLHTIEA-VPD--GSLRNIDVSEL 240

Query: 243 QHKLTNLEYFPLD 256
            HKLTNLEYFPLD
Sbjct: 241 HHKLTNLEYFPLD 241

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K9B6 (transcription factor bHLH118-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491282 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 1.4e-78
Identity = 165/246 (67.07%), Postives = 200/246 (81.30%), Query Frame = 0 

Query: 10  PFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPNASDDVVD 69
           PFS+D  +ELFPLPSLS  D+P+PQ P IS  D ++ + S+KPKN RR+  P  S D + 
Sbjct: 8   PFSYDLGEELFPLPSLSCIDIPVPQFPSISPLD-SNKSGSQKPKNGRRKNPPANSSDDIG 67

Query: 70  DDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRY 129
           D NPNEHKKKKI+HRDVERQRRQ+M++LYA+LRSLLP EYLKGKRSICDHMLEAVKYIR+
Sbjct: 68  DMNPNEHKKKKIMHRDVERQRRQDMASLYATLRSLLPHEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRH 127

Query: 130 MQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQH 189
           MQ++IQ LS+KRDELK++SDKNPV   VETL+SS R+SV+VR  N S  V+V+L+TATQH
Sbjct: 128 MQSRIQDLSNKRDELKRVSDKNPVATMVETLDSSKRESVLVRARNESGEVQVVLNTATQH 187

Query: 190 RLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNL 249
            LPVSNIL+ LA EGLEI++ IS+K N+ FIHTIE Q + +S    SIDVSELQHKL NL
Sbjct: 188 NLPVSNILRDLATEGLEILSYISTKVNDSFIHTIECQTLVDSNHTPSIDVSELQHKLINL 247

Query: 250 EYFPLD 256
           EYF L+
Sbjct: 248 EYFLLN 252

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KMQ4 (BHLH domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G157230 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 2.9e-76
Identity = 165/260 (63.46%), Postives = 204/260 (78.46%), Query Frame = 0 

Query: 1   MELDCGIEFPFSFDQADELFPLPSLSSFDLPI-PQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRK 60
           M+LDC I+ PF FDQ DELFPLPSLS   L +   PP I+S +NT+ N S+KPK  RRRK
Sbjct: 1   MDLDC-IQSPFPFDQVDELFPLPSLSPIHLSVADHPPLIASINNTNRNISEKPKKGRRRK 60

Query: 61  SPNASDDVVDDD-NPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICD 120
           SPN S D+ D++ NPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYA+LRSLLP+EYLKGKRSICD
Sbjct: 61  SPNTSADIEDENPNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYAALRSLLPVEYLKGKRSICD 120

Query: 121 HMLEAVKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKKL---SDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNG 180
           HM E VKYI++MQ KIQ L +KRDELKK     + +  + T+ETLNSS RDSV+V P   
Sbjct: 121 HMHETVKYIQHMQTKIQMLRNKRDELKKNIEDGEDSRNITTIETLNSSKRDSVLVMP-RS 180

Query: 181 SRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCR 240
             GV++LLDTAT HRLP+SN+++ L  + L+II+C S+++N+RF+HTIES+    +    
Sbjct: 181 CGGVQILLDTATHHRLPLSNLIKFLITQNLQIISCHSTRKNDRFLHTIESEA---AVDVE 240

Query: 241 SIDVSELQHKLTNLEYFPLD 256
           +ID+SELQ+KLTNLEYFPLD
Sbjct: 241 TIDMSELQNKLTNLEYFPLD 255

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A097IYP0 (BHLH transcription factor OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa5G157230 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 5.0e-76
Identity = 165/260 (63.46%), Postives = 203/260 (78.08%), Query Frame = 0 

Query: 1   MELDCGIEFPFSFDQADELFPLPSLSSFDLPI-PQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRK 60
           M+LDC I+ PF FDQ DELFPLPSLS   L +   PP I+S +NT+ N S+KPK  RRRK
Sbjct: 1   MDLDC-IQSPFPFDQVDELFPLPSLSPIHLSVADHPPLIASINNTNRNISEKPKKGRRRK 60

Query: 61  SPNASDDVVDDD-NPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICD 120
           SPN S D+ D++ NPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYA+LRSLLP+EYLKGKRSICD
Sbjct: 61  SPNTSADIEDENPNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYAALRSLLPVEYLKGKRSICD 120

Query: 121 HMLEAVKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVG---TVETLNSSTRDSVVVRPTNG 180
           HM E VKYI++MQ KIQ L +KRDELKK  +     G   T+ETLNSS RDSV+V P   
Sbjct: 121 HMHETVKYIQHMQTKIQMLRNKRDELKKNIEDGEDSGNITTIETLNSSKRDSVLVMP-RS 180

Query: 181 SRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCR 240
             GV++LLDTAT HRLP+SN+++ L  + L+II+C S+++N+RF+HTIE++    +    
Sbjct: 181 CGGVQILLDTATHHRLPLSNLIKFLITQNLQIISCHSTRKNDRFLHTIETEA---AVDVE 240

Query: 241 SIDVSELQHKLTNLEYFPLD 256
           +ID+SELQ+KLTNLEYFPLD
Sbjct: 241 TIDMSELQNKLTNLEYFPLD 255

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. NCBI nr
Match: XP_038876288.1 (transcription factor bHLH120-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 315.5 bits (807), Expect = 4.3e-82
Identity = 170/250 (68.00%), Postives = 209/250 (83.60%), Query Frame = 0 

Query: 7   IEFPFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPNASDD 66
           +EFPF FDQADELFPLP+LS  DL +PQ   I SK+ T+ N S+KPK +R+RKSPNASDD
Sbjct: 1   MEFPFPFDQADELFPLPALSPIDLSVPQSSLIPSKNKTNKNISEKPKGSRQRKSPNASDD 60

Query: 67  VVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKY 126
            +DD+NP+EHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYA+LRSLLP+EYLKGKRSICDHM E VKY
Sbjct: 61  -IDDENPSEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYATLRSLLPVEYLKGKRSICDHMHETVKY 120

Query: 127 IRYMQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTA 186
           I +MQ+KIQ+L+ KRDELKK  + +  + T+ETLNSS RDSVVV+P +G  G ++LLDTA
Sbjct: 121 IEHMQSKIQKLTKKRDELKKDIEDDSNISTIETLNSSKRDSVVVKPRHG--GFQILLDTA 180

Query: 187 TQHRLPVSNILQALAA-EGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHK 246
           TQHRLP+SN+++ L   + L+I++C S+K N+RF+HTIES+ + N G   +IDVSELQHK
Sbjct: 181 TQHRLPLSNLIKFLITDQRLQIVSCHSTKINDRFLHTIESEALVNIG---TIDVSELQHK 240

Query: 247 LTNLEYFPLD 256
           LTNLEYFPLD
Sbjct: 241 LTNLEYFPLD 244

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. NCBI nr
Match: XP_022958459.1 (transcription factor bHLH118-like [Cucurbita moschata] >KAG6606137.1 Transcription factor basic helix-loop-helix 126, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 1.2e-79
Identity = 167/246 (67.89%), Postives = 201/246 (81.71%), Query Frame = 0 

Query: 10  PFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPNASDDVVD 69
           PFS+D  +ELFPLPSLS  D+P+PQ P IS  DN + + ++KPKN RR+K P  S D + 
Sbjct: 8   PFSYDLGEELFPLPSLSCIDIPVPQFPSISPLDN-NKSGTQKPKNGRRKKPPANSSDDIG 67

Query: 70  DDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRY 129
           D NPNEHKKKKI+HRDVERQRRQ+M++LYA+LRSLLP EYLKGKRSICDHMLEAVKYIR+
Sbjct: 68  DMNPNEHKKKKIMHRDVERQRRQDMASLYATLRSLLPHEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRH 127

Query: 130 MQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQH 189
           MQ++IQ L +KRDELK++SDKNPV   VETL+SS RDSV+VR  N S GV+V+L+TATQH
Sbjct: 128 MQSRIQVLCNKRDELKRVSDKNPVATMVETLDSSKRDSVLVRARNESGGVQVVLNTATQH 187

Query: 190 RLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNL 249
            LPVSNIL+ LA EGLEI++ IS+K N+ FIHTIE Q + +S    SIDVSELQHKL NL
Sbjct: 188 NLPVSNILRDLATEGLEILSYISTKVNDSFIHTIECQTLVDSNHTPSIDVSELQHKLMNL 247

Query: 250 EYFPLD 256
           EYF L+
Sbjct: 248 EYFLLN 252

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. NCBI nr
Match: XP_023522249.1 (transcription factor bHLH118-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023534748.1 transcription factor bHLH118-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 305.4 bits (781), Expect = 4.5e-79
Identity = 165/243 (67.90%), Postives = 199/243 (81.89%), Query Frame = 0 

Query: 10  PFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPNASDDVVD 69
           PFS+D  +ELFPLPSLS  D+P+PQ P IS  DN + + ++KPKN RR+  P  S D + 
Sbjct: 8   PFSYDLGEELFPLPSLSCIDIPVPQFPSISPLDN-NKSGTQKPKNGRRKNPPANSSDDIG 67

Query: 70  DDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRY 129
           D NPNEHKKKKI+HRDVERQRRQ+M++LYA+LRSLLP EYLKGKRSICDHMLEAVKYIR+
Sbjct: 68  DMNPNEHKKKKIMHRDVERQRRQDMASLYATLRSLLPHEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRH 127

Query: 130 MQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQH 189
           MQ++IQ LS+KRDELK++SDKNPV   VETL+SS R+SV+VR  N S GV+V+L+TATQH
Sbjct: 128 MQSRIQDLSNKRDELKRVSDKNPVATMVETLDSSKRESVLVRARNESGGVQVVLNTATQH 187

Query: 190 RLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNL 249
            LPVSNIL+ LA EGLEI++ IS+K N+ FIHTIE Q + +S    SIDVSELQHKL NL
Sbjct: 188 NLPVSNILRDLATEGLEILSYISTKVNDSFIHTIECQTLVDSNHTPSIDVSELQHKLMNL 247

Query: 250 EYF 253
           EYF
Sbjct: 248 EYF 249

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. NCBI nr
Match: XP_022156904.1 (transcription factor bHLH118-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 1.7e-78
Identity = 169/253 (66.80%), Postives = 198/253 (78.26%), Query Frame = 0 

Query: 3   LDCGIEFPFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPN 62
           ++C I+ PFSFD  D+LFPLP LS  D+P+PQ P + S+       + KPKN RRRK P 
Sbjct: 1   MNCRIDSPFSFDVVDDLFPLPPLSCMDIPLPQLPSVVSRPAA----ALKPKNCRRRKPPP 60

Query: 63  ASDDVVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLE 122
            S    D  NPNEHKK+KIIHRDVERQRRQEMSTLYA+LRSLLP EYLKGKRSICDHM E
Sbjct: 61  VSS---DHSNPNEHKKRKIIHRDVERQRRQEMSTLYATLRSLLPFEYLKGKRSICDHMHE 120

Query: 123 AVKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVL 182
            VKYIR+MQ ++Q+LSDKR+ELKKLS ++   GT ETL++S RDSV VRP     GV+V+
Sbjct: 121 TVKYIRHMQRQVQELSDKREELKKLSGEDSDAGTAETLSASKRDSVAVRPR--GEGVQVV 180

Query: 183 LDTATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSEL 242
           LDT TQHRLPVSNIL+AL A GLEI+ CIS+K N+RF+HTIE+ V D  GS R+IDVSEL
Sbjct: 181 LDTGTQHRLPVSNILEALLAVGLEIVGCISTKINDRFLHTIEA-VPD--GSLRNIDVSEL 240

Query: 243 QHKLTNLEYFPLD 256
            HKLTNLEYFPLD
Sbjct: 241 HHKLTNLEYFPLD 241

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. NCBI nr
Match: XP_022995893.1 (transcription factor bHLH118-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 2.9e-78
Identity = 165/246 (67.07%), Postives = 200/246 (81.30%), Query Frame = 0 

Query: 10  PFSFDQADELFPLPSLSSFDLPIPQPPFISSKDNTDNNPSKKPKNARRRKSPNASDDVVD 69
           PFS+D  +ELFPLPSLS  D+P+PQ P IS  D ++ + S+KPKN RR+  P  S D + 
Sbjct: 8   PFSYDLGEELFPLPSLSCIDIPVPQFPSISPLD-SNKSGSQKPKNGRRKNPPANSSDDIG 67

Query: 70  DDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRY 129
           D NPNEHKKKKI+HRDVERQRRQ+M++LYA+LRSLLP EYLKGKRSICDHMLEAVKYIR+
Sbjct: 68  DMNPNEHKKKKIMHRDVERQRRQDMASLYATLRSLLPHEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRH 127

Query: 130 MQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVGTVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQH 189
           MQ++IQ LS+KRDELK++SDKNPV   VETL+SS R+SV+VR  N S  V+V+L+TATQH
Sbjct: 128 MQSRIQDLSNKRDELKRVSDKNPVATMVETLDSSKRESVLVRARNESGEVQVVLNTATQH 187

Query: 190 RLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNL 249
            LPVSNIL+ LA EGLEI++ IS+K N+ FIHTIE Q + +S    SIDVSELQHKL NL
Sbjct: 188 NLPVSNILRDLATEGLEILSYISTKVNDSFIHTIECQTLVDSNHTPSIDVSELQHKLINL 247

Query: 250 EYFPLD 256
           EYF L+
Sbjct: 248 EYFLLN 252

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. TAIR 10
Match: AT4G25410.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein )

HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 7.2e-27
Identity = 75/182 (41.21%), Postives = 120/182 (65.93%), Query Frame = 0 

Query: 70  DDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRY 129
           DDN    KKKK++HRD+ERQRRQEM+TL+A+LR+ LPL+Y+KGKR++ DH+  AV +I+ 
Sbjct: 37  DDN---KKKKKLLHRDIERQRRQEMATLFATLRTHLPLKYIKGKRAVSDHVNGAVNFIKD 96

Query: 130 MQNKIQQLSDKRDELKKLSDK----NPVVG-TVETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLD 189
            + +I++LS +RDEL + + +    NP  G T   +  S   +V+V+P      V V  +
Sbjct: 97  TEARIKELSARRDELSRETGQGYKSNPDPGKTGSDVGKSEPATVMVQPHVSGLEVVVSSN 156

Query: 190 TATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQH 247
           ++    LP+S +L+ +  +GLE+++  +++ N+R +HTI+ +V  NS  C  ID+  LQ 
Sbjct: 157 SSGPEALPLSKVLETIQEKGLEVMSSFTTRVNDRLMHTIQVEV--NSFGC--IDLLWLQQ 211

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. TAIR 10
Match: AT5G51790.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein )

HSP 1 Score: 115.5 bits (288), Expect = 6.1e-26
Identity = 78/203 (38.42%), Postives = 122/203 (60.10%), Query Frame = 0 

Query: 47  NPSKKPKNARRRKSPNASDDVVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLP 106
           NPS  PK  R +         +  +     K+KK++HR++ERQRRQEM+ L+ASLRS LP
Sbjct: 2   NPSNNPKKTRHQSH-------MPQERDETKKEKKLLHRNIERQRRQEMAILFASLRSQLP 61

Query: 107 LEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKK-LSDKNPVVGTVETLNSSTR 166
           L+Y+KGKR++ DH+  AV +I+  Q +I+ LS +RDELK+ + D   + G+     SS  
Sbjct: 62  LKYIKGKRAMSDHVNGAVSFIKDTQTRIKDLSARRDELKREIGDPTSLTGSGSGSGSSRS 121

Query: 167 D--SVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTI 226
           +  SV+V+P      V V    +     P+S +L+ L  +GLE+I+ ++++ N R ++TI
Sbjct: 122 EPASVMVQPCVSGFEVVVSSLASGLEAWPLSRVLEVLHGQGLEVISSLTARVNERLMYTI 181

Query: 227 ESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKL 247
           + +V  NS  C   D++ LQ KL
Sbjct: 182 QVEV--NSFDC--FDLAWLQQKL 193

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. TAIR 10
Match: AT5G51780.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein )

HSP 1 Score: 110.5 bits (275), Expect = 2.0e-24
Identity = 75/181 (41.44%), Postives = 118/181 (65.19%), Query Frame = 0 

Query: 79  KKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRYMQNKIQQLS 138
           +K++HR+ ERQRRQEM++LYASLRSLLPL ++KGKRS  D + EAV YI+Y+Q KI++LS
Sbjct: 2   EKMMHRETERQRRQEMASLYASLRSLLPLHFIKGKRSTSDQVNEAVNYIKYLQRKIKELS 61

Query: 139 DKRDELKKLSDKNPVVGT--------VETLNSSTRDSVVVRPTNGSRGVRVLLDTATQHR 198
            +RD+L  LS +  ++G+        VE +  S ++ VVVR      GV ++L +     
Sbjct: 62  VRRDDLMVLS-RGSLLGSSNGDFKEDVEMI--SGKNHVVVRQC--LVGVEIMLSSRCCGG 121

Query: 199 LP-VSNILQALAAEGLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGSCRSIDVSELQHKLTNL 251
            P  S++LQ L+  GL ++  ISS  ++R ++TI+++V D       ID++EL+ +L  +
Sbjct: 122 QPRFSSVLQVLSEYGLCLLNSISSIVDDRLVYTIQAEVND---MALMIDLAELEKRLIRM 174

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. TAIR 10
Match: AT1G12540.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein )

HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 3.3e-24
Identity = 76/196 (38.78%), Postives = 118/196 (60.20%), Query Frame = 0 

Query: 64  SDDVVDDDNPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEA 123
           S+ +  DD P   K K+  H+++ERQRRQE ++L+  LR LLP +Y+KGKRS  DH+LEA
Sbjct: 63  SEIMKGDDEP---KNKRAKHKELERQRRQENTSLFKILRYLLPSQYIKGKRSSADHVLEA 122

Query: 124 VKYIRYMQNKIQQLSDKRDELKKLSDKNPVVG--TVETLNSS-------TRDSVVVRPTN 183
           V YI+ +Q KI+++S+KRD +K+        G  ++ +L SS       T  +VVVRP  
Sbjct: 123 VNYIKDLQKKIKEVSEKRDRIKRSITHPSSRGEFSIRSLASSTCSCVGDTNIAVVVRPC- 182

Query: 184 GSRGVRVLLDTATQHRLPVSNILQALAAEG-LEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSGS 243
              G+ +++    +H   +S++LQ LA E    I++CIS++ +  FIHTI S+V +    
Sbjct: 183 -LIGLEIVVSCCNRHESCLSSVLQLLAQEQCFNIVSCISTRLHQGFIHTIASEVEEGI-- 242

Query: 244 CRSIDVSELQHKLTNL 250
              +  SELQ K+  +
Sbjct: 243 --EVYFSELQEKIIKI 249

[Close]
BLAST of Lcy02g014510 vs. TAIR 10
Match: AT1G62975.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein )

HSP 1 Score: 108.6 bits (270), Expect = 7.4e-24
Identity = 69/197 (35.03%), Postives = 118/197 (59.90%), Query Frame = 0 

Query: 72  NPNEHKKKKIIHRDVERQRRQEMSTLYASLRSLLPLEYLKGKRSICDHMLEAVKYIRYMQ 131
           N ++ + KK+ HRD+ERQRRQE+S+L+  LR+LLP +Y++GKRS  DH+++AV YI+ +Q
Sbjct: 67  NDDDRESKKMKHRDIERQRRQEVSSLFKRLRTLLPFQYIQGKRSTSDHIVQAVNYIKDLQ 126

Query: 132 NKIQQLSDKRDELKK-LSDKNPVVGTVETLNSSTRDS----------------VVVRPTN 191
            KI++L++KR+ +KK +S        +E   SS   S                + V  T 
Sbjct: 127 IKIKELNEKRNRVKKVISATTTTHSAIEECTSSLSSSAASTLSSSCSCVGDKHITVVVTP 186

Query: 192 GSRGVRVLLDTAT-QHRLPVSNILQALAAE-GLEIITCISSKQNNRFIHTIESQVVDNSG 250
              GV +++     +++  +S++LQ LA E    +++C+S+++  RF+HTI SQV D   
Sbjct: 187 CLVGVEIIISCCLGRNKSCLSSVLQMLAQEQRFSVVSCLSARRQQRFMHTIVSQVEDG-- 246

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9STJ61.0e-2541.21Transcription factor bHLH126 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH126 PE=2 SV=... [more]
Q9FLI08.6e-2538.42Transcription factor bHLH120 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH120 PE=2 SV=... [more]
Q9FLI12.8e-2341.44Transcription factor bHLH36 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH36 PE=2 SV=1[more]
Q9LN954.7e-2338.78Transcription factor bHLH55 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH55 PE=2 SV=1[more]
Q9STJ71.0e-2239.05Transcription factor bHLH118 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH118 PE=2 SV=... [more]
BLAST of Lcy02g014510 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1H5585.7e-8067.89transcription factor bHLH118-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459679 ... [more]
A0A6J1DUZ38.2e-7966.80transcription factor bHLH118-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023734... [more]
A0A6J1K9B61.4e-7867.07transcription factor bHLH118-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491282 PE... [more]
A0A0A0KMQ42.9e-7663.46BHLH domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G157230 PE=4 S... [more]
A0A097IYP05.0e-7663.46BHLH transcription factor OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa5G157230 PE=2 SV=1[more]
BLAST of Lcy02g014510 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038876288.14.3e-8268.00transcription factor bHLH120-like [Benincasa hispida][more]
XP_022958459.11.2e-7967.89transcription factor bHLH118-like [Cucurbita moschata] >KAG6606137.1 Transcripti... [more]
XP_023522249.14.5e-7967.90transcription factor bHLH118-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023534748.1 t... [more]
XP_022156904.11.7e-7866.80transcription factor bHLH118-like [Momordica charantia][more]
XP_022995893.12.9e-7867.07transcription factor bHLH118-like [Cucurbita maxima][more]
BLAST of Lcy02g014510 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT4G25410.17.2e-2741.21basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [more]
AT5G51790.16.1e-2638.42basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [more]
AT5G51780.12.0e-2441.44basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [more]
AT1G12540.13.3e-2438.78basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [more]
AT1G62975.17.4e-2435.03basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 127..150
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 25..86
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 58..86
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR13935:SF110HELIX-LOOP-HELIX DNA-BINDING SUPERFAMILY PROTEIN, PUTATIVE-RELATEDcoord: 41..249
NoneNo IPR availableCDDcd18914bHLH_AtORG2_likecoord: 79..151
e-value: 2.22529E-29
score: 103.922
IPR011598Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domainSMARTSM00353finuluscoord: 84..136
e-value: 3.9E-5
score: 33.1
IPR011598Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domainPFAMPF00010HLHcoord: 80..131
e-value: 5.8E-9
score: 35.8
IPR011598Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domainPROSITEPS50888BHLHcoord: 78..130
score: 12.912575
IPR036638Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamilyGENE3D4.10.280.10coord: 69..154
e-value: 1.1E-12
score: 49.7
IPR036638Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamilySUPERFAMILY47459HLH, helix-loop-helix DNA-binding domaincoord: 77..146
IPR015660Achaete-scute transcription factor-relatedPANTHERPTHR13935ACHAETE-SCUTE TRANSCRIPTION FACTOR-RELATEDcoord: 41..249

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy02g014510.1Lcy02g014510.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:2000112 regulation of cellular macromolecule biosynthetic process
biological_process GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular_component GO:0090575 RNA polymerase II transcription regulator complex
molecular_function GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity
molecular_function GO:0000977 RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
molecular_function GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity