Lcy02g001710 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGTATGAACTAAGAGAAACTTATTCTTTCCTAGAAAACACCATTACAAGAGAAGAAAAAGCATGCTTTGATTATTGGTTTGTTTGTATTAGAAATAACTCAAATCGAATTTTCAGGACAGAGTGAAGCCAAGAAGCATTGACTTGGATCCTTGTTGCATGTGAAGGAGGATGAGATACAAGTTCAATCATTGTCATATTCTTGGACCTTGCTTGTTAGACCATGATAACCTGGTTTTTTGTTTTTAGTTTTTGAAAATTATGCTTGTGATTTTCATCTTTTGAATGACACATTTGAATTTTTAGTCGAGATCCAAAAACAAAAACGAGTTTTTGGTTTTTTAAAACATGGGAAGAAGGTAGATAACAAAACAAATAAACTTATAGGTGGAGATAGTGTTTCTAAACTTAAATTTCAAAAACCAAATGGTTATCAAACGGGGTCTTAAAATTTTCAATTTTTACTTGACGAAGGGTTAAGCGTTCATGGCTGATCAAATTTTCTCTTAAGCAATCTTCAATATCAAGAGCCAATCCAGACACGATGGCATGTCCAAATTATGAAGCATCCAAGGGAATGTCTTTTTTTTTTTGAGAAGAGAAACGAATTTCATTGATGAATGAAATGTGGAGAAGAACTCCGGTCACCAAAGGGTGAATTACATAAAAGCTTTCCAATTGGAAATCAAAAAGGATAAACTATAATCAGAGAAGGGGTGTTTACATTTACACCAATACAAAGCATGAAAGAGAATTAGATCCATAAATTTATGAAAGGAAGAGAAAGAATCTCTGAAAATTCTAGAATTTCGTTCGCCCCATAAAAACCAAAAGAAGACTCTGTTCAAGGCAAGCCACAAAATCTTCTTTTCTCCATGAAAGGGATGATCCACAAAAATGAGATTAAGAACATCGTTAATGCAATTTGGAAAAACGGTGGACCATCCAAAAGCATCAAGAATCTCTGACCAATATCTGGATGCAAAGGTACAATGAACAAATAAATGCCCAGGATATTCTGAGCTAGCAGCACACATTATGCACCAAGATGGAGACAAGTGAAAATGAGGCATCCGTCGTTGAAGTCGATCAACTGTATTAATAGCACCATGACTAAGCTCCCATAGAAAAATCTTGATCTTCTTTGGATAGAAATCTGTCCAAATGGCCTTATATAGATCATTTGCCATATTCGAATAGTCTACTAAATCTTCCATGAGAGATTTAACAGAAAAAATATTGGACGATTCCAAAGGCCATATCCAGGAATCATTACGGTTCTGTAAGCTGATGGAGGAAAGAATAAGTGATAAATCCATCCATTCCTCTGTCTCTACATCATTTAAATTACGCCGAAGACTCAGATCCCATGCTGTTTGATAAGCAATCCATGTTTCACCAACCAAACTCCTTGGACGATCTGTCAAACGATAAAGACGAGGAAAATTTGTAGCCAGAACACCGCAATTTAACCACGAATCATGCCAGAATGAAGTAGCAAGACCGTTACCCAACCTTCTTTTAACACGTGAAGATACAAGGTCAATAGTAGACGTAATGAATCGCCAAGGAGATTTGTGAGAACTTTTCTGAATAATGGTAGGCCAGAGGTTAGGCAAGCCATAGTTATAATATTTAGCTACAATCAGCTTGTGCCATAGTGCGTTTTCCTCATGTAAAAATCTCCAAATCCACTTTGCAAGAAGAGCAAGATTGCGATTTTTTAAGTTACCAATACCAATACCCCCCATCAAATGTGGGAGTTGTACTGTTGCCCAATTAATATTGTGCATACCACCATCACCTCTAGATCCTTCCCAAAAAAAATCACGAAATAGCTTATCAAGAGTTTTTGCAACCTTTCCTGGCAATTTGAATAAGGATAAATAATAAATTGGCATACAGGAGAGAACTGCTTGAGTAAGAGTATGTCGACCACCTTTCGAAATATATGAATATTTCCAACTATGAAGTTTATGTTGGATTCTTTCAATCACAGGCTGCCAAAAAGGAATAGTTTTAGGACTGCCTCCCAAAGGTAAACCAAGGTAAGTGGAAGGCCAAATTCCTTGTTTACAGCCAAACGTAGTTGTCAACCATTCCATTTCTGACTCCTCTAAGTGAATTCCCAAAACTTCACTCTTGGAATAGTTAACATTCAATCCAGAAGCTAGCTCAAAAATTTTAACAATATCGAACATGTTAGCCAAAGCATCCTTACGAAAGATGGAGAATAATAAAGTATCATCAGCAAATTGTAAATGATTCACATAAAGATGTGAATTTCCAATCGGATGCGAGACAATTCGACCCATATTAGCGCTGTGTGATAATAAACGACTTAGGCAATCAGATACCAAGATAAAAAGAAAGGGGGAAAGAGGATCCCCTTGACGAATTCCTCGAGAGGGAATGATCTTGCCTCGTGGTTTTCCATTAATAATGATAGAGTAGTTAACACTAGAAAGACATCCATAAATCCATTTCCTCCATACCAAGCCAAAACCCTTGGCCTGAAGAATTGCATCTAGAAAATCCCAATCGACTTTATCAAAAGCCTTTTCAAGATCTAACTTAATCACCACACCTTTCTTATGAGATAAATTCCAATCATCAATCAGCTCATTTGCTATAAGCGAAGCATCGAGAATTTGTCTGTTAGCCACAAAGGCCATTTGATTCTCCGCAATAGTGGATGGCAAAACCATTTTCAACCGATTGGACAAAACTCTAGCTATAATCTTGTATGCACATGGGATTAGACTAATCGGTCGGAAGTCTGATACTGATTTAGAGTCTAATTTCTTTGGAATAAGGCAGATATAAGTTTCATTCAAAGATACATTGATAATACCTGTATTATAGAAATCCTCCATCATAGTCATAATATCACGTTTGATGGTATGCCAAGAAAATTTGAAGAATTCAGCTGTAAAACCATCTGGACCTGGAGATTTACTCGAACCTAAAGATTTAACTGCTTGATAGACCTCATCTTCAGAAAAAACCGCCTCCAATCCTGTCGATTGTGAATCACTAATTGGACACCAATCAACATTAGTTGGTAGAAATCTAGTGCCACGGTCCTTTGTAAACAAAGTTTGATAAAAACCAAGGAACTCCGCTTCTATATCATTATCTGTAAAGAGGCTATTGCCTTCTCTAGACAAGATCTCTGAGATGGAATTCTTTCTTTTAGGGGCAGCCATAATTCTATGGAAAAATTTTGTATTTTCATCACCTTCTTTTAACCAGTTCAGTTTACAGCGTTGGTGCCAATAAATGTGTTCTTGGGCTGATAAATCCTCAATTTGTTCTCGCAATAATCTTCTCGAAGATATTTGTTCCATAGATAATGGAACCCTGTCCTCTGTATCATCCAACAATTTCAATTGTGTAACAAGAGATGGAAGTTGAGCAGCAGATGATCGCTGAGATAAATTCCATTTTCTGAGCTCAGATTTCAACCCTTTAAGTTTCATCATAAACCCATGGCCTGGCCAACCCTGAACAGTGTTTTCAGACCACCAATTATCCATAAGACCACGAAAAGAGTCTATTTTCAGCCAAGCATTCTCGAATCTAAAGGGACAAGGGCCCCAAGAGAGATCCCCAAATGATAGAGTACATGGGTAATGGTCAGATGTAACCCTATCAAGACGAAGAAAACGAGCTGCACCAAATTTATTGAGACAGGTATCCGTCATTAAGAATCGATCAATCAATGAGCAATAATGATTTTCACCACAACTGGACCACGTGTAGCATCCATTCTGTAAAGGAGTGTCTATGAGATGGTAATCATCGATCCATTGGTTGAAAATACGCATACTCCTAGTCACGGGCCGGCCATGCGATTTTTCCCATGACCAGCGGGTGACATTAAAATCTCCTCCAAGGATCCAATTGTTACCACCTAAACCAGCCAAGTCGTGAAGTTCATTCCAAAAGTCCGATCTGTCAGCATGCCTAGAGGGGCCATAAATAGCCGATAGCCAAAAAGAGAAGTTATCAGCCATAAAGATATGAATAGAGAGAGTGAAAAGACCTTGAATAGTCTCCTTTACTGAAAATTCTGGTTCACTCCACATAATAAGAATGCCTCCAGAGGCACCCACAAATTCAAGAGAAGTCCAACCAATATGAGAAGAGCTCCATAGGGATTTAATAATCCTACTACAAATCTGAGATTTTTTAGTCTCCTGAATAAGAACAATGCCCGGGTTTTGCTGCTGAATAGTTTTCTTAATTAAAGCCCTTTTCTTCCATGAACCCAAACCACGCACATTCCATGTCAAAAATTTCATATAACATTCTCGGCCCCCTCCATTAACGCCAAAGTGGCTGCTTTATCATAATTGATATTAGATTGAAGATTTCGTACCTCCCTTTGTAGTTTAGGTTTCTTGCCTGTAGTTGCCAATTTTTTCCTTTTACTTGACTTTGGTACTGTTGGTAGAGCCATAATACAAAGGCCATGTTTACTTAAGATCGGGGCTAAATGTTGAAGGCAATTGGGAAATGTGTTCGGTGTTGGAGACTTCATATTTGGTACTGGAGAAAGCCGTGGGGAATGGTAGGGTAGGATTTGTGGAGGTTCCAATGGATTTGGAGAGGAGGTATTATGGGTAGGATTCTGTTGCAGTGGGGGCATGATGTCTATCGGGGATGGAGAGTTCTGGTACGGTTGGCTCGGATCAATTGGGCCTTCAATTAGTGGATCATTAAAGATGGTGAGGTCCAACGGTCGAGGAGATGTTGGGTCTTGAGTTGAGTTGTGGGCCGTAGGGTTTGTAGATGGGCTGGAGAGAAAAGCTTTAGTGTCGGATCCAACGTTCAATTCATTCCTTGATGTAGATCCAATGTGGCCGAATTTAAGAATTGTGGGCCCAGGCAGTTGACTAACCGATGAATCAGAAGGAGGCGGTGGGAGATAATTCTTTCCTTTGTCGATTTTATCAGATAAAAGCGGTGCACTGGAGGTGATAAAAT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MNRQLVIVTHIAQSPLCATEKPQPYSIKPPNLYISIPSLPFQSYHFRAQQSFRQDMLLQMAFSGPSLLPPCSAYRLNPLILTKQRRAFGLSRFHFRRPQLRLLAVAASANGVFTSPEIAKTFDFTSEERIYRWWESQGYFKPQFDQDSVPFVISMPPPNVTGSLHMGHAMFVTLEDIMVRYNRMKGRPTLWLPGTDHAGIATQLVVERMLASEGIKRVELGRDEFTKRVWEWKEKYGGTITNQIKRLGASCDWTREHFTLDDQLSRAVVEAFVRLHERGLIYQGSYMVNWSPNLQTAVSDLEVEYSEESGTLYHIKYRVAGGSRSDYLTVATTRPETLFGDVAIAVHPQDERYSKYVGMMAIVPMTYGRHVPIISDKNVDKDFGTGVLKISPGHDHNDYLLARKLGLPILNVMNKDGTLNKVAGLYCGLDRFEARKKLWADLEETGLAVKKEAHTLRVPRSQRGGEIIEPLVSKQWFVTMEPLAEKALRAVERGDLTIIPERFEKIYNHWLSNIKDWCISRQLWWGHRIPVWYIVGKNPEEDYIVARNADEALEQARKKYGKDVEIYQDPDVLDTWFSSALWPFSTLGWPDETAEDFKRFYPTTMLETGHDILFFWVARMVMLGIEFTGTVPFSYIYLHGLIRDSQGRKMSKTLGNVIDPLDTIKEFGTDALRFTLALGTAGQDLNLSTERLTSNKAFTNKLWNAGKFILQNLPSQNDSQSWESIRSFEFEKEDCLLKLPLPECWIVSELHSLIDMVTTSYDKFFFGDVGRDVYNFFWGDFADWYIEASKARLYQSGGDSVALAQAVLLYVFENILKLLHPFMPFVTEELWQALPHRKEALIISPWPQISLPKQASAVKKFENLKLLTKVIRNARAEYSVEPAKRISASIVASEEVNQYISEEKEVLALLTRLDLHNVYFANSPPGNVDQSVHLVAGEGLEAYLPLADMVDISAELQRLSKRLTKMKTEYDGFIARLNSPSFVEKAPEDIVRGVREKAEEAKEKIALTEKRLSLLRSTVPVPDY Homology
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4KE63 (Valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EMB2247 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1586.2 bits (4106), Expect = 0.0e+00 Identity = 769/970 (79.28%), Postives = 866/970 (89.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RBN5 (Valine--tRNA ligase OS=Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis (strain DSM 15242 / JCM 11007 / NBRC 100824 / MB4) OX=273068 GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 1.4e-238 Identity = 410/906 (45.25%), Postives = 595/906 (65.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3AF87 (Valine--tRNA ligase OS=Carboxydothermus hydrogenoformans (strain ATCC BAA-161 / DSM 6008 / Z-2901) OX=246194 GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 1.4e-238 Identity = 422/894 (47.20%), Postives = 581/894 (64.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q72ZW8 (Valine--tRNA ligase OS=Bacillus cereus (strain ATCC 10987 / NRS 248) OX=222523 GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 809.7 bits (2090), Expect = 3.8e-233 Identity = 416/914 (45.51%), Postives = 571/914 (62.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9X2D7 (Valine--tRNA ligase OS=Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) OX=243274 GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 809.3 bits (2089), Expect = 5.0e-233 Identity = 416/889 (46.79%), Postives = 573/889 (64.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZ88 (Valyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482028 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1901.7 bits (4925), Expect = 0.0e+00 Identity = 933/968 (96.38%), Postives = 950/968 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F580 (Valyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442245 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1899.8 bits (4920), Expect = 0.0e+00 Identity = 932/968 (96.28%), Postives = 949/968 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4H7 (Valyl-tRNA synthetase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496791 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1862.0 bits (4822), Expect = 0.0e+00 Identity = 914/968 (94.42%), Postives = 939/968 (97.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQF3 (Valyl-tRNA synthetase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013225 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1847.8 bits (4785), Expect = 0.0e+00 Identity = 909/968 (93.90%), Postives = 934/968 (96.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C571 (Valyl-tRNA synthetase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496791 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1787.3 bits (4628), Expect = 0.0e+00 Identity = 881/968 (91.01%), Postives = 906/968 (93.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. NCBI nr
Match: KAG6581186.1 (Valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1907.9 bits (4941), Expect = 0.0e+00 Identity = 936/968 (96.69%), Postives = 952/968 (98.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. NCBI nr
Match: XP_023528105.1 (LOW QUALITY PROTEIN: valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1905.2 bits (4934), Expect = 0.0e+00 Identity = 934/968 (96.49%), Postives = 951/968 (98.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. NCBI nr
Match: XP_022983417.1 (valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1901.7 bits (4925), Expect = 0.0e+00 Identity = 933/968 (96.38%), Postives = 950/968 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. NCBI nr
Match: XP_022935322.1 (valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1899.8 bits (4920), Expect = 0.0e+00 Identity = 932/968 (96.28%), Postives = 949/968 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. NCBI nr
Match: KAG7017926.1 (Valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1897.1 bits (4913), Expect = 0.0e+00 Identity = 936/987 (94.83%), Postives = 953/987 (96.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. TAIR 10
Match: AT5G16715.1 (ATP binding;valine-tRNA ligases;aminoacyl-tRNA ligases;nucleotide binding;ATP binding;aminoacyl-tRNA ligases ) HSP 1 Score: 1586.2 bits (4106), Expect = 0.0e+00 Identity = 769/970 (79.28%), Postives = 866/970 (89.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. TAIR 10
Match: AT1G14610.1 (valyl-tRNA synthetase / valine--tRNA ligase (VALRS) ) HSP 1 Score: 642.9 bits (1657), Expect = 4.4e-184 Identity = 385/987 (39.01%), Postives = 545/987 (55.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. TAIR 10
Match: AT5G49030.1 (tRNA synthetase class I (I, L, M and V) family protein ) HSP 1 Score: 238.0 bits (606), Expect = 3.3e-62 Identity = 200/811 (24.66%), Postives = 349/811 (43.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. TAIR 10
Match: AT5G49030.2 (tRNA synthetase class I (I, L, M and V) family protein ) HSP 1 Score: 238.0 bits (606), Expect = 3.3e-62 Identity = 200/811 (24.66%), Postives = 349/811 (43.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g001710 vs. TAIR 10
Match: AT5G49030.3 (tRNA synthetase class I (I, L, M and V) family protein ) HSP 1 Score: 238.0 bits (606), Expect = 3.3e-62 Identity = 200/811 (24.66%), Postives = 349/811 (43.03%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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