Lcy01g018770 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy01g018770
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr01: 40285562 .. 40289388 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy01g018770
SyntenyLcy01g018770
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACGAGGTATGGCTTGTGGTATGAACTTGTTTCTTGCTTGCCCATGGAGGGCTTGGGATGCACAAATGCACATTTTTACAATGTCAGACACTGTGACTAACGTCGAGACGCTGTCAGTGATCCATATTATATCAAATATTCATTCAGGAATTTTAATTTGCACTTTTAATTTATGCTAATTTACTCACTAGTTTTAATTGTATATAAAAAAATAAGGTAAAAATCTCTAAATGTTTCAATAAAATCAAGTTTTATACAAAAGTTTAGCTTAATCAATGTACAAAATTGACCATGGAATAACTTTACCAAAACTCGTAACTTGTTTTTAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAGAAAAACAAACTATAGTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTAAAATTCTATGAATTTCATATATACCAATTTATAATTCATTAAACACACATAAGAATACTTTTTTAAATGATCCTTCAAATGAAAAATAATTAGAAGTTAAAAATTACAATATTTTGTCAAGTTTAAGGTAAAGTACACAACACTTTACCTAAGTTTAAGGTGAAATTTAATGTTAGGATAGAAATTGATATAACCCAACTTTTATGGGTAACAAATATGTTCTCACATGAATCATATAGTCCAAAGACACAACTTGATCAAGTTAGAATTCACATTTGCTAAATATAGCATATATAACATATATACTAACTTGTCATTGATGAATACAAACATAGTTTGCATCGATAAGAATTTAACCACCTTATTCAAAAGATCCATAATTTTGTTAGGCTATTGGCCAACTTGAATGGTGCAACCAAAAGCTCATAGTACCTGGACTACCTTGAAACCAATATTTGTATATACATTTCTCAGGTATTGGTGATATCATCATCGCAGTACAATTTTAGAATAGATTGAAACATCCTTATATAATATCTTCCTTTTTCCAACAACTAATATAATATATCCCATGATAAGGCACTTAATCTAAGGTATTCTGTTTAACGCTTGCACAGACTAAGAGCCACATACAATCTTTCATGGTTCTCTAAACCTCTTTATTTTTAACATTCTCCTTTTTTACTCTCATAACTCTTTTTCTACTTGCTTTCCATTCATTCTATTTCGTTATTAAGACGGGAGTCTGGAGCTTACCTTTGACCTTCCATTCTCTTTGCACTTAGTAATCTTATATTTGTTCCATTGATAGTGACACGCTTAAAAGGTCTCATGCATATCTTTTAATACTTCAAAATGTTATTGATCTTGGTACTAACTTTAAAAACTCATTTTGCATTACATTTCTATATGACCACAAAAAATATTCTCTATAGAAGACTTTCTTGGAGTTTGCTTAATCTCTTAATTCAAGGAATTAAATACTCTAAATACCCTACTCTCTCCTGCCTTTTCTAACTAACAACATTCCTAGGTCCCACACAACCAAAATCATAATTCAAAATCAAGTCATTTCTAAACTAATTAACAAATACTTGAAACTGTCTAGCATAATTTTGAATTATTTCCAATAGGCCAATATCATAAATTCTTCAAGATTCCATACTTCATAAACTCAATTAATCATGGAGTATGTCATCAGAGATAAAATCATATGTAAATATAAATCTCCTTAAATTCTATATGATACTAAATCATACATTGCTTTCAATAATAAACAATTTACAGAATAAGTGCTAATTCTTTGAAATCTCAAATACCCAAATTATTTGCATGAATATAATCATAATTGATTTCAAAGTTTCACAAATTTCATCAAATATTAAAATAATATAAATATTTGTAAAAATTAACCACTCACAAAACTATTAACGAGAGACTCCTAATCATGAGCCATCCTAATCTCCGGTCCACCTGAAGTAATAAGAACTCTTGAATCACCCATTAAAGTTTTTTTTATTTTTTTTGAAGAGAACCGATTAAAGTATAAATTACTTATTTTGAAACCAAATCTTAATGTCCATCTCTATCATTGACCATGGCTTTCCTAGGGTTTAAGCTTTAAGTCCACCATGTCTTTATTTCATTATTCTCTTCTCCAATGACTTCTCTTTGGTACTTTAATGTACTTTTATAATAAAATAGTCCATCATCAATTTCCTTCCATTTCTTAGCTATTTACACTACAAAAGGTAAAGTCAAGACCGTCAAAGTGAACATAACTCAGTAGTAATTGACTTGTATCCTCGTTCAAAAGATCAGAGGTTCGAATTGACCAAAAAGTCTGACCTTTTAACACTATACAAAAACTTCCTCACCTTCTAATATATCTTATTTTTTCACTATTCATATTCATCATCCACTTAAATTCACAAAACATTTCTTTCATTCTAGTCCTTTTATTTCTTTCTCTTCTAGTTTTTTCCACCCAACAATAATTAAAACCACAACATCAACAGGTTCTTGCTAAAAGGGAGTTAAAAATCCATATCAAACTGTCTAAAACTGCTATATATTTTTCCTAATCCTTCAACTTTTGACAAAAAAAAATTGCTTACCCGGCTCGAATCTTTATCCTTCCGACGTTAGCCACGGCTTTTAAAAGATGTTTGATCCGTCCGAAACTATACACACAAGGGTTTCTAAGGATAGAGCTAAACTATAAAACACTTATAAGCGAATACGAAAAGATCATTTTAGAGCAAGCCGGCCGTTACCCATTGATCAAAAGCTAAAATCTTTGTTGGTTTGTGTTGTAACGAACAGATCTGACCTCTTTGAACTATGGGTGTTCAGATCTGGAATCGTTCGAATTGTGGGTTCCAAAACTGAACAGATCCAACTGGTTTGCGACTGGTCGTTTTTACTGTCTAGGTTGCAACCTGGGGGTCGTTTGTTCGTGTTCGAACATCGTCTGCAAGGAGGCGCGCCGTCGTGGAGTTTGCTGGAGAAAAGGGTCGTTACAGAGATCTGTGTGCGCGTGGGGTTCGCCGGCGACGAGAGAGCGCCGCCGTTGGCTCCTCGTGAATCGCCGAGAAGAAGAAGCAAGAGGAAGGAGGTGGTTGATGGGTGCTCACGAGAGGGAGAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAAATTGAGTTCTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCCCTTTCTTTTCTCTTTTTTTCCTTTTTCTTTTTCCCTTTCTCTCTCCAGACCACGGCTTTCATCTCTTAAAAACAATTCTTTTTCTCTTTCTTTCGTTTGTGTGGCTTCCATGAAGCCACGTCAAAAAAAAAAAAATAATCTACTTCCTTTTTTCTTTTTCATCTTTTTTCAAAATATGCCAAAGTCCCTCTTTTAAAAAAACAAAAAATACTATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAATACTACAAACGGAATATTATTGATAACATTCAAAGGAATGCCACGTTGAATGATATTCCTGTCGAGAAAGATTGAGCGGGGCCCACAAAAATCCACGTGGCTGACAATGATCAGAGCGTTAAAAGTGACAGTGTTGAATATTATTGATTCGTGATTTGAATTAATTAATGCTGGTTTAGCGAGTACTGGACACGTGGTTTAAATCGTTGTTGAATGTTGCGCGTCAAAATGGCTTGGTGTTTTGGACTACGTGTTCACTTGGGCCTTGGGCTTGTAGTGGTTATATTCGAGGTTGAGCCTTGGGCCTAAGATTAGGCTTCTTTGGTTATCTTTCAAAACAAGCCCAGTCCATCTTAGTGCTCTCTTTCCTCTCTTTGTCTGTCTCTCGCAGTTGATTTTGGATTTTTCTTGCAAACTTTATTTGAATACATTTTCAGATGATTGCTTGGCTGCTCTAAGTCAAGTCCCCTTATGGTTATGGCAATAG

mRNA sequence

ATGACGAGATCTGACCTCTTTGAACTATGGGTGTTCAGATCTGGAATCGTTCGAATTGTGGGTTCCAAAACTGAACAGATCCAACTGGTTTGCGACTGGTCGTTTTTACTGTCTAGGTTGCAACCTGGGGGTCGTTTGTTCGTGTTCGAACATCGTCTGCAAGGAGGCGCGCCGTCGTGGAGTTTGCTGGAGAAAAGGGTCGTTACAGAGATCTGTGTGCGCGTGGGGTTCGCCGGCGACGAGAGAGCGCCGCCGTTGGCTCCTCGTGAATCGCCGAGAAGAAGAAGCAAGAGGAAGGAGTTGATTTTGGATTTTTCTTGCAAACTTTATTTGAATACATTTTCAGATGATTGCTTGGCTGCTCTAAGTCAAGTCCCCTTATGGTTATGGCAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGACGAGATCTGACCTCTTTGAACTATGGGTGTTCAGATCTGGAATCGTTCGAATTGTGGGTTCCAAAACTGAACAGATCCAACTGGTTTGCGACTGGTCGTTTTTACTGTCTAGGTTGCAACCTGGGGGTCGTTTGTTCGTGTTCGAACATCGTCTGCAAGGAGGCGCGCCGTCGTGGAGTTTGCTGGAGAAAAGGGTCGTTACAGAGATCTGTGTGCGCGTGGGGTTCGCCGGCGACGAGAGAGCGCCGCCGTTGGCTCCTCGTGAATCGCCGAGAAGAAGAAGCAAGAGGAAGGAGTTGATTTTGGATTTTTCTTGCAAACTTTATTTGAATACATTTTCAGATGATTGCTTGGCTGCTCTAAGTCAAGTCCCCTTATGGTTATGGCAATAG

Protein sequence

MTRSDLFELWVFRSGIVRIVGSKTEQIQLVCDWSFLLSRLQPGGRLFVFEHRLQGGAPSWSLLEKRVVTEICVRVGFAGDERAPPLAPRESPRRRSKRKELILDFSCKLYLNTFSDDCLAALSQVPLWLWQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lcy01g018770 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy01g018770 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy01g018770 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lcy01g018770 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy01g018770.1Lcy01g018770.1mRNA