Lcy01g005030 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGGGTGTAGAAGAAACATTGTGACTGAATCTGCAACAAAACCCGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAAAGAGAGAAGAAACCACCAAAATCACATCTCATTTCTCCACACTCTTCATCAAGCTCTCTTCCATCTTCAAGATCCATCCCCAATTCAATTCCCCAAACTCCCACTCTTTGCTTCAACATTTTTTCACTTTGATCTCGATCGATTTCCATTTCCATTTCGATTTCGCTTTCAACTTCGGGTTTTGTGTCTACATTCTGAAAACTATTCATCAACCTCTCTTCTCCTTCACCCGCAGCCGACCCCTCCCCCCTCCGGTTCCTTCTCCAGCCGCCGAACCCACACCCCCGACGCGTTCCACGCGATTTCAGCACCCATACGCAAGGGGTTCAAGAGTTTCCGGCTTCCCCCACTCGAAATTAGACCTCAAACCATGTTAGGTACGTTTCCCATATTTGTTTGATTTGATTTACCCACACTAATCTCACGATTTCCAGCATTACCCATTTGATTTCGAACCCCGGAATTGCTCTAAATCGTGACACTCTGTCTGTGGACTTGAAGTTTGAATTACCCACTCCCTAACGGCTTCCAATTTGCAGATTTCATCTTCTTTGAATGCCAACGAGCAGCATCTTAGGCTTAAAGTTGGCTTTCGACGACTACCCACTATCCGAACCACCCCAAATCGGATTACCCATTGCTCGTGGAGTCCATAATTTCGATTTCAAACTCCAGCGAACATCAACCGGCAAGAATTAGAGCTTTTTGGTGTAGTTTGGTGAGTTTCAACACCCCTTGGACCTTTTAGACTTCAATTAAATTAGTTTAGATTAGTTGTTAATCATTGGGTGCTCTCAATTTTCAATTTCAAGCCTATTAGGACTCGTTCGGGCACTCTCGATCAAGATTCAAGTCCTTTAGGTAAGGCTAAGGCGGTAAGAGTATGTTTAGGCCCTTTTTAAGTAATTTAGAGTGGGTTCTAATCCTTGGAACACTTTTTCTGTAGGTTTGAATTGGTATCGAAGTGTTCGAATTGAACCTTAAGGATTGGTTTTGGGTGAGAAAATTCTTCCTAAACACTCTTTTGGTTTTGAATAAGGTTTTTAAGATAAGTTCTAACCTCTAGATGTTGTCGTTTAGGAGCTTATCTGGATTGTTTTGTCCTATGAGTCTGTTTGGTGATGAGGAGGAGGTTTGACGAAAGGAAGACCAGTAGATAATCTTTCTTTTTTGTTGGTTTGACTTTTAGTAGTTGAGTTTAGGTGGTTCTCGCTGTTGTTATCTAGTTTTTTTATTCATTAGTCGATGTTGATCATAGTTCGATGCTAGTCAGTTTTGGCTCAAGTTGAGGTTTTGAATTAGGCTTGTTTTTTAGAGTTGTGTTAGATTGTGTTTGGATGTTACCATTTCATTCTTTAAGCTCATCTAAGAAGCACAGACACGAACACGAGACATGGTGATACGTCAATTTCTAAAAAACTAAGACACAGATACGTTGAGGATACGTTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTAAAATGTTTTTTTAGTGTATATATAAATTTAACATAAGCTGCAGCGGCGGTGGCGATGACGGCCGGTGGTGACAAAGAGAGAAGGAAAGGGGCCAACAGAAATCGTGAAGAAGAAGAACTGAAATCGTGAAGGAAGGCTGTGCGTGACTGTTGTTTTCGAAAGTAGGGTTTCTGCTTTCTGATTTCTATTTTTTTTTTTTAAAATTAAACAGCAGCCCAGACTCAGGATTGGGCCCAATCCTTTTAATTTTTGAAACCAGCGTGCTCGTGGGTGTGTCACAACGTGTCCGTAAATAAAAAAAAAAAAAATAGGACATTGCGTGTCCGGACGAATCTATGTCTGACACGTGTCCGACACGTATCCTTCCTCCATTTGCACGTGTCCATGCTTCATAGAAGTTCATTGTATAGCTAGAGATTACAAGCTTTACTTTTGGAGTTGAGATGTTCTGGGAGTTTCAATAAAATTGAGTGCCTTTATTTTTTAAGCTGTGAGTCTCTTTAGTATTTGTTGCAAGGTCTATCTCGCATTTTATGTTGATGTTGAGCATGCTGGGATGTGATGGCTTTGACTATAGAAGTGAACATTTTCATTTGTCAGGTGTGTAAAATTTTGGGTAGGTTGTATTTATGGCGTTATGCTGCAGAAATTTTTGGGACGTTATGGTTAGCAATTAGCATTAAGATAAAAGGGTTAGTAATGTTCCCATATTCGGGGGTGTTACAGTTGGTATCAGAATGAAGTTGTTCCTGTAGATTGACCTAGGAAAACTAGGTTGTTAAGATAGTTTAGGCTTAATGGTCTTTCTTCATCTCCTCTCCATCACTAGGTATGTGGACTTGTTTTGTTTTACTGCCTGTTTTGCATGAATTATCTACTTTGCATAATATTTGTTTTGCCTGGGTTGGTTGATGTGTATAGATCATGGACCTTGCATTAATTCGATTTGCTTGGATTGTTTGCCTTGTGTGATGATTGTGGACTTACTTTGTTGCCTTGTCCGAGTATGCTTTTGCTTCCAGGCTAGCTTTGTTCTGTGGTAGTTAAGCATAGCATGTTTTCCTTGGCTGTGAAGATAGTTGGTGCTCATATGGTGCACGTTGTTGGTTTGTTTGCCTTGTTTCATTATGTCATGCCTGCATGTTTATTGATTTGTTTGTTGTTTTATTGTAGGTTGCTCTTGTCTTCTAGCAAGTACGAGAAGGGGAAAAGTGGCATCACAATCGGAGGCCAATGTTCGGATCTAGGTTCTCCATTTTTGGAAGCGGTGGTGCTGCTGCTGATAACGTCGACAAGTCGGCAAAAAGTGAGGTTGTTCCCGGCCTGAAACTTCGCTCTGATAAAGATGTGTATCGGCCTGGCGATCCGGTTGTTGTTACTATAGAAATTTGCTCCTCTGTCGGCCAATTGGAGTACTCTCTTTTGATCGAACGGCTTCGTTTTGAGATCATTGGGCTCCAGAAGTTGGATGCTCAGTGGTTTAGCACTCAAAAGCCAATCCCTGGATCCAAACAACGGAGAGGTTTGTGTATTTTGTGAATATCGTTCTTGGCGAGTCGTCATTAGCTTTTATTCTGTTCGCTTTTGTAATAACCATCTCTCTGACTGAGATACATTTCATCCGAAAGCACTTTTTTTGGACAAGTGAAAGGAAATCAGTATTTATCACTTTGTAGAATTTGCATGCTTCTGCAAAACTAATTGGATTTTTCTAATGAAAAAAGAGTTTCAATTTCATGTATTTTGGCCTTGGCAGGTGAACACGTTTTCATGGACTGCTCAGTACAGTCAATAGTTTCAAATCAGATAATATCCTCGGGGGCTACTAAGTCATGTAAGCCTATGTGTTCTGTGCACTGCATTTCTGTATCTCAGTTGCTAATATGTACTTGGTTCACTTGAATATTACTTATGTGATATTTTGACACCGTGATTACGTTAGTTTAATTCATAGTACACTGTTCATTACCTTTCGATACGAAGTTCGGCACACTATCAAATGACATGTGGTGAAAGATTGTTGGGAATTAGGAAGTGAATTCCTCGTTGCAAATTCTAAATTGCCAAAGTATTGATTTGCAATATGATACGGTTATTTGGAAATTAGATAGTAGAGACATTTTTCCACTTCGTCCCTTCACCATGAATATGTCTCTTCTCCATAAAAGTTTGTCTAAAGACATTTGAGGTAAAGGAATACCCAAAAATTGAAGATTCATTATTCGAAACTTAGCCTCGGGAGATATGTTATAGGAGAGGTGCATTAAAGGAGAAATCCTACTCTTCAAATTTTGACAACATGCCGGCCACTTTGCTGTAGAGGGTAAAAAACTCAAAATTATTTGTTTGTTCACTGCCCGTTTATCAAAAATTCTTGTCGTTTCTTGGTTCACCAAGCAATCTTTGGTTGGCAACTCTTTTGAGCTAAAAGGAAAGGCGTTTTGGAATTATGCGATCAAAAGGGGAAGTTTGGCGTGAGAGGAATTAAATTTTTTTTTTTTGATAGGAAACAAAAGCCATTTCATTGATGTATGAAATTGATACAAAAGAAGGTCCTATCTATGATTCTTACACAAAAGATCTCCATTGAGATATGAGGGTAGATAATCCATAATTACAAAAGGTGGAGATAGTTTACTCCAAGATAATGCAATGTAAGAAATAGATTAAAAAAAGGAGATAGCATTCTGGTGCTTATCTGTAAAGACTCGAGCATTTCTTTCAATCCATGGATGCTGCCTCAAATTCATGGATGCTGCCTCAAATTCATGGATGGTATGGAGAAGATTGCGGAGATGATCTTCCTTCGGAGAAAAAAAAAGAATGGTATCGTCTGCAAATTGGAGGTGAGTAATGGATATTTTATGTGGATCTTTTCCCACGTGGAAACCATCAACCAAGCCATTTTGTTTTACCAATATGAGCATCCTACTAAGACAATTAATCACAAGGATAAATAAGAAAGGGGAGAGAGGATCGCCTTGACAAAGGCCACTCGATGCTCGGATTTTACCTCTAGGCTTACCATTGATAATAAAGGAGAAGTTAGCCGAAAAGGTGCACCCTCTAATCCATTTCCTCCAGGTTAGCCCAAAACCTTTAGCTTGTAGGATATTCTCGAGAAAGTCCAAGACCACCATATCGAAAGCCTTCTCTATATCGAGTTTTATGACCATTCCACTTCTTTTCTTTCTATTCGATTCATCAATGATTTTGTTGGCAATTAGGGAGGCAATAAGGATTTGTCGGTTGGCCACAAATGCAAATTGGTGATCCATAGTCGTGTATGGGAGGACTCGTTTCAATCTTTCCGAGAGCACTCTAGCATTGACCTTGTAGAGGCAGGTTGTGAGGCTAATAGGTCCATAATCACCCACTCTTTTAGCGTCCACCTTTTTGGGGATTAAGCAAATATATGTTTCATTAAGACTGGCATTGAATGATTTC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ATGTTCGGATCTAGGTTCTCCATTTTTGGAAGCGGTGGTGCTGCTGCTGATAACGTCGACAAGTCGGCAAAAAGTGAGGTTGTTCCCGGCCTGAAACTTCGCTCTGATAAAGATGTGTATCGGCCTGGCGATCCGGTTGTTGTTACTATAGAAATTTGCTCCTCTGTCGGCCAATTGGAGTACTCTCTTTTGATCGAACGGCTTCGTTTTGAGATCATTGGGCTCCAGAAGTTGGATGCTCAGTGGTTTAGCACTCAAAAGCCAATCCCTGGATCCAAACAACGGAGAGGTGAACACGTTTTCATGGACTGCTCAGTACAGTCAATAGTTTCAAATCAGATAATATCCTCGGGGGCTACTAAGTCATATGTGGTACGAACAACACTTCCCAGCCGTATACCACCATCTTACAAGGGTGCCACTATTCGTTATATGTATTATGTTAAAAGTACATTACTAGGACGATGGCTAATACAGGAAAATGGTCGATCTCGTAAAGAGTCATTGAAGGATCAAATTGAAATGGAAGCTCGGGTTCCATTACAAGTGTGGGTCACTGAGAAAACCAGTGGCATGCTAATGGAAGTAGGTCAAAATGGTCAAAATGATGCCTTTCAAATGGATGTCTTTTGGAAAGAAATGGAAGCTGACACTGATTGGATCAGAGCAAATGATATATATGATGGCACTGATGAAGGATATGATAGCTCAAGGGATGAGATGTCGTCTGTCTCATCATACAATCCAATGAGAGAACCTTTTCATAGAACCTTTGGAAGTTCACTGTCATTTCAATCATCTGCCGCAAGATCAAGATCTTCAATAAGGGATGCTCCTTTTATTGAAGGAGAGCGATTCAGTTTATCTTCTAATGTTGCACATCCTCGGCTCTCTGTTGCTGAGGTCCTATATGATTCTGCCGATGTCGCATCACCTCAGAAGTCATCTGCGGTTGTCTCTCCCAGCCTGGTGTTGAGCTTTGAGAAGAATCAGTCAACAGATGATGATGCTGGAGTACCATCTTCACCAATGCCTAAAACTGTTGAACCTGTAGCATCAGAAGGCTTTATTCGAGGAAGATCTTACAATATCAGGGTAGATGACCAAGTTTTGCTTAAGTTTTGCCCCAAAAATTCTGATTCAACCTATTATTTTAGTGACATGATAGGTGGAACTCTTACCTTTTTCCATGAAGAAGTATCTAGGAGATGCCTTGAGGTTTCAATAACTTTGGAGACTTCAGAGACTGTATCTCGCCGTTTTGTCCATCCTTCTCGGAGGAATTCTCCAACGATTGTGAAGGTTCAAAGTGATCATTATGAGGTTGTTGCTGATTTAATTCAGACAAGCTTTCTTTTCTCAATTCCCATGGATGGGCCCATGTCTTTTTCCACTCCACACGTATCTTTGCAGTGGGCACTTCGCTTTGAATTTTTTACCACCCCCAAGAATGTGGATTGGACCAGATATGAGCATCCTCTCTTGATAGAAGGAAGAGAAAAAAGTGAGTGGATTCTTCCAATCACTGTGCATGCACCTCCATCTGGCTCTGCAGCTTCTCAGAACCGAAATGAGAGGCCTTTCTCTTTGGATCCCCTGTGGATGCACAGCTGA MFGSRFSIFGSGGAAADNVDKSAKSEVVPGLKLRSDKDVYRPGDPVVVTIEICSSVGQLEYSLLIERLRFEIIGLQKLDAQWFSTQKPIPGSKQRRGEHVFMDCSVQSIVSNQIISSGATKSYVVRTTLPSRIPPSYKGATIRYMYYVKSTLLGRWLIQENGRSRKESLKDQIEMEARVPLQVWVTEKTSGMLMEVGQNGQNDAFQMDVFWKEMEADTDWIRANDIYDGTDEGYDSSRDEMSSVSSYNPMREPFHRTFGSSLSFQSSAARSRSSIRDAPFIEGERFSLSSNVAHPRLSVAEVLYDSADVASPQKSSAVVSPSLVLSFEKNQSTDDDAGVPSSPMPKTVEPVASEGFIRGRSYNIRVDDQVLLKFCPKNSDSTYYFSDMIGGTLTFFHEEVSRRCLEVSITLETSETVSRRFVHPSRRNSPTIVKVQSDHYEVVADLIQTSFLFSIPMDGPMSFSTPHVSLQWALRFEFFTTPKNVDWTRYEHPLLIEGREKSEWILPITVHAPPSGSAASQNRNERPFSLDPLWMHS Homology
BLAST of Lcy01g005030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HKY7 (uncharacterized protein LOC111464493 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464493 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 939.5 bits (2427), Expect = 6.2e-270 Identity = 481/539 (89.24%), Postives = 498/539 (92.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KC17 (uncharacterized protein LOC111494236 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111494236 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 938.7 bits (2425), Expect = 1.1e-269 Identity = 482/539 (89.42%), Postives = 497/539 (92.21%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0M0 (uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495739 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 934.1 bits (2413), Expect = 2.6e-268 Identity = 472/537 (87.90%), Postives = 499/537 (92.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DN77 (uncharacterized protein LOC111022779 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022779 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 916.0 bits (2366), Expect = 7.3e-263 Identity = 465/539 (86.27%), Postives = 496/539 (92.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L132 (uncharacterized protein LOC111499409 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499409 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 915.6 bits (2365), Expect = 9.6e-263 Identity = 465/533 (87.24%), Postives = 492/533 (92.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. NCBI nr
Match: XP_011653362.1 (uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >XP_031739927.1 uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >KGN53681.2 hypothetical protein Csa_014549 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 954.1 bits (2465), Expect = 5.0e-274 Identity = 478/537 (89.01%), Postives = 505/537 (94.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. NCBI nr
Match: XP_038904898.1 (uncharacterized protein LOC120091119 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 952.2 bits (2460), Expect = 1.9e-273 Identity = 477/538 (88.66%), Postives = 503/538 (93.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. NCBI nr
Match: XP_023514696.1 (uncharacterized protein LOC111778917 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 943.7 bits (2438), Expect = 6.8e-271 Identity = 483/539 (89.61%), Postives = 501/539 (92.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. NCBI nr
Match: XP_022964483.1 (uncharacterized protein LOC111464493 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 939.5 bits (2427), Expect = 1.3e-269 Identity = 481/539 (89.24%), Postives = 498/539 (92.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. NCBI nr
Match: XP_022999897.1 (uncharacterized protein LOC111494236 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 938.7 bits (2425), Expect = 2.2e-269 Identity = 482/539 (89.42%), Postives = 497/539 (92.21%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g005030 vs. TAIR 10
Match: AT1G50120.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rgp1 (InterPro:IPR014848), Immunoglobulin E-set (InterPro:IPR014756); Has 144 Blast hits to 140 proteins in 61 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 86; Fungi - 10; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 614.0 bits (1582), Expect = 1.1e-175 Identity = 322/544 (59.19%), Postives = 400/544 (73.53%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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