Lcy01g003800 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy01g003800
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr01: 4553811 .. 4560398 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy01g003800
SyntenyLcy01g003800
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGACAGAACAGAATCAAAGATCCGCAACGGATACGAGGATTCCTGGAAGAGGGAAAATAACCTGGCGGGTTGTTGATGCAGCTGCTGGTCGTAAGAACACGAGACCCGGCACCGGTAGACGAAAGCCCGAAGTGAAAGAGAAACGAAAACGTATGATGAGGCACATGCAACTCTTAAAGCCCGTGTGTATTGACAGCGTGTTTTTTCTCGCCATTTCCTTAATTACTTTTAAAATAAATAAAAAATCTTAATTACTTATTTTACTATTGAGTTGAATTACCATTTTAACTCCGCTCTATATTTTGTAAGTTTCGATTTAGTCTCCATGATTTCATTGAATCTCTAAAATTTGAAGTGCTCCTAATGTTGTTCTTTCGTCAATATCTATGGTATTCAATTCAAATTAAGCAGTAATTGACATATATCCTCGACCAATAGGTCACTTTAAAATTTTATATTTATATTTATATACACAATGGAAATGTCCCTATATTAATAGTCATTGGTAGATTCATAACTTTATATCACAGCATTAAAACAAATAATAAAGTTTGAAATATATTTACTAAAGAACTTTTTAATATGATTAAGTTTTTGTCTTGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGTATTTGTATGTAAAATTTTAAAAGTGAATCTTTTTTTTTCTGTTATTTTTTCTTTTTACAATAAAAGTTAGAAGATACATATGGCTGATGATAGACTTTAAGGTGTGTTTGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTAGAAGAATGTTTGAGGTTTGTTTATACGCGTGAGATTGATTATCAAATAATTTTAACTGTTTTAGGTGTTTGGTAAAATTGATTTTTTGTTAATTTAAACAATCACTTTTTAGTTACCTTGATTTGGGGAATCTGGTTTTGTTATTTAAATTATGATATCTTTAGTTGGTGATTTGAAAACAAAATTTTGAAAACAAGAGATTCAATGCACAATATAATTGTATTTCATGTTTTCAAATATGTGTTTGGTAGCAGACTTATAAATTGGATTTCAATTTAAATTCAAAATGTGTTTGATAATATATTTATAAACCATAAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAACAAACCATAAACTATTTGTAATTATAAACTAAAGACTAAGTTGAATATAGATTATTGTTAATTAATTTATAAATATGTCATATGTTATAAAATTTGTATGATTGTTATTTTACAGTATCATAAAATTTATAATACATTATATTATACAAATTGTAATTTCACAAAAAAAAAAATGATTGAGTTTATAACATAAAATACTATATTTATTAAAGACTCTATTTTTAAAATTTTAATCATGCATTTAAGTCTCGTTTGATGACCATTTGGTTTTTTAAAATTATGTTTGTTCTCCCTCAATCTCCCTACCATGGTTTTCATATTTGTCAATGTCACATTTGAATTTCTAGCCAATTTCTAACAGCAAAAACAAATTTTTGAAAATTATTTTTTTAGTTTTTCAAAATTTGGTTTGGTTCTTTGAAAACATGTAAACGATGTATTAGAAAAAACAAAGAAACTTGTTGGTGGAATTAATGTTTATAAGCTTATTTTTCACAAACAGATTTGAAATCACAACCGATTTCAAATCGTGTTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACTCCAAAATGGCCAGATTTTGCAAGATTTCAAACTTAAAACTATCTTTCCAATTTTACCCATAAATATATATTTTTTCTTACTTTATGACTCATACTATAGTTGACTCAACTACCAATTTGTTTTTTTTTCCCTTTTTATATATTGATTCAATTTTTTTTGCTCCATCTATATGTATACTTTTTTTTTTATTTTTTATGTTTTCATACACTAGTTAGAGAAGAAATCCAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTCCTGCAAAATTATAAGGGGCATAATAGTAAAATGTTATACTTTCTTTTCATTTATTGTGAGCATCCAAACACTAGATTTTAATTTTAGTGATTTCGAATTATTTTGGTTTCAAACACAAATAGGAATTTAAAATCATCCATCTTTTAAAATCTTGGAATTTCAAATAATTTTCTGCAAAATTCATTTGCCAAACAAAGCATTAGCTTTTCGTATGATCTAACACGTCCTTCAAGAGATTTAAATTTTTTTTCCATTATATCATTCCCTAGTTAGTTCATGTGTCGATGCATTTGTGATATGTTTACTTTCCTATTCGACAATTTGACAAATATATTTTTTTCCCTTGAAACAATCGTGTTGTGTGTGTGTGTTTTCATTATTTTCAAGTCAAAGTTACTTTCATATTTGACAAGTTGGCAAGTAAATTACTGGTGAGATTCATATTTATTATATAAGGAAACAAATCATATCAATAATTTATTTAGTTTTGCCTGGTCCATCAATTAATTCGATATTTTATTTCATATAAAAATTATTTTTCTTAATATTTTATCAAATAATTTAGTGTAATCTGAATATAATTCTTATAACTGAAACCATATAAAATTTTAAGATAATTGTCTTATAACAATTTTAAAATACGAAAAAACAATATAAAGATGATGGAAATGATATATCCATGTAGCAATTATAACTAAATCGTGGCAATTTAGTATCGATATATCAAACACTACAACTTACTTGTTGTGATTTAAAGTTGAAATTGACCGGACACTAATTTGCTTATTGTTATGGTTGAATTTGTTAAAAGCAAAGTTGACACTGATTATTTTAAAAACTACTAACCTTTTAAAACTCTTTTTTCGGTTGGGAAGGACAAACCGTTTAAAACCTTTTTTTTAGAAAAAAAAACATTTTTTTGAAAAAAAAAAAAACATTTTAAAACGTAGTAATTAATACATCTTTAATATACATTATTGTATTCATTTTTCTTCTATTAGTAACAACTAGATTTTTTGAACGTGTGGTTTTCCTTTTTGAAAACTAAATTGAATAAAATAATTATGAAATTATGTATTGCTATATGATTATACATTAGATGTGTAAACAGAAATCCAATAGATAAACGCGAAAAAACAGAAATCGAATAAATACACACCATGAAAAAAAAAATCAAAGGATTAAAAGAAATTAAAACAGAAAAAAAAAATAGACACCATGAACTAAAAAAAACGTGAGAAGAGAAAATGGACATGGATGGGGAAGTAGAATAGAAAATAATTATTTTATGGGGAAGTTTTCTTTTTTATTATATGTTTTCGCGTTTATTTGTGGACTAATTTCTTGAATAATGTAATTTAAAAAAGAAATGACACAATTAGAGCAGTTTTAAAAATAATAATTTTAATAATGTACTTAAAATAAGAAATTACAAAGTAGGAGGGAAAGTTGAAAGTATTGACAAAAATAGTGTGTACAAAACTCGTGTACATGATACACGAGTCTACTGTGGTCAGATGTGGCGCCTACTGTGGTACACGTAAGCGATTTACGCTGAAGAATCGTGTACGTGGGTCACGATTAATACAGTAATCGTGAACATGGTACACAATATTGGATGAAGGAAATCGTGTACCATGTACACGATTTCTACGAATCAGAGGGATGGAGACGCCGGAGATAGGGCAAGAGGAAAGGACGATATCATGAGTTTTACAATATTTTCAAATTATGGGAAGGCTGCAACTAAGGTAGAAAAGGAAGTGGAATGAGAATCGAATGATCAATTTTCCTTCTGAAATTCTCGTTGCCAATAGGCCCAAGAGCTTGTTGGGGTCAGCTACTTTCAGAAATGGTTGCGATTCAAACCGACCTTAATCCACAAGAATCCATTCCTTTTCTTCTATTTTTCCTATTTTTCTTTTGGGAGAAACTCTTTGTGAGTTCTTTTATCTCTATATATGTTCTTTTTTATTCTTTTGTAATTTTAGTTTTGGACAGTTTCTTTTAAGGACTTTGAAATTGAATTGATAGTTGAAAGAATAAAAAAACTCATGTGGAAGTGCCTTCAATTCTAATCGCATTCACGAGTGGGTTTTTCATTTGTTCCTCTGCTAAAAATCCCATGAATTTTTCCTTATGGGTTCTTGATTTTTTTACTTTTTGTTAAGGTTGGAGGTCTTGTGAAATTCATTAGGGCTTGTCCAAGAACAGTCAGGCATGAGAGTGAAAAATGTGGCAAAAGTAAAAGATGAAGATACGTTGTTTGATGAAATGAAAAGGAGATTTCTGAGTTTTAAGGAAGTTGACCGCGACAAGAAATTGGAGGGAGGGAGACGTTGAAGATTTCTACCAGGGGAGACTGTTTTCGACCTGGGAGACGACACCGAACTCGTGTACATCGTACACGAGTTCCACATGGAACATCCGTACCTTGCTGGCACCACCTTGGCGCCTAATCAGTATGCCAATAAGCCCTTGTAATCGCGTCCCATAGCTACAATTTACCAAACTATATTATTAGTTTAGGAGCTATGTCATAGCTTATAAAAAATTAAATAAATATATCGAGATAATAAAAATAAAATCAAGACTATAGCAGCTCAACAACAAAAAAAAAAAACAAAAATCTCGTCCCTACTATCTTAAAATCCCAACCAACTACCATGAAAAAATCATACACAATACTAACGGGGTAAAAAGTGACGAAATAAAATAAAAATTTATGAGAAAATTGTCGTAAAAAAAGACAAAATTGAAAACGAGCCTCTCAAATGGGTCAGATGCGTAACTTTGGTCGTTATTGTGATGGGTAGCAAACAAAAGTTTCCTATTTACAAATACAGCAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAGCCCGTAAATGTGTGATGTCTCATAAATAACTTATTCTCATTCTTATTTCATCTCTATTTAAAAAATGAATTGACTCTCGTTCTTCTTCTCCATGTTTGAAGTCTATCGACGAAATCCTAAAACCTTTCCATTATTTTTGTCACGTGTGTTTTTTTGGTCCTATGTTTTTTTCTTTAGTCTAATTTATTTTTTTTGTTTTCATCTTCT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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGACAGAACAGAATCAAAGATCCGCAACGGATACGAGGATTCCTGGAAGAGGGAAAATAACCTGGCGGGTTGTTGATGCAGCTGCTGGTCGTAAGAACACGAGACCCGGCACCGGTAGACGAAAGCCCGAAGTGAAAGAGAAACGAAAACGTATGATGAGGCACATGCAACTCTTAAAGCCCAGGGATGGAGACGCCGGAGATAGGGCAAGAGGAAAGGACGATATCATGAGTTTTACAATATTTTCAAATTATGGGAAGGCTGCAACTAAGGTTGGAGGTCTTGTGAAATTCATTAGGGCTTGTCCAAGAACAGTCAGGCATGAGAGTGAAAAATGTGGCAAAACCCAGTCCATTTTTGAATTCGCTCGGTTCAGCCCCTCTCCCCTCTCCCGACGTCTGCAAGCCCAACTATTGCCTTCTCCTTCATCCTCGTCGGCGGCTGTCGGTGCTCCGTTAGCCACGCCTCCACTTGGCCGGCCATCAGCCACTTCACCTCCTCAATCTTACAACACCCATTCTGTCCTCTCCTTTGCGGGTCCAATTTCGTCTCCGCCTATCTCCTCTTCTCCGACGTCGGCACCGGCGACTGGGGTGCAGCCTCCCTCCGTAGCGACGCTCTCAATAATCCCCACTGGAAGGTTGCCTACTAACCTGGACTTGCAGGCTTGA

Protein sequence

MTEQNQRSATDTRIPGRGKITWRVVDAAAGRKNTRPGTGRRKPEVKEKRKRMMRHMQLLKPRDGDAGDRARGKDDIMSFTIFSNYGKAATKVGGLVKFIRACPRTVRHESEKCGKTQSIFEFARFSPSPLSRRLQAQLLPSPSSSSAAVGAPLATPPLGRPSATSPPQSYNTHSVLSFAGPISSPPISSSPTSAPATGVQPPSVATLSIIPTGRLPTNLDLQA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 26..51
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 164..206
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 138..206

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy01g003800.1Lcy01g003800.1mRNA