Lcy01g002450 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGTGAGCCTTGTTTTGGCAGTGGTGGCGATGTTATTGTTGTGGGCAGGAGGAGCAGTAGCGCAGTCGGATTGTAGCGATGTGTCGATCAACGTCTCGCCTTGCCTCAATTACATGGCCAGCAACTCCCCCACGCCGTCTTCGACCTGCTGCTCGGAGGTGGCCACCGTCGTCACCTCAGAGCCGCAGTGCCTTTATCGGATCATCGACGGTGGCGTGTCGGCGGTTGGGGTCAATGTCAACACAACTCTGATGTTCGCACTCTCCCGTGATTGCAATCTTATCAGCAGCAATGGTAAGATTTTCTAAAACAAATCTATACTATATATAAAAGGGGCTAAGAAGGGAGAATTTTTACATGTCAATTTTACCCTTGCAATTTTATTTAATTCCTATTTTGCCCTTCACTATTTGTTGATGGGACACGACCCTTTGAGTTTAGGTGTCCGTTGAGAGAAATTTGTACAACAGAGGTAGTTTTTCAACAGAGGTATTTGTTAAATATTTATTTATTTCTTTCTTTATTTTCTAGAAACCAATCTATTTGAAGAACATCAAACAAATATCCGTGAGATAAATAAACTATCTTATTATATCAGTTTTTTTTTTATTATCAATTCCAATTTATATTTTGTCGTTCAATCTTTGTTGACAGTACACACTACAAGAAAAAACACCTTCAGTGGCGCACGAAACACGTTGCTGAAACGAAAAACACGTCGCTAAAACTTTCACCGACGTGCATGGCTTTGTCGCTGCATCGGTCGCTGTTTCCGCGTAGTCGTAAGTATTTGCGGCGTCTACTGTTGTAACGACCCGACTTCTTAATAAGCCTTTAAGGGACCGTTACGACGATGCATGCTTTGGAGGCCTTTTTAAATAAAATAATTTGAAACATAAACACTAATTTAAACAAAAATTCTAAAACAAACTTTTATTCGGGATCCCTAAACTTTAAAAGGTTTTAAATATTCTTAAATAATTTCTAGAATAAAAATGTGCATGGCCTCTAGAAAATTTCTCAAACAAATTTACAATAAAGTAAAACATAATTCTTGAAGCGGAAAAAAAAAAAAATATGAAACTCAAAATAGTTCCTTCATGGCTGCCTTTCGGATTCTCATCAATCGCCTTTCACCTGCCCTTGCCTAAACCTGAAAAAAATATTTTTGAAAAGAATGAGTATTTTAATATACTCAGTAAGTGACCCTACTATTGAGGTTGGGTCACGCTTTAAAAACATTTTTTTAAAATCAACAATAAATATAATTTTGGTGGCTCTAACTTTATTTTAAACTCAGGATATACATCAATTTCATGCATATCTTAGACACATCAATTTCATGTGTCTTTCTACTGAGAGAGAATACACATCAATTTCACGCATATTCTAGACACATCAATTTCATATGTCTCCTACGGAGGCCGTCAATTTCACGAAACCTCGAGGTCGTCAATTTCACAAACCTCGACTTAGGTACATCAATTTCATGTCCCTAAGTCCAGTGTAGGCATCTCTGAATGTACATCAATTTCATGTACACTTATAAAACTCATAAATAATTCCTTTAATGGAATATTGAGAGACCACCAATCAAATTATTTCAAGCATCAACAAATACAAAGCAAGAATAATAAAATTTCATGCTTTCAACTATTTTCATAAACACATGCTCAATTAAAAAATAATAAATTTTCATGCACAATTCTCATGCTTTTAATAATAATAATAAATTTCAAGAACTACTCATAAGTACGAGAATTTTAGAAAATCAAACACGCGCACCCAATTAAAAGGTTCAATAGTAAGTTCACTTACCTCGGCTTAAGTATTTTGAACAGAACTAAATTCATTCTTTTAACTCCAAAGTCCTTAACCACACCAAACAGAATGTCGCTTGTTGAACAGAACTTTAATTGAGCGAAAATCCGAAATTATGAACTCGAAATTGGATGGGCAACACCAAAACCATCTCCTAACGTTGCTGGTCGGGTTCTAAAATTGCTCAAATTCGACGATTAAACTTCCAAACGCTATGGGTACCCAATACTAAAATCGCCCGAAAACTTGATAAACACGCCCAAATGCGGCTGTTCGTGCTCCAATCTTCACTGCAACACCGAGTACACGCCGGAGATACGCACGACGAAGGCTGAAAACGCGAGCTGCTGCTGCAAGGAGAAGTTCCGCCGTCGACCTGCTGCGAAGCCCGACCCAAAGCGCCGCCTGAACCGTGAAGAAGACACCGAAAACGCTGCTGTTGAACTTGAGGGCTGCGGTTGGAACTCGCGAACGTCGCCGCCGTGCAACACGCTGGAGGACGCGTGCCGCCGCCGGAGGTTCACGGCACCGCCGCGGATTCGATTTGCTCGCCGGAGGAACGTCGACGTCGCCGGAGGTGGGAGTTGGGGAAGGCAGCCGTCGGGTGTGAGGAAGAAGAGGCAAAAACCAGGAAGACCAAACTTAGGGCTGCGTGCATAGTTAAAAACAAAACCTAATGGGCTTGGGCTGGCTCTAACATCCCAGTAATTACAAAAATGCCACTCCAGCCATTTTTTAAATATTACACCAAATTTTCAATTTTCCCTCTTAAACCAAAATAAAACCCAAACTAAATAAACTTGAATTTTCCTTAAATTACGGGCGTTACAACTGTAGACGTTGCTGAAAGTGATCTTCAGTGACATCTACACGTCGGTGGAAGCGATAAGTAGGGACGTGGGGACACGTCGCTGAACATATGTTTCAGCGACATCTACCTAGTTGTCGCTAAAGAGTGTTTTCAGTGACGCGGTCGGCACGTTACTAAAATTTAATCTTCAGTGACGCAGTCCACATGTCACAGAAAATCCGTTTTAGTGACATGGACAACGTTGCTAAAGCACTCAAACTTGTAAGAAATTAGATATTTTGCAACATTTGTGCGTGTCGGTAAAAGTAATATTACGCGTCACTAAAAACTCAATGCTAGTGTTTTTTTTTGGTATGCTTTCCATGTTGTCATGGGAACGCACCATACTATGATCGTTTACCGACATTATGTAAAACGTAAAAAATAAATAGTTAATTCAATAAGTAAACCTATAAATAAAATAATATTACCATCTTCGAACTAATTAACAATTCAACAATCAAATAGAAATGTCATATACCAATTTAAAGTGAAAATGTACTACTTCATATATTAACCATAATCAAGAAACATGTCTAAAATCTAATACAAATTGATCATTTTCTAAAATGATCTCAAGTCTAGATGAAGTTTGTTTAACAAAATGATTCACATCACATCAAAATGACTAACAAAAGATCACAAACAAAAAAACCAACCTACATGTTTCACATTTCCATACAAAAAGGGGAAGCGCCTTGTCAAACCATTCATGCATCCAAGCTGGAAAAAAAAAATAAATAAAATATGTAAGCATGAGATTAAATAATTGAATTAGAGACGATATAACTCAAATCAAGATAAACAACTCATCAAAAGCTATAAAACAAAACTTACAACAAGAACTTTCAACATGGAAAAAACATGAACACAACTACACTTATGAGACATAATGAACACAAACTTAACAACATAAGCAACCATCTCAATTCAAAGAACTAAATAAAACAAGTGAAACTAAATTTATAAGAACTTAATGAAACTAAACTTATCAACATCACAACTACACTAGTTAAAATACTTAAGTGCAAATAGGTATCGACCTTCCTAAACACAACACCTAAATGGAAAATAAGTGAAACTAAACTTTAAAAAACACAATAACTAGTTAAAAAGACTAAGTGCAACAAGATATTGACCCCCCAAATAGAATAACTTAACAACTACAACTTAGAAACTCAACTTTGCAAATGGAATTAAACAATTCAACTCAACAACTAAACTCTGTCTCTTTAGATTTTTGGTCCCAAACATTTCACTTCCTGATTTATCCAGTACGTTGTTTTTTTGCAAGAAAGTAACACAACTACCCAAGGAAAAACACCTAAAGGAAAAGACAAATTTAAACTCATATAAAGAGTTTTCAGCACTATTATCTTATATGAAATCATGTTCTTGCATACACGGGCCCACCATTTCATCAATAAATAGTGCAGAGTATTTGAAACAAAAATTGAACTGCATAATTATTCTACCATCTGAAGTTCTAAATCTAACCCAACAATCAATCACCTAGCAACAAAATGCAGAGAAAAAGTGGTTACCTCCTAGATTCCACAAGGAGGGCACGTTGTTCAAGATTCTTTTCTGAGCTCGCATCTGACTCACCGGCTGTGTAGCTGTATATAGATTCAACCGAAACCACATTTCATTTCAATGTTAATAATTATAATAATGTATTCAAACCCAAGGGAAAATAATATTCTAAAGTAAATCCAATGTAGGTTGTAATCAACAAACACTCCACGAAGATAACTTATATCAGAAGAAGCAAATCAACATGTTTCTTTTGGTGAATAGCTTGCCTCTTTTCCATATGTCTCTCCTTTTGATGAAATGGAATTACCTTCGGCGGGGGCTTCAGCGGGAACTTCGACGGCGAGCTTCAAGAAAAGAACCCTCACTTTGGCGAGCTGTGACCTGAGACGCTCGAATAGAAGAGGAAAACGGGAGAGAGGGAAAACTGAAAATAGAAGAAGGAAAAGGGGAAAAACACCAACCCTAATCTTATTTTAATATTCTAATATTTTATTTCAAAAGAAAAAAAAATTCTAATATTTAGTGACACCAAACATAACCTTTAGCATCGTGATAAATATGTTCCTAAAAATAAAACTTTTTGTGGCGCGAGTTTACGCGTCTCTGAAACTATTAGTGACATCTAATTTTATCGCGTCACTGAAAATATGTAATTGCGACATTTGGTTTACGGTGCCACTGAAAGTCATATTTAGCAGCTTATTTTTGCTGCGTCACTAAAAACTTGTCACTGAAAACGTATTTTCTTGTAGTGACACTACTCTTCGAATTGAGGCATCC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MEVSLVLAVVAMLLLWAGGAVAQSDCSDVSINVSPCLNYMASNSPTPSSTCCSEVATVVTSEPQCLYRIIDGGVSAVGVNVNTTLMFALSRDCNLISSNGSDSLLANGSHRNFSILSAVEKIPVHGGFRSSSPMAGGGGCLPSPTSSTRKLASSFFGSPRLFTSSSSKGLSETESVMSPTSILEPFLGLRNSFWAESNSPRTVITESKRPWDSKGIGLGIVDALTEENSDPKPTKPETRMVLLGSQLKIQIPPLPTFVSPADESPNSPIEFGIKTRNSHLGSSSPVSSLSPAKKSAFGSSSSGHETPNSPLVFTGCLSAGEIEQSEDYTCVISHGPNPRTTHIFGDCVIESGGSGVYSPARKENGFFRDRTSFSPENFLSFCYNCKKNLEQGKDIYMYRGEKAFCSHECRYQEMMTEEGGD Homology
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L471 (FCS-Like Zinc finger 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FLZ8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 175.6 bits (444), Expect = 1.2e-42 Identity = 113/267 (42.32%), Postives = 156/267 (58.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LGS1 (Protein MARD1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MARD1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 129.0 bits (323), Expect = 1.2e-28 Identity = 104/287 (36.24%), Postives = 142/287 (49.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LYE4 (FCS-Like Zinc finger 10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FLZ10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 123.6 bits (309), Expect = 5.2e-27 Identity = 104/302 (34.44%), Postives = 151/302 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SL94 (FCS-Like Zinc finger 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FLZ11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 2.2e-17 Identity = 88/277 (31.77%), Postives = 131/277 (47.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LJ86 (Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LTPG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 77.8 bits (190), Expect = 3.3e-13 Identity = 52/152 (34.21%), Postives = 79/152 (51.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K8W8 (FLZ-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G234090 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 517.3 bits (1331), Expect = 6.0e-143 Identity = 257/283 (90.81%), Postives = 267/283 (94.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BHM4 (protein MARD1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489674 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 515.0 bits (1325), Expect = 3.0e-142 Identity = 255/283 (90.11%), Postives = 267/283 (94.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TFK1 (Protein MARD1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold306G00290 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 1.5e-141 Identity = 254/283 (89.75%), Postives = 266/283 (93.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KWN0 (protein MARD1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499383 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 494.2 bits (1271), Expect = 5.4e-136 Identity = 249/287 (86.76%), Postives = 263/287 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L312 (protein MARD1-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499383 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 494.2 bits (1271), Expect = 5.4e-136 Identity = 249/287 (86.76%), Postives = 263/287 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. NCBI nr
Match: KAG6574974.1 (FCS-Like Zinc finger 8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 550.1 bits (1416), Expect = 1.7e-152 Identity = 323/490 (65.92%), Postives = 350/490 (71.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. NCBI nr
Match: XP_038875421.1 (FCS-Like Zinc finger 8-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 1.3e-144 Identity = 263/286 (91.96%), Postives = 270/286 (94.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. NCBI nr
Match: XP_004139816.1 (FCS-Like Zinc finger 8 [Cucumis sativus] >XP_031744520.1 FCS-Like Zinc finger 8 [Cucumis sativus] >KGN44236.1 hypothetical protein Csa_015744 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 517.3 bits (1331), Expect = 1.2e-142 Identity = 257/283 (90.81%), Postives = 267/283 (94.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. NCBI nr
Match: XP_008447157.1 (PREDICTED: protein MARD1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 515.0 bits (1325), Expect = 6.1e-142 Identity = 255/283 (90.11%), Postives = 267/283 (94.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. NCBI nr
Match: KAA0040806.1 (protein MARD1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK17787.1 protein MARD1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 3.0e-141 Identity = 254/283 (89.75%), Postives = 266/283 (93.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. TAIR 10
Match: AT3G22550.1 (Protein of unknown function (DUF581) ) HSP 1 Score: 175.6 bits (444), Expect = 8.2e-44 Identity = 113/267 (42.32%), Postives = 156/267 (58.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. TAIR 10
Match: AT3G63210.1 (Protein of unknown function (DUF581) ) HSP 1 Score: 129.0 bits (323), Expect = 8.8e-30 Identity = 104/287 (36.24%), Postives = 142/287 (49.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. TAIR 10
Match: AT5G11460.1 (Protein of unknown function (DUF581) ) HSP 1 Score: 123.6 bits (309), Expect = 3.7e-28 Identity = 104/302 (34.44%), Postives = 151/302 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. TAIR 10
Match: AT2G25690.1 (Protein of unknown function (DUF581) ) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 1.6e-18 Identity = 88/277 (31.77%), Postives = 131/277 (47.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy01g002450 vs. TAIR 10
Match: AT2G25690.2 (Protein of unknown function (DUF581) ) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 1.6e-18 Identity = 88/277 (31.77%), Postives = 131/277 (47.29%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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