Lag0041289 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAGAGTAGAGAATATAGAATAGTGTTTTGGGATAGAATTCGGGTCCCCTTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTGCTCATCCTCCTAGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGTGAAACCGAGGCGGCCAAAGGCGGTGGGGACCAAACGGCATCGAACAGACTCGGCCCGAGCGAGCGGGCCGAGGGTCGGCCTCGGCCCAGGCCGAGCAGTGGGTCGGGTCAAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCCCACTTGCTGGTTTGCCTCCTTGGTCCATCTTTCAGGCCGATTTCTCCCCGATTGTCCTTGTCAGTTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACATATATATTAATTGAAACATTCATGGGTATACTTGTATAAAATTAAGATCTCGACACTCGTAAGGTTAGAATGAAAATAGATGAGAAGGTAGCGTGAAGATGAAGAGCACATAAGGAAAATGAGAAGAGATGTAGAGGATAAAAGCTCATGACGGCGTAAGATAGCAAGAAGCAGTTGAGTAGTACTTTAGTCAATGAGTGAGGTCGGACAGATGTTTCATAAAAGGACAGAGGAAAAGCACAAGGTAGTGGGGGAGGAAGGCCGTTGACTTTTATCCCAACACAAAAAAAGCATCTTTTTTTTTTTTCTTAAATATTCACTATCTTTTCAATTTAAATATTTAGATTAAATTATATAAAAAATGATGGTTAAACTTTTAGATTATTCTAAATTTCATCTTTTTTGGGTGTTGTTTGATAACCATTTGATTTTTTATTTTTTAGTTTTTGAAAATTAAACTTAAAAATACTACTACTACCAATATGTTTGTTGACTTTGTTATCTACATTCTTTTCATGTTTTTAAAAGTCATGTCAAGTTTTGAAAACTAAGGCCCCGTTTGATAACCATTTGGTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTTGGCTTGTTTTCTTCCAATTTTCCTACCATGGTTGTCATATTTGCCAATGACACATTTGAGTTCCTAGCCAAATTCTAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAAACTACGGCCCCGTTTGATAACCATTTGGTTTTTTGTTTTTAGTTTTTGAAAATTAAGCCTATAAACACTACTTCTACCTACAAGTTTCTCTTGTTCTAGTTATAAAAACATTCAAGATTTTATTTGATTTTTAATTTTTTGCTCCTTAACTTGGGGAATGTCTATTTTATTTTTAAAATTTTAAAAACGATATTTTGATCTTTGCCATATTATTTTTCTATCTAATATCTAGTTGTCTAATGATCCTCTCTAATATATATGGCTTGAAATCATACTCGTATTAATACGTTAGTATACATATATACTCAAAACTATGTCATTCATTTGTAAAAAGCAAAATAAAGGTGATGACAAAAATGATTTTTTTTTTTTAAATGTCAAAGATTAAAATAGGCATTTTAAAAATCTAAAGATGACAATGGAACAAATTTGAAAATTCAAGAACCAAAGTGAACATTTTGAATGTTTAGGGATGAAAATGAAACAATCTTGCAAGTTCAGGAACCAAATAAAATTTAAACTATTATTGTTTTATTAATATATTTGAACATGTGGACATGTTAATTGAATGCTAGTCACATGAAAACCTAATTTGTTTATAAAAAAAAATTTAACTTAGGCCCCATTTGATAACCATTTGATTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAGGCTTATTTTCTAACAAATTTCCTACCATGGTTTTCATTCTTGTCAAGGATACATTTGAATTCCTAGCCAAATTTCAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAAACTACGACCCCATTTGATAACCATTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAAGTTTAAAAACACTACTTTCACCTACTAGTTTCTTTGTTTTTCTAATACCCTTCTTTCCATATTTTAAAAAACCAAGCCAATTTTTGAAAACAAAAACAAGTAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGGCTAGGAATTCAAATGTATCATTGACAAGGATGAAAACCATGGTAGGAAAATTGAGAGAAAATAAGCCTAATTTTCAAAAACCAAACACAAAAAACCAAATGGTTATCAAACGGGGCATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAACATGAAAAAAAATGTATTAGAAAGACAAAGAAACTTGTATGTGAAAGTAGTGCTTGTAAGCTTAATTTTCAAAAACCAAATGGTTATCAAATGGGGTCTTATCTATTAAGTAGATTTCATTTTCTTCTAACTTACATGTCTCAGTGTCTAAATGATAATAAAACAATAATTTTAACCAAAATTGAGAATTTTAAAATATTAAAGTTGAAACTCAAAATTATGTACCAACCATTTGAAATATTCAACGAAATATATATTCAAACCATCTTACCATCATTTCTACTCATGAGAAAGGAGTAGGAAAAAGAAAAAAAAGGAATAATCATTAAGGGAAAAAATGACAAATTATGGAAAAGTCCAGATTTTTGGACACTTCACACTTCCTCCCTTTTCCTTAAGTCAGCGTTCGCCTTTTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTATTATTTATTCTCTTTTGCATTTTACTTTTTCATTTTCAACTTTAATATTATATTTTATTTCTCTTAACTTTTAGATTAAACAACAAATTTAATCCAACACTTTGATGATTGTATTCATTTGATCTTTTCAATTTTAAAGTATTTTGATGGTTCAGGTTGAAAGTGTGATTAAAGTCCCATATTGGCTAAATTAGAGGAATATGTATTTAAGGAATGACAAATATCTTCACTGACATGAGATCTTTTGGGTGAAACCAAAAGCAAAGTCATTAAGACTTATGCTCAAAAGGAACAATATCATTGTGGAGATTTATGGTACGTTGTGTATATAGGAATGTCATCAAGATTCTATGGGAATCAATTATGTCTCTGTTTATTTTATAGGATTAATTATTAAAATCTTATGTAATTTTAATAGATTAATCTATAAAACAATCAAAATTAATTCAAAGTTCTAATAAAAATGAATTAACTAATAATCCATGAATAATTTTTTTCTAATGGATCAAGGAATAATTTTAATTGAATAAATCAAGTTTATTTGACTAATTAAAAATATTTATTTAATATTTTCAATAAATATCTTTAATTACATTAATTTTAAGTTTTACTGTAAGTTTTATTGATCCACAAGTTAACTAATGAATAACTTTACCAAAACTCCAATGAATATATTTTTCTAATTGATCCATAAATAATTTAATTGAATAAACTAATTTAATTTGACTAATTAAAAATATTTATTTAATATTTTTAATAAATATCCTTAATTACATTAATTTTAAGTTTGGTTAATCCACAAATTAGCTAATAAATAACTTTACCAAAACTAACCAATTTTAACAAAATGCAGCTCTAACATTGTTTTTCTTTTATCTTTTTATCAGTCTTATATCATACATGCGTTTTATAATCTATTGAAAACATACTAGAATACTTTTTTTAACGATTTTTTTAAAAAGATATGATTATTTCATTACAATTGAATGATTAACTAGGTTAATTCATACATTATTTGTTAGGTTGATCATAAAAATCAATTTAAATAATATAATTAAATTTATTTTATTTTATTTTCGAGGAATATATAATTAATTTTAATAGATTGAATAACTTATTAGGTTAATTCAACATATTATTATAAGCGTGCCTCAACATATTATTATTTAAAAAAAAACATATTATTATAAAATAAGTTTTATTTGTTGGAATTTTACAAATAAAATGTGAAAGAAAGTGATTTAAATTAAATTCATCAAAAGTTTCAAAATGGATTGTAACATCAAACTCAATTTGAAGTTTCAATTACAAATTTAACATATGGAAGTTAAATTTTGTGTTATAACTCAATTGAGTTATATTTTTCATATGTTTCAATTTTATTTAATTTTGTTCTTACTAAGTTGCTAGCCTATAAATAGCAACTTGTTTCTTCATTTGAATCATCCTATTCCATTAGAAGCATTTTTTTTCTTCTTTCTTTGTTTCTTCTACTCTTGAGTCAAGTTGGGAGCAAGTATCCAAGAGTTTTGTCAGATCCAAGTAGTTTGAGGTTGTTGTTCTACTGGAATTAGTTATTGTCGTATCCTGCTGAAATGATCGCTATAGCCTGCTTGTAACATGTGTCGAGCGAATAATTGTCTTGAGGACAACGCTTTGTAAGCGTGCCTCGACTATTTATTGTCAATATATTTTGTAACATTATTGTCATATATACAGTGTCTGTATTGTTATTTACACTGTAATTGTTAGTATCCAGTTAAGGTGTAATCAATTTGCAAGTGTAATTCAGTTCTTATTTGAACATATTTCCAACCTTATATATTTTGGATGATTATAAAAATTAATTTTAATAGAATAAATTAATCTATTAAAAGAAAGATGAATATTGATAAAAATATGAGAAAGAGAGAAAAGTACATAAAGAAAACTCATACTTTTATAAGGGTATCAAATATCCACACCCATGGGGTATACAAAACCCATGGGAATAGCTCAAAACCTTGTACTAAACAAGAGATTTTGTATCCCTTCGTCATTTCCATCCTTATTCTTCCCCATCTTTATACCTCAAACAAAACGACCCTTAACCGTCTCTAAATTTTCAATTTTGCTTCTAATAACTTTTTTTGCTAGTGACACTATTTACTTAAATATTGACGTGATTGGTTGATTAGATATATTAAGGAATATTTATTATGATGAAAATATGTGGCACAAAGGAATATTCTAGTTACATAAACTAAGAGAAATAAATAAATAAATAAATAAAATGCATTTTTTTTTTGAAAATATATAAAATGCATTTAAACACACATC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TCTGTTGGCGCGATTTCGGCTAAGGAAAGTTGTGGGTAAGCCTTTTCCTTTCCGATCTAGTTAGTTTAAGGCTCGATCTCACTGTTTCCTCTCTCGTTTAGTCTGATTCGCGCGTGTCCAGCTACTCGAGCTTCACTTTCGAGCATCCTCTCCTCTGTCCAGTGGCGTTTTGACTCCGTTCTAGACCATTGCAGCATCGCCTAG ATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAGAGTAGAGAATATAGAATAGTGTTTTGGGATAGAATTCGGGTCCCCTTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTGCTCATCCTCCTAGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGTGAAACCGAGGCGGCCAAAGGCGGTGGGGACCAAACGGCATCGAACAGACTCGGCCCGAGCGAGCGGGCCGAGGGTCGGCCTCGGCCCAGGCCGAGCAGTGGGTCGGGTCAAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCCCACTTGCTGGTTTGCCTCCTTGGTCCATCTTTCAGGCCGATTTCTCCCCGATTGTCCTTTTGACTACGTGTCCAAGTGGGTGGAAGCCATTGCATGTCATCAGAATGATGCTAAGACGGTGTCAAGGTTTCTTCAATCGCACATTTTTGCGCGGTTTGGGACACCTAGGGCTCTTGTGAGCGATGAGGCCGCCGCTGTCTTCCCTCGTGCCGCCGTCCAGATCTGCAGCCGCCGCCGCTGCCCAGACTGTACTGCTGCCGCCGTCGACACGCCGAGCCGTGGGTCGTCTCTTCTTCGTGAGATATCCCTCCGCGAGCTCTCCCTCTCTCTGCGTCGTCTTCCTCCGCGCATTCTCCCTCTCTCTGCAGATCTCTCTTCCTCTCGTGTTGCTGTGCAGCTCTTCCTCGTGAGTAGCGTCGCCGCCTTCCCCAATCAGAGCCGCAACCTCTCACCCTCTCTGTTGGCGCGATTTCGGCTAAGGAAAGTTGTGGCTACTCGAGCTTCACTTTCGAGCATCCTCTCCTCTGTCCAGTGGCGTTTTGACTCCGTTCTAGACCATTGCAGCATCGCCTAG ATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAGAGTAGAGAATATAGAATAGTGTTTTGGGATAGAATTCGGGTCCCCTTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTGCTCATCCTCCTAGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGTGAAACCGAGGCGGCCAAAGGCGGTGGGGACCAAACGGCATCGAACAGACTCGGCCCGAGCGAGCGGGCCGAGGGTCGGCCTCGGCCCAGGCCGAGCAGTGGGTCGGGTCAAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCCCACTTGCTGGTTTGCCTCCTTGGTCCATCTTTCAGGCCGATTTCTCCCCGATTGTCCTTTTGACTACGTGTCCAAGTGGGTGGAAGCCATTGCATGTCATCAGAATGATGCTAAGACGGTGTCAAGGTTTCTTCAATCGCACATTTTTGCGCGGTTTGGGACACCTAGGGCTCTTGTGAGCGATGAGGCCGCCGCTGTCTTCCCTCGTGCCGCCGTCCAGATCTGCAGCCGCCGCCGCTGCCCAGACTGTACTGCTGCCGCCGTCGACACGCCGAGCCGTGGGTCGTCTCTTCTTCGTGAGATATCCCTCCGCGAGCTCTCCCTCTCTCTGCGTCGTCTTCCTCCGCGCATTCTCCCTCTCTCTGCAGATCTCTCTTCCTCTCGTGTTGCTGTGCAGCTCTTCCTCGTGAGTAGCGTCGCCGCCTTCCCCAATCAGAGCCGCAACCTCTCACCCTCTCTGTTGGCGCGATTTCGGCTAAGGAAAGTTGTGGCTACTCGAGCTTCACTTTCGAGCATCCTCTCCTCTGTCCAGTGGCGTTTTGACTCCGTTCTAGACCATTGCAGCATCGCCTAG MLKSANRTVGSGKVRARGESREYRIVFWDRIRVPFFSGEEGYKYLLILLGFLGIRRRFRSNQVKPRRPKAVGTKRHRTDSARASGPRVGLGPGRAVGRVKNPTPSVLARPTCWFASLVHLSGRFLPDCPFDYVSKWVEAIACHQNDAKTVSRFLQSHIFARFGTPRALVSDEAAAVFPRAAVQICSRRRCPDCTAAAVDTPSRGSSLLREISLRELSLSLRRLPPRILPLSADLSSSRVAVQLFLVSSVAAFPNQSRNLSPSLLARFRLRKVVATRASLSSILSSVQWRFDSVLDHCSIA Homology
BLAST of Lag0041289 vs. NCBI nr
Match: XP_024964983.1 (protein NYNRIN-like [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 5.5e-12 Identity = 36/44 (81.82%), Postives = 39/44 (88.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. NCBI nr
Match: XP_024962120.1 (uncharacterized protein LOC112502446 [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 2.1e-11 Identity = 43/86 (50.00%), Postives = 52/86 (60.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. NCBI nr
Match: XP_024963106.1 (uncharacterized protein LOC112503277 [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 79.0 bits (193), Expect = 8.0e-11 Identity = 34/42 (80.95%), Postives = 37/42 (88.10%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. NCBI nr
Match: XP_024965836.1 (uncharacterized protein K02A2.6-like [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 77.8 bits (190), Expect = 1.8e-10 Identity = 33/40 (82.50%), Postives = 38/40 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. NCBI nr
Match: XP_024962710.1 (uncharacterized protein LOC112502921 [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 3.0e-10 Identity = 41/86 (47.67%), Postives = 51/86 (59.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DR08 (uncharacterized protein LOC111023021 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023021 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.1e-09 Identity = 31/57 (54.39%), Postives = 41/57 (71.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A803R2M6 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 3.6e-09 Identity = 44/96 (45.83%), Postives = 54/96 (56.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9FX66 (Integrase catalytic domain-containing protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS19471 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 6.2e-09 Identity = 35/72 (48.61%), Postives = 46/72 (63.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9I071 (Reverse transcriptase OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS45276 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 8.1e-09 Identity = 34/72 (47.22%), Postives = 46/72 (63.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9GEK9 (Reverse transcriptase OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS25750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 8.1e-09 Identity = 34/72 (47.22%), Postives = 46/72 (63.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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