
Lag0041260 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGGAGATGGTGGCTACATGCGGATCGACGATAGTGTCAATCGGAAGTGGAGGTGGCGTTGGGACCTGAGGGTGACATTATCTATATGCGAAGATAGCATTGATTGGATGTGAGGGTGGCTGTGTTGGATGTGGAGATCGACAAAGGATACAAGATGATGTTGGAGAGGATGATTAAAACTGTGGCTAGGGTTTTGGCGAAAACGACTAGAGTTTTGGCGATGGTGGCTTGGATTTGAATAGTGTCAAGTCTTTGATACCATGAAACTATGTATGAAGGATGATAATATTCTGTATTTCATTGAGGGAGAAGATTTGGATTTATCTTATTTTTTTGATAAGAAACATCAAAAAGATTATATTTCAACAAAATGGCATAAACAACCTAGGGGACAGGGGTAGAGATCTCTCCTATCCAAAATCTATCTCAAAAGAGTCGGCCAAACAATCATTCATAAACTGTAATTACAATTATTATTTTTAATGTGTAAAGCAGTCCACCTGAGGCCACATTTTGTACACGATTACAAAAGTAATCGAAGCTATAGGATTTATCTTCGAAGGTTCTAGCATTTCTTTCCTTCCACAAAATCCACAAAATTGCCCTAAATGCACAACTAGTTACCACCCTAGCTTTCCTCTTCAGATTCCAAGCTAAAAGTCCTTCTGTCAACCAATCATCAACCCTTTTGGGGATGCAAAAAGATATACCCAAAAGCCTGGCAAATTGGCAATAAAACTCCATGCCTTCCAAGCAAAATCACAGTGAATAAAGATATGGTCTAGACTTTCCTCCATCTTTAAGCACAATCTGCAAGCCAAGGGGGATAAGGCCAAGTGACTGAACTTCTTTTGAAGTCTTTCATCAGTATTAAGGCTGCGGTAAGCCAATGACCACGAGAAAACCTCAACTTTCTTTGGACATTTGTGCTTCCAAATCAAGTTGGTAATAGCCGGGAGAGGATTTGGATTTATCCAAAGAGACTCCTAAGAAAAGCTGCTATCAATCTAAGCCTATCTGGAAAAGAAAAAATACAGGTATAAACACATACAGGGAAATAATTATCAGCACATACAAGGAAATAATCTCAAATATATTGACCTAATTTACAGCATGATTTTCTTCTGTGAACTTCCATAGTTTTTAGTTTTCAAGGCTCAAAGGTGCCAGCAACCTTTTGAATTATTTTAGTTGGATGGTTTGGTCGGTTTTATTTCATATTGAAGTCTAATAATTAAACCTATTGTAATGGTTTTTGAAGGTTCTCTATTGATTAATTGATTTTAACTTCTTATTGATCCCCAAATTTATTTTATTTCATGCAGAGGCATAGAAGCATTGCCTATCAATGTCGATCCCATTCCAGAAGATATAACTCAGGACTTTGGGCTTTTACGTCTTCATGATGTAAGTGTCCTTTTGCATTTAATCTAGTGGAAAATGGGAGAGGTTTTGGGGAAAATACTCGATGTTTCATTTACTACAGTCCTGTATATGAAGCCATAAACTAATAAGCATTAAAATTCGAATAAAAAATCTTGGAACCTATATTTGTAAAGGCTCTCGGTTGGTGTAAATGTCTTTATTATTCATTTACAAATTATAGTATTAATGATCATCAGATACATAACATTGCCAACCTAAGCATAGCTCAATTGGTCAAGACATTGTATCTTCAACTAAGAGATTAGAGGTTACTCTCATGTGTTGTTGATCTCAAATAATATGCATAACATTTAATTTTTGTTTGTAACTTAAAAAAATTTGAATATTTGTTTTCTTAACTTCAAAACGTTTATTTCCTAATTAATTATTTGATAACTTATTTTTTTTTCCATTCGGGCTTCTGAACACCCCAAAAGGTTAAGCGTTTGAGAAGAAATACTCACCAATCCACCAAAATGTTGACCAATCACTTCAAAAGTTGAACGATTCCAAAGAGACAGAGGTAAGTTCTTCACAGAAATCCAACCTCCATAACCTTCAATAACTTCTGGATGAAAATGTTTTTGACATGACCAATTTTCAATTTTCAAATGAAGGTTTCCTATGAGTTTCCACTTCCCATCAAATTTCATCTAAGAAAAACTATCGTCCAATTTCACCAAAGCTTTGTCAGCCATAAAAGGGTTGAGTAAAACCTTAGACTGAAAATAATCTTCCAAATCTTGTTTTACTTCCCTCCAAGAGTTATGTGCAAACATTCTGGAAACCACACAAAATTCATCTAACTTTAAGTCCACCACTTCTTTTTCTTTTTTGACCCAAAATGAAGAAAATTCTGGCAGCTAAGGAGCACGAATATGGACACGAGACACGAACACGGAGACACATCATTTTTTTAAAATCTAGGACACAGACACGACACTGACACGTTTAGTAAAATATAAAATTTTCAAAATATTTATCATTTTTATACTAGAAGGAAATTCAAAATCAATAAGTTTATGCATTTATATCTTTAAAATAATGAATTTAACGTATTTCACTCTTAAAATTTAACAAGGGTTCTATATAGACCTATATTGACATTGTACAACTAGTGTTTGTCACATATCAATTATGCTAACAAGTGTCTGACAAGTGTCGGAGTGTCCAAGTGTTCGACACGTGTCGTAGTGTCCAAGTATCCGACACGTGTCGGACACATACACACTAGCCAAACTAAAGTGTCCGTGCTTCTTAGTCTGGCAGCTTCTTAGAATGGAAACCATGATGGGGATGCCCTGATTTTGACCACATCACTTCGCATATCTTCTATCCAAATTCTTACTAATATTAACAGCCGACTTGGATGACTCTTCAATCTCAAACTTCTTTGAAAATTTTTAGCCGACTAAATTTCCACATATTCCCTAAGAAAATCTCTTACCATTTCCCAAAAAATTGACCAGCCTTTCTTAGCAAAACCAGCAGGAACTTGGGCGATGTTGAACCAGAAGCATTAAGCATAATAGACATGAGAGACCTGACAGTAAAATGCTTCGATTGATCAAAGGATCAACACCAAGAGTGATGTAGCCGAAGGTATGAATAATTTAGAAAGTATATTCTGATTTAAACTGAAGGCAACCAACCTTTAAATAGGCTTTTACAATGGGCCTATAATGGGCTTTAGAGATTAACAGATAGCACATGCTAGTCACATGGCCAAGAACCTAAACAACTAACTAACGGCTACATAAGATTTCCCCACCCAACAAAAATAACTCGACCTCGAGTTAGGTAATAAACGACCAAAAAGATGCAACATTTCTTCCCGAGACATAGATGTAACTTTTTGCGTGAAGCAGATTAGTCCACCAATCTTTAACGGAAAAGCCACTAACAAATTTATCTTGATGGTTCCCGTTGGCAGTCGCTGGCTTCTCTCCAATGCCAATGTTAGAATCTGTGTTCTTCGCTGGAGCTTTCATCTGCAAGAAAATTTTCAACAACATCTTCACGCTTCACATAATATTTGTCTTCTTTGGTCATTTGCAGGATTCCAAGATGATTCCAAATCTACTCCAGTGCTTGGTATCCAACAAAAAAACTCCTCTTCCTCAACTGTTCATATAGGATATGAGACCTCTGGTTCATTATTTTAACATCATCCAAAGTTGAATTATTATGCTGGCCATTCTCTATAGGGTTCTGGAAGCGGTTCCTAAATTCATGATTACTTCCCAAGAAACCTTCTCTCACAAAATAACCCATACAATTATTGTTGAATTCTTGTAGCATTGGTCGGCGTTCTTGATGGATTCTTGGAGGCAAATCTACTTCTTGGATTATTCTTTGTTCCATTCCTAGCTTTTCTTGCCACTGTCTTGTTTTGAAATCAGCTCCTAGCTTTTCTTGTTTTGAATTCAACTCCTTTGTTCCATTCCTAGTTTGCATCATCGGGTTTGTTGATTGTTGATCCGGTTTAATTCCCAACTTCTTGCAGATTACTTCTAAGGTTTTCTTGATCTCACCCACATCATTCTTCAAGATTTTCACATCTTGTTCAACCAACAGCAAGCATACGGTTGTTGCTCGTGGTGAGAGGACGGTGGTTGACTCTGCCTCTTTTCCAACCAAAGATGAATCTCCTCCCACGTTGGTCGAGACTCACTTGGTCGTCATAGTGGAAGCGCCCAAAAATCGTGCGCTCTGATACCAATATGATGTAGCCGAAGGTATGAATAATTCAGAAAGTATATTCTGATTTAAACTGAAGGCAACCAGCCTTTAAATAGGCTTTTACAATGGGCCTATAATGGGCTTTAGAGATTAACAGATAGCACATGCTAGTCACATGGCCAATAACCTAAACAACTAACTAACGGCTACATCAAAGAGTCATTCATTGATCATAACATAGCAGATGAAAGAATATGTGAGAGACTAGTCCATTCAATCACTTCCGAATCATTTAGATTACATTTGAGCCCCAAGTCCCATGTCGCATAAGAACTATTCCAAACTTGATGAACCGAAGCAGTAGATCTAGTAGTTAAGTGGCAATAATTCCACATGGTAGCCAAGAGTCATGCCAGAAATATATATTATGACCATTTCCAAGAACTCTCTAGATACAATTTTCAACAAGATCAATTGTAGTACAAATATAACGCCAAGGTGATTTCTACGGACCTCTCAAAATTTTGTTTGGCCACGTAATATTATCATCAACATAATAATATTTACCAACAATGATATTGTTGGTTTATGTTTTTATATTTTCCTTTCTTAGTGAGTTATTTTTGTGTATTCTTTCCTTTTATGTTTTATGTCTTTCCTTCTCTTTAAAAAATGTTCTTGTATCTTGTGTAATTACCAAATTATTCAATAGAAGAGAAATTAACTTTCAACAGATATTGTACCAAAGAGAACCTTGCTCATGTAAGAATCTCCAGATCCATTTAGCCATAAGAGCAAAATTTCTATTTCTAAAATGACTTATATTCAAACCACCCAAGAGAATAGGGAGCTGAGTTGTCTCCCATTTAATATTATGCATACC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ATGGTTGGAGATGGTGGCTACATGCGGATCGACGATAGTGTCAATCGGAAGTGGAGAGGCATAGAAGCATTGCCTATCAATGTCGATCCCATTCCAGAAGATATAACTCAGGACTTTGGGCTTTTACGTCTTCATGATGCATACAATGGAATTCATCAGCCAAAGAGTATAAAAGAAGCTGATTTGGCTCGCAAACGTTTTATATTTGATGAGTTCTTTTACCTGCAGTTGGCACGCTTATTCCAAATGCTTGAAGGCCTCGGTACAGCAATAGAGAAAGATGGTTTGCTGGACAAGTATCGTCAACCTCATTTAAATGCTGCATATATGAAGGAATGGTCTTGTCTCACCCAAAAGTTTCTTAAGGCTCTTCCATATTCCCTTACAGAGAGTCAGATGAAAGCTGTTGCAGAAATTGTTTGGGATTTGAAGCGACCAATTCCTATGAATAGGCTCTTGCAGGGTGACGTAGGATGTGGGAAGACAGTGGTTGCTTTTCTGGCATGTATGGAAGTTATAGGCACTGGATATCAGGCAGCTTTCATGGTTCCGACTGAATTGCTTGCTATTCAGCATTATGAGCATTTGCTTGGTTTGTTAGAGAACATGGAAGACATCGAGAATAAACCTTCTGTTGCTTTACTAACAGGTTCTATCCCATCAAAACAATCACGGATGATTCGTCAGAGCCTCCAAACTGGAGAGACTTCTTTAGTTATTGGAACTCACAGTCTAATATCAGAAAAAGTGGAGTTTTCTGCTTTACGCATTGCAGTTGTGGATGAGCAGCATCGTTTTGGTGTAGTTCAAAGAGGAAAGTTTAGCAGTAAGTTATTCAACAACTCCTTAAGTTCGAAAATTGCAGCCGAGGATTCTGATGGAACTTCAACTGTAGATTTCTCTATGGCCCCTCATGTTCTTGCGATGTCGGCCACTCCTATTCCAAGGACACTTGCTCTTGCATTGTATGGGGACATGTCGCTAACTCATATCACTGATTTGCCTCCTGGACGATTACCAGTCAAAACATATTCTATCGTGGGAAATGATGAAGGCTTTGAGAAGGTTTATGAGATGATGCTGGATGAGTTACAAATGGGAGGAAAGGTGTATCTCGTGTATCCAGTGATTGAGCAATCTGAACAGCTGCCTCAGCTTCGTGCTGCTTCAGAAGGTCTTGAATCAATTTCTTACAGGTTTCAGGACTATAACTGTGGGTTGCTGCACGGCAAAATGAAGAGTGATGAGAAAGAGGAAGCTTTACGGAGATTTCGGAGCGGAGATACTCAGATACTACTTTCTACCCAAGTCATTGAAATTGGAGTGGATGTTCCTGATGCATCAATGATGGTTGTTATGAATGCTGAGAGATTTGGAATTGCTCAGCTCCATCAACTAAGAGGACGAGTTGGACGTGGAATGAAGAAGTCTAGATGCATTTTGGTGGCATCTACTGCAAGCGGCCTAAGTCGCTTGAAGGTGTTGGAGAATTCGTCGGATGGTTTTCACTTGGCAGAAGTTGATCTTCTTTTACGTGGACCTGGTGATTTGCTTGGAAAAAAACAGTCGGGGCATCTTCCAGAGTTTCCAATTGCAAGATTGGAGATAGATGGGAATATTTTGGAAGAAGCACATCTTGCTGCTTTGAAAATCTTAAGCGTCTCTCATGATTTGGAGCAGTTTCCTGCCCTCAAGATGGAGCTCAGCATGAGGCAGCCACTTTGTCTCCTTGGTGATTAG MVGDGGYMRIDDSVNRKWRGIEALPINVDPIPEDITQDFGLLRLHDAYNGIHQPKSIKEADLARKRFIFDEFFYLQLARLFQMLEGLGTAIEKDGLLDKYRQPHLNAAYMKEWSCLTQKFLKALPYSLTESQMKAVAEIVWDLKRPIPMNRLLQGDVGCGKTVVAFLACMEVIGTGYQAAFMVPTELLAIQHYEHLLGLLENMEDIENKPSVALLTGSIPSKQSRMIRQSLQTGETSLVIGTHSLISEKVEFSALRIAVVDEQHRFGVVQRGKFSSKLFNNSLSSKIAAEDSDGTSTVDFSMAPHVLAMSATPIPRTLALALYGDMSLTHITDLPPGRLPVKTYSIVGNDEGFEKVYEMMLDELQMGGKVYLVYPVIEQSEQLPQLRAASEGLESISYRFQDYNCGLLHGKMKSDEKEEALRRFRSGDTQILLSTQVIEIGVDVPDASMMVVMNAERFGIAQLHQLRGRVGRGMKKSRCILVASTASGLSRLKVLENSSDGFHLAEVDLLLRGPGDLLGKKQSGHLPEFPIARLEIDGNILEEAHLAALKILSVSHDLEQFPALKMELSMRQPLCLLGD Homology
BLAST of Lag0041260 vs. NCBI nr
Match: XP_022941704.1 (ATP-dependent DNA helicase homolog RECG, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 1.8e-301 Identity = 527/561 (93.94%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. NCBI nr
Match: XP_022941705.1 (ATP-dependent DNA helicase homolog RECG, chloroplastic isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 1.8e-301 Identity = 527/561 (93.94%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. NCBI nr
Match: XP_022941702.1 (ATP-dependent DNA helicase homolog RECG, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022941703.1 ATP-dependent DNA helicase homolog RECG, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 1.8e-301 Identity = 527/561 (93.94%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. NCBI nr
Match: KAG6600818.1 (ATP-dependent DNA helicase-like RECG, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1043.9 bits (2698), Expect = 5.2e-301 Identity = 526/561 (93.76%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. NCBI nr
Match: KAG7031455.1 (ATP-dependent DNA helicase-like RECG, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1043.9 bits (2698), Expect = 5.2e-301 Identity = 526/561 (93.76%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4INA9 (ATP-dependent DNA helicase homolog RECG, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RECG PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 844.3 bits (2180), Expect = 7.9e-244 Identity = 414/561 (73.80%), Postives = 488/561 (86.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55681 (ATP-dependent DNA helicase RecG OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=recG PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 419.1 bits (1076), Expect = 8.2e-116 Identity = 243/553 (43.94%), Postives = 333/553 (60.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O34942 (ATP-dependent DNA helicase RecG OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=recG PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 4.4e-101 Identity = 211/529 (39.89%), Postives = 321/529 (60.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54900 (ATP-dependent DNA helicase RecG OS=Streptococcus pneumoniae serotype 4 (strain ATCC BAA-334 / TIGR4) OX=170187 GN=recG PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 7.0e-99 Identity = 216/526 (41.06%), Postives = 317/526 (60.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O67837 (ATP-dependent DNA helicase RecG OS=Aquifex aeolicus (strain VF5) OX=224324 GN=recG PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 8.6e-97 Identity = 223/530 (42.08%), Postives = 312/530 (58.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FSV3 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446985 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 8.7e-302 Identity = 527/561 (93.94%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FUH2 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446985 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 8.7e-302 Identity = 527/561 (93.94%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FP75 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446985 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 8.7e-302 Identity = 527/561 (93.94%), Postives = 546/561 (97.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IFJ2 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472714 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1040.0 bits (2688), Expect = 3.6e-300 Identity = 525/561 (93.58%), Postives = 545/561 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IDF6 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472714 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1040.0 bits (2688), Expect = 3.6e-300 Identity = 525/561 (93.58%), Postives = 545/561 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. TAIR 10
Match: AT2G01440.1 (DEAD/DEAH box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 844.3 bits (2180), Expect = 5.6e-245 Identity = 414/561 (73.80%), Postives = 488/561 (86.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. TAIR 10
Match: AT3G02060.1 (DEAD/DEAH box helicase, putative ) HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 1.3e-60 Identity = 155/450 (34.44%), Postives = 240/450 (53.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. TAIR 10
Match: AT3G02060.2 (DEAD/DEAH box helicase, putative ) HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 1.3e-60 Identity = 155/450 (34.44%), Postives = 240/450 (53.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. TAIR 10
Match: AT3G22330.1 (putative mitochondrial RNA helicase 2 ) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 4.5e-08 Identity = 39/144 (27.08%), Postives = 63/144 (43.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0041260 vs. TAIR 10
Match: AT3G22310.1 (putative mitochondrial RNA helicase 1 ) HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 1.9e-06 Identity = 38/142 (26.76%), Postives = 63/142 (44.37%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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