
Lag0040351 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTTCTGCTCGTCTCCCGTCGTTGCACTTCCGCAGTCCGTCTTCTTGGCGGCGAAGGCCATCGGACCACCGCAGAGCTCCGAGATGCCACGGCGGATTCGGCGATGAAGGTCCTCAGCCGGCCTCTGTCTGTGTATTATATCGGCGATCTGATCTTTAGTTTCTTCACGCAATGATCTGTTTGTGTGTTCTGCAGAGAACCAGAAGGACATCGTTGAAGCGAACTTGACGGTGTTGAGAGCGAGAATGGAGGATTTGAGGAAGAAAGAGCGGCGGATTCCGCTTCCGGCACATCGCGGTGGACTCGAATTCGATAATGGCCGGAGCTATCTGTCGATGAGCGATGCGAAGTTGGATCGCGGTTTTGATCGCAAAATTATGAAGAACTTTGCCCTAATTTCAGAGTGCTTGGAGGTGATGACTATGGTTTGTGGTGCATTTGGGCTCGTTCTTGTTGGTGGAACTTTAGGCATCTGTTTGGTTTCTCTTCTAGTTCATCATTTTGGTAATTGATTTGAAGTAAAGGTTTAAATTTCATTTTGGGATTTGAAATTTCAAAATCATTTTATTTTTCAAAATATATTTTTTTAAATTTAAGTTTTAAGAAATAATGTTTTGGCTCAAATAAATACATATTTATCGAGATATATATATATATATATATATTTGAAGTCATGTTTTCTGTTTGTTAAAAAAAAGCTAATGAAATTTCTGTAAATAGATGTTGAATGTGGATTCAAAATTTGTATGCTACTTGAAAATAATGGTTATAGATTCAAAATATGTTTTATAATATCTTTTATATGTTTAATTGATGGTGTAAAACTATTGAGGTTGTGATGATTTCTCCTCATATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTAAAATTAGATTTAAAAAAAAATACAAAAAATTTATCAATCAAAATGAAATTTAAATCCAAAGTAAAGAACGTTGATAGAAGAGAAATCAGTGAGACATGTCCTTACTATAGTTAAGGAATATGGTAGAAATTGTAAAAAATGTAAATTGCATAATGGTTGAAAGTGTGTTTTTTATATATCTTTTTGTGGTTGTAATATAACATTATATTTTGAATTTAATCATTTTTGTGATTTTATTATTATTATTATTATTTGGGATAAAAGTTTTTGGACCCAACAATTTAAAGAGATTGACTTTTTATTTTATATATATTTTTTAATTTTAATAACTATCCGAAGATGTAAAATCTTTAACCCTGTTGATTGATCAGAATATATATCTTAAGAATATATTGTCAATATATATATATATATATATATATACACACTTAGCAATAGAGATTTTATCGATAGATATTCGGAGTATGGTATTAAATTATTAATTTTAGCGGTAAAATATGCAAAATATAAAATATGATATTGATATATTAAATCGTTATATGTTGCAATAGCAATGGTATATTTGTAAGTTAAATTTATATGAAGTTAGGTTTTGCTCAGTGACCCTATTTGAAGATGTTGAAATTAAATCAAACCTTGCTTTCGGATTTTAATTATTTTTAATGTTATCATGTATTTCATACCAATTGCACTATGAATTTAACGAATAACATCATAATAAACTACCATTTATTCCAAAAAAAAAAATTAATTATGTAAACTGAAAAAAACCCATTGCATAAACAGTGTGATAATCGCATATATATGTAGCAAATGTTTTTATTTTACAAATATAATGTCCAGCCATTATTAATATTATTTCAATAATTGTTGAGTTTTTATCGGGCTAATATTAAATTATGATGTCACCAAAAAAAAAATATTAAATTATGATGTACTAAAAAAATATATAAATAAATTATGATGAGTATTAAAAAACCTAGGTACCTTAAAAATGATTAGATATCACCCTACAGATCTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACCCTACAGAAATGAGAGTTAGGGCATGTTTGGGAGTGATTTTGGCATGGCCAAAATCAATTTTGTCATTGCCAAAATCACTTCCCTTTCGAATATTGATGTTTGGCAAATGTTGAAATTAATTTTAGAAAAATCTAAAATCATCAAAAATTGATTTTCCATTAATTAGGTGGGGGTGATTCTTGGTGTGTGATTGACCGGGAATCACTCCATATGTTTGCCCTCATTTCATTAATTTATTGAAATACCAAATTTACCCCTATATTTAAGAAAAAAATTTCAGCCCTAATCGTCCCTCTATTTTGCTCCGCTCATCCCATCTTTTTATATTCAATTTTGCTCCAGTCATCTCTTCACGCAAGCAATGGTTGTATTGGAAATTATTTATATTCTGTATAAAGTATTGTATTTCTTAGTTTAATTAATTTCATCAAATAGGAAATAGCTAATAGAATTTTTATAGGTTTTATTTTATTATTAAAACCTAACAAAAACACTTAAAGAAATATTTTATTTTAATTTTAAGCACAATTTGCTAAAAACAAAAGGCAACTATGTATGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAAACCATGTATATAGTTTATTTGTCTACTTTTTAGTTTTTTAGAATGTAATGTTATAAACATATTTATAAAAAAAAATGTTATAAACATATTTTAAAAGCTATCTCTAAGGTATTAGGAGGAACAATAAATTTGAGCATAATTTACATAAAATACACCCAAATAACTCTGTCTTGCGAAAAAGGAAAAAAAAAAGTGAATATTTTGTGTGTTTGACTTGTAATAACTAAAAAAAAACATCTTACTTTTTTTTTTTTAGTACATCAACATTTGGGGGTGGGGGATTCGAATTTCTGACTTCATGGTCGTGGCTACATGCCAATTACCGTTGAGCTAAGCTCGCTTTGGCAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAACATCTTACTAATAATGAAATCTACTCGTATTTAAATAGAAGATTGTTCTAAATCAGAAAGTGTTAGTTTGTGTCTCTACTTTAAATTATTCTAATAAAATTATTTCATATTTAATCTTATATACTTTTGGAATACATACTCTGTATATTTAGAAAGATAATTATGCATTTTAAGAACAGCAAAAAGCTTAAGCTTGAATGGTAAAATATTAATAAATATTAACAAAAAAAAAGGTAAAACTTGCCTACTTAAACCTTTTTTTTTTTAATAATATAACATAATTATTATAAAACAATAATATAGATATATATAAATATATATATACACTTTGATATTTATCCTAATTATTTAGCCTTGATGTAAAATACTCTTTTTAGTAATTTGGTAATTCTAAAATTACTCTTGAAACCAAACATATAATATTTCAAAATCATTGAAACCAAACATATAATATTTCAAAATCATTTTTAAATATATGAAAATCACTTTTAAAAGTTTGGAACCAAACATAGATATGATTGTATGAAAATCAATTTTATATAATCAATTTTATAAAATCTCTTTTCCCAAAATCAATAATTCAATCATCACTCCCAAACATAGCCTTAAGGTTTCTCTCAACTTGTAACTCCTAATTTTCCGCATGCATGTGATGTTTAACGTTCTAATATATATATATATATATAGTCTTTTTAACATTTAGGTTTTTTTGTTTGTTTAAAAAAAAAGAGTCTTTTTAACAATACAGAGTCACACAAAAAAGCAATTTGATGGGAAGCACAACATATCAAATGTCACGCAATTAAGTAATTTGCCAATAATTATTTGGTCGCGGTACATATAATTAATCCTGTATTTTAATGATTCCACCTCAAAAAATAAAAAAATAAAAAAAAAATCTGATACTGATTGAATTTAAAATTACATGTTGTAGAAAATATATATAGTTACATAATTATTTAATACATATTACTAAATACACATGCTATTTAGTTTCGGTTGTGTATTTAATTTATATAGTTTATGGACTCGCCGTTTCAGTATCTAGTTTCTATAAATCATATTTTTATATTTTAGTTCATTTAACTATCATACTTGTTCATCCAACAAGAGCATGACTCGATTGACATAAAACTTGTATTCCGACCAAGAGGTCGAAGGTTTAATCCCCACCCCACATGTTGTAAAAAAAAAAAAAAACCTATCATATACTGGTTTAATTTGAGCCTAGTTCAACTATTTATTCTTTTTATTTATAGTACAAAACGAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAATTGTAGCATGGGAGACAACATTCACCTACAAAGGGTGCTTAATCCATAAAATTGCGTGAGTAGTCTTTCTCGCATATGGAAGACAAGATCATGATCGCTACTTCGTTACAATTCTTCAAGGGGATCTAAGAAACCCTCCAATTTGATCGTTGTCTAGAATTAGAATTTATGTGTTGTTAGCATTATCTCACGCCAATGCAGTATTAGCAAGTAATAGACTCATACTTCCACCCAGTTAAGACATTATAACTTCAACAACAAAATGTAGATATTTGAATTTTCATTTTTATATATGTCGAACTCAAAGAAAAGTTGTTACATTTATTTCTGATTTGGATTAATAATCCGAACTACTTTAAAAACTATTTAGTAGTTGTCATTATATAGTTTCTTATAAATCATTCAATAAAGACATGACAAAGACACTAACAAAACGGAGAAAATTAAAACGACATGCATTTTACTTGTTGAATATTGTTATAGGCAATTTTGGACCACCCCGTTGTACGAGGAGCTGACGAGGACAATCAGACAGGAAGATGGACCAAGGAGGCAAAACCGGCAAATGAGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTAGGCCCGACCCCCTGCTCGGCCTCGGCCATGTGCCGAGGCCGACCCTCGGCTCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTTCGGTCTCGTCTGGTCCCCACTGCCTCTAGATGCCCCGGTTTCGCCCGGTTTGACCTAAAACGCCTCCGAAACCCTAAAAAGGCTAGGAGGATGTACAGGTATTTATATCCCTCTTCGCCACTGAGGAGGGGATCC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ATGGCTTCTGCTCGTCTCCCGTCGTTGCACTTCCGCAGTCCGTCTTCTTGGCGGCGAAGGCCATCGGACCACCGCAGAGCTCCGAGATGCCACGGCGGATTCGGCGATGAAGAGAACCAGAAGGACATCGTTGAAGCGAACTTGACGGTGTTGAGAGCGAGAATGGAGGATTTGAGGAAGAAAGAGCGGCGGATTCCGCTTCCGGCACATCGCGGTGGACTCGAATTCGATAATGGCCGGAGCTATCTGTCGATGAGCGATGCGAAGTTGGATCGCGGTTTTGATCGCAAAATTATGAAGAACTTTGCCCTAATTTCAGAGTGCTTGGAGGTGATGACTATGGCAATTTTGGACCACCCCGTTGTACGAGGAGCTGACGAGGACAATCAGACAGGAAGATGGACCAAGGAGGCAAAACCGGCAAATGAGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTAGGCCCGACCCCCTGCTCGGCCTCGGCCATGTGCCGAGGCCGACCCTCGGCTCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTTCGGTCTCGTCTGGTCCCCACTGCCTCTAGATGCCCCGTGTGGCGAGCACCACACCGGTGCGCAGGTTTACTGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCTTCATCTACAAATTTACCGTTGATGGCACGTGGAGGTCAGGCTGTGCTCCGAGAACTGTCGCTATCGGCCGATTCACGGAGGCGATGAGCAGCGAAGCCAAGGAACACACGTTCGACGAAGCCACAGCGGCGGCCGAAGAGCTATATCTCATCAGAGACACTTTTTTTCCTGTAAATCCCGATGACAAAACTTCCAAATTGCAAGAGCTCTCGGATCTTGCTGTCAAGATCCTCGATTCTATTCCTCCAGAACAAAGGAAAACACCTTTGCAGCGTGCTATGTATGAATACCTAAGAGGAAAAATGTTGGATGTATTTCCAGAATATAGAAAAGAAGCAGAGGATCATCTCTCCAAAGCTGTTAAGTTGAATCCATCCCTTGCCGATGCATGGCTGTGTTTAGGTAACTGCATTTGGAAAAAAGGAGATTTATCTTCAGCAAAGAACTGCTTTACTTTAGCATTAAACAAGCGCCCTGAGAAAAAGTTACTTTGTCAGTTATCAATGCTTGAAAGGAAAATAGCTCAAGGTACCGAGAATGAGGCAAAACTTGTAGAGGAAAGCATTCAACACGCAAAAGAAGCAGTTACTTTGGATGTGAAAGATGGAAACTCTTGGTATAATCTAGGAAATGCATGCCTTACAAGTTTTTTTGTTACTGGAGCGTGGGATCACAATAAGCTTCTGCAATCTCTGAAGGCATATCAAAATGCGGAAAAAGATGAAAAAATGATGTCAAATCCAGACTTGTATTTTAATTGTGCAACTGTTAACAAATATCTGGAGAATTATGAGAGGGCCCTAAGTGGATTTGAGGCTGCTGCTTTGAAGGATCCTAGTCTTAGTGCTACTAGAGAGGTTCAGAAGATGGTGAATCTTCTTGACAAATTGGAGAACATGTTGAAGGCACATGCTAAAACCCGAAGGGTTCCATCTTTGGCATCATCGGTGGATATTGTTTGTTCGAATTCCTCATACAAGAGAGCCACTGTAGACCATCTGTCAGAGGGTCTGAACAAAACAGTTGCAGTAATTGGAAAGGTCCTGTTCTTCGTTAAGCATGATAGTCTTGCCCCACTATATTATCTGGTGTGTGATTCAAACCAAACATGCTTTGTTTTATCTTTGTATGGTATGCGGAATGATACGGTTAAGGAAGGAGATCAGATTACACTACTGGAACCGTATTCTCGCAACTTTGATTTTTCTTGGAAGGGAAAGCATTACCGGTTCAAATCAATCCGCGTCGATTTCTTAGAACAAGTTCTTGTCAATGGAAAAGCTCCCTCTGCTCACCAGGCAGTCCAGACATCAATATATGCCCAACACAAACCCTGA MASARLPSLHFRSPSSWRRRPSDHRRAPRCHGGFGDEENQKDIVEANLTVLRARMEDLRKKERRIPLPAHRGGLEFDNGRSYLSMSDAKLDRGFDRKIMKNFALISECLEVMTMAILDHPVVRGADEDNQTGRWTKEAKPANETGQDRRGRVLGPTPCSASAMCRGRPSARSRGPSPFGLVWSPLPLDAPCGEHHTGAQVYCLAGHVFPFIYKFTVDGTWRSGCAPRTVAIGRFTEAMSSEAKEHTFDEATAAAEELYLIRDTFFPVNPDDKTSKLQELSDLAVKILDSIPPEQRKTPLQRAMYEYLRGKMLDVFPEYRKEAEDHLSKAVKLNPSLADAWLCLGNCIWKKGDLSSAKNCFTLALNKRPEKKLLCQLSMLERKIAQGTENEAKLVEESIQHAKEAVTLDVKDGNSWYNLGNACLTSFFVTGAWDHNKLLQSLKAYQNAEKDEKMMSNPDLYFNCATVNKYLENYERALSGFEAAALKDPSLSATREVQKMVNLLDKLENMLKAHAKTRRVPSLASSVDIVCSNSSYKRATVDHLSEGLNKTVAVIGKVLFFVKHDSLAPLYYLVCDSNQTCFVLSLYGMRNDTVKEGDQITLLEPYSRNFDFSWKGKHYRFKSIRVDFLEQVLVNGKAPSAHQAVQTSIYAQHKP Homology
BLAST of Lag0040351 vs. NCBI nr
Match: KAG6601256.1 (Tetratricopeptide repeat protein 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 902.9 bits (2332), Expect = 1.6e-258 Identity = 477/644 (74.07%), Postives = 498/644 (77.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. NCBI nr
Match: XP_022150636.1 (tetratricopeptide repeat protein 5-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 786.9 bits (2031), Expect = 1.3e-223 Identity = 391/411 (95.13%), Postives = 401/411 (97.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. NCBI nr
Match: KAG7032049.1 (Tetratricopeptide repeat protein 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 781.2 bits (2016), Expect = 7.1e-222 Identity = 399/467 (85.44%), Postives = 414/467 (88.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. NCBI nr
Match: XP_023514705.1 (tetratricopeptide repeat protein 5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 777.7 bits (2007), Expect = 7.9e-221 Identity = 386/417 (92.57%), Postives = 400/417 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. NCBI nr
Match: XP_022980032.1 (tetratricopeptide repeat protein 5-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 777.7 bits (2007), Expect = 7.9e-221 Identity = 387/417 (92.81%), Postives = 400/417 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8N0Z6 (Tetratricopeptide repeat protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 218.8 bits (556), Expect = 1.8e-55 Identity = 152/414 (36.71%), Postives = 228/414 (55.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q99LG4 (Tetratricopeptide repeat protein 5 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ttc5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 215.7 bits (548), Expect = 1.6e-54 Identity = 148/433 (34.18%), Postives = 230/433 (53.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5BK48 (Tetratricopeptide repeat protein 5 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ttc5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 214.5 bits (545), Expect = 3.5e-54 Identity = 146/433 (33.72%), Postives = 230/433 (53.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0P5H9 (Tetratricopeptide repeat protein 5 OS=Bos taurus OX=9913 GN=TTC5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 209.5 bits (532), Expect = 1.1e-52 Identity = 149/432 (34.49%), Postives = 229/432 (53.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DC38 (tetratricopeptide repeat protein 5-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018722 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 786.9 bits (2031), Expect = 6.3e-224 Identity = 391/411 (95.13%), Postives = 401/411 (97.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IQB7 (tetratricopeptide repeat protein 5-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479525 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 777.7 bits (2007), Expect = 3.8e-221 Identity = 387/417 (92.81%), Postives = 400/417 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H0J5 (tetratricopeptide repeat protein 5-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458836 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 775.8 bits (2002), Expect = 1.4e-220 Identity = 387/417 (92.81%), Postives = 400/417 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KUM0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G611630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 767.3 bits (1980), Expect = 5.1e-218 Identity = 379/417 (90.89%), Postives = 397/417 (95.20%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BFP3 (tetratricopeptide repeat protein 5-like isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489332 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 765.4 bits (1975), Expect = 2.0e-217 Identity = 381/421 (90.50%), Postives = 397/421 (94.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0040351 vs. TAIR 10
Match: AT3G04240.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 7.5e-04 Identity = 33/100 (33.00%), Postives = 51/100 (51.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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