Lag0039884 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0039884
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr13: 633069 .. 637402 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0039884
SyntenyLag0039884
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTACAAGAAGCTGATGAGGACAACCGGGGAGAAATCGGGCATGAAGACGGACCCTAAGAGGCGAAACCGACAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCAACCCCCTGCTCGTCCTCGGCCCATGGCCGAGGCTGAGCTCATGGTCGGCCTCGGCCATGGGCCTAGGCCGAGCCCGTCCGACTCCGCTTGGTCCCTACCGCCTTTGGCCGCCCCGGTTCCGCCTGGTTTGTCCCGAAACGCCTCCGAATTCCTAAAAACCATAGGAGCATGAGCAGGTATTTATACCCCTCTTTGCTACTGAAGAAGGGGACTCGAACTCTCTACTCTCTTCTCTTACTCTCTAGCCCTCCTATCTCCGTTTTCTAACTTAAGCATCGGAGTCGGTGTGGCTAGCACCACACCGGTGTGCAGGTTTTCCGTTTTGCAGGTCACGTCTTCCCCGCTCTCAAACAAATTCACCGCCGATTATCACGTGGAGCGAAGGTAATTTACCTAACGAAATTTGATCATCAACACTATGTATATATGTGTCCCTTTCGAGATGCGAGAATGTTAGGATTTTGTTTCAAATTTCTCGAATTGACTGGAAGAATTTGGATTGTCTACTTTTTTGTATTGGAGTAAAGTCGGTTTGTATGATTGAGATAATTGATGTTTATTTTGAAACTAATTGTTGTGTTTTCTAGTGAATTCTATCTTAAAATTAGCTAGAGTAGAGTTTCAATTCATCATTTTCTTTTGAGAAAATAATTAATGATTTTATCTATATTAAATTGGGTGAAGAATAAGATGGGGTGGAAAATTTATTCTTTATGTTCTCGTCATTAAAATTGTTTGTTTATTTGTGTGTATTTAGGTGAGACTTCTATTAATACTCAAATAAATTTTATCCAATCTTAATATTGTTGAGTTAAAAAAAATTGTAATCTAAATAATTGAATTATTGGATACAAAATATACATTGACTTAAAGTAAGTTTATTTCAATGAACAATAACTATTGTCTTCACTATATCTATTTGTAGATTATTCTAACATTTGAAAGTTATTTTTCTAAAAACAGAAGTATAAAATTCAATGCATCTTATTGTCTCAACCACATCTCAAATGTTTTTAAAAGCAATTAAGTATAAACTTTAATGTCGTCTTATATTTCGTCTCTTTATTGAAAATATTTGTTGGATGCACATAGTTGTTGGGCATTTAGAATTATTTTCCAATTTGATGTGAAATGTCCAAATTGTTAAATAATTAAAATAATTTTCAAACAATATAATAATTGAATTTTAGTAATGGGTATTTTGTCTATGAATATGATATAGACTATAAGGTTTTCTCGTATTGGAAACAAAAATGTGACCTATGACTATTTAAATAGTATATACCAATATCTTTCAATAGATTTTTTTTAAAATTTAAACCATTAATCACCATTTATCAAATTGTAGGTCTTTGATACTTTTTTCAAATATATATTTTAAATATAAATATATAACATTCATAAGATTTTATTTAGATTTTGTCGAATACTATGACTTGTGGTAGATGTTGATAAATTTTTAAGATACTTTTATCATTTATAATAAATTAATTATCGACGTGTGAAAGAAATGATAAAAAATTACTCTATTAATTAAGTTTTTTTTTTTTTTGAAAAATACTCTATTAGTTTTTTTTTTTTAATAAAAAAAATACTCTATTATTTAAGTTGACATATAAATTTCTTTTAGAATATTCGTATGCAAATTATTTTGAGTTACTTTATTGCTTTCTTGAATAAATAAATAAAGTAATAAACCAATCAACGACTCTTCCAGGAAGATGTTGGATTTATGGGAATTGGTGCACGTGTAGTATGGCTCTTCAAAAAGTTTTTGTAATAATAATATTTTTTTTTTGTTATGTTCGAATATTATCACGCAAGAAAGTATAAAGGGAGGAAGATTTTTTTTATTTCAAAAAAAAAAAAGAGAGGAAGGTTTTTCTTTAATAAATTAAGGATAATGATTCTAAAAAAAGTAAAATCTATTTGTAGATATTGTCTCATCCTATTTACAACATGTTAAAATACAGTTGACGTTGATTTTTATTGGTTTAGTTCAATCACACGTGGATGGAGAGATTTTAATATCTAACACATCTTGAATATATGTTTAAGTTGGTAGTTCATGTTAAACTTTTAGAATTCATACATTCATGCATGACCCACCCTTAAGTTAATTTTTTAATTTTCATAACACAATTAGAAACTTTCAATGCCTTAAAAATAAAAACAAAATTTTAAAAATATTGTTTTTCAAAAAATATCATTTTACTATTTGAATTTTCTAGATTATATTAGTCCTTCAATTTCAAAAGGTTTATTTTTAGTTCTCAAACAATTTTTTTTTAAAGTTAAAACTGATATTTGAGGATGGAGACTTTCAAACTTTTGACCTCTTGGTGGATAATAGATGTCAATTATTGTTGAGTTATATATGCTCATTTTGACAATTTCTTTCAACAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTCAAATATATGTATTAATATACTAACATGTGTATTTGAACCACTTTAGATAAACTAAAATAGAAATGAAATCAAAACTAAAATAGATCTTTCGAAAGTTTAGAAATGAAATCAATAAAATTAAAATTTTAACGAGTAGAGTAAAATAATTCTAAAAGTTTGAGAGACGAAAATGAAACTTAAACCCGAAGTAAATGATATATTTAGGTTGACACAAGAATATAAGAGTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGATAATTATAAAAGTTGGAACTTGGTACTTTGTTAGGTAGGTAAAGAATAATGTACTATGAGCCAGAAAGGATAAGCTTTAATTTTGGTATTTATTTAATACAAAAAGAGAAGTGATGGGTTACAAAAGAGGAAGGCAATAATATAAAGACTGGAAAATTGGCACTTTGTGACTCTTTTTTTCTTTTCATCTTAGAAAAATGCAGTGGATAACTCCCCTTGTATATGCAGAAGCCAGCAGAAAGTACTTCCTTTTGACAGCTTGTTTTTCAGTTATCAATCACTACACGAACCCACTTTTTTCCCTTCCAAAAAAACTATATTTCATGTTTCTGCAATGTATTTCATATTTTATAGTACATTTAACAACAAACCATTACTCTAAAGTGAGTATAACTCAGCGGTAATTGACATATGCTCTCGACGAAGATTTTGGAGATTCAAATTCCTCCACCCTAAATGTTGTTGAATTAAAAAAAATATATATATCATAAAGCCAATACAAATTCTTACAAATATATGTGGATAAGCATACATCTCTCTTGCCAAAACGAGGATAGCTCAATAATAATTAACACGTATTATTGATCGAGAGGTAAAAGATTTGAGTTTTTCCACTCCTAAATGTTGGTGAACTAAAAAAAATACATTTTTTCCTTTTTAAGTTAAAAAAATTGTAGAGGTGAATAATGAATTTTGTTTTGTTCGACAATACGTGGGTGTGGAAGAATTCGAACTTCTGATTTCTTGGTCGATGATATATGTTTTAATATATTGAACTAAGTTCAGATTAATGAGTGATAAAGAATAACTTCAACTTTTTAAAAAAGTAATGAATGTTTGCCCACTTAACCATGTTCAAACAACTAAACAGCTTGATAAGTAAGAGCATATTTCATCTTTTTAATAAAGTTATATATTTCATGTTCAATCATCTTTCCATCACCTTTATGCGAAAAATATGTATTAAAAAATGATTAAAAATATTATTTTAGTCTTTGTAATTTGAATTTCATTCAATTTTAATCTCTATACTTTTAAATGTTCAACACTATCTTCTATATTTTCAATAAATCTCAAAATTAATCATTTAAAATTATTTTTTCTTCATGTAATAAAAGACATGATGCAAATATATTTTCTAAACTTATAAAGAAAAAACTAATACAGATTAAATTTTTGTTTAGAAATTTTAATAATAAACTAATGGTAGATACATACTTTAAGATTTATTAAAAGTATTAAAAATACTCTAAAATGAAACGAAATTCAAAATATTAAAATATATATATATATATTTTTTAGAAAGGAGCGTATAAGGGCACGGGGGGCTCACGCTGGCAGCACACGCCGTCGAGTCGTCGGGCACGCACCGAACCCGGTTTGAGGGGGTTGCGCGACTCGGAGCCACCAGCCAGCCACACGACTAGCCGTTACATCATCAATTCGCTCAATCTCCAGCCACGTATTCGCTTGAAATCCACGTGGCACCACCTCATTCGAGCACCGGATTCAATGACATTAACGTGA

mRNA sequence

ATGTACAAGAAGCTGATGAGGACAACCGGGGAGAAATCGGGCATGAAGACGGACCCTAAGAGGCGAAACCGACAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCAACCCCCTGCTCGTCCTCGGCCCATGGCCGAGGCTGAGCTCATGGTCGGCCTCGGCCATGGGCCTAGGCCGAGCCCGTCCGACTCCGCTTGGTCCCTACCGCCTTTGGCCGCCCCGGTTCCGCCTGGTCACGTCTTCCCCGCTCTCAAACAAATTCACCGCCGATTATCACGTGGAGCGAAGCACACGCCGTCGAGTCGTCGGGCACGCACCGAACCCGGTTTGAGGGGGTTGCGCGACTCGGAGCCACCAGCCAGCCACACGACTAGCCGTTACATCATCAATTCGCTCAATCTCCAGCCACGTATTCGCTTGAAATCCACGTGGCACCACCTCATTCGAGCACCGGATTCAATGACATTAACGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTACAAGAAGCTGATGAGGACAACCGGGGAGAAATCGGGCATGAAGACGGACCCTAAGAGGCGAAACCGACAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCAACCCCCTGCTCGTCCTCGGCCCATGGCCGAGGCTGAGCTCATGGTCGGCCTCGGCCATGGGCCTAGGCCGAGCCCGTCCGACTCCGCTTGGTCCCTACCGCCTTTGGCCGCCCCGGTTCCGCCTGGTCACGTCTTCCCCGCTCTCAAACAAATTCACCGCCGATTATCACGTGGAGCGAAGCACACGCCGTCGAGTCGTCGGGCACGCACCGAACCCGGTTTGAGGGGGTTGCGCGACTCGGAGCCACCAGCCAGCCACACGACTAGCCGTTACATCATCAATTCGCTCAATCTCCAGCCACGTATTCGCTTGAAATCCACGTGGCACCACCTCATTCGAGCACCGGATTCAATGACATTAACGTGA

Protein sequence

MYKKLMRTTGEKSGMKTDPKRRNRQVGRAKTEGVGFLAQPPARPRPMAEAELMVGLGHGPRPSPSDSAWSLPPLAAPVPPGHVFPALKQIHRRLSRGAKHTPSSRRARTEPGLRGLRDSEPPASHTTSRYIINSLNLQPRIRLKSTWHHLIRAPDSMTLT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..28
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 94..127
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..45

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0039884.1Lag0039884.1mRNA