Lag0039514 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0039514
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
Descriptionbeta-amylase 2
Locationchr2: 45460874 .. 45468796 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0039514
SyntenyLag0039514
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTAGGCTTATTGAGTCGGTGTGCAGGTCACTCTGACCCATACAAATCAAAGGACAATCCCTCGTGAACAGGAGTCCATAACTCACTCAGAATTAAGACTAAGTTGTGTTGATGGTCTGCAAGTTCACAGGTCACAAGTAATAAAGAGACGGTAAGTAAACCGAATATCGTATCCACGGGGAGTAGCGTGACTTAGGCAAGCAAAGATTCTAAACACTAAAATTAACAAGAATGCATATTATCTAGGTAATCCAACGCAGAGAGAAATTAAAGCAAACAACGAAATATTAAAGCAGTAAATTGATCAAGCAGAGGTTCACACACTGAGGGTTCACAAATAGGATGAGAGTTCGGGTCTTGAAATCCAATATATAATCTACTAGATATTTGACTGCTTATTATTATGCCCACTAATTATAGATCTAAAATCTACTTAATTAACATAGGATCTCCTATCGGTTTCCCCTAATTATCGTTAACTCATATTAATAACCTAAGTGTCCTTAGCGCTATTAATTGGGTTAAGTCTTAAGTCCTGATTCATTTTAGATTTCTAGGCCTAACCAACTACTCTCGCTGTCACTACGAGCAGTTAAGTCTAGTTAATTGAGCTATGTCCTAACTTAGTTTCTCTCCGTCAAGTTTCCACTAAGTAACAGATCAATATAAATTTGGCCAGAATTTATAAAGTATTACGACCACTCAATTAAATAAACAGCAATTGGACACAACAATAGTAGTCAAAGGACGAGCCCTCATAGATAGGAGTTCATAACTCACTCAGGAGTGAAATTGAATCTCATATGATCCTCCTATGAAATATTAATCTTCTCAATTAACAAATTTATATAGAGAAACTAAATATTTTGTGGTCCAGTCTTATACAAACTTATTGTATATGATACCCCCACTTACATGTCTCCACATGAACGATTTAGATCAAATCATTTGTAACTACTCACAAAGTGATCCATATTAATAGTGTTTCTAAGATAAAGCACCCAAGCTTATTTATATAATATAGACTCTCGTTTGATTATTTCTTGAACATAATCCTCCTATATTTCAACCACATATTGTTCAAAATTACACTAATAATATGAATTTTTCATATAATGGATTATGTAAATTGCAATTAAAAAATTATCGGTTAAAAATCACTTTTAGTCCTTACACTTTCATGAAAGTAACAAATTAGTCCTTGAACTTTGATTTGAAACGATCTAGTCCCTGTATTTTCAATTTTGTAACAATTTGGTCCATATACTTTCACTACTACAAATTTGGCCTTTGTTGACGCTTGGCTTTTTACGTTTATTGACGCTTGTGTCAAAAAAGCGTCAATAAACATAATTTTTATACTTAAATAGATATATTGATGGTTTTATGGTATCAAGAAATGATATGGTTTATGTTGACGGCCAAAAAGCGTCAATAAAGGTGACTAAAAACGTACTTTACGTAGATTTTCGTCCAACTCCGCCTTTCCACATAGTTGACGGACAAAAAACATCAATGAAAAGGGTTTTGTTGACGGTTTTTATTGACGCTTATTAGCCATCAATAAACACCGTAATCATTGATGGCTAATAAGCGTCAATAAACATTACTATATTGACGCACAATAAACATCAATATTAATGAGGGTTTCGTGATGGGTATTAAACGTAAAAAAAAAAAAACTTATCTTTTTTGGAATTTTGGATTTAAGTTTAAATTGCTCTCAAATTTGAAGTGATTTTAGTAGTTTAAATTTGGTTTTTAATTAGAAAAAGAGATTTAGTTGGAAAAAAAAAACCCAAAATTTTATTTTAATTTATTTTGTTTATTTGAATGGATTAACAGAAACAAAAGAAAAAGGAAAAAAATAAGAAAAACAAAACCCTAAGGGTCTGTTTGGTTGGTGATCTGAAAACAGGAATTTGAAAACAAGGGATTCAATGAAAACAGAGTTGTATTTCATGTTTTCAGATATGTGTTTGGTAGCAGATTCAGAAATTGGATCTGAATTTAAATAATGGTTCAGAATGTGTTTGACAATATATTTATAAACGATAAATTATTTGTAGTTATCAACTAAATACTAAGTTGAATATAAAATATTATTAATTAATTAATAAAAATGTTATGTATTATAAATTTATTATTATTATTATTATTTTACAATATCATATAATTTATAATACATTATATTATACAAATTGAATTTATAATATGAAATACTATATTTATTAAAGTTTTTATCTTTTTAAATTAATTCTGCATTTAAAATTTTGAAATTCAAAATCGGGATACAACGAAAACATAAAAAAGTTGTTTTCAGAATTTTCACTATTTGGATCACAGAATCCGAAAACAGTTTTCAGAAACACGTCTACCAAATGCATATTCACTGAATTCAGTGAATCTGAAAACATAAAACAGGATCCGGATTGTCTACCAAACAGGCCCTAAGCAATTCAATCTCTCTCCCTCTCCCCACGTCGTTCGTCCTCCCAATCGCAACCCCCTTGCCGTTTTTTTTCTTCGCACTGTATTTTCGTCTTCAGCAGGTCGCGGGTCGATTTCTTCAGCATTGTATTTTCGTCTTCAGCAGGTCGCGGGTTGCGTTTTCTTTGTCTTCTTCTCAGCGCCGAGTTCGTCAGCGCCCTGTTCGTCCTCGCAAACGCACGTCGGTAGTTGCAGTTCAGTCGCCGTTCAGCGTCGTTGTTTCGTTTGCTTCGCACGCCGTACTTTCGTCTCCTTCTCACGTCGTAGTTCAGCGCCCTGTTCTTCCGTCTTCGCAGCGCCCTGTTCAGCCGCCTTTTAGTCGTAGTTCAGCCGCCGTTCAACTCGCCCCAACACTGTTGTTCAACCCGTCTTTTAGCTCGCACAAGCACTGTCGTTCAGCCCACCGTTTTAGACTTTTGGTGAGTTCAACCCCTTTTGTAGGTTCAGCCTTGACTCACTCGATTTCTTCATATTTCAGCTTTACGCACATGTAGTTTTAGACTTCGAAATTGTTCTAGATCATGACTTATGCTTATTCGATTTGGTATTCGGATTACCCACTATTTAGTAGCTTCAATTTTACAGGTTTAAGGTTCTTTGAAAGCCAACCAGCTTAGAATCAACTCAGGTAATTTCCAATCATACTTCTTTTTATTATTCTTTTTTTAAATTCATACTTCAATGAATTTCATCCTTATATGTTAAGTTATTGTTTGTTTTTCCTTTGTACATAGTTTAGGGATCAGTTCTGAATAAGTGATGGAATTGATACTTTCCATCAATTAAGTTTTCATATCTTTTTGAAATTTTTTTGCTAGTTGCTCTGTGAGTTTTTGGTTGCTGGGTAAACTTTTGTTTGGATATTCTAGTTGAGAGTTGGGAATCGTTGGGTAAAGTTTTCATTTTTTTTAAAGTTCATTTCTATCTTTTCTTTTTCATCCATAAAGTTTAGATTTGTTGTTTTTTTCACAATTTTTGTTCTATTTTGAGTCGAGAGCTTAAGCAAGCAACCAAGGGAGACACAGAAGAGGTTAAGGACTAAAAGTATTTTGATCATGAATACATTTCTCTTTTGTTGTTCTTTTTTCTTTTCGGTTTGTTCGTTTTTTAACTTCTTTTGAGTTGATTCTTTGGCGTAGTTGAATCTATGAAATTCCACTTCCCTTCATAGAGTTTATATGATGTTTTCTTGTTTTTGTCCCTTCACAGATTCTCTGTCGTGTTTCTTCTCGCTGTGTTTTTAATGGGTTCTTTTTCTTGTTTGTGTTTTTTTTTTAATTATTCGGGTTGAGATTGGTTGTTGATTGGGTTCTTTATTCAGTGTCTAAATTTTGGACATGTGTTTTTGGAATATTATGCAGGTTTCTTTTGCGATGGAGATGATTATGATGGCTACTATGGTAGGTTCTTCCTTACTCCCAAATTTTAGTGGATCATGGTGATCGGCTACTTTATTTAGCAAAGTTAGCTTTTGAAGGAGTCGGCATAGTTGCCAAGGTAAGTGAGCTTTGTAGCTTTGTAAACTACCAATATTCAGAGTGTAGCTTGTAGCTAGATAGTTGGAATAAAAATTCAGTGGTGAAAAGGTATCCTGCTTCTTGGAACTTCTTGGAAAATGTTTATTAGATTCTTGGTTACAACATTACATTTTTGGATGAATATTTGTCAATTTTAATAAGTTTTTCTTGTTAACAAGGGGACTTTTGTGCTGGACTCTTGATGTTTGGCCACCAAGAGAAACTTGTAAAATGTTTTATTGAAATTTGTAGTTCGAGACCCATATGATTTTGAATTAATGACTTACAGTTGAATTTGGGCGTTCTATTACCATGTCTAACCCTCAATTTTCATTCAATTAATTTCTCCATAAGTGTTAAGATGAAGGAAAGAAAAGAAAATCATCAAAGAGATGTCTAGTTGATGATCCACTGATATTGTATCATTATGACTACAACAAATATTACCTTCCATAGCATGTAATTGTAGCATTAGGATAAACAAGCTATAAATTTATACTTTATTAGCTTAGGTATCAAGAATGCGCCATATTTGTGACGTTTCTTTGACTTGAACGAGGTATTGCAATGTTCCCAAAGAAAAAAGAATATGGTTAGTTATATGTTTGTCCTTAGGGTGTTAAGAGATAGTATTGGTGGAGTGTAATGCTCCATATTTGTGACATTTCTTTGACTTGATCTGGCCTTAAAACTTTAATACTTGTTTGTTTTCCATAGCTGACGAATGAATTGGGAAGCTTGTTATGTTGGCTAAATTTGATAAACTGTACTGATGCCAAAATCTGGAAGTTTAACTAAGTTCTGTTTAAAGAAACCTTCAATATTTACATTGTAATTGACTTCCCACTTAGTAATATCTTCTTTGTGGAATTTATATGAATTGCTTTAGCATTTATTCCTTTAACTCGGGGGAAATCTACTAATTTCCAATACAGAGCAAGTTACTTTGATATTTTAGATGTTTTCCCCAAAGGTCTGTATTTAAATGTTA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mRNA sequence

ATGGTAGGCTTATTGAGTCGGTGTGCAGGATCCGGATTGTCTACCAAACAGGCCCTAAGCAATTCAATCTCTCTCCCTCTCCCCACGTCGTTCGTCCTCCCAATCGCAACCCCCTTGCCGTTTTTTTTCTTCGCACTGTATTTTCGTCTTCAGCAGGTCGCGGGTCGATTTCTTCAGCATTGTATTTTCGTCTTCAGCAGGTCGCGGGTTGCGTTTTCTTTGTCTTCTTCTCAGCGCCGAGTTCGTCAGCGCCCTGTTCGTCCTCGCAAACGCACGTCGGTAGTTGCAGTTCAGTCGCCGTTCAGCGTCGTTGTTTCGTTTGCTTCGCACGCCGTACTTTCGTCTCCTTCTCACGTCGTAGTTCAGCGCCCTGTTCTTCCGTCTTCGCAGCGCCCTGTTCAGCCGCCTTTTAGTCGTAGTTCAGCCGCCGTTCAACTCGCCCCAACACTGTTGTTCAACCCGTCTTTTAGCTCGCACAAGCACTGTCGTTCAGCCCACCGTTTTAGACTTTTGGTTCTTCCTTACTCCCAAATTTTAGTGGATCATGGTGATCGGCTACTTTATTTAGCAAAGTTAGCTTTTGAAGGAGTCGGCATAGTTGCCAAGGTGCCTAATGTAGTGTTTGCTGTCGGATTTTTGATAGCATCAAACATAGTTACGGGAAAAACAGAGGAAACAGGGCAAGATAGCAGAAATGCGACCGCATTTTTGCCAAAGCTAAATGAAATGCGACAACGTTTTTGGGCAGAAACAGAAAAGTCCAAGTCTGTCGGGGTCGTTTTGAACAAGCTTTCCATGCACCTAACCAGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTAGGCTTATTGAGTCGGTGTGCAGGATCCGGATTGTCTACCAAACAGGCCCTAAGCAATTCAATCTCTCTCCCTCTCCCCACGTCGTTCGTCCTCCCAATCGCAACCCCCTTGCCGTTTTTTTTCTTCGCACTGTATTTTCGTCTTCAGCAGGTCGCGGGTCGATTTCTTCAGCATTGTATTTTCGTCTTCAGCAGGTCGCGGGTTGCGTTTTCTTTGTCTTCTTCTCAGCGCCGAGTTCGTCAGCGCCCTGTTCGTCCTCGCAAACGCACGTCGGTAGTTGCAGTTCAGTCGCCGTTCAGCGTCGTTGTTTCGTTTGCTTCGCACGCCGTACTTTCGTCTCCTTCTCACGTCGTAGTTCAGCGCCCTGTTCTTCCGTCTTCGCAGCGCCCTGTTCAGCCGCCTTTTAGTCGTAGTTCAGCCGCCGTTCAACTCGCCCCAACACTGTTGTTCAACCCGTCTTTTAGCTCGCACAAGCACTGTCGTTCAGCCCACCGTTTTAGACTTTTGGTTCTTCCTTACTCCCAAATTTTAGTGGATCATGGTGATCGGCTACTTTATTTAGCAAAGTTAGCTTTTGAAGGAGTCGGCATAGTTGCCAAGGTGCCTAATGTAGTGTTTGCTGTCGGATTTTTGATAGCATCAAACATAGTTACGGGAAAAACAGAGGAAACAGGGCAAGATAGCAGAAATGCGACCGCATTTTTGCCAAAGCTAAATGAAATGCGACAACGTTTTTGGGCAGAAACAGAAAAGTCCAAGTCTGTCGGGGTCGTTTTGAACAAGCTTTCCATGCACCTAACCAGCTGA

Protein sequence

MVGLLSRCAGSGLSTKQALSNSISLPLPTSFVLPIATPLPFFFFALYFRLQQVAGRFLQHCIFVFSRSRVAFSLSSSQRRVRQRPVRPRKRTSVVAVQSPFSVVVSFASHAVLSSPSHVVVQRPVLPSSQRPVQPPFSRSSAAVQLAPTLLFNPSFSSHKHCRSAHRFRLLVLPYSQILVDHGDRLLYLAKLAFEGVGIVAKVPNVVFAVGFLIASNIVTGKTEETGQDSRNATAFLPKLNEMRQRFWAETEKSKSVGVVLNKLSMHLTS
Homology
[Close]
BLAST of Lag0039514 vs. TAIR 10
Match: AT4G00490.1 (beta-amylase 2 )

HSP 1 Score: 42.7 bits (99), Expect = 5.3e-04
Identity = 18/32 (56.25%), Postives = 25/32 (78.12%), Query Frame = 0 

Query: 175 YSQILVDHGDRLLYLAKLAFEGVGIVAKVPNV 207
           YS++L+DHGDR+L +A LAFEG  I AK+  +
Sbjct: 350 YSRVLIDHGDRVLAMANLAFEGTCIAAKLSGI 381

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lag0039514 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0039514 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0039514 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0039514 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT4G00490.15.3e-0456.25beta-amylase 2 [more]
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0039514.1Lag0039514.1mRNA