Lag0038323 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0038323
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr2: 15336539 .. 15343873 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0038323
SyntenyLag0038323
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTATTGCTTGATGATGAAAATGGGACAAAGTCACGCCTTATATAGAGCTTCAGGGCAGACAACGTCGCGACACTGTGACGTAATTAGCTTTCTCTCCAAGATATCCCAACGTCTCGACGCTGTCCTTCGGCTGGAAAATTCCAGAATGTGTTCTTGGCTGATTTTGGGCTTCTCCTTTAATCTTATGGCCCAATTCTTCTCCATTTAGGGTTTTCAGACTCCTCCAATTGACCCACCATGAATCCTCATGATCAGTTCTTCATTATTTGAGCTTCTTTTTCCTCTTTTTTCTCCAAAATTCCACTAAAACTCCTAGGGACAAAAAATAATTAATTAATAGAATTTGCACACTAAAAACACATTAAAGCACAACAAAAACCATTAAATTCAAGGGTAAAATAGTGGCATTTATGCATGCTATCAACCCCCAAACTAGAACAATTACTAGTTCTCAGGTAATAAAGCCTATGACAACATACCATAAAGAACAACCAGCACAAATGAACAGTTGATATGTCTTGAATCTGTTAGGTAGCGTTTCAAATCACCAAGTACGGGAGTCTAGGGGCGAAGCGCCCAATGGGGGTTCTGGGGCAACGCCCCTTAAGCTAAATTCTGTATAGATATTAGATATGTAATTTCATTTTGGGCTTTATTTTGGGCCTATTCTATTAGGATTAAGAGTGATGCCATATATAAACCCTCTTAATCTCATATGCCTTAACCTCTGTTATCTGCATATATGTTTTCTCCTCACTAATAAGATTATTCTCTCCCTCTGTCCCTGTATGTAGCTAACACACCGTTAGTGAACCACATAAATCTGTGTTGCCTTTTCTCTTTCATTCTTGCTTTGTTGAATTTTTCGTTTACTGTCATAATATGAACAATTCATATAGTTAGATTCATACTTCAAAAGTAAGATTCTCAAAATCAAAGGAAAAAGAAAAAAAAGCACTTGATAGAATTGGAGTGACTTTTTTTTTTTTCTTTTTCGGAAGATCTTTCATGTACCTTTAATTTATTATCTTGCATTCTAATTTCCATTATGAGCTAAGCTTCTTCTCGGGGATTCAAGTATCTGGATACCTTGAGTAGAAGAAAGTCTCACATCTTGCAAAAGCAACCTTGCTCTTACTTAGCATCTTTTTGCTGAAGTTTAAGTTTCATTGTTAACTTAAACCGATAATTTGAGTTAACATAGTTTGTGCTTGGCTAGTGGTCGAAAGGTTTGAGTTAAGTGTGTGGGTTCGCAAAAACAATAGTGGAAAAGAGCCTAGAAATAAGACTTTAATTCTTGCATCCTAGAAATCCTAGAAATAGGACTGGAACCACTAGGATTTTAAAGTCATGTGCGTTAATCATAAGTGTTGGGTTTTATGCCCTAAACTTGTGGATTGTAAATGTAAACTTATTTATTTATTCAATAAAGATAACTTTTTATTTTATTGTGATGTTTTTAGACTTGGATGAACTCAGATCCAATAAACAAACATCTTAGGTTATTTAATGTAACTTGAACAATATGTGGTTGACATATAAGGGATCATGTCCAAGTAATAATCTAAATGGTCTATAGTATATGGATGAGGTTAGGTACCTTATCCTGGTGACACTATGGATACAACCCACTTTGTATTAGATACAAATGAATTGATCCAAATCGTTCATGTAGAGACATGCGAGTGAGGGTATCCTATACAATGAGAAGACCCAATTGCAAAATAATTAATCTTTCATTGTAACACCATTAATTGAATAGATTAATATTTCATAGGATGACCATGTAACTCAATCTCAATCTTGAGTGAGTTATGGACTCCTACCTATGAGAGATTATCCTTTGATTTGTATGGGTGAGTGACGAGACAGCCAGGGTGGTGTCGAATTCTCCCTAAGTTGTCAAATAAAATTTATAACCCACGACACTACTACTAATTTTGTAGCAATAGCGACCGGGGTTGAACATAGGAAAGATGGATTTTTGGAATGAAGGACAAGTAAAAATAAAATAAAATAAAATAATTAAAGGTTGAATTTTAAAAGACGGGAAATAAGCATGCATAAGAGAAAGTAGACGGGATCAATAACATAAAAAGGGATCGTTAGATTGAGATTTATTATGTTTGATTCTAATTCATTGACTTCTTAGTTTTCTCTAATAATCGTTCTAAATTGATTTCATTAGTCTGATCGGCTTCTAGGTTACTCGGAGGACTCCCCTACACTAACCTGTGTTAATTAACTCGCTAATCAGGAATTCGACAATTAACAAGATTAATTAATATGAACTCTATCGCTTGCCACCCCTTATGCATAATTTAGCAACCATCCGAGACCTCTGCAACGATTACTACTTATATCTAACGAGTTTATTAACAAGCAATTTTGCAACCACCTATTAAAACTAGCCGCTTTGGGATTGTGGGTCCGAATTGTAAGAACTAAATTCAAATGCAATTTAAATCTAATTCCTACAACCTTTAACATAGATCCTGGGCCTATCAAAGGTCGTCTCGCGTAGAGAGTGGCTTGCCTCAACCTAGTGGCTATCTAAAAATAATTGATAGAATACACAAGCGGTAATCACATAGGATGTCAATCCTAATTGACTAGCCTCATGTATTGGTTTAAACAGGATTACATGCAAAACTCAATGTAAATACAACAAGAACAGAAAGTATAAACCAGGAAACTCAGCCAATATTATTTAGAATCAAGACATAAATCCAATCCAACGATCTAAACGAGTTTAGCTACGCATAAATGAAGTAATAGCAACAAATAACATAAAAGAATCCATAGAATATGACCAACAATGGCCTACAAGAGTGCTGGAATGTGAAAGAGACAAAGAAATCGTAAAAGGGACCAAAATTCTAACCTAACCACAGACTAAATCGAGAGACTACTGATAAGGGTAAAAAAATATACCTATTTTACTCTTATATTTAGCTCATTTCTTGGTCAAATATTGAGTGTTTAGGTCAATTTTACTATTTTCGAGCTCAAAGTATGTTAATTTGATAAGATAGGGTGTTGAAAGTCACTTTTGTTGATTTATGCTTATTTGTGCCTAAAAAGACTTGATTTGAAGCAAATTTGACTTAGTTTACTGTTGTGCAGAAAAACAGAGGAGAAGCTGGAATTCCCCAGAAATGCGACCGCATTTCTAGGAAGGCAAAATCGAAATGCGACCGCATTTCTGAAAAAACAGAGACCGTTTCGAGTCGTGCGCGGGTCATTGTTGATGAGTCTTCTTCGCACCTAACCGGTTGTTTTGACCCCGAAACTGACTGGGCAACCTTCCAACACCTATTTCGTAGCTCCTCAACTAATTTCTACACTATATAAGCTTGGGATTCGAAGTCAAATTCATGCAGAACTCACTTGGAAGAAAAAGGGTGGTGACAGAACCCTAGCTCGACGCCAATGAGTAGGGATGCCCGAGGTCCTTCTTAGATGACCAAATTCTAATCCGATAGAGAGTTAGACATCAAACCTTGTGGTTTGTAGAGAGTTTCACCAATTCCCATCTTGTAAAAGTGAGAGAGTGGAGTGTCTTAGCAAACTCTAGAAGGATTGAGTAAATTGAAAAACCCATAATATTTAGCTATCTCCTTTATTTCCAACTCTTGAATCTTTTCATTATTCTGTATTCTTTACATTCTTATTCTAATGAATATGTGTTCATTTGCTTTTTATCCCATCATGAGTAGCTAAATCCCGTTGAGGGGTTCAATGTGGTGAATTCCCTTATGGTTTAATGGCTTGAAAGTGTTTTATTTGCTTAAGTTGTGTTTAATGCATATCATTCTTGATTGATTATCACTCTAATCTTGTTGAGTTTAATTTGATCACTTAGACTTTGCATGCTATGTGAGTTTGATATCGAAAGGGACAAACGATATCAGTTCTCATAAAGGTGATATATATAGGAGAAAAAGCTCGAAAGAGATTGTTCGACGGTATAGGGAAAGCTGCCTAAGGCACCCTATATCGACTATAGGGTTATAGGTTGTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTCCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGTGAGAGGTTTGGAGTCGCCACCAATCATCTTGGGGTGTGATTGGTCACCCATTTTAAAAAAAGTGGTCTTTGAAAACCAAAAATTAGGTTCGGGGATCAGTTGTGTGTAGGGAAGGTGTTAGCACCCTACAACACCCGTTTGAAAACATTTTATTTTATTACTCTAATTCATTAAACAAAAGGTCCGTGTCTTAACGAAAATAAACAAAAAAAAAATGAAAATTGAAAATTAATTGTCTCACTAATTTCACCTTATCTTTAAATAAAGTAAGGATTTAATTTTGTGAGTGGGGTTAACCCATGACTTTATTATCATGTAAAAATTTCCTAATTAAAGAAAATCTTTCACCTCAAGAATTTGAAAATTATTTCAACTCCGTCATAGGCTATACATGAGCTAATTTGTCTCTCAACTATTACCTCACATTTCAAAAATAAAATATGAAGTAATAATCATGAGTGGTATGACACCATTCAATGGAAAAATATTTTTTCATTTTTAAATCAAATTCAATTAGAAATTCATTTGGAATTACCAAAGTAAAACTATTTTGAAGTTCATTTGGAAAATCCAATTTAGAATCAAATCGAAGTTGATTTGAAAATTTTCTAATTTAAGATCCAATTGAAATTTTGATTGCCAAAATAATTGACTAGTTAAACTTTAGGCTAATTTCCAGGCAGGGTGTTCCCTTTCGGTCAGCTTAAATACCCGTTCTTAGACAAAATTAGCATTAAAGTTTTCATAATCAATCTATTTTAACCATTCAAAATATTAAATAATGTTTTTGAAATTTGATTTAACCTTTCCAAAATCGAAATTGATTTCCAATTTAGTTTAAAATTGAAATTGATTTTCAATCTAAGACCAAAAGACATTGACTGGAAACTTTAATTTAGAACCAAATTGACATTT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mRNA sequence

ATGTATTGCTTGATGATGAAAATGGGACAAAGTCACGCCTTATATAGAGCTTCAGGGCAGACAACGTCGCGACACTGTGACGTAATTAGCTTTCTCTCCAAGATATCCCAACGTCTCGACGCTGTCCTTCGGCTGGAAAATTCCAGAATGTGTAGCGTTTCAAATCACCAAGTACGGGAGTCTAGGGGCGAAGCGCCCAATGGGGGTTCTGGGGCAACGCCCCTTAAGCTAAATTCTAAAAACAGAGGAGAAGCTGGAATTCCCCAGAAATGCGACCGCATTTCTAGGAAGGCAAAATCGAAATGCGACCGCATTTCTGAAAAAACAGAGACCGTTTCGAGTCGTGCGCGGGTTGTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTCCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGAGCCTTGTTGGAAAAAAAAAAGTGGCGGCACGGTGGCGGCGGTGACAGTGGTGACGGCAACGGCGGTACGACAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGTGGTGAGTGGCGGCGGCGGTACGGTGGTGAGTGGCGGCGGCGGCAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGTCAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGCAGTGAGTGGCGGCGGCGGTACGGTGGTGACGATAAAGTTCGATTTAACCAAAAGGAAAAGGGAATGGACCTGGCTCAGACCAGGCTTCGACCTCTACTGACTAGCAGGGTTCGATTTAACCAAAAGAAAAGGGGAATGGGACCTGGCTCAGACCAGGCTTCGACCTCTATTGACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTATTGCTTGATGATGAAAATGGGACAAAGTCACGCCTTATATAGAGCTTCAGGGCAGACAACGTCGCGACACTGTGACGTAATTAGCTTTCTCTCCAAGATATCCCAACGTCTCGACGCTGTCCTTCGGCTGGAAAATTCCAGAATGTGTAGCGTTTCAAATCACCAAGTACGGGAGTCTAGGGGCGAAGCGCCCAATGGGGGTTCTGGGGCAACGCCCCTTAAGCTAAATTCTAAAAACAGAGGAGAAGCTGGAATTCCCCAGAAATGCGACCGCATTTCTAGGAAGGCAAAATCGAAATGCGACCGCATTTCTGAAAAAACAGAGACCGTTTCGAGTCGTGCGCGGGTTGTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTCCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGAGCCTTGTTGGAAAAAAAAAAGTGGCGGCACGGTGGCGGCGGTGACAGTGGTGACGGCAACGGCGGTACGACAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGTGGTGAGTGGCGGCGGCGGTACGGTGGTGAGTGGCGGCGGCGGCAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGTCAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGCAGTGAGTGGCGGCGGCGGTACGGTGGTGACGATAAAGTTCGATTTAACCAAAAGGAAAAGGGAATGGACCTGGCTCAGACCAGGCTTCGACCTCTACTGACTAGCAGGGTTCGATTTAACCAAAAGAAAAGGGGAATGGGACCTGGCTCAGACCAGGCTTCGACCTCTATTGACTAG

Protein sequence

MYCLMMKMGQSHALYRASGQTTSRHCDVISFLSKISQRLDAVLRLENSRMCSVSNHQVRESRGEAPNGGSGATPLKLNSKNRGEAGIPQKCDRISRKAKSKCDRISEKTETVSSRARVVSQRHRDAERPTSFPKGLFRGALLEKKKWRHGGGGDSGDGNGGTTVSGGVGTVVSGGGGTVVSGGGGSEWRRRYVSEWRRRYGSEWRRRYGGDDKVRFNQKEKGMDLAQTRLRPLLTSRVRFNQKKRGMGPGSDQASTSID
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 113..133
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 54..88
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 147..184
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 113..131
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 240..259

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0038323.1Lag0038323.1mRNA