Lag0035676 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0035676
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3: 26900326 .. 26906926 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0035676
SyntenyLag0035676
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTCTCTACATGAACGATTCAGGATCACATCGTCTTCACTATATACAAAGTGGACCGCATCTCATAGTGTTTCTAGGATAAGGTACCCAGCCTTATCCCTATACTATAGACCGTTTAGGCTATTACTTGAACTTGATCCACTTTTGTGTCACTACATAAAGTTCAAGTATTCATACCATATAGCCATGGATGTTAGTTTATTGGATTTGAGTTATTTAACGTGCAATTCACTTATTTAATAACTTAAGTGAACAAAAACTCAATAACGACTTTATCGAACAAGTGTATAACTATTTGTTGCATTCACTATCTACGAGTTTTATGGCACCAATCCCAACTGTTTGTCCTTATCAATTTTACCTTTTTGATTTATTTTCCCGTGTGTTATTCAATTTTTTGGCTGTTCTGCGACCCTGTCTTTCTTATTTATTTGTTTGATAGCAAATCTTCTTAAAACCCCTCATTTTTTTTACTCTCTATAAAAACCGGAATTTAAAAAGAAAACAACCCTTTCCAGTGGACGACTTGACCACTAATGCTACAGAGTAGTTAGGAGCCGGTTACAATTTTTATTTGGTCGAGAGGCCTCGACAACCTCTCCATTAATTACTCATCTAGTTTATCAATTGAACCTCGACAACTGCATATATGACACATTTTTTGTGCCTTGCTTTGAAGCATTCTGCCATAAGTTGAGGGCCTTTTTCCTTATCTAGAGGCAGGCACAAATGCTGGTGCAATCTAACTATCTTGTATTCTGCTAAGCTCTTCCTTTTCCAGATTGCGAGCATAATTCTTCTATTACGTGCTCCGCAAGATTCTTTCTTTTCTAGATGTGGGCGCATTTTGGACCTACACAAAACCATTAAACTTTAACAAATTATTAATAAAATACCTTTTTTTTTTATATCATTCAAGTATAATTTTCATATTTTAAGATTTCTACTGTGTGATGCTTACTTTAGACTAATTTTACTCCAAAGGATAAAATTTTAAGCATGAAGTCTTTGTTTTCCAAACAATAAGCTCGACTTTTAAGGCTAAATAACTCACATAAATGTGCGTTATCAAGTAGCTTTGATCAAACTACTTGTGGAGTGATTCGAATCTTGAGTTTAGAAACAAATTTTATTTACTCTTGATGTTGATATGCCTTGAATCTGTTATCTAGCGCTCTGAATGACCATGTACAAGGGTCTCGCTGTAATTTGTATATGATTTCTCCTCACTAATAAAAACTACTCTTTCTCTTTGCCTGTGGATGTAGCTAACACACCATTAGTGAACCACGTAAATATGTGTTGTTCTTCCCTCTTTCATTCTTGCTTTGTTGAACTTTTTATTATTGTCATAACACTTGATATTGATCATCAGGGTAAATCCATTCTATCTTCTTCCTTGGGATGAAATCATCTTGATGTGAGGGTTTTAACATTTGAGATATAGGGGTTTGCATATCCATAAAGGTTTCAAGCCTAAGTGCAAGTGCACATTGTCAACCAAATAATATAAAATGGGGAGCATTCCAAGTATTGAATTCCAAGGGTAGGGTGTTAAACAAAGATTCAATTAAAGACAAAGATTTCCTCAAAGTTTAAGATTGAGGTAACCAAATAATCAATTGATGAATGATTGTTGGATCTGTGTTGGATTTGGATTCAAAATCCTTGGCCAAGGTGTAACAACAAAAAAAAATATAGTTTTTTTTTAAAAAAAGAATCCCCGTCAGTCACGAGGGGAGAGGGGGCACATCTCATGCTTGCCCCCCAAAACGGTCATTCAACGTTTTTTTTAAAAAGGATTTTTTTTCTTCTCCCATTCAACTCGGCTCTCTCTCTATCTATCTATCTCTCTCCTCTCTCACTCGTTGCTCTCCCTTTCGTCTCTGTAGCACCACTACCGTGCCGCCACAACCACCACCGTCGAGCTCAGGTCCGACCGCAGCAAGTCGCCAACGGTTAGTCTCTCTCTCTTTCGTGGGTCTCAAGCTCTCAGCGTCACTCTCCCTCTCTCTTCTGTAGATCCATCACGTCGCTGCCACCTTGATCCGACAACTGTAAAGTCGCGGTGTCACTTTTCTCTCTCACCCGCTCGCTTCTCTCTTTAACTGGCAGTCCGTCGCTTTAGATTCGGTCGTCGTGAGACCCACGCCGTCGTAAGCCTTCCGAACCGCCGCTGTCATCGCAAACCGTCGTCGCCGTCGTTCAAGTTTGGTTGTCGCCTATCAGTTCCGGTTAGTGGTTCTCGGTAAGGATCTCTCTCTCCATTGCTTTCTCTCCCTAAAATCTCTCTTGGCTCAAATTGTAACACCCGTAATTTAAGAAAATTTCAAAATTCATTAGTTTTGGAGTTAAATTGGAGTTGTAGGGAAATTAAAAAAAAAATGAAAAATTGGTGAGATTTTTAAATTTGGGCTGGAGCGGCAATTTCGTAAATAAACAGATGTTTAAGCCAAACCCTAGCTTCTTTTTTTTAAAGTTGCACGCAGCCCTAGGCAAGCCAATCTTCATCTCTACCCTCCTTCTCTTTCTTGTTTCAATCGCCTGTGTGCCCATTCACGAGCAGCCCCTCCCCCTTCTCGATTTCTTCCCCTTCTTGCTTCGGTGACGACATTCACCAACTCCAACGATCCACGGCACTGTGTGACTCCTCAAGCAAACTCACGACAGCACTGCTACGGCCCGACGAGCAGTCTCACAGTGGTGCAGCGCGATTTTCAGGCGGGGGCTCGCGATTTTCAGGCGTGGGCTCGCGATTTCAGTGAGCGGCGTCATCTTCGTGGGTTTCCGGCAAGGCGACACACGTTTAGCAGGTGGCGATTTTGGCTGTAGATGGTGGCTGCTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTTCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGTGAGAGGTTTGGAGTCGCCACCAATCATCTTGGGGTGTGATTGGTCACCCATTTTAAAAAAAGTGGTCTTTGAAAACAAAAAATTAGGTTCGGGGATCAGTTGTGTGTAGGGAAGGTGTTAGCACCCTACAACACCCGTTTGAAAACATTTTATTTTATTACTCGAATTCATTAAACAAAAGGTCCGTATCTTAACTAAAATAAACAAAAAAAAAATGAAAATTGAAAATTAATTGTCTCACTAATTTCACCTTATCTTTAAATAAAGTAAGGATTTAATTTTGTGAGTGGGGTTAACCCCTAACTTTATTATCATTTATTATCATGTAAAAATTTCATAATTAAAGAAAATCTTCCACCTCAAGAATTTGAAAATTATTTCAACTCCGTCATAGGCTTTACATGATATTATTTGTCCCATGTCTATTATTTCACATTTTAGGAATAAAATGTGAATTAATAATTATGAGTGGTATGACACCATTCAACAAAAAGAAATCATTTTTTATTTTCCAAATAAAAAAACTAATTAGAAATTTCAAAGTTAAAAATTAAAATAAAGAATTTGAAATCAATTGAAAGAAGGTTAAATAATTTAGAAATTCGAACTAAAACCAAATTAAAATTCAATTGGAAATCTCAGTTTAAAAGTCATTTTGAAATTGTTTTGAGAATTCCAATTTAAAGTCAAATGGAAGTTGATTTCAAAAATTCTAAATTAAAAGTTGATTGCAAAAATATCTAGGCTAATTTCCAGGCAGGGTGTTCCCTTTCGGTCAGCTTAAATACCCGTTCTTAGACAAAATTAGCCTAAAGTTTCCATAATCAACTTTAAAAAACTTTTCTTGAAATCCAATTTAAAACTAAATTAAATTTCATTTGAGATTCATTTAAGGGAAATTGCAATGGGTAGCAAAAAATATTAGGATATTTGCAAATCTAGCTATGATTTTTTAGGTTTGCAAACATAGCAAAATTTTAAAAATCTGATTTCCGTTTTTTTTATTATTCCAGTTTTGCCCTTGTTGGTATATCAACAGGTATATTAGTAGTATATCTGATATACTTTATATTTACTGATATACAAAATATAATGTATATCAGTTAACTAATATACCAAATTTGATATACTTGAATGAATACCATGATATACCTAATATATACTTGATAGGATAAGCATAACATTTGATATACTTGATTAAATGTTGATATATCAATGATATACTTAATATGTTACTTTCTTTACTTATATTTGTTATGATTTCTTTTCTCTTTATTGAATTATGTTGTGTTATTTACATCTTTTAAAATGAAATGTCCTGTTATGAATGTTGATATACCATTGATATACCTCATTCGTTTTTTTTTTTTTAACTTACCTCATTTTTTTATACTAAAATAATTAATAACATTGATATACCTGATTAGGAGTAGCTAAATACATCAATGATAGACTTGTTATTAAGAAAAAAACCACTGATATATATTTTTAATTTTTGGTGTATTATGAAGGTCATGGAATGCAAAATTTGTTATAAGTATATCAATAAGATGCAATTTTAAGTATATCATTAGTGTATTAGTAGTCACTAAAAATGTAATTTAAAGTATATCATTAGTGTATCGGTAGTATATTATTAAGATGATGTATAATATATTGATGACATATTTTCCAAACATGAGCATAACTCAACTAGCATAAGATATACACATTCAACCAAGACGTTAGAGGTTTAAATCCCCTACCACACATATTATGTCCAAATAAAACTAATATTTCTAATTCTTTATTGATGAAGTATATCAAATATATCTAAAAAAAGCTCATGTGTATACTTCATAAATGAAGTATATTATATTCACAAAATATACATCTGATATACTTTATATTTAGTATATCAGTTGATTGATATACCCAATATCTAGTATATCAGAACACTAAATAAATGAATGATGTACCTGATATACAGTATATCAATAACACCATTGATATACTTTTTAAAATTCCAGCGTGTTTTAGGGGTTTTTTTGACTTTTCAACTTTAATGCTTAGGCGGGCCCACGTTTTTTTGCTATATTTGCAACATTAAAAAACT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mRNA sequence

ATGTCTCTACATGAACGATTCAGGATCACATCGTCTTCACTATATACAAAGTGGACCGCATCTCATAGTGTTTCTAGGATAAGCACCACTACCGTGCCGCCACAACCACCACCGTCGAGCTCAGGTCCGACCGCAGCAAGTCGCCAACGATTCGGTCGTCGTGAGACCCACGCCGTCGTAAGCCTTCCGAACCGCCGCTGTCATCGCAAACCGTCGTCGCCGTCGTTCAAGTTTGGTTGTCGCCTATCAGTTCCGGTTAGTGGTTCTCGCACTGCTACGGCCCGACGAGCAGTCTCACAGTGGTGCAGCGCGATTTTCAGGCGGGGGCTCGCGATTTTCAGGCGTGGGCTCGCGATTTCAGTGAGCGGCGTCATCTTCGTGGGTTTCCGGCAAGGCGACACACGTTTAGCAGGTGGCGATTTTGGCTGTAGATGGTGGCTGCTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTTCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGAACTTTGTTGGAATCAACGGAAAGCGGCGGCACGGTGGCGGCACGGCGGTACGACAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGCGGTGAGTGCGGCGGCAGTGGTGGCGGCAACGGCGGTGAGTGGCGATGGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTCTCTACATGAACGATTCAGGATCACATCGTCTTCACTATATACAAAGTGGACCGCATCTCATAGTGTTTCTAGGATAAGCACCACTACCGTGCCGCCACAACCACCACCGTCGAGCTCAGGTCCGACCGCAGCAAGTCGCCAACGATTCGGTCGTCGTGAGACCCACGCCGTCGTAAGCCTTCCGAACCGCCGCTGTCATCGCAAACCGTCGTCGCCGTCGTTCAAGTTTGGTTGTCGCCTATCAGTTCCGGTTAGTGGTTCTCGCACTGCTACGGCCCGACGAGCAGTCTCACAGTGGTGCAGCGCGATTTTCAGGCGGGGGCTCGCGATTTTCAGGCGTGGGCTCGCGATTTCAGTGAGCGGCGTCATCTTCGTGGGTTTCCGGCAAGGCGACACACGTTTAGCAGGTGGCGATTTTGGCTGTAGATGGTGGCTGCTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTTCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGAACTTTGTTGGAATCAACGGAAAGCGGCGGCACGGTGGCGGCACGGCGGTACGACAGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGCGGTGAGTGCGGCGGCAGTGGTGGCGGCAACGGCGGTGAGTGGCGATGGTAG

Protein sequence

MSLHERFRITSSSLYTKWTASHSVSRISTTTVPPQPPPSSSGPTAASRQRFGRRETHAVVSLPNRRCHRKPSSPSFKFGCRLSVPVSGSRTATARRAVSQWCSAIFRRGLAIFRRGLAISVSGVIFVGFRQGDTRLAGGDFGCRWWLLSQRHRDAERPTSFPKGLFRGTLLESTESGGTVAARRYDSEWRRRYGGECGGSGGGNGGEWRW
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 26..53

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0035676.1Lag0035676.1mRNA