Lag0033053 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0033053
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 40400669 .. 40405628 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0033053
SyntenyLag0033053
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGGATCCGTACGTTCTGAATTTTGAGGTGGTTGACGAAATTGCCCTCCCCGGTTGTTGAAGGGGTTGGTGTTGAGGCGAGGGTGGTTTGGGAATTTAAGGAGTTTTTGGTTTTTACAGGCGGTAGTTGAGAGAGGTGGTTCGTTTGTAGCCATCTCCGTCTGCTAAATTTCAGTTCATTTTTCACCCTCTTTCTTCGACGGTAAATTTGGTAACTTTTTTTTTTTTCTTTTCCTAAAAAGAAAGTTACTAATCTATGCAGTAAAACCGATAGGCGTTAGGTCAAGTTGAAGTCGATTTACGGTTGACCATCTAGTCCCAGACCACACATTTCCCTTTCTTCTCTTTTTATTTATTACTAAAATCAACTCAAATCAAATTGTTTGATTATTTCGGATTATTTATTTAAGTTTAATGTAATTTAAGTTTAGTTTTAATTTAGTTTTTATGATTATTAGTAAATGAGCACCAAGGTAACTGTTGATGTCAAAATCTGGACAGGGAGAACTCACCTGACCACGTGACGTAAATTTGTTTGAAGGGAAAGACGTGGCGTGCAAAACAACGGAAACCTGCACACCGGCGGTGTGGTGCTTGTCACACCGCCTCCGATGCTTAAGTCAGTAATCGGAGGGAATATGAGCAAAATCAAAGAGCTAGAGGAAGAGAAGAGAGAGTTTTCGGATCCCTTCTCCAAGGTTAAAGAAGGGTTTATATACATTTGCCCATTTTAGGGTTTCTAGGTGTTCGAAGACGATTCGACTGAACCATATTGACCAGGGCAACCAAAAGACTCCAGGAACCGAGCGGAAGGGAGGAAACTCGGCCCGCACAAGCGGGCCGAGGATCGGCCTCGGCTATGGGTCGAGGCCAGGTGGGGTTGGGCAAACCCTATGGCCCATTTCCCCTTTGGATCCGTTTTCGGGTTGTGTCTTTGATTTCGTGTCGCATTGTCCTCGACTACTCCTTGGATTCTGGAATGGTCCAGAATTACCTATAACAGTAACAACAAGGATGATTTGTGATGTTTTGTTAAATTACATGAATCATATTGAAATTAATGAGCAAACTATAAGAATAAAGTTAAAATTTTTAATGGAATAAATTGAAAATCAATCCAAATTATAAAACACACAAAATTTAACTTTTAACTTATAATTTAACCGTTGTCTGGTTCAAATTTGTTGGGTCTTCTCTACTATTTTAATAAGATCAAACTATAAGAATAAAATTGAAACTTTCAATGCCCATCAAACTCCAACAACCAAAATTTTACTTTTAATTTATAATTTAACCGTTATCGTTTTACTGGTTTAAATATATATTTCAGTAATGTTTTAGCTAGTTTTTAGTTCGTGCATTTTAGGTTTATTTTAAATTTTTGTTCGTAACTTTTGTAAAATATTTATAAATTTAAATATATACATATATAGAAAGTTGGGCCTTAATCCGATTTTGGGCTGACAACTAGGAATTTGGGCCTGGGTTGTGTTAGTCTTTGTAAGGCTTTTCTTTGGGCCGAGGAGGCCCATAACAAAACACAACTTGAGCTTCATATGGTCAGTGAAAATATTGAGCATGTACATTATCTTACAAATTAAATTAAAATTTTAAAAATTTTAGGGTATTTTATTTTTGAGAATATAATGAGGTGTTATACATCATAAGGATAATCAAATTTAAATATTTTTTTAAAAAATTAAACCATATGGTAAATTTAGAGTAATGATTGCTTAATTAATTTAGAAGTTGACTAAAAAACTCCACTTTATTCATGATTAGACAACCACGAGATTCATTCAAATAATTAATTAATCAAGCTTCAATAATTGAGAAAATAATGTGCGTAAATTAAGAAGCTTAAGAAAACCCAAAGATTAGTATAGGAATAAATGACTAAATATATTTTTTTTTCTTTTTTTCTGTAAAATGACTTCCTATCTTATCTTTATTAACTTTACAACCAGACCAGAACAGTAATTCAGAAGCATGCGAATTAAAATAATTTGTCCGAAATGACAACGACAAAAATAATAATAATAAAAATAATTTTTTAAAAAAAATTTAAAGAAAGGACAGTGGGCCGGACAAAAAGCCATAACGTACGGCCCATAATGGTATATAAAAGGCAGCCAGCCACGTGGCACTATTTTCTCTCTCTAAAATCTAAATTACAGACAGGTGTCCATTGTGCTATGACAGAATTTATGAATATGATTTGATTGGAAAAGCTTACATAAAGTAAGCTCAAGAAAATAAGGTCACGTTATTTAAGTAGCTCAATCTGTATAAAGTTGTACTAATGATCAAAGGTTTTTGGTTTGAATCTCCTCATCTCATAAATTGTCAAAAAAACATAATAATAATAATAAAGTCCATTTTCATGTTTTTGTTTGTAATGAAATATTCATTAGATTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGAAAAATATTTATTAGAATTTGTTCCATAGTCATTCATAGATTTATCATGTTACTGAGGATTTCAGTCGAGTAACTTCTACTTTGTGTTGTCACTTCCTTCTTCGCTAGAAGAGAGAACGTCCCTTTCAATTCCTTTTACTTGATTTGGGTGTCTTTCCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATATATAAGGTGGGAGATTTAAATCTCTGACCCGTTAATTGAGAGTGTATAAGCGTTGTCCAGTTAAGCTATACTTATGCTGGTAATTGAGGATTTCATTTTTACCTAATTTTTTTTGTTTAATGCATTTTCCCCTAAAAAAAAGATATATGATGATGGTTGAGCTTTTAACGTCATTGTATTTAAATTCAAGTAATTTTTTTTTTATTGCATATGAATTTAAATTTGATATTCGTTTTCTTCTAAAAAAATATGTTGCAACTTCAACAATTTTTTTTTTCTTCTTTAAACTATGCTTTCAAATTTGTGTTTCAATTATTGATTTTTTTATTGGGAATAGAAAAGAGTCTTTTTTTTTTTATGAAAAAAGAGTCTAAACATTGTCAATTGTCGAAATAAATTGACCAGAGGATGTTATTACCCATGGAAAATAAAATATTTGTAAGAAATAATAAACCAGTGGTAGTAAGTTATTTAATATTATAAATCAAGAAAATTTACAAAAACTACCTTTAAACTATCGTGGTTGTTATTGTTGAGAGACCGACATTGAAGAGATGAACGGAGACCTCACAATTTAAAAGATGTATGAGTTATTCCTCTCATTGCCAATCAATCCAAAGGGACACCATCTTTTGAGAGAACATGTTGAGGATCCCACATTGAAAGGATGAATGGAGACCTCACAATTTATAAGAGATAGGAAGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAATAAGTTTAAAAATTACCATAAAAACACTCAAATTCAACTAAGTACAAAATGGCCAAACTAAGCTACAAAGACACTTCATCCTCAACCAACAAAATCAAGCAACCAAAAAAGAAACTCATCATTTCCCTTCACTTTAAGTATAAAAAATTTCACTTATATGTTCATTAAATCTCCCATAAAAAGAACAAACAAAAAGATATTTTAAATATAAGAATGAAAAGACAACTATTTTTCTCCAAACCTTGTTTACCATTTTGGAGGAAACCATGAAACATACACAACCCTTATGGTTTTTTTGTCTCATGATATATGCATAGTAATTTCATAAATCATTAATATCTTCATTTTAGTTTCAATTATAACAAGAATCATCTTTTATGTGGCATATGATTGTGAAATATAAGTGGCCTTCCAACTTTGCCTTACATAGATTTCATCACCCAACATTAATTATCCCTCGACAACCCTTTTAATTTCTAAATATAGGAAGTCATTTCGACCCACAAATGTTTGACCCCTAATTTTAATAAGTCTATTTTTGTAATTTATATTTAGATTTTGATTTTGATTTGCAATTTGTATAGCCATGCTCTCAACATGGTTAAAAATACTTCTCACTCAAAATCGTCACGTTAAAATGGTTATTTAAAAATATATTCTAGGTGCACCTTATAAAATGTATATAATGATAATATGTAGTACAAAATGAAAACTTATGAGTTAGGATTTATATGTAACAGAAATTTACACACGTAAATATATATTTAGTAAGCTCATATGTCATACCTAAAAGTAAAGACCAAACCTATATAATAAAAAGAGTTCTATGATTGCCAACAAGAACATAGCTCAACTGACATAAAACTTTTAGAATAGTAAGTCATTTTTCAAACATGTGACACTAAAAATATATAAAGATTCGCAGTGGGGTCAAGGGAAATTGGATTTTTTTTTTTCAAAAAGAATAAAATTCTATCAATTTAGTCTTTTGTTTTTTTTAATCAAAGAAAATAGAATAGAAAAAAAAATGAAAGAAAGAAAGAAGGCAAATAATTGAGTGTAATGATGGTTGAGAATAAATGAGGCCAAAGAAGAGGCCCATCAATGATGGCCCACAAATGAACGGCCCTGATGTATGGAGGAAAGAGACAGATCAAAGGCCTACTTGCAAAGGCTGTGTCCTTCTTCCTTGCTTCAATCCAAAGCCTGCAATTTGCTTGTCCTTATTCACTCCCCACCCCACACACACACACACACAACCACCCTTCATTATATGTTTGGTTAAATTACCATTTTGGTCCTCGAGCGTATAATTGCCCTCGCCCACTTCAGGTCTCGATGTCTCGATGTATAGTTCTTGTTTCGTTTCAAACCCTAGTCTCTGTAGTTTTAAAAGTTTCAATATCTTGTTGATAACGTTCCTCTAACGTTACTAAATGTTAACAGATCTCGTTCGTGACGTGTTTCGATGAGTTGGTGACTGAGAAAACATACCATATAAGAGGCGTTGCGTTTGGGATTGATTTTGCTGGAGTTAAAAGCGACTGTGAGAGAATTTTAACTGTTTTTAGTGTTTGGTATAATTGA

mRNA sequence

ATGGCGGATCCGGAAAGACGTGGCGTGCAAAACAACGGAAACCTGCACACCGGCGGTGTGGTGCTTGTCACACCGCCTCCGATGCTTAAGTCAGTAATCGGAGGGAATATGAGCAAAATCAAAGAGCTAGAGGAAGAGAAGAGAGAGTTTTCGGATCCCTTCTCCAAGGGCAACCAAAAGACTCCAGGAACCGAGCGGAAGGGAGGAAACTCGGCCCGCACAAGCGGGCCGAGGATCGGCCTCGGCTATGGGTCGAGGCCAGGTGGGGTTGGGCAAACCCTATGGCCCATTTCCCCTTTGGATCCGTTTTCGGGTTGTGTCTTTGATTTCGTGTCGCATTGTCCTCGACTACTCCTTGGATTCTGGAATGGTCCAGAATTACCTATAACAATCTCGTTCGTGACGTGTTTCGATGAGTTGGTGACTGAGAAAACATACCATATAAGAGGCGTTGCGTTTGGGATTGATTTTGCTGGAGTTAAAAGCGACTGTGAGAGAATTTTAACTGTTTTTAGTGTTTGGTATAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGGATCCGGAAAGACGTGGCGTGCAAAACAACGGAAACCTGCACACCGGCGGTGTGGTGCTTGTCACACCGCCTCCGATGCTTAAGTCAGTAATCGGAGGGAATATGAGCAAAATCAAAGAGCTAGAGGAAGAGAAGAGAGAGTTTTCGGATCCCTTCTCCAAGGGCAACCAAAAGACTCCAGGAACCGAGCGGAAGGGAGGAAACTCGGCCCGCACAAGCGGGCCGAGGATCGGCCTCGGCTATGGGTCGAGGCCAGGTGGGGTTGGGCAAACCCTATGGCCCATTTCCCCTTTGGATCCGTTTTCGGGTTGTGTCTTTGATTTCGTGTCGCATTGTCCTCGACTACTCCTTGGATTCTGGAATGGTCCAGAATTACCTATAACAATCTCGTTCGTGACGTGTTTCGATGAGTTGGTGACTGAGAAAACATACCATATAAGAGGCGTTGCGTTTGGGATTGATTTTGCTGGAGTTAAAAGCGACTGTGAGAGAATTTTAACTGTTTTTAGTGTTTGGTATAATTGA

Protein sequence

MADPERRGVQNNGNLHTGGVVLVTPPPMLKSVIGGNMSKIKELEEEKREFSDPFSKGNQKTPGTERKGGNSARTSGPRIGLGYGSRPGGVGQTLWPISPLDPFSGCVFDFVSHCPRLLLGFWNGPELPITISFVTCFDELVTEKTYHIRGVAFGIDFAGVKSDCERILTVFSVWYN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 44..81
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 55..71
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..22

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0033053.1Lag0033053.1mRNA