Lag0032227 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTGGCGGTGGGAAATGGTGGGAATGGAGGTTTTTGGCTCTCAAGGGTTTTTGGCGGTGGAAAATGGTGGGAATGGAAGTTCGTGGAAGACGAAGACGGACGGACGGGCTGATGCATGAAGGTGGTTCTGGTGGGAGGTTGGGCGGTTAATTGCAGCACTTAAGGTATCATAATTACTGTGTTCTTATTTGTTTTTAATTTTCAGGGTTTCTTAGTTGCAGGTAGTATATCTTCTTATTGACAGGACTGTTTTTTTCCAATTAATGCATTCCGAAGGTGTTTCTCTCTACTGAGGGAGGTTGAACTTTGTACTCCTTCCCCAATAAAGGTATTGACTCCTTTTTCCGAGAAACAATTTTTTCCAGTAGATCTAGATTTTTAAAATAGTTTTGTTTTTTGGATTCTTTAATTTCAAACTTCCTAAAATGTCTCCAACTTATTTGTAGGGGTATATTTTATCTCTCTTAAACTCTGATTTTGGTTTTAAACGTTGAGAACACGTTAGGGGTTTGTTGGGGGGCATTTGTGTCTTTTACAAATAGGGATTCATTAATCACTAAATCGTTTAGCCATCTATTTAATTTATAAACATTTGTAGTCATTTTTCAAGCCACCTAATTATTTTTAGCCATATTTCTTGTTGCCCCTTTTTTGTTTTGAAAGACCAAACATGAGATTTTAATTTTAATGATTTCAAATCATTTTGGTTCCAAACACAAATAGGAATTTAAAATCATTTTTGTCATTTAAAACCCTAGAATTTGAAATCATTTCCTACAAAATCCATTTGTCAATCAGAGCATAAGGGCCTATTTGATATGTTCTCATTTCTCGTTTTTCATTTCCTATTTCCTATTTCCTGTTTCTTGTTTCTTAAGAAGTAAAAACAAAAACATATTAGGCCCCATTTGATAACCATTTTAGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTCTATTTTGATTTTTCGTTTTTGGTTTTCTGTTGTTTATATGTTTTGTAACTGTTTTTTGTTTTCTGTTGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAACCATACTTGTTTGATAATTGTTTTGGTTTTTCAGTTTTTTAAAAAATTAGAGAAATGAAAAGATGTTTTAGAGAGAGAAAATGTATAGAGATATTTTTTTTTTGAAACAAAAAAGTTGTTTAAAAAATGTATAGAGATATTGAAACAAAATTTAGAGCCACAAAATAAATGTTTTTTAGAGAAAAATTAAACATATAAAATTTAGAGACATGAAAGAAAATGGTTAGAGAGAGAATATTAGTTAGAGAAAGAAAGAAAAAAGTTAGACTAGTAGAGATAATTTTTTTATAGAAAAATTAAATGAAAAGAGAAATGTTAGAGAGATAGTAAGTTAAAAGAGTAAATATATGCTAAAGAAATAACCCTAAATTAGAAAAAAAGAAATTTGTAGCGAAAGAAAATTAATTCGGGGAGATTTTTTTTTTTTCAAAAGAAAAGTCAGAATATTTTTATTAGGAAAGAAAATTATTGATAAATTTTAGAAATAGATAAGTGATGGAGTGAATATCACTCACGCGGAAGCAATTAGGATCTTAGACACTCTAACTACATCAATTTTATGGATTAAAAGCATGGTATCATTAAGTCGAAAATAGGGAAAAATGACCAACCTCTTTGAAGCTCGAATTCAAGCACTCCATTGGATGAAATGGATCACGAACTCTTCATGGATTACCGCTAGTGTCTTCCCTGCTATCTTCCGACCTTAGAACAGCTTGTGAGAACCATTTGTGATGCTAATTAAAGGGAAATGAAGGCTTGGGAGAGTTTTAAACTTTTGTTATTTTGAGAGAGAAATCACAACACCATTAGTTTTAATCTTCAACTTTCTTCTCTGTTTAAAGAAGAACATGCAAATGCCTTCATCAAATGAAGACACAAAGATAATTGAGGGATTAGGTGTTGGAGTGGTGTTTAATCTTGGTTTGTCATAAAAACCACCCCTTTCAAACACTAGTGTTTTACCACGTGCCTTGCACGTGTAATTTTTTACTTTAAAAATATTTAGAATTATATATAATTTGGATAAAAAATTACTCAATAGAATAATTTTTTAATTACTTAAAGATCAATTTTATATTCTTATTAATATAGTTTTATTCAATCAGTTGAATGTTTTTATAGCTTAGTATATATCTAGGTGTTTTTTCAATTTAGTCTCTTTTGCAAAAAGTTTTAATTTAGTTATTTATGTTTTAGTATTTTTTTTAATTTATCTTTAACAAAATTTAAACATTTATTTTAGTTTGAATGGATCAACACGATTAAGTGATCGTACTTACTCGATTGGTACGATTCGATTTATTAATTTGACACAATTTTATATACCCTTCATAGCAATTATAGAGTTGAATTTTTTAAACATGTGTTGAAAATCAATACTTAATTAATCCAAAAAATGAACTATACTTAAAAAAGTAGGATACTTTGAGTTCATTAAAATTAAATTATTATTACTTAATTACTTAAACATTTTTGAAATATTAAAACTGTAAAACTAAAATTTTGTTAAAGAAGGAAATTAACAAAGAAGATATGACTTTTTTATATATATATATATATATATAGAGGATGTGAAAATGTTATTGAGTTCATTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAACATTAAAATTAAATTATTATTACTTAATTACGTAAACATTTTATTTATAAAAAAATTACGTAAACATTTTTCAAAATATTAAAACTGTAAAATTAAAATTTTGTTAAAGAAGAAAAGTAAACCAAGAAGATAAGACTAAATTTCTAAAATAATATGTTTAAAAAGAATAATATATATACTCTTAAAAAAAACGTACAAAAAATAAAACAATAATATATTTTATTTTAATCATTGTTCTTGTTCTCAAAATATACAGAAAAAATATTAGGTTAGATTTGAATAATCTTTTAAACAAAATGGTTTTAAAAATAGGAGAATTTTTAATTAACAAATTCTAAACATAAATTTGAAACATTGAAAAGGGTACTAATTAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAGACAAAACCTTAGCATCAGACAATTTCTTTAAAGTAGAGATCTCTAGTATGGCTCATTTGCTACTTCAACAAATCAAAACTTTGTTCTATCATGTAAAACAAATTGTGTCAAAGAAACTAAAAAGAGGAAGATGTGATTTTGATTGTGGAAATAAGTCCCTTTTATAATTGAAATAATAGGAGTTAAAAAACTGTTAGTATTTCAAAACCTTCTAAATTCCATGAACTTTTTATATAGGAGTTAAACAACTGTTGGTATTTCAAAACCTTCTAAATTCCATGAACTTTTTATAAATGAGGTAGGACTATCCATATTCTACCTTTTTAACATTTCTCTCATTTATCAATAATTATGAATGTCATTAAATATTTATTTATCAAATTATATTTTCTATTAATTTTAAAAAGTAAAACACACCAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAATGATAGAAATGAATTATTGGTTGATTTCAACGTGTGAGGGTATATGTATAAATAGCAAAAAAGAATTCAATATTTTAACTATACACTAATTTCTTCAAATAAACATGCTCACTTGACAATGACAAACGTACACCGCTATTCAAGTTCATCAATGTTGAATTGTAATATTGGAAGCATAAGATCTAGGAGTGAAGAAAACTCGCTATTCAACTTGTTATTCTACCTTAATAAACTTCAACCGCTATTCAACTTGCTCCCTTGCAACTTGAATTGTAACACCAATCTCTTGAGATGCTTTGAAAAAGAATGAGGAGCCTTTGGGGGCAATGCATTTAGAGAACAACAATAAAGAAATAATGAAACTCTAGGTATGTTGGTGAGAAAATGGTGAAGAAAACTCCTTTTTATAGTAGTAGAATGTGAGAAGTTACAAAACTTTTTGAATTCTAAATCTTTTAAATTTTCATTTTGAATTAAATTAAAGAAAAAAAATCTTATAAGTTGTAGGAAAAACCTTTTACCTTCCAACCTTTAAGATTCTATACACTTATGGTTGATAATTGATTATTAATTAAATAATTTTATATTTATAATTAATTATATTAATGACATATTTTGTAAATTAGAAAGTTGAAGAAGGGACAAAAGTGTCCAAAAATGTTTTTCCAACATCCTCACTTTTTAATATAGTATAGATTAGAGATTTTTGAATTAAAAAAATCAAAAATTTATTTCTAAATTAATTTTAAATAAATCTGATTCTAATAATTAATTTTAAATAATTAATTAAACAATTTAATTAATTATATTAATTTAATATCAAATATTAAATTAATTTATTTGTACCAATTCCGATCTCTCTCAATCCAATATGAATCTCTATTCATATATAAAATTCAAACCAGTAGCTGCACTCTCCTCGCTGTAGATATACTTCCGTCCACTCGATATAATAATGATTAGTAAGTCGATCATGGTTATATTGAGGGCAAAGAGAGGATTGAGAAACATAATTCGAAATTTGCCTCACGAATTAACAAAGGACAGAAAGAACTCATTTTTCAACCGAGTGATTGGGTTTGGGTGCATTTTCGCAAAGAGCATTTCCCTCGAAACGGAAGACAAAGTTACATCCAAGAGGGGATGGTCATTATCAAGTTCTTGAAAGTATTAACAACAATGCCTACAAGATTGATCTGTCGGGAGAATTTTCAGTAAGTTCTACTTTCAATGTTGTTGACTTGAGTCCTTTTGATGTAGGTGATGACTATCCTGATTCGAGGATGAATCCTTTCGAAGAGGGGGAAGATGATAAGAATCATGGTGCTCCACACGTTCCAACTGGACCTATTACACATGCCAAGGCTAAGAAACTTCAACAAGCTAAGCATCATTTATTCACATACAAAATTGGTTAGGTTCAGCTCCACATTCATTTCACATGCTGCAAATTAACCCAAGAG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MFGGGKWWEWRFLALKGFWRWKMVGMEVRGRRRRTDGLMHEGGSGGRAFPSKRKTKLHPRGDGHYQVLESINNNAYKIDLSGEFSVSSTFNVVDLSPFDVGDDYPDSRMNPFEEGEDDKNHGAPHVPTGPITHAKAKKLQQAKHHLFTYKIAGVTDTSEGLTSRYWSRSVDIENMSAVRRVQLFSKTRPRILSNLPLRERLPQVFCLLDLETYRCNLCGYCVIQRRKFQRSRGEEAVAFSFVGALLAKNGQVYNEVPHLQLSPLASRGGAVATICKKKNLSTWHCGPTQPSEFVEILTDSGKKLEPNPLFDEWNTVDQALSGWLFGSMSPAIAADVVSFKTSREVWKALEKVYGATSKSRINQLRDVLQNTKKGSMKMVEYLAVMKQASENLKLAGNPVSLSDLISYALAGLDSEYIPIVCTIEDKDFSTWQEFSSVLINFEGTLSRYTVPTNTNTSDLPDLAAHFAYNRNNQSTGQRHFSSNRGNQGQTTVPPNFSGNRGSNRGRGGRGRNNFQRGNSKPTCQLCGKYGHSAPYCYMRFEEEFNNPHASGNNNKGGSSTPSSSAYIATPEILNDPKWLVDSGATNHVTADVGNLASKTKYHGKESLIVGNGSKLVVSHVGNSSISSSSGNFMVKLNNMLHVPKISRNLISIARLTADNNVYVEFHPGFCLVKDKASRRVILHGTLKDGLYQLELPSIQNSKSTVSPSSFLVDSAFNKPSVNESIVKSPVVLQVQCSP Homology
BLAST of Lag0032227 vs. NCBI nr
Match: TXG55646.1 (hypothetical protein EZV62_020902 [Acer yangbiense]) HSP 1 Score: 315.8 bits (808), Expect = 9.5e-82 Identity = 190/444 (42.79%), Postives = 265/444 (59.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. NCBI nr
Match: TXG69253.1 (hypothetical protein EZV62_004188 [Acer yangbiense]) HSP 1 Score: 312.0 bits (798), Expect = 1.4e-80 Identity = 181/422 (42.89%), Postives = 257/422 (60.90%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. NCBI nr
Match: TXG67243.1 (hypothetical protein EZV62_008518 [Acer yangbiense]) HSP 1 Score: 310.1 bits (793), Expect = 5.2e-80 Identity = 180/422 (42.65%), Postives = 257/422 (60.90%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. NCBI nr
Match: XP_022157748.1 (uncharacterized protein LOC111024384 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 306.2 bits (783), Expect = 7.6e-79 Identity = 167/312 (53.53%), Postives = 218/312 (69.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. NCBI nr
Match: XP_022157750.1 (uncharacterized protein LOC111024384 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 1.7e-78 Identity = 163/302 (53.97%), Postives = 214/302 (70.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94HW2 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 156.4 bits (394), Expect = 1.3e-36 Identity = 128/447 (28.64%), Postives = 213/447 (47.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZT94 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE2 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 141.7 bits (356), Expect = 3.2e-32 Identity = 118/422 (27.96%), Postives = 192/422 (45.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A803PEH4 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 2.9e-84 Identity = 197/476 (41.39%), Postives = 282/476 (59.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A803QD97 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 318.5 bits (815), Expect = 7.1e-83 Identity = 178/419 (42.48%), Postives = 264/419 (63.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7HHE9 (Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_020902 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 315.8 bits (808), Expect = 4.6e-82 Identity = 190/444 (42.79%), Postives = 265/444 (59.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7IJ06 (Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_004188 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 312.0 bits (798), Expect = 6.7e-81 Identity = 181/422 (42.89%), Postives = 257/422 (60.90%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0032227 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7ID32 (Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_008518 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 310.1 bits (793), Expect = 2.5e-80 Identity = 180/422 (42.65%), Postives = 257/422 (60.90%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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