Lag0031511 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0031511
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 9397529 .. 9402119 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0031511
SyntenyLag0031511
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTTCACATTGGTTAATGGGTCGGCGAAGGATTCCTTTCGTGTTTACAAAGGTTCGGTGTGACATGACAGTAATTTTTATATATTTTTGCAGCAAGTTTGTCCTTTTTTCTAGTATTGGTTAATTTGTCGTGTTTCTAAATTTTTTTTTTTTTTGAAAAAATGTTTCTAAAAATAATTGATTGAGTTAACCCATTCCAATAGATTTGACTTAGTTCCAATTTAATCCCTACAGTTTATTTGATAACTATTTAAATTTTTATTTTTAAAAAATTTAAACTTATAGACACTACTTCCATATATACGTTTTGTTATAAGTAATTTCGGACCACCCCAATATGCAAGGAGTTGAGAAGGACAACGCGATACTACTCGAAGGAGGCAACTAGGAAACCGTCCCCGGAGGAAAAACAGGCCAGAGGGTCGGCCTCGGCCCGAGGTCCAGCTCTTCCGCCTCCGTTCGGTCCCTAGTGCTCCCAACCGCACCGATTCCACTTGGTTTAGCCCAAATCGCCTCCAAATCGCCTCCAAATGCCTAGAGCAGGAAAAGGTATTTAAACCCTTCTTCGTCACTAAAGAAGGGATCCCGAAACTATTCTCTAAACCCTACTTTTCCTCTTGCTCTCTTGCTCTCTTCCTTCAGCTTTCCGACTTAAGCATCGGAGGCGGTGTGACAAGCACCACACCGGTGTGTAGGTTTCCTTGTCTTGCAGGCTATGCCTTTCCCCTTCAAACAAATTTACCGTTGGCAGCACGTGAAGGTCAAGTGAGTTCTTCCTGTCCAGATTTGACCATCAATAATACGTTTCTTTATTTTGTTATCTATCTTCTTTCCACGTTTAAAAAATAAAGTAAGTTTTGAAAATTTAAAAGGAAAAAAAATAGTTTTCAAAATTTGAAAAAGAAAAATTGGCTAGAAAATAGGAATCGAAATGTATATAGATAAAAACTATTTTAAGGAAATGAAAAGAAAAACGTGCATAATTTTTTAAAAATCAAATAATTATCATTATAAAAGTTTCAATTTTGTAGAGTGACCCAAGATTAATTTTATCAAAAGTTTTAATAAAGTCCATGTAATCTTAAAAGTATTAGATTACTCATTGAGGAAAACATCACTACATGTCTCCAAACTGTTTTGTTTATCCTTCTAGAAATCCACTCATTTCTCTTAATCATTTTACTTATATTTTAGCATGTAAATATAAAATTTATCTAATATAGTGAAAATTTGTAACAATAAGATGATCTATGACATTCAAAACTTTTAAAATTACATAAACCATTAAATAAAAGTCTAAAGCAAAACTCATTAATAATGGTCAATTTAAGCATAGATCGACTAGTTAAGGTGTCACTCAACCAAGAAGTTTGAAATTCGAGTTATCTCATTTAACATATTTTCGAACTAAAAAATAACTAACTATATTGTATTATAAATTTGGAGAGATCAAAAACAAAATTAAATCTTATTTTAATATATTATTTTAAAAATTTGTAATAATTTGTGCATATATAATATATAGCCGAGTATAAGTGCAAAGAGCACAAGTATAATAAGTACTTTTATGGGAATGGTTTGGTTGTGATTTTAAAAGAAAAGTTGATTTATTCGTATTTATCTATAGACCCAACAGTTCCAACGAAAGATACGTATCAAAGCAAAGTCTTGCAAAGTCGATGAAGAGTATATATTTTATCTATACTATATATAAATGGGGCTAAGAGGGGAGAATCTTTTGTTTCCTCTTTTACCCCTACTTTTTTAGTAAATTCCTGTTTTGACATTTCTTGATGCAAGGTGACTCTTCGAGTATATGTCTGTTCATTCCGATAGATGCAATTAATATTGACGAGACACGACTATTGGTGACGGTAGTTATACATCAAATCGATGCATCCATTTGCGTATGGTTACGATTCATGTATAAAAGACATTGAACTATGTAATATACTTCTTTTACAATTAATTATTCTAATTTATTGTTGTTCATAGATAATTGATTTTGTGCAAAGCATGTTGTTGAGATTCATGAATTTCGTAGTTATATTATTTGTATTTTTAGATTTCAGAGTTGTTATTTCATGAAATTCCGTTATTTAGTAGTTATAGTATTCTTTATTTATGTTTTCTTTTCACTCAAACAATTGGTTCCCCGTCGGGCTTCAATCACCTATTTCAAAATGGATGAGAAAGGTCAGTTAATTATCGTATTCATCGTCTCTTTATTTTCATGTGGTTGGTTCTTTGATAATTTTATTTAAAGATTGTGTATGAAATTGTAGTAAAATTTAATTTCTCTCTAAAAAAATTGTGATTTGAAATTGAAAAGTTAAAATATTTAGAAACTGCACTACATTTTTCATCATTCATCAGCAATAGAATTACATTTCTTTCAATGGGTAAAAATTGTAAGTACTTTAACATAAAATTGTAGATTGCAATTAATTTTTGTTTTTGACTATTGTGGTTGTTACCCAAAACACACTATAACTTATCTCTGTATAAAATTCACTTCATCAGGGAATTTTGATGAAATATTCTTTCTTTATGTTGTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAATAAAAAACCTTTCTTCAATTGCATGAAATTTCATATCGAGATTTTATTTTTTATTATTGATTTTACTGGTTATGATTGTGATTTGATGGATTTTATATTATTTCATATTATGGTCTGATGTATTTACATGATTAATTATTATTAACATAAATAATTATACAAAGAAGTATAATAACCTTAATAAATTTATTCACTTGTTAGTTGGGATTTAGGACTGATATTGATTAATTATTCTTGACTTTTTAAATCAAATTTTAAAATGAAAAAAAATGATGACGGTTTGGATTATCATCATTTTTTACTATTTAAATTGAATGAAAAATATATTCATTCAACATTTAAATTTCTCTATGAAAATTTGTGTTTTAAAGATTTTTAACCACGTGCATTGCACGGGTCTTATAACTAGTTTAATTAAAAGATTTTTTATTAAGTTAAATTTAAATTCTAAAATTTAGAACAAATCGAAGATATTTTCCTTTTTCTCTAAAAAGATCATATATGCTAAAAATTAATGATTTTGAAGTATATTGTTATACTAACCTTTTACCTACCTTTAATCATACAAGTTCAAAAAAAATATTAAATTATGTGTTTAGTTTCTAAACTTGTAAGGTTGTGTGGATTTAGTCTTTGAACTTTAAAACACATTAAATATAAATAGTATTCGAACCTTTAATTTTGTGTCAAATAAGTCACTAAACTTTAAAAAATATTCAATAAGTCTTTAAACTTACACTTCTGCCTCCAATAAGTCTCCCAACTTTTAATTTTGTGTCTAATATGCTCTTGATCTATTTGACATTTTTCAAAATTAACATACCTATTAGATACAAAATTGAAAGTTTAAGGTCCCATTAGACATAAAATTTAATATTATATATTGATTCTCTTTTTTAAAAATCACAAACATGTCACGGACATATTAGACATTTTTAAAATTCAAGAACCTATTGGATACAAAATTGAATGTTCATGGAGCTATTAGACACTTTTTCACTTTTTTAAGTTTAAAAGACTAAATAGACATAAACCTCAAATTGTAAGAACTAAACTTATAATTTAACCTTTAATTTTTTTAAAAAATAATAAAGATCGGGAAATTATTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAAGGGAAATTATTTATTAAAAACAGAGAAGATAGGTCGAAATATTTCTTTACAAAAAAGTCAAGATATCAATGTTAACAAATCATTAGTAATTCTATTATATATAGATTTTCTGTAATATGATATATATAATTGGTTGTATGAACATAGATAACTTTGAGTTCAAAATTAAAGTTTGTTTTAGCAGATGGAGAACCTCTGTTCTTGTTCACAATTATTCAATAATATTAGAATATATATTTTTTTTTGACGGAATTAAAATATTTATTTTCGAGCATTTGCTATATGATGCAATGTTTCCATTTGTTTTCTTCCTTAGCAATTATATACGTAACAGCCGAAGCGAGCTTAGCTCAGTGGTAATTGGCATTGTTATAGGTGATTTTGGACCACACAGATGCACAAGGAGCTGACGAGAACAATCGGGCAGAGGTAGGACCAAAAGACCGACCCAAAGGAAGACCGGACCAAAGGGTCGGGCCAACATGGCCCGACCCATATGGTCGGCCTCGGCAAAAGGCCGAGGCCGACCATTCGGCCCGTATGCGTGGGCCGAGCCTAGTGACCTCTTTTCGGTCCCTGATGCCCCGAATCGCCCTGGTTCTGCTGGTTCGTCCCGAAACACCTTCGAATTCCTAAAAACCCTAGGAGGACAAACATGTATAAAACCCCCTCTCACCACGGAAGAAGGGTTCCGAAACTCTATTCCTAACTCTCCCCTTACTATCTGTAGCTTCTCCTCGGTTTTCTGACTTAGGCATCGGAGGTGGTGTGGCCTACACCACGCCGGTGTGCAGCGGTTTTTGCTGGTCTTGCATGTCACGTCTTCCCCAGTTTCTACAAATTCACTGTTGGTGTCACGTGA

mRNA sequence

ATGTTCACATTGGTTAATGGGTCGGCGAAGGATTCCTTTCGTGTTTACAAAGGACAACGCGATACTACTCGAAGGAGGCAACTAGGAAACCGTCCCCGGAGGAAAAACAGGCCAGAGGGTCGGCCTCGGCCCGAGGTCCAGCTCTTCCGCCTCCGTTCGGTCCCTAGTGCTCCCAACCGCACCGATTCCACTTGGTTTAGCCCAAATCGCCTCCAAATCGCCTCCAAATGCCTAGAGCAGGAAAAGCTTTCCGACTTAAGCATCGGAGGCGGTGTGACAAGCACCACACCGGTGTGTAGGTTTCCTTGTCTTGCAGGCTATGCCTTTCCCCTTCAAACAAATTTACCGTTGGCAGCACGTGAAGGTCAAGTGATTTTGGACCACACAGATGCACAAGGAGCTGACGAGAACAATCGGGCAGAGGTAGGACCAAAAGACCGACCCAAAGGAAGACCGGACCAAAGGGTCGGGCCAACATGGCCCGACCCATATGGTCGGCCTCGGCAAAAGGCCGAGGCCGACCATTCGGCCCGTATGCGTGGGCCGAGCCTAGTGACCTCTTTTCGGTCCCTGATGCCCCGAATCGCCCTGGTTCTGCTGGCATCGGAGGTGGTGTGGCCTACACCACGCCGGTGTGCAGCGGTTTTTGCTGGTCTTGCATGTCACGTCTTCCCCAGTTTCTACAAATTCACTGTTGGTGTCACGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTCACATTGGTTAATGGGTCGGCGAAGGATTCCTTTCGTGTTTACAAAGGACAACGCGATACTACTCGAAGGAGGCAACTAGGAAACCGTCCCCGGAGGAAAAACAGGCCAGAGGGTCGGCCTCGGCCCGAGGTCCAGCTCTTCCGCCTCCGTTCGGTCCCTAGTGCTCCCAACCGCACCGATTCCACTTGGTTTAGCCCAAATCGCCTCCAAATCGCCTCCAAATGCCTAGAGCAGGAAAAGCTTTCCGACTTAAGCATCGGAGGCGGTGTGACAAGCACCACACCGGTGTGTAGGTTTCCTTGTCTTGCAGGCTATGCCTTTCCCCTTCAAACAAATTTACCGTTGGCAGCACGTGAAGGTCAAGTGATTTTGGACCACACAGATGCACAAGGAGCTGACGAGAACAATCGGGCAGAGGTAGGACCAAAAGACCGACCCAAAGGAAGACCGGACCAAAGGGTCGGGCCAACATGGCCCGACCCATATGGTCGGCCTCGGCAAAAGGCCGAGGCCGACCATTCGGCCCGTATGCGTGGGCCGAGCCTAGTGACCTCTTTTCGGTCCCTGATGCCCCGAATCGCCCTGGTTCTGCTGGCATCGGAGGTGGTGTGGCCTACACCACGCCGGTGTGCAGCGGTTTTTGCTGGTCTTGCATGTCACGTCTTCCCCAGTTTCTACAAATTCACTGTTGGTGTCACGTGA

Protein sequence

MFTLVNGSAKDSFRVYKGQRDTTRRRQLGNRPRRKNRPEGRPRPEVQLFRLRSVPSAPNRTDSTWFSPNRLQIASKCLEQEKLSDLSIGGGVTSTTPVCRFPCLAGYAFPLQTNLPLAAREGQVILDHTDAQGADENNRAEVGPKDRPKGRPDQRVGPTWPDPYGRPRQKAEADHSARMRGPSLVTSFRSLMPRIALVLLASEVVWPTPRRCAAVFAGLACHVFPSFYKFTVGVT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 128..178
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 13..44
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 132..153

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0031511.1Lag0031511.1mRNA